Là phần mềm viết công thức hóa học khá mạnh, sử dụng miễn phí, với một tập tin duy nhất là: draw24.exe có kích thước 7,24Mb (chương trình đã có kèm theo một số plugin hỗ trợ như Wiew in RasMol hay Generate Name with AutoNom). Để chuyển các cấu trúc dưới dạng hình học 2 chiều thành công thức lập thể (3 chiều) cần cài đặt plugin 3ddraw của ACD
Trang 1Giới thiệu
Là phần mềm viết công thức hóa học khá mạnh, sử dụng miễn phí, với một tập tin duy nhất là: draw24.exe có kích thớc 7,24Mb (chơng trình đã có kèm theo một
số plug-in hỗ trợ nh Wiew in RasMol hay Generate Name with AutoNom).
Để chuyển các cấu trúc dới dạng hình học 2 chiều thành công thức lập thể (3 chiều) cần cài đặt plug-in 3ddraw của ACD
I cài đặt
Hình 1: Chọn Next để tiếp tục các bớc cài đặt
2 Tiếp tục chọn Yes và Next để tiếp tục quá trình cài đặt.
Trang 2Hình 2: Chọn Yes để cài đặt phần gọi tên tự động
3 Chọn Finish để kết thúc quá trình cài đặt Itiếp tục quá trình cài đặt.
Hình 3: Chọn Finish để hoàn thành việc cài đặt ISIS/Draw
4 Chọn Next và Yes để tiếp tục cài đặt phần gọi tên tự động, sau đó chọn Finish
để hoàn thành việc cài đặt phần gọi tên tự động
Hình 4: Chọn Finish để hoàn thành việc cài đặt AutoNom Standard
II Cài đặt Muốn chuyển công thức từ 2D sang 3D ở cả hai phiên bản đều phải cài đặt thêm
Trang 3Nhắp chuột chọn Installation (hình 2), sau đó chọn Install an Add-in (hình 3)
Chọn đờng dẫn đến ACDFREE đã đợc cài trên ổ cứng, nhắp chuột vào Open sau đó nhắp chuột để tiếp tục các xác nhận
Hình 1: Chọn Add-in Manager từ Menu Options
Hình 2: chọn Installation từ hộp thoại
Hình 3: Chọn Install an Add-in từ hộp thoại
Trang 41 Nhắp đúp vào biểu tợng để cài lên ổ cứng
2 Khởi động chơng trình ISIS/DRAW 2.4 hoặc 2.5
3 Vào Menu Option\Add-in… và tìm File 3D vừa cài đặt ở b và tìm File 3D vừa cài đặt ở bớc 4 (Thao tác theo hớng dẫn)
II Hớng dẫn sử dụng
tuy nhiên tải thêm một plug-in plug-in 3ddraw của ACD và cài đặt để chuyển các cấu trúc dới dạng hình học 2 chiều thành công thức lập thể (3 chiều)
Để cài đợc Plug-in này ta tiến hành theo các bớc sau:
B
ớc 1: Cài đặt chơng trình 3ddraw (có biểu tợng nh hình vẽ).
B
ớc 2: Khởi động chơng trình ISIS Draw (đã cài từ trớc), chọn Add-in Manager
từ Menu Options (hình 1)
Nhắp chuột chọn Installation (hình 2), sau đó chọn Install an Add-in (hình 3)
Hình 1: Chọn Add-in Manager từ Menu Options Hình 4: Chọn đờng dẫn để cài đặt
Trang 5Chọn đờng dẫn đến ACDFREE đã đợc cài trên ổ cứng, nhắp chuột vào Open sau đó nhắp chuột để tiếp tục các xác nhận
2 Khởi động chơng trình:
Cách 1: Nắp đúp vào biểu tợng trên màn hình
Cách 2: Start>Programs> ISIS Draw 2.4 Standlone> ISIS Draw 2.4
3 Màn hình làm việc của chơng trình:
Hình 2: chọn Installation từ hộp thoại
Hình 3: Chọn Install an Add-in từ hộp thoại
Hình 4: Chọn đờng dẫn để cài đặt
Trang 64 Nội dung thanh công cụ:
5 Một số ví dụ:
a) Biễu diễn phân tử toluen:
- Vẽ vòng benzen (dùng công cụ vẽ vòng benzen)
- Vẽ liên kết đơn (dùng công cụ Single Bond)
Hình 5: Màn hình làm việc của chơng trình
Hình 6: Biểu tợng các công cụ trên thanh ngang
Hình 7: Biểu tợng các công cụ trên thanh dọc
Trang 7- Có thể đọc tên tự động (sau khi dùng công cụ chọn toàn bộ phân tử, rồi nhấp vào phần đọc tên tự động
Có thể chuyển công thức vừa vẽ thành công thức không gian 3 chiều với Plug-in 3ddraw của ACD đã cài đặt (nh hớng dẫn ở trên) hoặc sử dụng Plug-in Rasmol đã tích hợp khi cài phiên bản ISIS Draw 2.4
- Sử dụng 3ddraw: Dùng công cụ lựa chọn để chọn phân tử, sau đó chọn ACD 3D Viewer từ Menu Object
Hình 8: Công thức sau khi đã hoàn thành
Hình 9: Chọn ACD 3D Viewer từ Menu Object
Trang 8Nhấp chuột trái vào biểu tợng (3D-Optimize) để tối u hóa cách sắp xếp trong không gian của phân tử
Sau đó chọn các kiểu biểu diễn phân tử nh: sticks (hình que), spacefill (mô hình đặc)… và tìm File 3D vừa cài đặt ở b
Ví dụ nếu ta chọn mô hình đặc sẽ thu đợc hình sau
a Ví dụ 2: Vẽ phân tử phenolphtalein
Bớc 1: Vẽ vòng benzen, dùng công cụ vẽ vòng benzen.
Hình 10: Hiển thị ban đầu trong ACD 3D
Hình 11: Chọn các kiểu hiển thị phân tử … từ thanh công cụ từ thanh công cụ
Hình 12: Phân tử toluen dạng hình cầu đặc
Trang 9Bớc 3: Thêm 2 nhóm thế: Dùng công cụ vẽ nối đơn, liên tục.
Bứôc 4: Vẽ thêm hai vòng benzen: Dùng công cụ vẽ vòng benzen
Bứôc 5:Thêm các nhóm thế, Dùng công cụ vẽ nối đơn và nối đôi
Bớc 6: Thêm các kí hiệu nguyên tố, nhóm chức và tên: Dùng công cụ vẽ
nguyên tử
O
OH
OH O
Phân tử phenolphtalein
b Ví dụ 3: Vẽ sơ đồ biến đổi cấu tạo dẫn đến biến đổi màu sắc của phenolphtalein
trong các môi trờng axit, trung tính, kiềm loãng và kiềm đặc
Trang 10C
OH
OOH H
OH
C
OH
H OO
C
C OO
O OH
H
H
O
OH
O C
H OO C
OH
-Mau hong (III)
-Mau do tim (IV)
-+
+
Quinon phenolat
-_
-dac
Khong mau
Nh vậy trong kiềm đặc phenolphtalein khôn
(trong file nộn gồm cú 2 file hướng dẫn sử dụng và hướng dẫn cài đặt
