Tổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazoleTổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học của các dẫn xuất dị vòng kết hợp chứa 1,3,4-oxadiazole
Trang 1B Þ GIÁO DĀC VÀ ĐÀO T¾O TR¯âNG Đ¾I HàC CÄN TH¡
-
Trang 2
B Þ GIÁO DĀC VÀ ĐÀO T¾O TR¯âNG Đ¾I HàC CÄN TH¡
-
NM 2023
Trang 3CHÂP THUÂN CĂA HÞI ĐâNG
Luận án này với tựa đề là <Tổng hợp và đánh giá hoạt tính sinh học các dẫn xuất
dị vòng kết hợp chāa khung 1,3,4-oxadiazole= do nghiên cāu sinh Nguyễn Phú Quý thực hiện theo sự h°ớng dẫn cÿa PGS.TS Bùi Thị Bửu Huê Luận án đã báo cáo và đ°ợc Hội đồng đánh giá luận án tiến sĩ thông qua ngày: dd/mm/yyyy Luận án đã đ°ợc chỉnh sửa theo góp ý và đ°ợc Hội đồng đánh giá luận án xem lại
Trang 5Trong nghiên cāu này, 67 dẫn xuất dị vòng kết hợp mới dựa trên các khung c¡ bản 1,3,4-oxadiazole, benzimidazole và quinazolinone định h°ớng kháng ung th° đã đ°ợc thiết kế và tổng hợp thành công bằng ph°¡ng pháp tổng hợp cổ điển Các quy trình tổng hợp đ°ợc thiết kế khá đ¡n giản, ít tán kém, hiệu quả, sử dụng các tác nhân phản āng khá thân thiện với môi tr°ßng Các hợp chất tổng hợp đ°ợc bao gồm 11 dẫn
xuất kết hợp benzimidazole/hydroxamate (7a-k), 15 dẫn xuất kết hợp quinazolinone/hydroxamate (12a-j, 13a-b, 14a-c), 36 dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole (43a-q và 44a-s) và 05 dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone (45a-e) Cấu trúc cÿa các hợp chất này
đ°ợc xác nhận đầy đÿ dựa trên các dữ liệu phổ nghiệm bao gồm HR-MS, FT-IR,
1H-NMR và 13C-NMR
Kết quả đánh giá hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất tổng hợp xác định
đ°ợc 07 cấu trúc hit, trong đó dẫn xuất kết hợp benzimidazole/hydroxamate (12h) và
quinazolinone/hydroxamate (7g) thể hiện hoạt tính āc chế chọn lọc enzyme HDAC6 in
vitro và in silico tát t°¡ng đ°¡ng với chất đái chāng d°¡ng belinostat Hai hợp chất hit
này cũng thể hiện hoạt tính āc chế tát 06 dòng tế bào ung th° á ng°ßi (ung th° buồng trāng SKOV-3, ung th° vú (MCF-7, MDA-MB-231, EMT6), ung th° gan Hepa1c1c7, ung th° não N2a) Bên cạnh đó, 03 dẫn xuất chāa khung kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole thể hiện độc tính tát trên 03 dòng tế bào ung th° á ng°ßi (HeLa, MCF-7 và A549), trong đó hợp chất 43b đ°ợc xem là hit đái với dòng tế bào
ung th° MCF-7 trong khi hợp chất 43d và 43i là hit đái với cả ba dòng tế bào khảo sát
Cả ba dẫn xuất này đều thể hiện hoạt tính āc chế protein hTS, EGFR và HER2
in silico Đái với cấu trúc kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone tìm
đ°ợc 02 cấu trúc hit là 45a và 45c lần l°ợt thể hiện hoạt tính mạnh gấp 5 lần và 13.5
lần so với chất đái chāng d°¡ng 5-FU đái với dòng tế bào ung th° MCF-7
Các kết quả nghiên cāu cÿa luận án góp phần khẳng định tiềm năng cÿa các cấu trúc dị vòng kết hợp nói chung và các cấu trúc kết hợp chāa khung 1,3,4-oxadiazole, khung benzimidazole và quinazolinone nói riêng, trong nghiên cāu và phát triển thuác mới, đặc biệt là thuác kháng ung th°
Tć khóa: Benzimidazole, HDAC, EGFR, hTS, HER2, độc tính đối với tế bào,
Trang 6ABTRACT
Nitrogen- and oxygen-containing heterocyclic compounds, especially 1,3,4–oxadiazole, benzimidazole and quinazolinone, are known to have diverse
biological activities and are considered as important frameworks in drug discovery
research Recently, hybrid heterocycles have become a well-established and powerful
biologically relevant due to their enhanced activities and lower harmful side effects
compared to single heterocyclic moieties
In this study, 67 new hybrid heterocyclic compounds containing
1,3,4-oxadiazole, benzimidazole, and quinazolinone core structures were designed and
successfully synthesized based on classical organic synthetic methods All the
designed synthetic procedures are simple, efficient, with the use of non-toxic and
environmentally friendly reagents The synthesized structures include 11 hybrid
benzimidazole/hydroxamate derivatives (7a-k), 15 hybrid quinazolinone/hydroxamate
derivatives (12a-j, 13a-b, 14a-c), 36 hybrid derivatives of
oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone hybrid derivatives (45a-e) The structures of
the synthesized compounds were fully determined based on spectroscopic data
including HR-MS, FT-IR, 1H -NMR and 13C-NMR
Results on the anticancer activity studies revealed 07 hit compounds The
benzimidazole/hydroxamate 12h and quinazolinone/hydroxamate 7g proved as
selective HDAC6 inhibitors in both in vitro and in silico studies, with the activities
comparable to the positive control belinostat These two hit also showed good
cytotoxicities against six human cancer cell lines (SKOV-3, MCF-7, MDA-MB-231,
EMT6, Hepa1c1c7 and N2a) Besides, the three 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole
