Thuật ngữ chuyên môn - Di truyền học

THUẬT NGỮ CHUYÊN MÔN Adaptation: tiến trình thích nghi của các cá thể trong quần thể, hoặc loài sinh vật Additive: tính cộng, biểu thị hoạt động các alen đồng hợp tử Additive x additive: tương tác tính cộng x tính cộng, biểu thị hoạt động tương tác không alen giữa những cặp alen đồng hợp tử Allele: một cặp hoặc một series của yếu tố hình thành gen, định vị trên cùng một locus trên nhiễm sắc thể tương đồng ANCOVA: viết tắt từ chữ analysis of covariance, phân tích hợp sai giữa hai cặp tính trạng liên quan nhau Ảnh hưởng của môi trường: hay còn gọi là ảnh hưởng ngoại cảnh, một yếu tố quan trọng trong di truyền số lượng, vì hầu hết các tính trạng do đa gen điều khiển đều chịu ảnh hưởng này Ảnh hưởng của sự lai đảo: viết từ thuật ngữ “recriporocal” nhằm giải thích ảnh hưởng của cây mẹ, hay ảnh hưởng di truyền của tế bào chất (cytoplasm) Ảnh hưởng của tính cộng: ảnh hưởng của hoạt động alen đồng hợp tử Ảnh hưởng của tính không cộng (non-additive): ảnh hưởng của hoạt động alen không hoàn toàn đồng hợp, hoặc tương tác không alen ở dạng cộng x cộng, cộng x trội, và trội x trội Ảnh hưởng của tính trội: ảnh hưởng của hoạt động alen dị hợp tử ANOVA: viết tắt từ chữ analysis of variance, phân tích phương sai của tính trạng Apomixis: hiện tượng sinh sản trong đó cơ quan phát dục hoặc cơ quan có cấu trúc tương tự đảm nhận chức năng sinh sản một phần, tạo ra hạt có nguồn gốc vô tính, thí dụ như hạt cho hai mầm: mầm hữu tính và mầm vô tính Apomictic: thuộc về hiện tượng apomixis Asymmetrical: không đối xứng Autogamy: tự phối Backcross: hồi giao, trong tổ hợp lai, có bố mẹ sẽ có giống cho (donor) và giống còn lại là giống tái tục (recurrent), con lai F1 được lai lui với giống tái tục nhiều lần được gọi là hồi giao. Balance: sự cân bằng là điều kiện mà trong đó các thành phần di truyền được điều chỉnh theo một tỉ lệ nhất định đảm bảo cho sự phát triển hài hòa Balanced polymorphism: hiện tượng đa hình cân bằng Basic number: số liệu căn bản thường để chỉ số liệu nhiễm thể trong tổ tiên lưỡng bội của một dạng đa bội (polyploids), được ký hiệu bằng chữ x. Biến dị:sự xuất hiện khác nhau của cá thể do sự khác biệt về thành phần di truyền của nó, hay sự khác biệt do môi trường mà nó đang phát triển. Biến dị bào chất: biến dị do ảnh hưởng của tế bào chất Biến thiên liên tục: biến thiên có dạng phân bố chuẩn Bioinformatics: ngành tin sinh học, ứng dụng thành tựu của tin học hiện đại vào giải thích hiện tượng sinh học, điều khiển các chương trình nghiên cứu công nghệ sinh học, quản lý số liệu di truyền, thiết lập mô hình dự đoán kết qủa,v.v Biometry: một ngành học có nhiệm vụ nghiên cứu và giải thích số liệu thống kê trong sinh học Biotype: loại hình sinh học, thường được đề cập trong biến dị của côn trùng. Biotype có thể ở dạng đồng hợp, hoặc dị hợp. Breeder seed: hạt giống tác giả Breeding: chọn giống là một nghệ thuật và là một khoa học làm thay đổi cây trồng hay vật nuôi về mặt di truyền. Bulk: trồng dồn, con lai được thu thập mẫu hạt và trồng dồn lại để gia tăng tần suất đồng hợp tử lặn, trong trường hợp tính trạng chọn lọc do gen lặn điều khiển Bulk segregants: con lai đang phân ly theo phương pháp trồng dồn