Tổng hợp một số dẫn chất n hydroxybenzamid mang khung 2 oxoindolin hướng kháng tế bào ung thư

MỤC LỤC DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT DANH MỤC CÁC HÌNH DANH MỤC CÁC SƠ ĐỒ DANH MỤC CÁC BẢNG ĐẶT VẤN ĐỀ PHẦN TỔNG QUAN 1.1 ACID HYDROXAMIC VÀ HOẠT TÍNH KHÁNG TẾ BÀO UNG THƢ CỦA CÁC DẪN CHẤT 1.1.1 Histon deacetylase (HDAC) 1.1.2 Một số đích tác dụng khác acid hydroxamic 1.2 CÁC ACID HYDROXAMIC ỨC CHẾ HDAC 11 1.2.1 Cơ chế tác dụng 11 1.2.2 Liên quan cấu trúc – tác dụng acid hydroxamic ức chế HDAC 12 1.3 TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU CÁC ACID HYDROXAMIC 15 1.3.1 Tình hình nghiên cứu acid hydroxamic giới 16 1.3.2 Tình hình nghiên cứu nƣớc acid hydroxamic 18 PHẦN NỘI DUNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 21 2.1 HÓA CHẤT, NGUYÊN VẬT LIỆU 21 2.2 NỘI DUNG NGHIÊN CỨU 22 2.3 PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 2.3.1 Nghiên cứu docking 22 2.3.2 Tổng hợp dẫn chất: 22 2.3.3 Kiểm tra độ tinh khiết chất tổng hợp đƣợc 22 2.3.4 Xác định cấu trúc: 23 2.3.5 Thử hoạt tính sinh học 23 2.3.6 Đánh giá mối liên quan cấu trúc hóa học, số lý hóa với hoạt tính sinh học chất tổng hợp đƣợc 25 PHẦN KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 26 3.1 NGHIÊN CỨU DOCKING 26 3.2 TỔNG HỢP HÓA HỌC 27 3.2.1 Tổng hợp dẫn chất N-hydroxy-4-((3-(hydroxyimino)-2-oxoindolin-1yl)methyl)benzamid (IIIa) 27 3.2.2 Tổng hợp dẫn chất 4-((5-flouro-3-(hydroxyimino)-2-oxoindolin-1yl)methyl)-N-hydroxybenzamid (IIIb) 30 3.2.3 Tổng hợp dẫn chất 4-((5-cloro-3-(hydroxyimino)-2-oxoindolin-1yl)methyl)-N-hydroxybenzamid (IIIc) 31 3.2.4 Tổng hợp dẫn chất 4-((5-bromo-3-(hydroxyimino)-2-oxoindolin-1yl)methyl)-N-hydroxybenzamid (IIId) 32 3.2.5 Tổng hợp dẫn chất 4-((5-nitro-3-(hydroxyimino)-2-oxoindolin-1yl)methyl)-N-hydroxybenzamid (IIIe) 33 3.2.6 Tổng hợp dẫn chất 4-((5-methyl-3-(hydroxyimino)-2-oxoindolin-1yl)methyl)-N-hydroxybenzamid (IIIf) 34 3.2.7 Tổng hợp dẫn chất 4-((5-methoxy-3-(hydroxyimino)-2-oxoindolin-1yl)methyl)-N-hydroxybenzamid (IIIg) 35 3.2.8 Tổng hợp dẫn chất 4-((7-cloro-3-(hydroxyimino)-2-oxoindolin-1yl)methyl)-N-hydroxybenzamid (IIIh) 36 3.3 KIỂM TRA ĐỘ TINH KHIẾT 37 3.4 KHẲNG ĐỊNH CẤU TRÚC 38 3.4.1 Kết phân tích phổ hồng ngoại IR 38 3.4.2 Kết phân tích phổ khối lƣợng MS 40 3.4.3 Kết phân tích phổ cộng hƣởng từ hạt nhân 1H-NMR 40 3.4.4 Kết phân tích