hybrid derivatives 43b, 43d, and 43i displayed good cytotoxicity against the three
cancer cell lines (HeLa, MCF-7, A549), in which compound 43b was found as the hit
for the MCF-7 cancer cell line while compounds 43d and 43i were the hits towards all
three tested cancer cell lines These three hit compounds exhibited inhibition activity
in silico against the hTS, EGFR and HER2 proteins For the hybrid structures
containing three heterocycles 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone,
compounds 45a and 45c indicated good cytotoxicity which was 5-fold and 13.5-fold,
respectively, stronger than the positive control 5-FU against the MCF-7 cancer cell
line
The obtained results from this research contribute to affirm the potent of hybrid
heterocyclic structures in general, and the hybrids containing 1,3,4-oxadiazole,
benzimidazole and quinazolinone heterocycles, in particular, for discovery and
development of new drugs, especially anticancer drugs
Keyword: Benzimidazole, cancer, cytotoxicity, HDAC, EGFR, hTS, HER2,
Trang 8MĀC LĀC
M ĀC LĀC i
DANH M ĀC BÀNG v
DANH M ĀC HÌNH vi
DANH M ĀC S¡ Đâ x
DANH M ĀC TĆ VI¾T TÄT xiii
CH¯¡NG 1 GIàI THIâU 1
1.1 Lý do chọn đề tài 1
1.2 Mục đích nghiên cāu 2
1.3 Nhiệm vụ nghiên cāu 3
1.4 Tính mới cÿa luận án 3
1.5 Cấu trúc cÿa luận án 4
CH¯¡NG 2 TäNG QUAN TÀI LIâU 5
2.1 H ÿp chÃt dß vòng 1,3,4-oxadiazole 5
2.1.1 Giới thiệu chung về hợp chất dị vòng 1,3,4-oxadiazole 5
2.1.2 Các ph°¡ng pháp tổng hợp các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole 6
2.1.2.1 Ph°¡ng pháp tổng hợp 2,5-diaryl(alkyl)-1,3,4-oxadiazole 6
2.1.2.2 Ph°¡ng pháp tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole-2-thiol 9
2.1.3 Hoạt tính sinh học cÿa các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole 10
2.1.3.1 Hoạt tính kháng khuẩn cÿa các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole 10
2.1.3.2 Hoạt tính kháng virus cÿa các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole 12
2.1.3.3 Hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole 14
2.2 H ÿp chÃt dß vòng benzimidazole 15
2.2.1 Giới thiệu chung về hợp chất dị vòng benzimidazole 15
2.2.2 Các ph°¡ng pháp tổng hợp dẫn xuất benzimidazole 16
2.2.2.1 Tổng hợp benzimidazole từ o-phenylenediamine 17
2.2.2.2 Tổng hợp benzimidazole từ aryl amidine 18
2.2.2.3 Tổng hợp benzimidazole từ 2-haloaniline (azidoaniline) và aldehyde 19
2.2.3 Hoạt tính sinh học cÿa các dẫn xuất benzimidazole 20
2.2.3.1 Hoạt tính kháng khuẩn cÿa các dẫn xuất benzimidazole 20
Trang 92.2.3.2 Hoạt tính kháng virus cÿa các dẫn xuất benzimidazole 21
2.2.3.3 Hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất benzimidazole 23
2.3 H ÿp chÃt dß vòng quinazolinone 24
2.3.1 Giới thiệu chung về hợp chất dị vòng quinazolinone 24
2.3.2 Các ph°¡ng pháp tổng hợp dẫn xuất quinazolinone 25
2.3.2.1 Tổng hợp quinazolinone từ 2-aminobenzoic acid 26
2.3.2.2 Tổng hợp quinazolinone từ anthranilamide 27
2.3.2.3 Tổng hợp quinazolinone từ isatoic anhydride 29
2.3.3 Hoạt tính sinh học cÿa các dẫn xuất quinazolinone 30
2.3.3.2 Hoạt tính kháng virus cÿa các dẫn xuất quinazolinone 32
2.3.3.3 Hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất quinazolinone 33
2.4 Các d Án xuÃt dß vòng k¿t hÿp chąa khung 1,3,4-oxadiazole 35
2.5 Các m āc tiêu sinh hác trong nghiên cąu phát trißn thuác kháng ung th° 40
2.5.1 Histone deacetylases (HDAC) 40
2.5.2 Human Thymidylate synthase (hTS) 42
2.5.3 Epidermal growth factor receptor (EGFR) và Human epithelium receptor 2 (HER2) 42
2.6 Ph°¢ng pháp ti¿p cÃn in silico trong thi¿t k¿ tång hÿp thuác 43
CH¯¡NG 3 PH¯¡NG PHÁP NGHIÊN CĄU 45
3.1 Hóa ch Ãt, dāng cā và thi¿t bß 45
3.1.1 Hóa chất 45
3.1.2 Dụng cụ và thiết bị 46
3.2 N ßi dung nghiên cąu 46
3.2.1 Tổng hợp hóa học 46
3.2.1.1 Tổng hợp các dẫn xuất kết hợp benzimidazole/hydroxamate (3a-k) 46
3.2.1.2 Tổng hợp các dẫn xuất kết hợp quinazolinone/hydroxamate (12a-j, 13a-b, 14a-c) 47
3.2.1.3 Tổng hợp các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole (43a-q) và (44a-s) 47
3.2.1.4 Tổng hợp các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone (45a-e) 47
Trang 103.2.2 Xác định hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất tổng hợp đ°ợc 48 3.2.2.1 Xác định hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất kết hợp
benzimidazole/hydroxamate (3a-k) và quinazolinone/hydroxamate (12a-j, 13a-b, 14a-c) 48 3.2.2.2 Xác định hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất dị vòng kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole (43a-q) và (44a-s) 48 3.2.2.3 Xác định hoạt tính gây độc tế bào ung th° in vitro cÿa các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone (45a-e) 49
