Đánh giá các xét nghiệm

Trường Đại Học Nông Lâm ĐÁNH GIÁ CÁC XÉT NGHIỆM TS Lê Thanh Hiền Khoa Chăn Nuôi Thú Y Bệnh hay không bệnh Có hay trang thái sức khỏe khảo sát ? Xét nghiệm -XN sàng lọc (screening test) -XN chẩn đoán (diagnostic test) MỘT SỐ THUẬT NGỮ   Độ xác (accuracy), mức giá trị (validity) Độ tin cậy (precision) Độ xác xét nghiệm  Độ xác (accuracy) xét nghiệm tỷ lệ tất kết xét nghiệm (cả dương tính lẫn âm tính) so với tổng số xét nghiệm  Độ xác gọi mức giá trị (validity)  Độ xác thường dùng để diễn đạt khả chung xét nghiệm Độ tin cậy  Độ tin cậy khả lập lại (repeatability) cho thấy giống kết đo lường sau nhiều lần lập lại  Đôi độ tin cậy gọi tính (precision) Độ nhạy độ chuyên biệt xét nghiệm  Độ nhạy (Sensitivity) định nghĩa xác suất thú thật có bệnh phát chẩn đoán  Độ chuyên biệt (Specificity) định nghĩa xác suất để thú không bệnh phát phương pháp chẩn đoán Công thức độ nhạy độ chuyên biệt xét nghiệm  Để xác định Se, Sp người ta so sánh kết chẩn đoán phương pháp cần xác định với phương pháp chuẩn (được gọi chuẩn vàng, gold standard)  Phương pháp chuẩn phương pháp xem độ xác cao (tuy nhiên hoàn toàn tuyệt đối)  Do việc sử dụng phương pháp chuẩn tốn thời gian tiền bạc nên người ta thực phương pháp có độ xác thấp xác định độ chuyên biệt độ nhạy phương pháp Se = a/(a+c) Sp = d/(b+d) SESe =[Se(1-Se)/(a+c)]1/2 SESp =[Sp(1-Sp)/(b+d)]1/2 Mối liên quan Se, Sp tỷ lệ nhiễm    Trên thực tế vào kết xét nghiệm để xác định tỷ lệ nhiễm Điều chấp nhận phương pháp chẩn đoán công nhận Việc tính tỷ lệ nhiễm thông qua kết dạng tỷ lệ nhiễm mà người ta gọi tỷ lệ nhiễm biểu kiến (AP: apparent prevalence) Se = a/(a+c) Sp = d/(b+d) P = (a+c)/N AP = (a+b)/N  Từ tính AP = Se × P+(1-Sp)×(1-P)  Trở lại nghiên cứu phương pháp xác định Trichinella spiralis phương pháp tiêu Se = 29/32 = 90,625% TP= 32/200 PV (+) = 29/55 = 52,72% Sp= 142/168 = 84,524% AP = 55/200 = 27,5% PV (- )= 142/145 = 97,93% Xét nghiệm kết hợp  Kết hợp song song (parallel testing) kiểu kết hợp mà xét nghiệm thực mẫu  Kết luận cuối phối hợp kết hai xét nghiệm Bất hay xét nghiệm cho kết dương tính xem mẫu kết luận dương tính  Như thú cho âm tính xét nghiệm cho âm tính Điều làm cho xét nghiệm kết hợp song song gia tăng độ nhậy cách đáng kể  Công thức tính độ nhạy độ chuyên biệt xét nghiệm song song sau Separ = – (1-Se1)×(1-Se2) Sppar = Sp1×Sp2     Kết hợp (serial testing) xét nghiệm thực trước sau Xét nghiệm có độ nhạy cao thực trước Những mẫu cho kết dương tính tiến hành xét nghiệm (thường có độ chuyên biệt cao) Mục đích chung cho kiểu phối hợp làm tăng độ chuyên biệt cho xét nghiệm chung Công thức tính