KHÁI NIỆM VỀ BẢN ĐỒ DI TRUYỀNsinh vật, một cá thể, một NST hoặc một gen… người ta thu được các dữ liệu di truyền bằng hình dạng: kích thước, màu sắc của NST hoặc bằng độ lớn, vị trí sắp
Trang 1BẢN ĐỒ DI TRUYỀN
Trang 2KHÁI NIỆM VỀ BẢN ĐỒ DI TRUYỀN
sinh vật, một cá thể, một NST hoặc một gen… người ta thu được các dữ liệu di truyền bằng hình dạng: kích thước, màu sắc của NST hoặc bằng độ lớn, vị trí sắp xếp của gen, các nucleotid tạo nên các loại bản đồ di truyền khác nhau.
chia bản đồ di truyền thành nhiều loại khác nhau: bản đồ di truyền liên kết, bản đồ di truyền tế bào, bản đồ vật lý, bản đồ trình tự gen.
Trang 3LỊCH SỬ PHÁT TRIỂN BẢN ĐỒ DI TRUYỀN
dấm
được bản đồ di truyền tế bào
(ở người, cây lúa…)
Trang 4MỘT SỐ LOẠI BẢN ĐỒ CHỦ YẾU
Hiện nay có nhiều loại bản đồ di truyền như:
Trang 5MỨC ĐỘ CHÍNH XÁC CỦA MỘT SỐ LOẠI
BẢN ĐỒ DI TRUYỀN
Bản đồ hình thái NST Bản đồ di truyền tế bào
Marker 1 Marker 2 Marker 3 Bản đồ di truyền liên kết
Gen
Trang 6BẢN ĐỒ HÌNH THÁI NST
trình phân bào giảm phân, loại protein, nhuộm với thuốc nhuộm.
biểu hiện ở các vệt (band) màu đậm nhạt khác nhau trong cấu trúc NST.
thể chia thành nhiều dạng khác nhau.
Trang 7có thể xác định được sự khác nhau về cấu trúc NST.
thu được các băng khác nhau Dựa vào khóa phân loại chuẩn có thể xác định được vị trí phân loại của các cá thể sinh vật
Trang 8CÁC PH ƯƠ NG PHÁP NHU M BĂNG Ộ
NaOH, sau đó nhuộm giemsa Thu được các NST có các màu đậm nhạt khác nhau Vùng đậm là vùng giàu A-T, vùng nhạt là vùng giàu G-C
nhiệt sau đó nhuộm giemsa Kết quả vùng đậm giàu
G-C, vùng nhạt giàu A-T
giàu A-T, vùng nhạt giàu G-C
bão hòa, sau đó nhuộm giemsa Băng sẫm là các vùng dị nhiễm sắc
Trang 9QUY ƯỚ C Đ C B N Đ NST Ọ Ả Ồ
QUY ƯỚ C Đ C B N Đ NST Ọ Ả Ồ
Tâm độngCánh ngắn
Trang 10BẢN ĐỒ DI TRUYỀN LIÊN KẾT
trên ruồi giấm
trên cặp NST tương đồng
Tần số tái tổ hợp giữa các locus gen là tần số trao đổi chéo hoán vị gen, xảy ra giữa các locus gen của các cặp NST tương đồng trong giảm phân
hợp/tổng số các cá thể thu được trong quần thể đời con
Từ đó xác định được khoảng cách tương đối giữa các gen trên NST, tính bằng đơn vị centimorgan (cM)
Trang 11BẢN ĐỒ DI TRUYỀN LIÊN KẾT (Tiếp)…
1 cM = 1% tần số trao đổi chéo giữa 2 cặp gen
1cM được xác định tương đương với 1Mb so với các bản đồ khác
Bản đồ di truyền liên kết chỉ xác định được vị trí tương đối giữa các gen trên NST, không xác định được chính xác vị trí và kích thước của gen
Do xây dựng trên cơ sở tần số tái tổ hợp giữa 2 locus gen nên độ chính xác thấp
Việc thiết lập bản đồ vô cùng phức tạp nhưng có vai trò quan trọng trong việc nghiên cứu di truyền học
Đã có nhiều phần mềm được xây dựng làm tăng độ chính xác
Trang 12BẢN ĐỒ DI TRUYỀN GIAO NẠP
trên cơ sở giao nạp ngắt quãng ở từng thời điểm xác định.
plasmid giới tính với bộ gen Plasmid gắn với
bộ gen là episo.
nhân tố giới tính F và một phần DNA sang tế
Trang 13BẢN ĐỒ DI TRUYỀN GIAO NẠP (tiếp)…
+ Hfr: thr+, leu+, aziR, tonAR, lac+, strR.
