Giám sát sự lưu hành virus cúm gia cầm tại các chợ buôn bán gia cầm sống trên địa bàn thành phố hải phòng

Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung -Lớp KSCN K13 LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành chuyên đề này, nhận giúp đỡ quý báu nhiều cá nhân tập thể Tôi xin gửi lời cảm ơn sâu sắc chân thành tới thầy hướng dẫn TS Lê Anh Tuấn dẫn dắt, giúp đỡ em suốt trình thực tập Tôi xin chân thành cảm ơn tới Th.S Nguyễn Thị Thanh - Phòng dịch tễ, chi cục Thú y Hải Phòng tận tình giúp đỡ bảo hoàn thành đợt thực tập tốt nghiệp Tôi xin cảm ơn cán bộ, nhân viên Chi cục Thú Y Hải Phòng tạo điều kiện sở vật chất nhiệt tình giúp đỡ thời gian thực tập Lời cảm ơn gửi tới Ban giám hiệu nhà trường thầy cô giáo Viện Sinh - Nông, trường Đại Học Hải Phòng tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ em thời gian thực tập tốt nghiệp Tôi xin bày tỏ kính trọng, lòng biết ơn tới Th.S Phạm Thị Minh Nụ tận tình bảo, dạy dỗ, truyền đạt kiến thức cho trình học tập Cuối cùng, xin gửi lời cảm ơn đến gia đình người động viên, ủng hộ giúp đỡ để hoàn thành luận văn Tôi xin chân thành cảm ơn! Sinh viên Nguyễn Công Chung i Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN i MỤC LỤC .ii Tài liệu nước 55 .xliv PHỤ LỤC 56 .xliv DANH MỤC HÌNH VÀ ĐỒ THỊ xlv DANH MỤC BẢNG lxxxviii Thuật ngữ chữ viết tắt cxxxi Nghĩa cxxxi Cs cxxxi Cộng .cxxxi HPAI cxxxi Cúm gia cầm độc lực mạnh cxxxi OIE cxxxi Tổ chức thú y giới .cxxxi PBS cxxxi Dung dịch đệm cxxxi P.P.P cxxxi Đoạn mồi tạo thành khuôn .cxxxi RT-PCR cxxxi Phản ứng dây chuyền cxxxi Subtype cxxxi Kiểu phụ cxxxi Type cxxxi Dạng, Loại cxxxi VAHIP cxxxi Phòng chống dịch cúm gia cầm, cúm người dự phòng đại dịch cxxxi ii Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 LỜI CẢM ƠN cxxxii Phần MỞ ĐẦU 1.1 ĐẶT VẤN ĐỀ 1.2 MỤC ĐÍCH VÀ YÊU CẦU 1.2.1 Mục đích 1.2.2 Yêu cầu Phần .3 TỔNG QUAN TÀI LIỆU .3 2.1 TÌNH HÌNH BỆNH CÚM GIA CẦM TRÊN THẾ GIỚI - Tình hình dịch cúm H5N6 giới 2.2 Tình hình bệnh cúm gia cầm Việt Nam 2.3 TRIỆU CHỨNG, BỆNH TÍCH CỦA GIA CẦM MẮC BỆNH CÚM 11 2.3.1 Triệu chứng lâm sàng gia cầm mắc bệnh cúm .11 Hình 2.1 Xuất huyết da chân, mào tích sưng to, xuất huyết 12 2.3.2 Bệnh tích gia cầm mắc cúm gia cầm .13 2.4 Chẩn đoán bệnh .13 2.4.1 Chẩn đoán dựa vào dịch tễ học 13 2.4.2 Chẩn đoán dựa vào triệu chứng bệnh tích .14 Hình 2.2 Bệnh tích da gà bị cúm A,H5N1 .15 Hình 2.3 Bệnh tích tim, gan gà bị cúm A,H5N1 16 2.4.3 Chẩn đoán phòng thí nghiệm 16 2.5 Vacxin phòng bệnh cúm gia cầm 16 2.5.1 Khái quát loại vacxin phòng bệnh cúm gia cầm 16 2.5.2 Tình hình sử dụng vacxin cúm gia cầm giới 18 2.5.3 Tình hình sử dụng vacxin cúm gia cầm Việt Nam 19 3.1.2 Địa điểm thời gian nghiên cứu .21 3.2 NỘI DUNG