3.3 Ph°¢ng pháp nghiên cąu 49
3.3.1 Các ph°¡ng pháp tổng hợp hóa học 49 3.3.1.1 Ph°¡ng pháp tổng hợp các dẫn xuất dị vòng kết hợp
benzimidazole/hydroxamate (3a-k) 49 3.3.1.2 Ph°¡ng pháp tổng hợp các dẫn xuất dị vòng kết hợp
quinazolinone/hydroxamate (12a-j, 13a-b, 14a-c) 51 3.3.1.3 Ph°¡ng pháp tổng hợp các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-
oxadiazole/benzimidazole (43a-q) và (44a-s) 55 3.3.1.4 Ph°¡ng pháp tổng hợp các dẫn xuất dị vòng kết hợp 1,3,4-
oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone (45a-e) 57
3.3.2 Ph°¡ng pháp xác định hoạt tính kháng ung th° in vitro 59
3.3.2.1 Ph°¡ng pháp xác định hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất kết hợp benzimidazole/hydroxamate (3a-k) và quinazolinone/hydroxamate (12a-j, 13a-b, 14a-c) 59
3.3.2.2 Ph°¡ng pháp xác định hoạt tính gây độc tính tế bào ung th° in vitro cÿa
các dẫn xuất kết hợp chāa khung 1,3,4-oxadiazole (43a-q), (44a-s) và (45a-e) 60
3.3.3 Xác định hoạt tính kháng ung th° in silico bằng ph°¡ng pháp docking phân
tử 61 3.3.3.1 Xây dựng cấu trúc và chuẩn bị thông sá đầu vào cÿa các hợp chất và các enzyme 61 3.3.3.2 Docking khảo sát trên các enzyme HDAC 62 3.3.3.3 Docking khảo sát trên các enzyme hTS, EGFR, HER2 62
3.4 Ph°¢ng pháp theo dõi ti¿n trình phÁn ąng, tinh ch¿ và xác đßnh cÃu trúc sÁn
ph ¿m 62
3.4.1 Sắc ký lớp mßng 62 3.4.2 Sắc ký cột 62
Trang 113.4.3 Đo nhiệt độ nóng chảy 62
3.4.4 Ph°¡ng pháp phổ hồng ngoại (FTIR) 63
3.4.5 Ph°¡ng pháp khái phổ phân giải cao (HRMS) 63
3.4.6 Ph°¡ng pháp phổ cộng h°áng từ hạt nhân (NMR) 63
CH¯¡NG 4 K¾T QUÀ VÀ THÀO LUÂN 64
4.1 K ¿t quÁ tång hÿp hóa hác 64
4.1.1 Kết quả tổng hợp các dẫn xuất kết hợp benzimidazole/hydroxamate 64
4.1.2 Kết quả tổng hợp các dẫn xuất kết hợp quinazolinone/hydroxamate 74
4.1.3 Kết quả tổng hợp các dẫn xuất dị vòng kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 90
4.1.4 Kết quả tổng hợp các dẫn xuất dị vòng kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone 112
4.2 K ¿t quÁ đánh giá ho¿t tính sinh hác 119
4.2.1 Kết quả đánh giá hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất benzimidazole/hydroxamate và quinazolinone/hydroxamate 119
4.2.1.1 Hoạt tính gây độc tế bào ung th° in vitro 119
4.2.1.2 Hoạt tính āc chế enzyme HDAC in vitro 122
4.2.1.3 Kết quả docking phân tử trên các enzyme HDAC 123
4.2.2 Kết quả đánh giá hoạt tính kháng ung th° cÿa các dẫn xuất dị vòng kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole (43a-q) và (44a-s) 129
4.2.2.1 Kết quả đánh giá độc tính đái với tế bào ung th° in vitro 129
4.2.2.2 Kết quả đánh giá hoạt tính āc chế các protein hTS, HER2 và EGFR in silico cÿa các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 133
4.2.3 Kết quả đánh giá hoạt tính gây độc đái với tế bào in vitro cÿa các dẫn xuất dị vòng kết hợp 1,3,4-oxadiazole/quinazolinone/benzimidazole (45a-e) 137
CH¯¡NG 5 K¾T LUÂN VÀ ĐÀ XUÂT 140
5.1 K ¿t luÃn 140
5.2 ĐÁ xuÃt 141
DANH M ĀC CÁC CÔNG TRÌNH ĐÃ CÔNG Bà CĂA LUÂN ÁN 142
TÀI LI âU THAM KHÀO 143
PH Ā LĀC PL1
Trang 12DANH M ĀC BÀNG
Bảng 3.1: Các hóa chất sử dụng trong quá trình tổng hợp 45
Bảng 3.2: Các dụng cụ và thiết bị sử dụng trong tổng hợp 46
Bảng 4.1: Hiệu suất tổng hợp các dẫn xuất benzimidazole/hydroxamate 3a-k 68
Bảng 4.2: Tín hiệu proton cÿa dẫn xuất 3b 70
Bảng 4.3: Dữ liệu phổ nghiệm cÿa các dẫn xuất benzimodazole/hydroxamate (3a-k) 70 Bảng 4.4: Hiệu suất tổng hợp các dẫn xuất kết hợp quinazolinone/hydroxamate 81
Bảng 4.5: Tín hiệu proton cÿa dẫn xuất 12g 83
Bảng 4.6: Dữ liệu phổ các dẫn xuất quinazolinone/hydroxamate 84
Bảng 4.7: Hiệu suất tổng hợp các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 95
Bảng 4.8: Tín hiệu proton cÿa dẫn xuất 43h 98
Bảng 4.9: Dữ liệu phổ nghiệm cÿa các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 43a-q và 44a-s 98
Bảng 4.10: Hiệu suất tổng hợp các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone 45a-e 115
Bảng 4.11: Tín hiệu proton cÿa dẫn xuất 45b 116
Bảng 4.12: Dữ liệu phổ các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone 117
Bảng 4.13: Kết quả độc tính đái với dòng tế bào ung th° MCF-7 120
Bảng 4.14: Hoạt tính āc chế đái với 05 dòng tế bào ung th° cÿa dẫn xuất 3g và 12h 121
Bảng 4.15: Hoạt tính āc chế các enzyme HDAC cÿa hợp chất 12h và 3g 122
Bảng 4.16: Năng l°ợng docking cÿa hợp chất 3g và các t°¡ng tác hydrogen với các amino acid thiết yếu tại tâm hoạt động cÿa enzyme HDAC 124
Bảng 4.17: Kết quả docking cÿa hợp chất 12h và belinostat đái với các enzyme HDAC 127
Bảng 4.18: Độc tính đái với tế bào cÿa các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 130
Bảng 4.19: Năng l°ợng liên kết và t°¡ng tác kỵ n°ớc đ°ợc dự đoán cho phāc hợp phái tử-thụ thể 134