Cận giao không chọn lọc: quá trình con lai cho cận giao hoàn toàn, không có tác dụng chọn lọc của con người Certified seed: hạt giống xác nhận được sử dụng trong qúa trình thương mại hạt giống, không phải là hạt giống cơ bản Centromere: tâm động của nhiễm sắc thể Character: tính trạng di truyền Chromosome: nhiễm sắc thể là vật chất di truyền có trong nhân tế bào Chỉ số chọn lọc: giá trị biểu thị trong phân tích hiệu qủa chọn lọc của một chương trình lai tạo Chỉ số môi trường Ij: biểu thị giá trị đại số của địa điểm khảo nghiệm chương trình giống cải tiến nào đó, trong phân tích tương tác GxE Chỉ số ổn định s2di: biểu thị mức độ ổn định của tính trạng Chỉ số thích nghi bi: biểu thị mức độ thích nghi của tính trạng (rộng hay hẹp) Clone: dòng vô tính là một nhóm sinh vật được duy trì bằng phương pháp phân bào đẳng nhiễm từ một dòng tổ tiên (dòng gốc) Cluster di truyền: nhóm di truyền được phân ra nhờ phép tính mức độ khác biệt của các tính trạng (qui mô hình thái học), hoặc của DNA (qui mô phân tử) Combining ability: khả năng phối hợp, được chia ra khả năng phối hợp chung biểu thị Complementary gene: gen hoạt động bổ sung Complete dominance: tính trội hoàn toàn Coupling: những alen lặn liên kết với nhau xuất hiện trên một nhiễm thể tương đồng và những thể alternative trội của nó xuất hiện trên nhiễm thể khác (còn được gọi là liên kết alen thuộc dạng cis, ngược lại với dạng trans, dạng repulsion) Covariance: hợp sai là trung bình của tổng các tích của độ lệch giữa hai biến số từ các giá trị trung bình của cá thể Crossing over: hiện tượng quấn chéo của nhiễm sắc thể Cường độ chọn lọc: biểu thị mức độ chọn lọc trong quần thể con lai đang phân ly Cytoplasmic inheritance: di truyền do tế bào chất, ảnh hưởng của mẹ. Trong tế bào chất, có những cơ quan mang vật chất di truyền như cytoplast, ty thể bộ, ribosome, . D2 – Mahalonobis: phép tính hiệu số bình phương khoảng cách của Mahalonobis Deficiency: sự thiếu đoạn hay mất đoạn của nhiễm sắc thể Degree of freedom: độ tự do viết tắt là df trong phân tích ANOVA, hay phân tích thông qua các phép thử khác trong thống kê sinh học Deviation: độ lệch, giá trị lệch so với trung bình mẫu Diallel cross: lai diallel tất cả các cặp theo tuần tự bố mẹ là nghiệm thức của chương trình lai Discriminant function: phương trình biệt thức giúp cho phân biệt giữa các tính trạng mục tiêu và phân biệt giữa các cá thể trong quần thể, hoặc giữa hai quần thể Disequilibrium: tính chất không cân đối của một quần thể Disruptive selection: chọn lọc đột phá Dominance: tính trội. biểu thị hoạt động alen dị hợp trong di truyền số lượng Dominance đẳng hướng: hoạt động alen dị hợp theo cùng một hướng [+ve] hoặc [-ve] Dominance hypothesis: lý thyuết về tính trội trong giải thích hiện tượng ưu thế lai Dominance of linked genes: tính trội của những gen liên kết với nhau Dominance x additive: hoạt động tương tác không alen giữa tính trội x tính cộng Dominance x dominance: hoạt động tương tác không alen giữa tính trội x tính trội Dominant epistasis: hiện tượng epistasis có tính trội Double cross: lai kép Duplicate epistasis: hiện tượng epistasis có tính chất lặp đoạn Donor parent: bố mẹ cho nguồn gen mục tiêu trong chương