NGHIÊN CỨU 21 3.3 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 21 iii Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 3.3.1 Nguyên liệu 21 3.3.1.1 Mẫu thí nghiệm 21 3.3.1.2 Phương pháp lấy mẫu 22 3.3.1.3 Phương pháp bảo quản mẫu .22 3.3.2 Bố trí thí nghiệm 22 3.3.3 Phương pháp điều tra 23 3.3.4 Phương pháp xét nghiệm .23 Hình 3.1 Cơ chế hoạt động Taqman probe 24 Phần 29 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 29 4.1 HIỆN TRẠNG BUÔN BÁN GIA CẦM TẠI CHỢ CỦA THÀNH PHỐ HẢI PHÒNG 29 Bảng 4.1 Số lượng gia cầm buôn bán chợ thành phố Hải Phòng 32 Biểu đồ 4.1 Số lượng gia cầm buôn bán chợ qua năm điều tra 32 4.2 TỔNG HỢP KẾT QUẢ XÉT NGHIỆM MẪU SWAB TẠI CÁC CHỢ BÁN GIA CẦM TRONG THÁNG 12 NĂM 2015 VÀ THÁNG 1, THÁNG NĂM 2016 CỦA THÀNH PHỐ HẢI PHÒNG 34 36 Biểu đồ 4.2 Tỷ lệ lưu hành virus tháng 12 năm 2015 tháng 1,2 năm 2016 36 44 Biểu đồ 4.6 Tỷ lệ lưu hành virus cúm A/H5N6 chợ thành phố Hải Phòng tháng năm 2016 .44 4.3 ẢNH HƯỞNG CỦA TỶ LỆ TIÊM PHÒNG VACXIN TỚI SỰ LƯU HÀNH VIRUS 50 4.4 BIỆN PHÁP PHÒNG TRÁNH VÀ XỬ LÝ KHI CÓ DỊCH CÚM GIA CẦM XẢY RA 51 PHẦN V 53 KẾT LUẬN VÀ KHUYẾN NGHỊ .53 iv Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 5.1 KẾT LUẬN 53 5.2 KHUYẾN NGHỊ .53 TÀI LIỆU THAM KHẢO .53 PHỤ LỤC 55 Kết xét nghiệm mẫu swab chợ TT Tiên Lãng tháng 12 năm 2015 55 TT (KH mẫu) 55 Loại mẫu 55 Kết 55 Hầu họng .55 Phân tươi 55 Chất thải 55 Nước thải .55 Nước uống .55 A 55 H5 55 H7 55 N1 55 N6 55 .55 x .55 .55 .55 .55 .55 x .55 .55 .55 x .55 .55 v Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 .55 .55 .55 x .55 .55 .55 .55 .55 x .55 .55 .55 .55 .55 x .55 .55 .55 x .55 .55 .55 x .55 .55 .55 x .55 .55 .55 .55 10 55 x .55 .55 vi Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 .55 .55 11 55 x .55 .55 12 55 x .55 .55 13 55 x .55 .55 .55 .55 .55 .55 14 55 x .55 .55 .55 .55 .55 .55 15 55 x .55 .55 .55 .55 .55 .55 vii Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 16 55 x .55 .55 .55 .55 .55 .55 17 55 x .55 .55 .55 .55 .55 .55 18 55 x .55 .55 .55 .55 .55 .55 Tổng .55 12 55 .55 .55 .55 .55 12 55 .55 viii Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 .55 .55 .55 Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Lương Văn Can tháng 12 năm 2015 56 TT (KH mẫu) 56 Loại mẫu 56 Kết 56 Hầu họng .56 Phân tươi 56 Chất thải 56 Nước thải .56 Nước uống .56 A 56 H5 56 H7 56 N1 56 N6 56 19 56 x .56 .56 20 56 x .56 .56 .56 .56 .56 .56 21 56 x .56 ix Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 .56 22 56 x .56 .56 23 56 x .56 .56 24 56 x .56 .56 25 56 x .56 .56 .56 .56 26 56 x .56 .56 .56 .56 27 56 x .56 .56 28 56 x .56 .56 .56 .56 .56 x Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 có nhiều subtype H N virus cúm