+ F- : thr-, leu-, azis, tonAs, lac-, gal-, strs.
- (-) mất khả năng tổng hợp,
- (+) có khả năng tổng hợp.
Trang 14PHƯƠNG PHÁP LẬP BẢN ĐỒ GIAO NẠP
mật độ thích hợp)
máy rung làm ngừng quá trình giao nạp.
Trang 15BẢN ĐỒ DI TRUYỀN TẾ BÀO
khác nhau với thuốc nhuộm đặc hiệu tạo thành các băng màu khác nhau
quang…
tích bệnh lý, đột biến cấu trúc NST
đoạn NST kích thước từ 1-2Mb với độ chính xác cao
Trang 16B N Đ DI TRUY N T BÀO Ả Ồ Ề Ế
B N Đ DI TRUY N T BÀO Ả Ồ Ề Ế
Trang 17B N Đ DI TRUY N T BÀO NG Ả Ồ Ề Ế Ở ƯỜ I
Trang 18B N Đ LAI PHÓNG X Ả Ồ Ạ
đại các đoạn NST đứt gẫy do xử lý phóng xạ được lai với NST bình thường tạo nên các khảm NST
NST với kích thước khác nhau
dụng hợp nhân và tế bào lựa chọn
lý)
phóng xạ một cách chính xác và có hiệu quả
Trang 19CÁC B ƯỚ C THI T L P B N Đ LAI PHÓNG X Ế Ậ Ả Ồ Ạ
CÁC B ƯỚ C THI T L P B N Đ LAI PHÓNG X Ế Ậ Ả Ồ Ạ
một tế bào bình thường nhờ kỹ thuật PEG hoặc nhờ virus Sendai làm dung hợp nhân giữa 2 tế bào
hợp làm dung hợp nhân hai tế bào
khảm của tế bào lai
Trang 20SƠ ĐỒ LẬP BẢN ĐỒ LAI PHÓNG XẠ
Dung hợp nhân giữa tế bào cho và tế bào nhận
Tế bào lai phóng xạ Lựa chọn tế bào lai phóng xạ
Trang 21BẢN ĐỒ GIỚI HẠN
thước các đoạn DNA bị cắt bằng enzym giới hạn.
nhau có thể cho nhiều đoạn cắt khác nhau hình thành nên các bản đồ giới hạn khác nhau.
hạn, số lượng, kích thước đoạn cắt.
khác nhau giữa các cá thể trong loài.
Trang 22PHƯƠNG PHÁP LẬP BẢN ĐỒ GIỚI HẠN
PCR tạo ra một lượng DNA cần thiết.
enzym giới hạn các mẫu trong điều kiện thích hợp.
thang DNA chuẩn, tính toán kết quả và lập bản đồ.
Trang 23VÍ D V L P B N Đ GI I H N Ụ Ề Ậ Ả Ồ Ớ Ạ
VÍ D V L P B N Đ GI I H N Ụ Ề Ậ Ả Ồ Ớ Ạ
Sử dụng enzyme Hind III và Bam HI
Kết quả điện di có được
Hin III
HinIII +
2.8kb 1.2kb
1.3kb 1.0kb
đoạn trong bộ gen
Từ đây thiết lập nên
bản đồ giới hạn Tuy
nhiên, nếu với số
lượng enzym giới
hạn lớn thì việc tính
toán gặp rất nhiều
Trang 24B N Đ V T LÝ Ả Ồ Ậ
B N Đ V T LÝ Ả Ồ Ậ
cắt từ bộ gen
trong các loại vector tách dòng khác nhau hoặc các đoạn DNA thu được bằng các kỹ thuật phân tử RFLP, SSR…
vật lý mang đặc trưng riêng tạo nên các loại bản đồ có độ chính xác khác nhau
di truyền của cá thể và các loài sinh vật trong các nghiên cứu đa dạng sinh học và vốn gen của các loài sinh vật
Trang 25BẢN ĐỒ TRÌNH TỰ GEN
nucleotid trên phân tử DNA.
gen trên NST, trình tự sắp xếp chính xác của các nucleotid trong mỗi gen.
độ khác nhau.
phức tạp đòi hỏi sự cộng tác của nhiều nhà khoa học.