trình cải tiến giống Duplication: hiện tượng lặp đoạn, trong trường hợp hai gen, tỉ lệ phân ly ở F2 là 15:1 Đa hình: (polymorphism) biểu thị tính chất khác biệt alen của hai cá thể Đa tính trạng (pleiotropy): một gen điều khiển nhiều tính trạng Emasculation: động tác khử đực EMS: error mean of square, trung bình bình phương sai số trong ANOVA, tương đương với phương sai mẫu Epistasis: tính trội của một gen so với một gen khác không allelic với nhau. Gen bị át khuất được gọi là “hypostatic”. Thuật ngữ epistasis được dùng để mô tả tất cả hiện tượng tương tác không alen Epistasis kiểu [i]: tương tác không alen kiểu tính cộng x tính cộng Epistasis kiểu [j + l]: tương tác không alen kiểu [tính cộng x tính trội] + [ tính trội x tính trội] Equilibrium: hiện tượng cân bằng trong quần thể Environment: môi trường, điều kiện ngoại cảnh ảnh hưởng đến sự thế hiện của gen điều khiển tính trạng số lượng Error: sai số trong phân tích thống kê (pooled error: sai số góp) F1: thế hệ con lai đầu tiên F2: thế hệ con lai thứ hai do tự thụ, thế hệ có thông tin di truyền lớn nhất nhờ hiện tượng phân ly Family: họ là một nhóm cá thể quan hệ trực tiếp với một dòng tổ tiên (dòng gốc) Foundation seed: hạt giống nguyên chủng Fitness: giá trị thích nghi liên quan đến sự đóng góp di truyền của một kiểu gen đối với thế hệ kế tiếp, tương ứng với những kiểu gen khác trong cùng một quần thể Fitness profile: phổ giá trị thích nghi Full diallel: bộ con lai diallel đầy đủ (kể cả lai thuận nghịch) Gamete: giao tử là tế bào gốc, kết qủa của gián phân giảm nhiễm, có chức năng trong giao phối (bao gồm giao tử đực và giao tử cái) Gene: là đơn vị di truyền Gene frequency: tần suất gen là tỉ lệ mà trong đó những alen của một gen xuất hiện trong quần thể Gene interaction: tương tác gen là hiện tượng cải tiến của hoạt động gen bởi một gen khác không alen, hoặc bởi nhiều gen khác Germplasm: qũy gen Genome: bộ gen, bộ nhiễm sắc thể tương ứng với một bội thể của một loài Gene flow: dòng chảy của gen từ cây transgenic sang cây trồng hoang dại có quan hệ gần gủi Gene frequency: tần suất gen H 2 General combining ability: khả năng phối hợp chung Genetic advance: hiệu qủa chọn lọc đối với một tính trạng hay nhiều tính trạng Genetic constitution: nền tảng di truyền Genetic equilibrium: điều kiện trong đó những thế hệ kế tiếp nhau của một quần thể có cùng một kiểu gen, với cùng một tỉ lệ trên cơ sở những gen mục tiêu nào đó, hoặc những phối hợp của các gen này. Genetic gain: xem genetic advance Genotype: kiểu gen, là toàn bộ kiến trúc di truyền của một sinh vật Genotype x environment interaction: tương tác giữa kiểu gen và môi trường Genotypic Coefficient of Variation (GCV): hệ số biến thiên kiểu gen tính bằng phần trăm, là thương số giữa giá trị trung bình với căn bậc hai phương sai kiểu gen B: hệ số di truyền nghĩa rộng, biểu thị % do di truyền so với ảnh hưởng môi trường H2N: hệ số di truyền nghĩa hẹp, biểu thị hoạt động của gen cộng tính so với gen không cộng tính Haploid: thể đơn bội, tế bào hoặc sinh vật có số nhiễm sắc thể là 1n Heritability: hệ số di truyền là tần suất của biến thiên quan sát được do di truyền, cái còn lại do môi trường, nói đúng hơn biến thi6n do ảnh hưởng