type A mà chưa xác định Vì cần có nhiều đề tài, dự án nghiên cứu virus cúm gia cầm nhằm xác định subtype khác virus cúm type A  Đối tượng lấy mẫu không đạt tính đại diện nguyên nhân ảnh hưởng đến kết lưu hành virus Do lấy mẫu chợ nên có thay đổi chợ lấy mẫu hộ lấy mẫu tháng 54 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 TÀI LIỆU THAM KHẢO TÀI LIỆU TIẾNG VIỆT Bùi Quang Anh (2005), “Báo cáo dịch cúm gia cầm Hội nghị kiểm soát dịch cúm gia cầm khu vực châu Á” FAO, OIE tổ chức thành phố Hồ Chí Minh từ 23-25/2/2005 Bộ Nông nghiệp Phát triển Nông thôn, Ban quản lí dự án Nông nghiệp, ” Hướng dẫn chương trình giám sát cúm gia cầm năm 2010” Cục thú y, 2004, “Tài liệu tập huấn phương pháp chẩn đoán cúm gia cầm” Cục thú y (2007), “Sổ tay chẩn đoán cúm gia cầm” Cục thú y, phòng dịch tễ “Báo cáo tổng kết công tác phòng chống dịch bệnh gia súc, gia cầm năm 2009 phương hướng năm 2010”, tr – 6.Nguyễn Tiến Dũng, Malik Peiris, Robert Webter, Kent Inui, Đào Thanh Vân, Bùi Ngọc Anh, Bùi Nghĩa Vượng, Nguyễn Thế Vinh, Nguyễn Viết Không, Ngô Thanh Long (2004), “Nguồn gốc virus cúm gia cầm H5N1 Việt Nam năm 2003/2004”, tạp chí Khoa học kỹ thuật thú y 11(3), tr – 14 Phạm Sỹ Lăng (2004) “Diễn biến cúm gia cầm Châu Á hoạt động phòng chống bệnh”, Tạp chí khoa học kỹ thuật thú y, 11(3), tr 87 - 93 Lê Văn Năm (2004), “ Bệnh cúm gà”, Tạp chí Khoa học Kỹ thuật Thú y , tr 81-86 Tô Long Thành (2006) “Kinh nghiệm phòng chống dịch cúm gia cầm sử dụng vaccine cúm gia cầm Trung Quốc”, Tạp chí khoa học kỹ thuật thú y 12(3), tr 87 – 93 10 Nguyễn Ngọc Tiến cs, 2013, Lưu hành virus cúm gia cầm độc lực cao H5N1 Việt Nam vacxin phòng bệnh cúm gia cầm” 11 Tổ chức y tế giới (2004), “Hướng dẫn phòng chống lây nhiễm bệnh cúm gà”, Nhà xuất Nông nghiệp Hà Nội 53 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 Các trang web tiếng Việt 12 Bách khoa toàn thư mở wikipedia http://vi.wikipedia.org/wiki/C%C3%BAm_gia_c%E1%BA%A7m 13 Cục thú y http://www.cucthuy.gov.vn/index.php.option=com_content&task=view&id =777&Itemid=91 TÀI LIỆU NƯỚC NGOÀI 14 Alexander D.J (2007), An overview of the epidemilogy of avian influenza Vacinne 25(30): 5637-5644 Review Các trang web tiếng anh 15 Avian influenza – Highly Pathogenic (HPAI), Fowl Plague http://www.thepoultrysite.com/diseaseinfo/62/avian-influenzahighlypathogenic-hpai-fowl-plague 54 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 PHỤ LỤC Kết xét nghiệm mẫu swab chợ TT Tiên Lãng tháng 12 năm 2015 TT Loại mẫu Kết Hầu Phâ Chất Nướ Nướ A H5 H7 họn n thải c c tươi thải uống g x 0 x x 0 x 0 x 0 x x x x 0 10 x 0 11 x 12 x 1 (KH 13 x N1 N6 0 14 x 1 0 15 x 1 0 16 x 1 0 17 x 1 0 x 1 0 1 12 0 18 Tổn 12 2 g 55 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Lương