độ chuyên biệt độ nhạy xét nghiệm kết hợp sau SeSer = Se1×Se2 SpSer = – (1-Sp1)×(1-Sp2) Ví dụ     Trong đàn bò sữa 200 con, tỷ lệ bệnh viêm vú khoảng 5% Dùng xét nghiệm CMT có độ nhạy 86% độ chuyên biệt 65% để chẩn đoán Có thể dùng phương pháp phân lập vi sinh vật gây viêm nhiễm sữa để chẩn đoán Phương pháp phân lập có độ nhạy 70% độ chuyên biệt 89% Sự kết hợp xét nghiệm với làm thay đổi độ nhạy độ chuyên biệt nào? Mức độ phù hợp hai xét nghiệm   Mức độ thống gọi trị số thống kê kappa (K) Trị số K biến động từ     -1 (không thống nhất) qua zero (thống ngẫu nhiên mà thôi) đến +1 (thống hoàn toàn) Thông thường K      từ đến 0,2 nhẹ, 0,2 đến 0,4 = được, 0,4 đến 0,6 = vừa, 0,6 đến 0,8 = nhiều, 0,8 đến = hoàn toàn thống Ví dụ  Trong bệnh xá thú y, người ta ghi nhận 120 ca bệnh nghi ngờ viêm phổi mèo chẩn đoán phương pháp nghe trực tiếp lâm sàng Kết ghi nhận từ bác sĩ thú y sau: bác sĩ thú y cho 31 bị viêm phổi (chỉ có 10 bác sĩ thú y đồng ý) 89 không bị viêm phổi (trong bác sĩ thú y cho có viêm phổi) Xác định mức độ tương đồng nhận định từ bác sĩ thú y Bài tập  Trong tỉnh có 400 hộ nuôi gà đẻ qui mô công nghiệp Cơ quan quản lý có danh sách cụ thể 400 hộ Để đánh giá tình hình bệnh Marek, người ta chọn ngẫu nhiên 50 hộ Cách chọn sau: Từ danh sách 400 hộ sau xếp theo thứ tự abc, chọn hộ số sau chọn hộ thứ (cách hộ danh sách), hộ thứ 393 để tổng cộng 50 hộ/hộ mong muốn Bài tập a/ Hãy cho biết phương pháp lấy mẫu kiểu b/ Giả sử dùng phương pháp để đánh giá bệnh này: Phương pháp kiểm tra lâm sàng (đánh giá mổ khám), phương pháp PCR Trong PCR xem phương pháp chuẩn Trong 50 hộ lấy mẫu kiểm tra phương pháp PCR có 15 hộ xác định có bệnh 35 hộ xác định không bệnh Tính tỉ lệ hộ bệnh trung bình 95% độ tin cậy tỉ lệ trung bình Bài tập c/ Giả sử độ nhạy độ chuyên biệt phương pháp kiểm tra lâm sàng lần lược 80% 85% Dùng kiện bên để thiết lập bảng 2x2 kết xét nghiệm từ phương pháp từ tính tỉ lệ tiên đoán dương tỉ lệ tiên đoán âm cho phương pháp kiểm tra lâm sàng Diễn giải ý nghĩa giá trị theo thực tế ...  Giá trị tiên đoán cải thiện cách chọn xét nghiệm có độ nhạy độ chuyên biệt cao   Xét nghiệm nhạy cải thiện giá trị tiên đoán âm (ít kết âm tính giả) Xét nghiệm chuyên biệt giúp cải thiện giá. .. (accuracy) xét nghiệm tỷ lệ tất kết xét nghiệm (cả dương tính lẫn âm tính) so với tổng số xét nghiệm  Độ xác gọi mức giá trị (validity)  Độ xác thường dùng để diễn đạt khả chung xét nghiệm Độ... )= 142/145 = 97,93% Xét nghiệm kết hợp  Kết hợp song song (parallel testing) kiểu kết hợp mà xét nghiệm thực mẫu  Kết luận cuối phối hợp kết hai xét nghiệm Bất hay xét nghiệm cho kết dương