phổ cộng hƣởng từ hạt nhân 13C-NMR 42 3.5 HOẠT TÍNH SINH HỌC 44 3.6 SƠ BỘ ĐÁNH GIÁ MỨC ĐỘ GIỐNG THUÔC 45 PHẦN BÀN LUẬN 47 4.1 TỔNG HỢP HÓA HỌC 47 4.2 KHẲNG ĐỊNH CẤU TRÚC 48 4.2.1 Phổ hồng ngoại 48 4.2.2 Phổ khối lƣợng MS 49 4.2.3 Phổ cộng hƣởng từ hạt nhân 50 4.3 THỬ HOẠT TÍNH SINH HỌC 51 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 57 TÀI LIỆU THAM KHẢO 59 PHỤ LỤC 65 DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT H-NMR : Phổ cộng hƣởng từ hạt nhân proton (Proton Nuclear Magnetic Resonance) 13 C-NMR : Cộng hƣởng từ hạt nhân 13C (Carbon Nuclear Magnetic Resonance) A431 : Tế bào ung thƣ biểu mô A549 : Tế bào ung thƣ phổi ngƣời CTCL : U tế bào lympho T da(Cutaneous T cell lymphoma) DCM : Dicloromethan DMF : Dimethyl formamid EGFR : Thụ thể yếu tố tăng trƣởng biểu mô (Epidermal Growth Factor Receptor) FDA : Cục quản lý thực phẩm dƣợc phẩm Hoa Kỳ (Food and Drug Administration) HAT : Histon acetyltranferase HDAC : Histon deacetylase HepG2 : Tế bào ung thƣ gan HL-60 : Tế bào ung thƣ bạch cầu IC50 : Nồng độ ức chế 50% (Inhibitory Concentration) IR : Phổ hồng ngoại (Infrared Spectroscopy) MCF-7 : Tế bào ung thƣ vú MeOH : Methanol MMP : Protein chứa kim loại (Metalloproteinase) MS : Phổ khối lƣợng (Mass Spectrometry) SRG : Nhóm nhận diện bề mặt ( Surface RecognitionGroup) T0nc : Nhiệt độ nóng chảy TACE : Enzym chuyển yếu tố hoại tử khối u (Tumor Necrosis Factor-α Converting Enzyme) TCA : Acid tricloroacetic TCL : Sắc kí lớp mỏng (Thin Layer Chromatography) TNF-α : Yếu tố hoại tử khối u (Tumor Necrosis Factor alpha) TSA : Trichostatin A ZBG : Nhóm kết thúc gắn với Zn2+ (Zinger binding group) DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1.1 CTCT chung acid hydroxamic Hình 1.2.Mô hình cấu trúc hoạt động thụ thể yếu tố tăng trƣởng biểu bì Hình 1.3 Các dẫn chất acid hydroxamic mang khung quinazolin Hình 1.4 Các dẫn chất acid hydroxamic khung N-aryl salicylamid Hình 1.5 Một số acid hydroxamic ức chế MMP Hình 1.6 Các dẫn chất α,β-cyclic- β-benzamido hydroxamic 10 Hình 1.7 Dẫn chất β,β-cyclic-β-benzamido hydroxamic 11 Hình 1.8 Vai trò điều khiển chu trình tế bào chất ức chế HDAC 12 Hình 1.9 Cấu trúc acid hydroxamic ức chế HDAC 13 Hình 1.10 Mô hình ZBG theo nghiên cứu Vanommeslaeghe K 15 Hình 1.11 Các dẫn chất N-hydroxyfurylacrylamid 16 Hình 1.12 Dẫn chất