Bảng 4.20: Độc tính tế bào cÿa các chất 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone 138
Trang 13DANH M ĀC HÌNH
Hình 1.1: Một sá thuác điều trị ung th° hiện nay 1
Hình 1.2: Một sá cấu trúc dị vòng kết hợp có hoạt tính kháng ung th° 2
Hình 2.1: Cấu trúc cÿa reserpine và penicillin G 5
Hình 2.2: Cấu trúc các đồng phân cÿa oxadiazole 5
Hình 2.3: Cấu trúc một sá thuác có khung 1,3,4-oxadiazole 10
Hình 2.4: Các cấu trúc 1,3,4-oxadiazole kháng Staphylococcus aureus 11
Hình 2.5: Cấu trúc 1,3,4-oxadiazole có hoạt tính kháng khuẩn 11
Hình 2.6: Dẫn xuất 4-[5-(2-chlorophenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]benzenamine có hoạt tính kháng khuẩn 11
Hình 2.7: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole có hoạt tính kháng khuẩn và kháng nấm 12
Hình 2.8: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole có hoạt tính kháng lao 12
Hình 2.9: Dẫn xuất t°¡ng tự Raltegravir có khả năng kháng virus HIV-1 12
Hình 2.10: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole có tác dụng kháng virus HIV-1 13
Hình 2.11: Dẫn xuất t°¡ng tự Indinavir āc chế protease 13
Hình 2.12: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole āc chế tổng hợp DNA cÿa virus 13
Hình 2.13: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole có hoạt tính kháng virus HCV 14
Hình 2.14: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole kháng tế bào ung th° bạch cầu 14
Hình 2.15: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole kháng dòng tế bào ung th° NCI-60 14
Hình 2.16: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole kháng dòng tế bào UACC-62 và NCI-460 15
Hình 2.17: Dẫn xuất 2-(5-(benzylthio)-1,3,4-oxadiazol-2-yl)aniline kháng ung th° 15
Hình 2.18: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole chāa nhóm thế sulfonamide kháng ung th° 15
Hình 2.19: Cấu trúc cÿa imidazole và benzimidazole 16
Hình 2.20: Dẫn xuất benzimidazole có hoạt tính kháng lao 20
Hình 2.21: Các dẫn xuất benzimidazole có khả năng kháng nhiều chÿng vi khuẩn 20
Hình 2.22: Dẫn xuất actinonin chāa benzimidazole có hoạt tính kháng khuẩn 21
Hình 2.23: Dẫn xuất benzimidazole chāa nhóm thế methylthio kháng khuẩn 21
Hình 2.24: Dẫn xuất benzimidazole có nhóm thế tại N-1 có hoạt tính kháng khuẩn 21
Hình 2.25: Dẫn xuất benzimidazole có hoạt tính kháng virus HBV 22
Trang 14Hình 2.26: Dẫn xuất benzimidazole chāa amine dạng vòng có khả năng kháng virus
HIV 22
Hình 2.27: Dẫn xuất benzimidzole có tác dụng āc chế enzyme NS5B cÿa virus HCV22 Hình 2.28: Dẫn xuất benzimidazole kháng nhiều chÿng virus 22
Hình 2.29: Dẫn xuất benzimidazole có hoạt tính kháng virus CVB-3 và CVB-6 23
Hình 2.30: Dẫn xuất benzimidazole kháng dòng tế bào ung th° gan 23
Hình 2.31: Dẫn xuất benzimidazole kháng dòng tế bào ung th° bạch cầu 23
Hình 2.32: Dẫn xuất benzimidazole kháng nhiều dòng tế bào ung th° 24
Hình 2.33: Dẫn xuất benzimidazole kháng các dòng tế bào ung th° vú 24
Hình 2.34: Dẫn xuất benzimidazole āc chế sirtunin và kháng ung th° 24
Hình 2.35: Cấu trúc các dẫn xuất cÿa quinazolinone 25
Hình 2.36: Dẫn xuất quianzolinone có hoạt tính kháng khuẩn 30
Hình 2.37: Dẫn xuất quinazolinone có nhóm thế methylthio có hoạt tính kháng khuẩn 31
Hình 2.38: Dẫn xuất quinazolinone chāa khung triazole, oxadiazole có hoạt tính kháng khuẩn 31
Hình 2.39: Dẫn xuất quinazolinone nhạy với chÿng khuẩn S aureus và E coli 32
Hình 2.40: Dẫn xuất quinazolinone mang nhóm thế sulfonamide có hoạt tính kháng khuẩn 32
Hình 2.41: Dẫn xuất quinazolinone có hoạt tính kháng virus HIV 32
Hình 2.42: Dẫn xuất quinazolinone chāa nhóm thế benzalamino có khả năng kháng TMV 32
Hình 2.43: Dẫn xuất quinazolinone có hoạt tính kháng virus cúm A 33
Hình 2.44: Dẫn xuất quinazolinone kháng ung th° bạch cầu và ung th° ruột kết 33
Hình 2.45: Dẫn xuất quinazolinone mang nhóm thế sulfonamide kháng ung th° 33
Hình 2.46: Dẫn xuất quinazolinone kháng dòng tế bào HT29 và HCT116 34
Hình 2.47: Dẫn xuất quinazolinone kháng dòng tế bào MCF-7 và EGFR-TK 34
Hình 2.48: Dẫn xuất quinazolinone kháng dòng tế bào HCT116, MCF-7 và EGFR-TK 34
Hình 2.49: Cấu trúc chung cÿa chất āc chế HDAC và các chất āc chế HDAC loại hydroxamate đ°ợc FDA Hoa Kỳ cấp phép l°u hành 41
Hình 2.50: Các chất āc chế chọn lọc HDAC6 42
Trang 15Hình 3.1: Cấu trúc dẫn xuất benzimidazole/hydroxamate 47
Hình 3.2: Cấu trúc các dẫn xuất quinazolinone/hydroxamate 47
Hình 3.3: Cấu trúc các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 47
Hình 3.4: Cấu trúc các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone 48
Hình 4.1: Thiết kế cấu trúc và phân tích tổng hợp các dẫn xuất benzimidazole/hydroxamate 65
Hình 4.2: Thiết kế cấu trúc và phân tích tổng hợp các dẫn xuất hydroxamate mang khung quinazolinone nhắm mục tiêu HDAC6 75
