ặc tính dịch tể mô tả và không gian của đợt dịch tai xanh tại đồng nai từ 20092012

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC TÂY NGUYÊN BÙI VĂN MẠNH ĐẶC TÍNH DỊCH TỄ MÔ TẢ VÀ KHÔNG GIAN CỦA ĐỢT DỊCH TAI XANH TẠI ĐỒNG NAI TỪ 2009 - 2012 LUẬN VĂN THẠC SĨ NÔNG NGHIỆP ĐẮK LẮK, NĂM 2015 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC TÂY NGUYÊN BÙI VĂN MẠNH ĐẶC TÍNH DỊCH TỄ MÔ TẢ VÀ KHÔNG GIAN CỦA ĐỢT DỊCH TAI XANH TẠI ĐỒNG NAI TỪ 2009 - 2012 LUẬN VĂN THẠC SĨ NÔNG NGHIỆP Chuyên ngành: THÚ Y Mã số: 60640101 Người hướng dẫn khoa học: ĐẮK LẮK, NĂM 2015 TS Lê Thanh Hiền LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu riêng Các số liệu, kết nêu luận văn trung thực chưa công bố công trình khác Tác giả Bùi Văn Mạnh i LỜI CẢM ƠN Chân thành cảm tạ Ban Giám hiệu Trường Đại học Tây nguyên Ban chủ nhiệm khoa toàn thể quý thầy cô Khoa Thú y Trường Đại học Tây Nguyên tận tình truyền đạt kiến thức cho thời gian học tập trường Quý thầy cô cán đào tạo sau đại học Trường Đại học Tây Nguyên nhiệt tình giúp đỡ hướng dẫn thời gian học tập hoàn thành luận văn Chân thành ghi ơn TS Lê Thanh Hiền TS Cao Văn Hồng tận tình giúp đỡ suốt thời gian học tập, thực đề tài hoàn thành luận văn Trân trọng cảm ơn Ban Lãnh đạo Chi cục Thú y Đồng Nai tạo điều kiện thuận lợi công việc để học tập hoàn thành luận văn Chân thành cảm ơn Phòng Dịch tễ, Trạm Thú y, Phòng Nông nghiệp (Kinh tế) huyện, thị xã Long Khánh Thành phố Biên Hòa giúp đỡ thu thập số liệu Gửi lời cảm ơn đến Gia đình, bạn bè lớp cao học Thú y K7 - 2012 chia sẻ khó khăn, buồn vui trình học tập, thực đề tài sống ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT vi DANH MỤC CÁC BẢNG, BIỂU ĐỒ vii DANH MỤC BẢNG vii DANH MỤC BIỂU ĐỒ viii DANH MỤC HÌNH ix MỞ ĐẦU .1 Đặt vấn đề Mục tiêu nghiên cứu Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tổng quan tình hình kinh tế - xã hội tỉnh Đồng Nai .3 1.1.1 Điều kiện tự nhiên 1.1.2 Tình hình Kinh tế - Xã hội 1.2 Tình hình chăn nuôi tỉnh Đồng Nai .5 1.3 Tổng quan bệnh tai xanh (PRRS) 1.3.1 Khái quát bệnh heo tai xanh .6 1.3.2 Căn bệnh học 1.3.3 Đặc điểm truyền lây 1.3.4 Dấu hiệu lâm sàng 1.3.5 Bệnh tích 10 1.3.6 Chẩn đoán 11 1.3.7 Vắc-xin phòng PRRS 16 iii 1.4 Diễn biến dịch heo tai xanh Việt Nam 18 1.5 Diễn biến dịch heo tai xanh Đồng Nai 21 1.6 Tình hình nghiên cứu dịch tễ học mô tả không gian 21 1.7 Giới thiệu phần mềm Quantum GIS .23 1.7.1 Giới thiệu phần mềm R 24 1.7.2 Giới thiệu phần mềm SaTScan .25 Chương ĐỐI TƯỢNG, NỘI DUNG, PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 26 2.1 Đối tượng, thời gian, địa điểm nghiên cứu 26 2.1.1 Đối tượng nghiên cứu 26 2.1.2 Thời gian nghiên cứu 26 2.1.3 Địa điểm nghiên cứu .26 2.1.4 Nguyên liệu 26 2.2 Nội dung nghiên cứu 26 2.3 Phương pháp nghiên cứu 27 2.3.1 Thống kê, thu thập thông tin tình hình chăn nuôi, dịch heo tai xanh Đồng Nai từ năm 2009 đến năm 2012 27 2.3.2 Nghiên cứu đặc tính dịch tễ học mô tả dịch huyện có dịch heo tai xanh từ năm 2009 đến năm 2012 địa bàn tỉnh Đồng Nai 27 2.3.3 dịch Thiết lập đồ nguy cơ, nghiên cứu đặc tính không gian .29 2.4 Phương pháp xử lý số liệu 31 Chương KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 32 3.1 Tình hình chăn nuôi địa bàn tỉnh Đồng Nai .32 3.2 Tình hình dịch heo tai xanh tỉnh Đồng Nai từ năm 2009 – 2012 .35 3.3 Các đặc tính dịch tễ học mô tả dịch tai xanh huyện có dịch heo tai xanh từ năm 2009 đến năm 2012 địa bàn tỉnh Đồng Nai 39 3.3.1 Phân bố thời gian ổ dịch heo tai xanh 39 3.3.2 Tính tỷ lệ bệnh, tỷ lệ chết, tỷ lệ hộ có dịch đàn có dịch 40 iv 3.3.3 Khoảng thời gian dịch .52 3.3.4 Các đặc tính không gian dịch 54 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 64 4.1 Kết luận 64 4.2 Đề nghị .65 TÀI LIỆU THAM KHẢO 66 PHỤ LỤC 69 v DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT FA Fluorescent antibody Phương pháp kháng thể huỳnh quang GIS Geographic Information Hệ thống thông tin địa lý System GDP Gross Domestic product Tổng sản phẩm quốc nội IHC Immunohistochemistry Phương pháp hóa mô miễn dịch PRRS Porcine Reproduct Hội chứng rối loạn sinh sản, Respiratory Syndrome hô hấp heo RNA Ribonucleic Acid Axít Ribonucleic GPS Global Positioning System Hệ thống định vị toàn cầu vi DANH MỤC CÁC BẢNG, BIỂU ĐỒ DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1: Protein cấu trúc Vi-rút PRRS Bảng 3.1: Đàn heo tỉnh Đồng Nai năm 2009 - 2012 theo huyện .32 Bảng 3.2: Tình hình dịch heo tai xanh tỉnh Đồng Nai từ 2009 đến 2012 .37 Bảng 3.3: Tỉ lệ mắc bệnh heo tai xanh đàn có bệnh 41 Bảng 3.4: Tỉ lệ mắc bệnh theo lứa tuổi heo đàn có bệnh 44 Bảng 3.5: Tỉ lệ chết bệnh heo tai xanh đàn có bệnh 47 Bảng 3.6: Tỷ lệ hộ có dịch theo qui mô đàn năm 2012 (n=493) 50 Bảng 3.7: Khoảng thời gian có dịch tai xanh tai Đồng Nai 52 vii DANH MỤC BIỂU ĐỒ Biểu đồ 3.1: Phân bố thời gian ổ dịch heo tai xanh Đồng Nai 39 Biểu đồ 3.2: Tỷ lệ mắc bệnh tai xanh đàn có bệnh năm 2010 theo huyện.42 Biểu đồ 3.3: Tỷ lệ mắc bệnh tai xanh đàn có bệnh năm 2012 theo huyện.43 Biểu đồ 3.4: So sánh tỷ lệ mắc bệnh tai xanh theo lứa tuổi heo tỉnh Đồng Nai năm 2010 2012 45 Biểu đồ 3.5: Tỷ lệ chết bệnh heo tai xanh đàn có bệnh năm 2010 48 Biểu đồ 3.6 Tỉ lệ chết bệnh heo tai xanh đàn có bệnh năm 2012 49 Biểu đồ 3.7: Tỉ lệ hộ có dịch theo qui mô nuôi năm 2012 Đồng Nai 51 viii 1062 1095 1099 1109 1126 1165 1176 1188 1189 1193 1197 1198 1199 1200 1221 1223 1272 1301 1313 1353 1367 1386 1394 1398 1418 1424 1426 1465 1474 1480 1483 1497 1498 1532 1547 1548 1595 1623 1662 1671 1678 1679 1680 1681 1697 1744 1745 1780 1824 1907 1923 1926 1955 1968 1985 1990 2004 2015 2018 2019 2025 2057 2066 2109 2113 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 48,000 46,000 49,000 59,000 41,000 55,000 55,000 53,000 48,000 52,000 30,000 51,000 48,000 49,000 53,000 51,000 51,000 41,000 45,000 52,000 47,000 51,000 49,000 56,000 50,000 52,000 20,000 60,000 -19,000 51,000 -20,000 -15,000 -13,000 33,000 52,000 21,000 54,000 49,000 102,000 16,000 31,000 31,000 31,000 31,000 56,000 55,000 55,000 6,000 48,000 22,000 55,000 14,000 3,000 11,000 20,000 15,000 12,000 42,000 21,000 21,000 59,000 56,000 23,000 2,000 6,000 19,976 18,191 18,434 18,434 33,524 20,057 23,464 21,111 19,570 20,543 35,065 18,434 18,029 20,543 20,219 18,191 19,813 