Văn Can tháng 12 năm 2015 TT Loại mẫu Kết Hầu Phâ Chất Nướ Nướ họn n thải c c tươi thải uống 19 g x 20 21 x x 22 23 x x 0 24 25 x x 26 27 28 x x x 1 29 x 30 31 x (KH x x x 34 35 x x 12 H5 H7 N1 N6 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1 1 0 0 1 0 32 33 36 Tổn A 2 0 x g Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Quán Toan tháng 12 năm 2015 TT (KH Loại mẫu Kết 56 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 Hầu Phâ Chất Nướ Nướ A H5 H7 N1 N6 họn n thải c c tươi thải uống 37 g x 1 0 38 x 39 x 0 40 x 1 0 41 x 1 0 42 x 1 0 43 x 44 x 0 45 x 0 46 x 0 47 x 0 48 x 0 0 0 49 x 50 x 51 x 52 x 53 x 54 Tổn 12 2 x 11 g Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Đầm Triều tháng 12 năm 2015 57 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 TT Loại mẫu Kết (KH Hầu Phâ Chất Nướ Nướ mẫu họn n thải c c ) 55 g x tươi thải uống 56 x 57 x 58 x 59 x 60 x 61 x 62 x 63 x 64 x 65 x 66 x 67 A x 0 0 0 N1 N6 0 x 69 x 70 x 71 x 72 12 H7 68 Tổn H5 2 x g 58 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Đầm Triều tháng năm 2016 TT Loại mẫu Kết Hầu Phâ Chất Nướ Nướ H5 H7 họn n thải c c tươi thải uống g x x x x x 0 x 0 x x x 10 x 11 x 12 x 0 (KH 13 A x 0 x 15 x 16 x 17 x 18 12 N6 14 Tổn N1 2 x g Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Lương Văn Can tháng năm 2016 59 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 TT Loại mẫu Kết (KH Hầu Phâ Chất Nướ Nướ A H5 H7 mẫu họn n thải c c ) 19 g x tươi thải uống 0 20 21 x x 1 22 23 x x 0 24 25 x x 0 26 27 28 x x x 0 29 x 30 31 x 0 x 32 33 x x 34 35 36 Tổn N6 1 0 x x 12 N1 0 x g Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Quán Toan tháng năm 2016 TT (KH Loại mẫu Hầu Phâ Chất Kết Nướ Nướ A H5 H7 N1 60 N6 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 họn n tươi 37 g x 38 thải c c thải uống 0 x 0 39 x 40 x 0 41 x 0 42 x 0 43 x 44 x 45 x 46 x 47 x 48 x 0 49 x 50 x 51 x 52 x 53 x 54 Tổn 12 2 x 0 g Kết xét nghiệm mẫu swab chợ TT Tiên Lãng tháng năm 2016 61 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 TT Loại mẫu Kết (KH Hầu Phâ Chất Nướ Nướ mẫu họn n thải c c ) 55 g x tươi thải uống 56 x 57 H5 H7 0 x 1 58 x 0 59 x 1 60 x 0 61 x 62 x 63 x 64 x 1 65 x 66 x 67 A N1 N6 0 0 1 0 x 68 x 1 0 69 x 1 0 70 x 1 0 71 x 1 0 x 1 0 1 12 0 72 Tổn 12 2 g 62 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 Kết xét nghiệm mẫu swab chợ TT Tiên Lãng tháng năm 2016 TT Loại mẫu Kết Hầu Phâ Chất Nướ Nướ H5 H7 N1 N6 họn n thải c c tươi thải uống g x x 1 0 x 0 x x x 0 x x x 10 x 11 x 12 x 0 0 (KH 13 A x 14 x 15 x 16 x 17 x 18 Tổn 12 2 x g Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Lương Văn Can tháng năm 2016 63 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 