Hình 4.3: Thiết kế cấu trúc khung kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 91
Hình 4.4: Thiết kế cấu trúc và phân tích tổng hợp các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/quinazolinone/benzimidazole 45 113
Hình 4.5: Cấu trúc thể hiện độc tính tát với dòng tế bào MCF-7 121
Hình 4.6: Hoạt tính āc chế các enzyme HDAC cÿa 12h và 3g 123
Hình 4.7: Mô hình Swiss cÿa HDAC11(A); Phân tích Ramachandran cÿa mô hình cấu trúc cÿa enzyme HAC11 (B) 124
Hình 4.8: Biểu đồ năng l°ợng t°¡ng tác dự đoán cÿa hợp chất 3g (đ°ßng màu xanh) so với belinostat (đ°ßng màu tím) với các enzyme HDAC 125
Hình 4.9: Cấu hình liên kết với HDAC6 cÿa hợp chất 3g (A) và belinostat (B) 126
Hình 4.10: Biểu đồ năng l°ợng t°¡ng tác dự đoán cÿa hợp chất 12h (đ°ßng màu vàng) so với belinostat (đ°ßng màu tím) đái với các enzyme HDAC 128
Hình 4.11: Cấu hình docking cÿa 12h và belinostat với HDAC6 (A) và HDAC11(B) 129
Hình 4.12: So sánh hoạt tính cÿa dẫn xuất 43i với các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole đã đ°ợc công bá 131
Hình 4.13: Đặc điểm cấu trúc thể hiện hoạt tính gây độc tế bào tiềm năng cÿa các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 133
Hình 4.14: Kết quả docking phân tử trên hTS, EGFR và HER2 (từ vùng thân n°ớc – màu xanh d°¡ng đến vùng kỵ n°ớc – màu nâu) 135
Hình 4.15: T°¡ng tác 2D cÿa hợp chất 43d tại các vị trí hoạt động t°¡ng āng cÿa hTS, EGFR và HER2 136
Hình 4.16: T°¡ng tác 2D cÿa hợp chất 43i tại các vị trí hoạt động t°¡ng āng cÿa hTS, EGFR và HER2 136
Trang 16Hình 4.17: T°¡ng tác 2D cÿa hợp chất 43b tại các vị trí hoạt động t°¡ng āng cÿa hTS, EGFR và HER2 136 Hình 4.18: T°¡ng tác 2D cÿa hợp chất 43e tại các vị trí hoạt động t°¡ng āng cÿa hTS, EGFR và HER2 137 Hình 4.19: T°¡ng tác 2D cÿa hợp chất 44h tại các vị trí hoạt động t°¡ng āng cÿa
hTS, EGFR và HER2 137 Hình 4.20: So sánh hoạt tính cÿa các dẫn xuất có cấu trúc t°¡ng đồng với hợp chất 45c 138
Trang 17DANH M ĀC S¡ Đâ
S¡ đồ 2.1: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole từ ethyl formate formylhydrazone 6
S¡ đồ 2.2: Các ph°¡ng pháp tổng hợp dẫn xuất 2,5-diaryl(alkyl)-1,3,4-oxadiazole 6
S¡ đồ 2.3: Tổng hợp các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole sử dụng POCl3 7
S¡ đồ 2.4: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole từ diacylhydrazide 7
S¡ đồ 2.5: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole sử dụng tác nhân CDI và Ph3P 7
S¡ đồ 2.6: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole sử dụng tác nhân Deoxo(-)Flour 8
S¡ đồ 2.7: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole sử dụng Cu(OTf)2 8
S¡ đồ 2.8: Tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole sử dụng tác nhân iodine 8
S¡ đồ 2.9: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole từ tetrazole với dung môi pyridine 8
S¡ đồ 2.10: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole từ tetrazole với dung môi o-xileno 9
S¡ đồ 2.11: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole-2-thiol 9
S¡ đồ 2.12: Tổng hợp dẫn xuất bis-(1,3,4-oxadiazole) 10
S¡ đồ 2.13: Tổng hợp 2,5 (hoặc 2,6)-dimethylbenzimidazole từ acetanilide 16
S¡ đồ 2.14: Các ph°¡ng pháp tổng hợp dị vòng benzimidazole 17
S¡ đồ 2.15: Tổng hợp dẫn xuất 2-aryl-1H-benzimidazole 17
S¡ đồ 2.16: Tổng hợp dẫn xuất benzimidazole bằng dioxane dibromide 17
S¡ đồ 2.17: Phản āng tổng hợp benzimidazole từ carboxylic acid 17
S¡ đồ 2.18: Tổng hợp dẫn xuất benzimidazole từ benzendiamine và lactic acid 18
S¡ đồ 2.19: Tổng hợp dẫn xuất benzimidazole bằng xúc tác c¡ kim 18
S¡ đồ 2.20: Tổng hợp dẫn xuất benzimidazole từ N''-phenyl-N'-tosylacatamidine 18
S¡ đồ 2.21: Tổng hợp benzimidazole từ tác nhân aryl amidine trong môi tr°ßng kiềm 19
S¡ đồ 2.22: Tổng hợp benzimidazole từ 2-haloaniline và aldehyde 19
S¡ đồ 2.23: Tổng hợp benzimidazole từ azidoaniline và aldehyde 19
S¡ đồ 2.24: Ph°¡ng pháp tổng hợp dẫn xuất quinazolinone 26
S¡ đồ 2.25: Tổng hợp dẫn xuất quinazolinone từ anthranilic acid và cyanogen 26
S¡ đồ 2.26: Phản āng Niementowski 26
S¡ đồ 2.27: Tổng hợp dẫn xuất 2,3-disubstituted quinazolin-4-one bằng vi sóng 26
S¡ đồ 2.28: S¡ đồ tổng hợp quinazolinone từ methyl antharanilate cÿa Phakhodee 27
Trang 18S¡ đồ 2.29: Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4(3H)-one mang nhóm thế trifluoromethyl
27
S¡ đồ 2.30: Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4-(3H)-one bằng tác nhân CuCl2 27
S¡ đồ 2.31: Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4(3H)-one với tác nhân FeCl3.6H2O 28
S¡ đồ 2.32: Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4-one từ tác nhân CuI2 28
S¡ đồ 2.33: Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4-one từ tác nhân p-TsOH và PIDA 28