có tính chất cộng của gen Heterosis: ưu thế lai, giá trị con lai so với giá trị trung bình bố mẹ Heterobeltiosis: ưu thế lai tuyệt đối, giá trị con lai so với giá trị bố mẹ cao nhất Heterozygous: dị hợp tử, có những alen không giống nhau ở một hoặc nhiều loci Homeostasis: hiện tượng gen phát triển đồng dạng, thông qua đột biến, chức năng điều khiển bị chuyển đổi Homozygous: đồng hợp tử, có những alen giống nhau ở một hoặc nhiều loci trên nhiễm sắc thể tương đồng Hybrid: sản phẩm của một cặp lai giữa những bố mẹ khác nhau về di truyền Inbred line: dòng cận giao, đồng huyết Inbreeding: tạo dòng cận giao, dòng đồng hợp tử Interallelic interaction: tương tác giữa các alen Intermediate heterozygote: dị hợp tử trung gian Isogenic line: dòng đẳng gen Khả năng phối hợp chung: giá trị GCA của một tính trạng biểu thị khả năng của bố mẹ kết hợp trên cơ sở hoạt động gen cộng tính Khả năng phối hợp riêng: giá trị SCA của một tính trạng biểu thị khả năng của một cặp bố mẹ kết hợp nhau trên cơ sở hoạt động gen không cộng tính, điều kiện tạo ra hiện tượng ưu thế lai Khoảng cách di truyền: giá trị đo lường mức độ khác biệt giữa hai nhóm kiểu gen khác nhau Lai ba thử nghiệm: lai thử nghiệm trên cơ sở các quần thể cơ bản bao gồm bố mẹ, F1, BC1, BC2 cho lai với các dòng F2 Lethal: gen gây chết Linear: tuyến tính, tương quan tuyến tính, có dạng đường thẳng Linkage: liên kết gen là hiện tượng phối hợp của những tính trạng trong di truyền do sự định vị của gen trên cùng một nhiễm sắc thể Linkage map: bản đồ liên kết gen với marker trên cơ sở giá trị tái tổ hợp Linked digenic interaction: tương tác có tính chất liên kết hai gen Linked epistatic genes: những gen tương tác không alen, liên kết chặt chẽ với nhau Location: vị trí, địa điểm nơi sinh vật thể hiện tính trạng di truyền Locus: nơi gen định vị trên nhiễm sắc thể Lưỡng bội: tế bào hay sinh vật có số nhiễm sắc thể là 2n Ma trận: tập hợp các giá trị có tính chất đối xứng và cân đối (ma trận vuông), không cân đối, không đối xứng (ma trận chữ nhật) Ma trận của kiểu gen: tập hợp giá trị phương sai và hợp sai kiểu gen Ma trận của kiểu hình: tập hợp giá trị phương sai và hợp sai kiểu hình Ma trận đảo (inverse matrix): ma trận đã được giải theo hướng ma trận đơn vị đối nghịch Ma trận đơn vị : ma trận có số cột và hàng tương đương với ma trận đối xứng, chứa các thông số bằng 1 và 0 Mass selection: chọn quần thể, loại bỏ những cá thể không đúng dạng hình mục tiêu, giữ lại quần thể trên đồng ruộng Mean: giá trị trung bình Meiosis: gián phân giảm nhiễm Meitosis: gián phân giảm nhiễm Modifying gene: những gen ảnh hưởng đến sự thể hiện của một gen không alen với nó hoặc những gen không alen với nó Mutation: đột biến gen Multiple allele: đa alen, một gen có nhiều hơn hai alen Neutral character: tính trạng trung tính Nguồn biến dị: nguồn tạo ra những thay đổi do di truyền bên trong và ảnh hưởng của môi trường bên ngoài Non-allelic interaction: tương tác không alen Non-selective inbreeding: cận giao không có tính chất chọn lọc Nullisome: Cây 2n thiếu một căp nhiễm thể, ký hiệu là 2n-2 Overdominance: tính chất siêu trội, khi hoạt động gen không cộng tính có ưu thế hơn hoạt động gen cộng tính Overdominance