54,698 33,118 39,040 18,110 21,842 19,408 21,111 20,462 20,138 62,242 19,976 17,217 17,380 17,461 17,623 17,947 37,012 24,113 39,689 17,136 20,462 17,380 32,956 40,663 39,121 35,390 34,173 20,300 18,434 23,221 33,605 19,651 20,462 9,024 24,032 36,850 28,575 23,058 25,005 25,330 11,863 20,787 33,280 11,863 19,327 21,030 19,651 20,057 0,320 0,353 0,347 0,347 0,943 0,320 0,379 0,322 0,324 0,319 1,042 0,347 0,358 0,319 0,319 0,353 0,321 2,348 0,917 1,302 0,356 0,332 0,326 0,322 0,318 0,319 2,856 0,320 0,387 0,381 0,378 0,372 0,361 1,169 0,404 1,345 0,390 0,318 0,381 0,907 1,409 1,307 1,063 0,985 0,319 0,347 0,370 0,949 0,323 0,931 0,730 1,103 1,857 1,354 1,054 1,155 1,172 0,709 0,945 1,635 0,709 0,883 0,956 0,896 0,913 28,024 27,809 30,566 40,566 7,476 34,943 31,536 31,889 28,430 31,457 -5,065 32,566 29,971 28,457 32,781 32,809 31,187 -13,698 11,882 12,960 28,890 29,158 29,592 34,889 29,538 31,862 -42,242 40,024 -36,217 33,620 -37,461 -32,623 -30,947 -4,012 27,887 -18,689 36,864 28,538 84,620 -16,956 -9,663 -8,121 -4,390 -3,173 35,700 36,566 31,779 -27,605 28,349 1,538 45,976 -10,032 -33,850 -17,575 -3,058 -10,005 -13,330 30,137 0,213 -12,280 47,137 36,673 1,970 -17,651 -14,057 76 2,02R 2,00R 2,20R 2,92R 0,54 X 2,52R 2,27R 2,30R 2,05R 2,26R -0,37 X 2,34R 2,16R 2,05R 2,36R 2,36R 2,24R -1,00 X 0,86 X 0,94 X 2,08R 2,10R 2,13R 2,51R 2,13R 2,29R -3,11RX 2,88R -2,61R 2,42R -2,70R -2,35R -2,23R -0,29 X 2,01R -1,35 X 2,65R 2,05R 6,09R -1,22 X -0,70 X -0,59 X -0,32 X -0,23 X 2,57R 2,63R 2,29R -1,99 X 2,04R 0,11 X 3,31R -0,72 X -2,46RX -1,27 X -0,22 X -0,72 X -0,96 X 2,17R 0,02 X -0,89 X 3,40R 2,64RX 0,14 X -1,27 X -1,01 X 2134 2160 2174 2201 2221 1,00 1,00 1,00 1,00 1,00 42,000 7,000 7,000 128,000 6,000 13,891 27,520 31,577 10,078 22,247 0,726 1,294 1,532 0,716 1,014 28,109 -20,520 -24,577 117,922 -16,247 2,03R -1,48 X -1,78 X 8,50R -1,17 X R denotes an observation with a large standardized residual X denotes an observation whose X value gives it large leverage Số liệu xử lý thống kê mintab so sánh tỷ lệ bệnh heo theo lứa tuổi Chi-Square Test: Tỷ lệ bệnh đàn heo theo lứa tuổi năm 2010 Expected counts are printed below observed counts Chi-Square contributions are printed below expected counts benh 114 124,54 0,892 kobenh 49 38,46 2,889 Total 163 12597 14863,05 345,486 6856 4589,95 1118,742 19453 92339 90006,52 60,445 25463 27795,48 195,732 117802 17722 17777,90 0,176 5546 5490,10 0,569 23268 Total 122772 37914 160686 Chi-Sq = 1724,931 DF = P-Value = 0,000 Chi-Square Test: Tỷ lệ bệnh đàn heo theo lứa tuổi năm 2012 Expected counts are printed below observed counts Chi-Square contributions are printed below expected counts benh 2,43 0,135 kobenh 4,57 0,072 Total 610 663,56 4,324 1303 1249,44 2,296 1913 5192 4997,71 7,553 9216 9410,29 4,011 14408 1438 1579,30 12,642 3115 2973,70 6,714 4553 Total 7243 13638 20881 Chi-Sq = 37,747 DF = P-Value = 0,000 cells with expected counts less than 77 Các code sử dụng R để vẽ đồ nguy liên tục library(foreign) library(splancs) library(maptools) library(spdep) setwd("C://Manh_dn/R/manhdongnai") # loading data dongnai.dat