S¡ đồ 2.34:Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4-one từ tác nhân oxy không khí 29
S¡ đồ 2.35: Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4-one bằng tác nhân H2O2 29
S¡ đồ 2.36: Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4-one với xúc tác ceric amoni nitrate 29
S¡ đồ 2.37: Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4-one với xúc tác Thiamine hydrochloride 30
S¡ đồ 2.38: Tổng hợp dẫn xuất quinazolin-4-one với xúc tác nano CuO 30
S¡ đồ 2.39: Tổng h¡p dị vòng kết hợp1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 35
S¡ đồ 2.40: Tổng hợp 5-aryl-2-amino-1,3,4-oxadiazole từ acylhydrazide và cyanogen bromide 36
S¡ đồ 2.41: Tổng hợp dẫn xuất chāa khung 1,3,4-oxadiazolylbenzimidazole 36
S¡ đồ 2.42: Tổng hợp dẫn xuất chāa khung oxadiazole/benzimidazole từ 4-(5(6)- substituted-1H-benzimidazol-2-yl)benzohydrazide 37
S¡ đồ 2.43: Tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/quinazolinone thông qua cầu nái ethylene 37
S¡ đồ 2.44: Tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/quinazolinone thông qua cầu nái thioether 38
S¡ đồ 2.45: Tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/quinazolinone 39
S¡ đồ 2.46: Tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/quinazolinone có cầu nái là dị vòng thiazole 39
S¡ đồ 3.1: Tổng hợp dẫn xuất benzimidazole/hydroxamate 49
S¡ đồ 3.2: Tổng hợp các dẫn xuất quinazolinone/hydroxamate 51
S¡ đồ 3.3: Tổng hợp các dẫn xuất quinazolinone/hydroxamate (13a-b) 52
S¡ đồ 3.4: Tổng hợp các dẫn xuất quinazolinone/hydroxamate (14a-c) 54
S¡ đồ 3.5: Tổng hợp các chất trung gian bezimidazole-2-carbaldehyde và benzimidazolylmethyl chloride 55
S¡ đồ 3.6: Tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 56
Trang 19S¡ đồ 3.7: Tổng hợp dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone
58
S¡ đồ 4.1: Quy trình tổng hợp các dẫn xuất N-benzyl o-phenilenediamine 65
S¡ đồ 4.2: Quy trình tổng hợp dẫn xuất kết hợp benzimidazole/hydroxamate 66
S¡ đồ 4.3: C¡ chế phản āng tổng hợp các dẫn xuất benzimidazolyl thiol 4a-g 67
S¡ đồ 4.4: Ph°¡ng pháp tổng hợp dị vòng quinazolinone 76
S¡ đồ 4.5: Quy trình tổng hợp các dẫn xuất 2-mercaptoquinazolinyl hydroxamate (12a-j) 77
S¡ đồ 4.6: C¡ chế phản āng tổng hợp dẫn xuất 2-mercaptoquinazolinone 78
S¡ đồ 4.7: Quy trình tổng hợp hai dẫn xuất kết hợp quinazolinone/hydroxamate 13a-b mang cầu nái dị vòng piperazine 79
S¡ đồ 4.8: C¡ chế phản āng ng°ng tụ ghép vòng tạo chất trung gian 24a-b 80
S¡ đồ 4.9: Quy trình tổng hợp các dẫn xuất quinazolinone/hydroxamate 14a-c 81
S¡ đồ 4.10: Ph°¡ng pháp tổng hợp dị vòng 1,3,4-oxadiazole 92
S¡ đồ 4.11: Thiết kế quy trình tổng hợp các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 92
S¡ đồ 4.12: Quy trình tổng hợp chất trung gian 37 và 38 93
S¡ đồ 4.13: C¡ chế phản āng đóng vòng tạo dẫn xuất benzimidazole 94
S¡ đồ 4.14: Quy trình tổng hợp các dẫn xuất kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole 94
S¡ đồ 4.15: C¡ chế phản āng tổng hợp các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole 96
S¡ đồ 4.16: Quy trình tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole/quinazolinone/benzimidazole 114
Trang 20DMSO-d6 Deuterated dimethylsulfoxide
FT-IR Fourrier Transformation Infrared spectroscopy
GI50 50 percent growth inhibition
1H-NMR Proton Nuclear Magnetic Resonance
HRMS High Resolution Mass Spectroscopy
Trang 21iPr Isopropyl
IC50 50 percent inhibitory concentration
mCPBA meta-Chloroperoxybenzoic acid
TFA Trifluoroacetic acid
TsOH p-Toluenesulfonic acid
TLC Thin Layer Chromatography
Trang 22CH¯¡NG 1 GIàI THIâU
1.1 Lý do chán đÁ tài
Ngày nay, bệnh ung th° đang gia tăng và đang là một trong những căn bệnh gây
tử vong hàng đầu trên thế giới cũng nh° á Việt Nam Nhiều thuác điều trị ung th° đã đ°ợc nghiên cāu và đ°a vào điều trị Trong thßi gian gần đây, các nghiên cāu tập trung vào thuác tác dụng chọn lọc á māc độ phân tử Nghiên cāu sinh lý bệnh học cÿa ung th° đã giúp tìm ra nhiều enzyme đóng vai trò quan trọng trong quá trình phát sinh, sinh tr°áng và phát triển cÿa tế bào ung th°, trong đó có các enzyme histone deacetylase (HDAC) hay các protein thymidylate synthase (TS), epidermal growth factor receptor (EGFR) và human epidermal growth factor receptor-2 (HER2)
Các hợp chất dị vòng, đặc biệt là dị vòng chāa nitrogen và oxygen đã và đang đ°ợc tập trung nghiên cāu nhiều vì những hoạt tính sinh học tiềm năng cÿa chúng, đặc biệt là hoạt tính kháng ung th° (Kumar et al., 2023) Nhiều loại thuác có cấu trúc chāa
dị vòng nitrogen và oxygen đã đ°ợc FDA (Hoa Kỳ) cấp phép dùng trong điều trị ung th°, điển hình nh° Isimertinib (āc chế EGFR tyrosine kinase), Lapatinib (āc chế HER2 và EGFR) và Methotrexate (āc chế thymidylate synthase và dihydrofolate reductase)