N1-((5-bromo-2-thiopheneyl)methyl)-N7-hydroxy-N1-(4methoxyphenyl) heptanediamid 16 Hình 1.13 Cấu trúc chất tƣơng tự SAHA có nhóm C7 17 Hình 1.14 Cấu trúc HPOB nghiên cứu Lee J.H cộng 17 Hình 1.15 Các dẫn chất acid hydroxamic mang khung isatin-3-oxim 18 Hình 1.16 Cấu trúc số dẫn chất hydroxamic với cầu nối propenamid19 Hình 4.1 Phổ khối lƣợng chất IIIc 49 Hình 4.2 Biểu đồ so sánh giá trị IC50 dãy chất IIIa-h với SAHA dòng tế bào SW620 PC-3 52 Hình 4.3 Biểu đồ so sánh giá trị IC50 dãy chất với SAHA dòng tế bào AsPc-1 NCI-H23……………………………………………………52 DANH MỤC CÁC SƠ ĐỒ Sơ đồ 1.1 Tổng hợp số amid ngƣợc SAHA 19 Sơ đồ 1.2 Tổng hợp acid biaryl hydroxamic 20 Sơ đồ 3.3 Quy trình tổng hợp chung 27 Sơ đồ 3.4 Quy trình tổng hợp chất IIa 27 Sơ đồ 5.3 Quy trình tổng hợp chất IIIa 28 Sơ đồ 3.6 Quy trình tổng hợp chất IIIb 30 Sơ đồ 3.7 Quy trình tổng hợp chất IIIc 31 Sơ đồ 3.8 Quy trình tổng hợp chất IIId 32 Sơ đồ 3.9 Quy tình tổng hợp chất IIIe 33 Sơ đồ 3.10 Quy trình tổng hợp chất IIIf 34 Sơ đồ 3.11 Quy trình tổng hợp chất IIIg 35 Sơ đồ 3.12 Quy trình tổng hợp chất IIIh 36 Sơ đồ 4.1 Cơ chế phản ứng tổng hợp dẫn chất IIa-h 47 Sơ đồ 4.2 Cơ chế phản ứng tổng hợp acid hydroxamic 47 Sơ đồ 4.3 Cơ chế phản ứng tạooxim 48 DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 3.1 Kết docking dẫn chất với HDAC2 26 Bảng 3.2 Chỉ số lý hóa hiệu suất tổng hợp acid hydroxamic 37 Bảng 3.3 Giá trị Rf nhiệt độ nóng chảy (tonc) chất IIIa-h 38 Bảng 3.4 Kết phân tích phổ IR dẫn chất IIIa-h 39 Bảng 3.5 Kết phân tích phố MS dẫn chất IIIa-h 40 Bảng 3.6.Kết phổ 1H-NMR dẫn chất IIIa-h 41 Bảng 3.7.Kết phổ 13C-NMR dẫn chất IIIa-h 43 Bảng 3.8 Kết thử hoạt tính kháng tế bào ung thƣ 45 Bảng 3.9.Đánh giá mevaluation of Naryl salicylamides with a hydroxamic acid moiety at 5-position as novel HDAC-EGFR dual inhibitors”, Bioorg Med Chem., 20, p 4405–4412 PHỤ LỤC Phụ lục 1.1- 1.8: Phổ hồng ngoại IR củacác chất IIIa-h Phụ lục 2.1-2.8: Phổ khốilƣợng MS chấtIIIa-h Phụ lục 3.1-3.8: Phổ 1H-NMR chấtIIIa-h Phụ lục 4.1-4.8: Phổ 13C-NMR chấtIIIa-h Phụ lục 5.1: Kết thử hoạt tính sinh học [...]... hồng ngoại IR của IIIa Phụ lục 1 .2: Phổ hồng ngoại IR của IIIb Phụ lục 1.3: Phổ hồng ngoại IR của IIIc Phụ lục 1.4: Phổ hồng ngoại IR của IIId Phụ lục 1.5: Phổ hồng ngoại IR của IIIe Phụ lục 1.6: Phổ hồng ngoại IR của IIIf Phụ lục 1.7: Phổ hồng ngoại IR của IIIg Phụ lục 1.8: Phổ hồng ngoại IR của IIIh Phụ lục 2. 