TT Loại mẫu Kết (KH Hầu Phâ Chất Nướ Nướ mẫu họn n thải c c ) 19 g x tươi thải uống 20 21 x x 0 22 23 x x 0 24 25 x x 0 26 27 28 x x x 0 29 x 30 31 x 0 x x x 34 35 H7 N1 N6 0 0 0 x x 12 H5 32 33 36 Tổn A 2 0 x 0 g Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Quán Toan tháng năm 2016 TT (KH Loại mẫu Hầu Phâ Chất Kết Nướ Nướ A H5 H7 N1 64 N6 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 họn n tươi 37 g x 38 x 39 x 40 x 41 x 42 x 43 x 44 x 45 x 46 x 47 x 48 x 49 thải c c thải uống x x 51 x 52 x 53 x 54 12 0 0 50 Tổn 2 x 1 0 g Kết xét nghiệm mẫu swab chợ Đầm Triều tháng năm 2016 65 Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 TT Loại mẫu Kết (KH Hầu Phâ Chất Nướ Nướ mẫu họn n thải c c tươi thải uống 55 g x 56 x 57 x 58 x 59 x 60 x 61 x 62 x 63 x 64 x 65 x 66 x 67 A x 0 0 0 0 N1 N6 0 x 69 x 70 x 71 x 72 12 H7 68 Tổn H5 2 x g 66 [...]... .56 0 .56 6 .56 Kết quả xét nghiệm mẫu swab tại chợ Quán Toan tháng 12 năm 2015 56 TT (KH mẫu) 56 Loại mẫu 56 Kết quả 56 Hầu họng .57 Phân tươi 57 xii Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 Chất thải 57 Nước thải .57 Nước uống .57 A 57 H5 ... .57 0 .57 0 .57 5 .57 Kết quả xét nghiệm mẫu swab tại chợ Đầm Triều tháng 12 năm 2015 57 TT (KH mẫu) 58 Loại mẫu 58 Kết quả 58 Hầu họng .58 Phân tươi 58 Chất thải 58 Nước thải .58 Nước uống .58 A 58 H5 58 xvi Đồ án tốt nghiệp... .58 0 .58 0 .58 0 .58 Kết quả xét nghiệm mẫu swab tại chợ Đầm Triều tháng 1 năm 2016 59 TT (KH mẫu) 59 Loại mẫu 59 Kết quả 59 Hầu họng .59 Phân tươi 59 Chất thải 59 Nước thải .59 Nước uống .59 A 59 H5 59 H7 ... .59 0 .59 0 .59 0 .59 Kết quả xét nghiệm mẫu swab tại chợ Lương Văn Can tháng 1 năm 2016 59 TT (KH mẫu) 60 Loại mẫu 60 Kết quả 60 Hầu họng .60 Phân tươi 60 Chất thải 60 Nước thải .60 Nước uống .60 A 60 H5 60 H7 ... .60 0 .60 0 .60 1 .60 Kết quả xét nghiệm mẫu swab tại chợ Quán Toan tháng 1 năm 2016 60 TT (KH mẫu) 60 Loại mẫu 60 Kết quả 60 Hầu họng .60 Phân tươi 60 Chất thải 60 Nước thải .60 Nước uống .60 A 60 H5 60 H7 ... .61 0 .61 0 .61 0 .61 Kết quả xét nghiệm mẫu swab tại chợ TT Tiên Lãng tháng 1 năm 2016 .61 TT (KH mẫu) 62 Loại mẫu 62 Kết quả 62 Hầu họng .62 Phân tươi 62 Chất thải 62 Nước thải .62 Nước uống .62 A 62 H5 62 H7 ... .62 0 .62 0 .62 8 .62 Kết quả xét nghiệm mẫu swab tại chợ TT Tiên Lãng tháng 2 năm 2016 .63 TT (KH mẫu) 63 Loại mẫu 63 Kết quả 63 Hầu họng .63 Phân tươi 63 Chất thải 63 Nước thải .63 Nước uống .63 A 63 H5 63 H7 ... .63 0 .63 0 .63 2 .63 Kết quả xét nghiệm mẫu swab tại chợ Lương Văn Can tháng 2 năm 2016 63 TT (KH mẫu) 64 Loại mẫu 64 Kết quả 64 Hầu họng .64 Phân tươi 64 Chất thải 64 Nước thải .64 xxxv Đồ án tốt nghiệp SV: Nguyễn Công Chung - Lớp KSCN K13 Nước uống