Hình 1.1: Một sá thuác điều trị ung th° hiện nay Trong sá các hợp chất dị vòng chāa nitrogen và oxygen có tiềm năng kháng ung th° thì các dị vòng 1,3,4-oxadiazole, benzimidazole và quinazolinone đ°ợc quan tâm nghiên cāu nhiều Để đạt đ°ợc những tác nhân kháng ung th° tiềm năng, các phân tử
hữu c¡ nhß có cấu trúc kết hợp cÿa hai hoặc nhiều đ¡n vị cấu trúc có hoạt tính kháng ung th° đ°ợc quan tâm nghiên cāu nhiều trong thßi gian gần đây, do các cấu trúc kết
Trang 23hợp này th°ßng có hoạt tính d°ợc lý mạnh h¡n, chọn lọc h¡n và có thể ít gây tác dụng phụ h¡n so với những cấu trúc riêng lẻ (Bosquesi et al., 2011) Cấu trúc kết hợp giữa khung 1,3,4-oxadiazole với khung imidazole (4) (Du et al., 2013), chalcone với
benzimidazole (5) (Oskuei et al., 2021) hay các cấu trúc kết hợp khung quinazolinone với khung benzimidazole (6) (Singla, et al., 2017) và (7) (Huang et al., 2020) là những
ví dụ về hợp chất dị vòng kết hợp chāa khung 1,3,4-oxadiazole, khung benzimidazole hay khung quinazolinone kết hợp với các dị vòng khác có hoạt tính kháng ung th° tiềm năng
Hình 1.2: Một sá cấu trúc dị vòng kết hợp có hoạt tính kháng ung th°
Tuy nhiên, việc nghiên cāu tổng hợp và đánh giá hoạt tính kháng ung th° cÿa các
cấu trúc dị vòng kết hợp chāa khung 1,3,4-oxadiazole với khung benzimidazole, đặc biệt là các cấu trúc kết hợp cả ba khung 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone ch°a đ°ợc nghiên cāu nhiều Dựa trên những hoạt tính kháng ung th° đã đ°ợc xác nhận cÿa khung 1,3,4-oxadiazole cũng nh° khung benzimidazole và quinazolinone, việc kết hợp các đặc điểm cấu trúc này vào trong cùng một phân tử hāa hẹn có thể tạo
ra các cấu trúc mới với hoạt tính kháng ung th° đ°ợc tăng c°ßng cũng nh° có thể khắc
phục một sá hạn chế cÿa những cấu trúc riêng lẻ nh° các tác dụng phụ không mong muán, tính kháng thuác,… Vì vậy, nghiên cāu <Tång hÿp và đánh giá ho¿t tính sinh
h ác các dÁn xuÃt dß vòng k¿t hÿp chąa khung 1,3,4-oxadiazole= là thực sự cần thiết
nhằm đa dạng hóa cấu trúc cÿa nhóm hợp chất dị vòng chāa khung 1,3,4-oxadiazole kết hợp với khung benzimidazole và quinazolinone, góp phần cung cấp nguồn nguyên liệu cho nghiên cāu sàng lọc và phát triển thuác mới, đặc biệt là thuác kháng ung th°
1.2 Māc đích nghiên cąu
- Thiết kế cấu trúc, quy trình tổng hợp và tổng hợp các dẫn xuất dị vòng kết hợp chāa khung 1,3,4-oxadiazole, benzimidazole và quinazolinone;
Trang 24- Đánh giá hoạt tính kháng ung th° in vitro và in silico cÿa các dẫn xuất tổng hợp đ°ợc
1.3 Nhiãm vā nghiên cąu
Thiết kế cấu trúc, quy trình tổng hợp và tổng hợp các dị vòng kết hợp
- Thiết kế cấu trúc, quy trình tổng hợp và tổng hợp các dẫn xuất mang các khung kết hợp benzimidazole/hydroxamate và quinazolinone/hydroxamate
- Thiết kế cấu trúc, quy trình tổng hợp và tổng hợp các dẫn xuất mang khung kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole
- Thiết kế cấu trúc, quy trình tổng hợp và tổng hợp các dẫn xuất dị vòng kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone
Xác định cấu trúc hóa học cÿa các dẫn xuất tổng hợp đ°ợc dựa trên các ph°¡ng pháp phổ nghiệm bao gồm HR-MS, FT-IR, 1H-NMR và 13C-NMR
Đánh giá hoạt tính kháng ung th° in vitro cÿa các dẫn xuất tổng hợp đ°ợc bao
gồm hoạt tính āc chế các enzyme HDAC (HDAC3, HDAC4, HDAC6, HDAC8, và HDAC11) và hoạt tính gây độc các dòng tế bào ung th° á ng°ßi (tế bào ung th° buồng trāng SKOV-3, ung th° vú MCF-7, MDA-MB-231, EMT6, ung th° gan Hepa1c1c7, ung th° não N2a, ung th° cổ tử cung HeLa, và ung th° phổi A549)
Đánh giá hoạt tính kháng ung th° in silico cÿa các dẫn xuất tổng hợp đ°ợc thông
qua nghiên cāu docking phân tử trên các enzyme mục tiêu HDAC3 (PDB ID: 4A69), HDAC4 (PDB ID: 4CBT), HDAC6 (PDB ID: 5EEI), HDAC8 (PDB ID: 1T67), HDAC11 (NCBI ID: NP-079103.2), hTS (PDB ID: 1HVY), EGFR (PDB ID: 2J6M)
và HER2 (PDB ID:3PP0)
1.4 Tính mái căa luÃn án
Đã thành công trong thiết kế cấu trúc, quy trình tổng hợp và tổng hợp đ°ợc 67 dẫn xuất dị vòng kết hợp mới dựa trên các khung 1,3,4-oxadiazole, benzimidazole và quinazolinone Các cấu trúc bao gồm các dẫn xuất kết hợp benzimidazole/hydroxamate (11 dẫn xuất), các dẫn xuất kết hợp quinazolinone/hydroxamate (15 dẫn xuất), các dẫn xuất kết hợp hai khung dị vòng 1,3,4 oxadiazole/benzimidazole (36 dẫn xuất) và các dẫn xuất kết hợp ba khung dị vòng 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone (05 dẫn xuất)
Kết quả đánh giá tiềm năng kháng ung th° in vitro cÿa các hợp chất mới tổng
hợp đ°ợc đã xác định đ°ợc bảy (07) cấu trúc hit làm c¡ sá cho các nghiên cāu tiếp theo nhằm phát triển thuác kháng ung th° mới Các cấu trúc hit tìm đ°ợc bao gồm:
▪ Hai (02) cấu trúc mang khung benzimidazole/hydroxamate (12h) và quinazolinone/hydroxamate (7g) thể hiện độc tính tát trên 06 dòng tế bào