1: Phổ MS của IIIa Phụ lục 2. 2: Phổ MS của IIIb Phụ lục 2. 3: Phổ MS của IIIc Phụ lục 2. 4:... lục 2. 5: Phổ MS của IIIe Phụ lục 2. 6: Phổ MS của IIIf Phụ lục 2. 7: Phổ MS của IIIg Phụ lục 2. 8: Phổ MS của IIIh Phụ lục 3.1: Phổ 1H-NMR của IIIa Phụ lục 3.1: Phổ 1H-NMR mở rộng của IIIa Phụ lục 3 .2: Phổ 1H-NMR của IIIb Phụ lục 3 .2: Phổ 1H-NMR mở rộng của IIIb Phụ lục 3.3: Phổ 1H-NMR của IIIc Phụ lục 3.3: Phổ 1H-NMR mở rộng của IIIc Phụ lục 3.4: Phổ 1H-NMR của IIId Phụ lục 3.4: Phổ 1H-NMR mở rộng của... 1H-NMR của IIIe Phụ lục 3.5: Phổ 1H-NMR mở rộng của IIIe Phụ lục 3.6: Phổ 1H-NMR của IIIf Phụ lục 3.6: Phổ 1H-NMR mở rộng của IIIf Phụ lục 3.7: Phổ 1H-NMR của IIIg Phụ lục 3.7: Phổ 1H-NMR mở rộng của IIIg Phụ lục 3.8: Phổ 1H-NMR của IIIh Phụ lục 3.8: Phổ 1H-NMR mở rộng của IIIh Phụ lục 4.1: Phổ 13C-NMR của IIIa Phụ lục 4.1: Phổ 13C-NMR mở rộng của IIIa Phụ lục 4 .2: Phổ 13C-NMR của IIIb Phụ lục 4 .2: ... Phổ 13C-NMR mở rộng của IIIb Phụ lục 4.3: Phổ 13C-NMR của IIIc Phụ lục 4.3: Phổ 13C-NMR mở rộng của IIIc Phụ lục 4.4: Phổ 13C-NMR của IIId Phụ lục 4.4: Phổ 13C-NMR mở rộng của IIId Phụ lục 4.5: Phổ 13C-NMR của IIIe Phụ lục 4.5: Phổ 13C-NMR mở rộng của IIIe Phụ lục 4.6: Phổ 13C-NMR của IIIf Phụ lục 4.6: Phổ 13C-NMR mở rộng của IIIf Phụ lục 4.7: Phổ 13C-NMR của IIIg Phụ lục 4.7: Phổ 13C-NMR mở rộng của... 13C-NMR của IIIf Phụ lục 4.6: Phổ 13C-NMR mở rộng của IIIf Phụ lục 4.7: Phổ 13C-NMR của IIIg Phụ lục 4.7: Phổ 13C-NMR mở rộng của IIIg Phụ lục 4.8: Phổ 13C-NMR của IIIh Phụ lục 4.8: Phổ 13C-NMR mở rộng của IIIh Phụ lục 5.1 Kết quả thử hoạt tính sinh học Ghi chú: 53A (IIIa); 53B (IIIb); 53C (IIIc); 53D (IIId); 53E (IIIe) 53F (IIIf); 53G (IIIg); 53H (IIIh) ... 27 3 .2. 1 Tổng hợp d n chất N- hydroxy-4-((3-(hydroxyimino) -2- oxoindolin- 1yl)methyl)benzamid (IIIa) 27 3 .2. 2 Tổng hợp d n chất 4-((5-flouro-3-(hydroxyimino) -2- oxoindolin- 1yl)methyl) -N- hydroxybenzamid. .. 4-((5-bromo-3-(hydroxyimino) -2- oxoindolin- 1yl)methyl) -N- hydroxybenzamid (IIId) 32 3 .2. 5 Tổng hợp d n chất 4-((5-nitro-3-(hydroxyimino) -2- oxoindolin- 1yl)methyl) -N- hydroxybenzamid (IIIe) 33 3 .2. 6 Tổng hợp. .. d n chất 4-((5-methyl-3-(hydroxyimino) -2- oxoindolin- 1yl)methyl) -N- hydroxybenzamid (IIIf) 34 3 .2. 7 Tổng hợp d n chất 4-((5-methoxy-3-(hydroxyimino) -2- oxoindolin- 1yl)methyl) -N- hydroxybenzamid