hypothesis: giả thuyết siêu trội trong giải thích ưu thế lai Outcross: hiện tượng tạp giao trong tự nhiên Panmictic: có tính chất giao phối ngẫu nhiên Panmixia: quần thể giao phối ngẫu nhiên Partial dominance: tính trội từng phần, không hoàn toàn Path analysis: phân tích theo đường dẫn Pedigree: gia phả, phả hệ, phương pháp chọn giống theo gia phả Phenotypic Coefficient of Variation: (PCV)hệ số biến thiên kiểu hình tính bằng phần trăm, là thương số giữa giá trị trung bình với căn bậc hai phương sai kiểu hình Phân bố chuẩn: phân bố theo dạng hình chuông, phân bố normal Phân bố nhị thức: phân bố trên cơ sở xác suất của hai sự kiện có hoặc không, thí dụ như p và q trong kiểu gen A và a. Phân tích diallel: phân tích con lai và bố mẹ theo mô hình của Hayman, và Griffing Phân tích khả năng phối hợp: phân tích con lai và bố mẹ theo mô hình của Griffing Phân tích tính đa dạng về di truyền: phân tích nhóm di truyền có quan hệ huyết thống gần gủi, số nhóm di truyền có quan hệ với nhau trên cơ sở giá trị khoảng cách nhóm đa dạng Phenotype: kiểu hình, sự xuất hiện của một cá thể phản ánh tương tác giữa kiểu gen bên trong và môi trường Phương sai: giá trị biểu thị chênh lệch giữa tổng bình phương của từng cá thể so với giá trị tổng bình phương Phương trình biệt thức: phương trình giúp cho chúng ta phân biệt cá thể với cá thể, hoặc nhóm với nhóm trên cơ sở chỉ số phân biệt Pleiotropic: có tính chất đa tính trạng Pleiotropic effects: ảnh hưởng đa tính trạng (xem đa tính trạng) Pleiotropy: xem đa tính trạng Polygenes: đa gen Polymorphism: xem đa hình Pooled error: xem sai số góp Population genetics: di truyền quần thể, một ngành học di truyền sử dụng lý thuyết toán học để nghiên cứu và giải thích các hiện tượng di truyền trong quần thể sinh vật Probability: xác suất Pure line selection: chọn dòng thuần, chọn từng cá thể trong quần thể, trồng so sánh các dòng, chọn lọc dòng tối ưu. QTL: quantitative trait loci, những loci của tính trạng di truyền số lượng [...]... một cấu trúc được gọi là “bivalent” Statistics: ngành thống kế học phục vụ cho việc giải thích các hiện tượng trong sinh học, nhất là lĩnh vực di truyền số lượng, trên cơ sở lấy mẫu để ước đoán qui mô toàn di n của quần thể Hiện nay, người ta còn phát triển thành thuật ngữ “biometry” và “bio- informatics” trên cơ sở phát triển của ngành tin học hiện đại Tái tổ hợp: hiện tượng recombination làm gia tăng...Quantitative character: tính trạng số lượng là tính trạng do nhiều gen điều khiển, chịu ảnh hưởng yếu tố môi trường rất mạnh Quantitative genetics: di truyền số lượng, một ngành học di truyền có tính chất ứng dụng từ nguyên tắc lý thuyết của di truyền quần thể, nhằm nghiên cứu và xác định chiến lược lai tạo, chọn lọc giống cây trồng, vật nuôi, nó có thể được xem là tiền thân của ngành chọn giống... liệu lai thử nghiệm Tetraploid: thể tứ bộ Thông số di truyền: các giá trị di truyền số lượng sau khi được phân tích theo một mô hình lý thuyết nào đó Tiêu chuẩn chọn lọc: những tính trạng có liên quan đến sự kiện quan trọng mà nhà chọn giống phải cải tiến Tính át khuất: xem epistasis Tính bất dục đực: tính bất dục đực có thể do tế bào chất hoặc do di truyền trong nhân, giuýp nhà chọn giống thuận tiện... fitness: giá trị thích nghi tương đối Repulsion linkage: liên kết thúc đẩy trong trường hợp trans RGA: (rapid generation advance) kỹ thuật làm rút ngắn thời gian của một chu kỳ sống bằng cách lợi dụng phản ứng nhạy cảm của loài với độ dài ngày SAHN: phương pháp phân nhóm di truyền trên cây gia hệ Sai số chuẩn: gía trị SE là căn bậc hai của phương sai phản ánh độ lệch của giá trị ghi nhận đối với giá trị... lọc Selection intensity: cường độ chọn lọc Selection pressure: áp lực chọn lọc, xem sức ép chọn lọc Self-fertilization: tính chất tự thụ tinh là hiện tượng tiếp hợp giao tử đực và cái trong cùng một cá thể Self-incompatibility: khả năng không tự tiếp hợp do hiện tượng ngăn cản thụ tinh về sinh lý học của sinh vật Sibs: con lai của cùng một bố mẹ dẫn xuất từ giao tử khác nhau, trong đó half sibs là con... nhà chọn giống thuận tiện trong sản xuất dòng con lai F1 Tính cộng: xem additive, biểu thị hoạt động của các alen đồng hợp tử Tính đa tính trạng: xem pleiotropic effect Tính thích nghi: (1) adaptibility, biểu thị sự thích nghi rộng của một cá thể, hoặc thích nghi hẹp trong điều kiện nhất định, (2) fitness, biểu thị sự đóng góp di truyền của một kiểu gen đối với thế hệ kế tiếp, tương ứng với những kiểu... tương quan không tuyến tính (non-linear) chúng ta phải xem xét ở mô hình phân tích khác (hàm parabol, hàm số mũ, hàm log, ) Ưu thế lai: xem heterosis Ưu thế lai chuẩn: xem standard heterosis Ưu thế lai trung bình: chính là ưu thế lai (heterosis) Ưu thế lai tuyệt đối: xem heterobeltiosis Variance: phương sai là bình phương của độ lệch chuẩn của quần thể Variation: biến dị di truyền, sự xuất hiện khác nhau... sibs với nhau Siêu trội: xem overdominance Significance test: trắc nghiệm mức độ có ý nghĩa về mặt thống kê, ở hai mức độ phổ biến là 0,05 và 0,01 Similarity: giá trị tương đồng là cơ sở để phân nhóm di truyền các kiểu hình Single cross: lai đơn, lai giữa hai kiểu gen, thông thường là hai dòng cận giao trong chọn giống cây trồng Species: loài sinh vật, đơn vị được xếp hạng dưới genus và trên variety... thế lai tuyệt đối: xem heterobeltiosis Variance: phương sai là bình phương của độ lệch chuẩn của quần thể Variation: biến dị di truyền, sự xuất hiện khác nhau của cá thể do sự khác biệt về thành phần di truyền của nó, hay sự khác biệt do môi trường mà nó đang phát triển Variety: giống là bậc được xếp loại dưới species, đó là một nhóm cá thể thuộc loài, biểu thị sự khác biệt với giống khác, biểu thị... hình của epistasis Triploid: thể tam bội Trisomic: người ta có thể tạo ra những dòng triplo có dạng 2n+1, để đánh dấu từng nhiễm sắc thể so với bộ nhiễm sắc thể bình thường Nếu có một gen mục tiêu hiện di n trên cá thể là triplo số a, b, hoặc c nào đó, người ta sẽ biết được gen ấy định vị trên nhiễm thể a, b hoặc c Trội hoàn toàn: tương tác gen cộng tính và gen không cộng tính tương đương nhau Trội từng . Population genetics: di truyền quần thể, một ngành học di truyền sử dụng lý thuyết toán học để nghiên cứu và giải thích các hiện tượng di truyền trong quần. mạnh Quantitative genetics: di truyền số lượng, một ngành học di truyền có tính chất ứng dụng từ nguyên tắc lý thuyết của di truyền quần thể, nhằm nghiên