ung th° á ng°ßi (tế bào ung th° buồng trāng SKOV-3, ung th° vú MCF-7,
Trang 25MDA-MB-231, EMT6, ung th° gan Hepa1c1c7 và ung th° tế bào não N2a) và khả năng āc chế chọn lọc enzyme HDAC6 tát t°¡ng đ°¡ng chất đái chāng d°¡ng belinostat
▪ Ba (03) cấu trúc mang khung kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole,
trong đó 01 cấu trúc (43b) thể hiện độc tính đái với dòng tế bào ung th°
MCF-7 và 02 cấu trúc (43d và 43i) thể hiện độc tính đái với cả 03 dòng tế
bào ung th° HeLa, MCF-7 và A549 tát t°¡ng đ°¡ng chất đái chāng d°¡ng 5-FU
▪ Hai (02) cấu trúc mang đặc điểm kết hợp cả ba khung
1,3,4-oxadiazole/benzimidazole/quinazolinone (44a và 44c) thể hiện độc tính
cao gấp 5-13.5 lần so với chất đái chāng d°¡ng 5-FU đái với dòng tế bào MCF-7
Āng dụng ph°¡ng pháp tiếp cận in silico bằng mô hình docking phân tử góp phần làm rõ thêm kết quả đánh giá hoạt tính kháng ung th° in vitro cÿa các hợp chất hit mang khung benzimidazole/hydroxamate, quinazolinone/hydroxamate và khung dị vòng kết hợp 1,3,4-oxadiazole/benzimidazole
1.5 CÃu trúc căa luÃn án
Ch°¡ng 1 Giới thiệu: Trình bày lý do chọn đề tài, mục đích và nhiệm vụ nghiên cāu, tính mới cÿa luận án
Ch°¡ng 2 Tổng quan tài liệu: Trình bày một sá ph°¡ng pháp tổng hợp và hoạt tính sinh học cÿa các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole, benzimidazole, quinazolinone và các dẫn xuất dị vòng kết hợp chāa khung 1,3,4-oxadiazole
Ch°¡ng 3 Ph°¡ng pháp nghiên cāu: Trình bày các ph°¡ng pháp nghiên cāu đ°ợc thực hiện trong luận án bao gồm các ph°¡ng pháp tổng hợp các dẫn xuất, ph°¡ng pháp đánh giá hoạt tính sinh học và xây dựng mô hình mô tả docking phân tử Ch°¡ng 4 Kết quả và thảo luận: Trình bày các kết quả nghiên cāu và thảo luận kết quả nghiên cāu cÿa luận án bao gồm kết quả tổng hợp các dẫn xuất, kết quả đánh giá hoạt tính sinh học và kết quả docking phân tử
Ch°¡ng 5 Kết luận và đề xuât: Trình bày các kết luận cÿa luận án và đề xuất một
sá nội dung cho các h°ớng nghiên cāu tiếp theo
Trang 26CH¯¡NG 2 TäNG QUAN TÀI LIâU
Hợp chất dị vòng là các hợp chất mạch vòng có một hoặc nhiều dị nguyên tá (nguyên tá khác carbon và hydrogen) trong cấu trúc, ví dụ nh° nguyên tá oxygen, nitrogen hay sulfur Ngày nay, các hợp chất dị vòng có nhiều āng dụng trong cuộc sáng, đ°ợc sử dụng phổ biến trong nhiều ngành công nghiệp nh° hóa d°ợc, d°ợc phẩm, hóa chất hay nông nghiệp xanh, hay đ°ợc sử dụng để tổng hợp các chất hữu c¡ khác Trong sá các hợp chất dị vòng đ°ợc biết thì các dị vòng chāa nguyên tá nitrogen
và oxygen đ°ợc āng dụng phổ biến để sản xuất d°ợc phẩm Đa sá các thuác sử dụng trên thị tr°ßng hiện nay trong cấu trúc đều có dị vòng chāa nitrogen và oxygen Một sá thuác có nguồn gác ly trích từ tự nhiên mang dị vòng nitrogen nh° kháng sinh nhóm
Penicillin, Cephalosporin, Vinblastine, Reserpine (Pragi et al., 2012)
Hình 2.1: Cấu trúc cÿa reserpine và penicillin G
2.1 Hÿp chÃt dß vòng 1,3,4-oxadiazole
2.1 1 Giái thiãu chung vÁ hÿp chÃt dß vòng 1,3,4-oxadiazole
Oxadiazole là một hợp chất dị vòng th¡m thuộc họ azole Xét về mặt cấu trúc
oxadiazole có thể đ°ợc xem nh° một dẫn xuất từ dị vòng furane (1) nh°ng thay thế hai
nhóm (−CH=) bằng hai nguyên tử nitrogen loại pyridine (−N=) Công thāc phân tử là
C2H2N2O t°¡ng āng với bán đồng phân tùy thuộc vào vị trí cÿa nguyên tử nitrogen
trên vòng là 1,3,4-oxadiazole (2); 1,2,3-oxadiazole (3); 1,2,4-oxadiazole (4) và
1,2,5-oxadiazole (5) (Patel et al., 2014)
Hình 2.2: Cấu trúc các đồng phân cÿa oxadiazole Đồng phân 1,3,4-oxadiazole là đồng phân duy nhất không chāa liên kết oxygen-nitrogen Trong bán đồng phân cÿa oxadiazole, các nhà nghiên cāu th°ßng tập trung
Trang 27vào các đồng phân 1,3,4-oxadiazole và 1,2,4-oxadiazole vì tiềm năng về hoạt tính sinh học mà hai dẫn xuất này có đ°ợc (De Oliveira et al., 2012)
Trong tự nhiên, hợp chất 1,3,4-oxadiazole th°ßng tồn tại d°ới dạng chất lßng, có nhiệt độ sôi á 150 ºC Trong cấu trúc cÿa 1,3,4-oxadiazole không tồn tại bất kỳ liên kết
có khả năng xoay tự do Các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole mang nhóm thế á vị trí C2, C5
th°ßng không màu (Somani et al., 2011)
2.1 2 Các ph°¢ng pháp tång hÿp các dÁn xuÃt 1,3,4-oxadiazole
Năm 1965, Ainsworth lần đầu tiên tổng hợp dị vòng 1,3,4-oxadiazole bằng
ph°¡ng pháp nhiệt phân ethyl formate formylhydrazone 6 á áp suất khí quyển Phản
āng đóng vai trò c¡ sá trong tổng hợp dị vòng 1,3,4-oxadiazole với tác chất là ethyl formate formylhydrazone (S¡ đồ 2.1) Tuy nhiên, đây là dạng tổng hợp dị vòng đ¡n, khó có thể phát triển thêm nhóm thế trên dị vòng từ phản āng này (Ainsworth, 1965)
S¡ đồ 2.1: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole từ ethyl formate formylhydrazone
biến khác cũng đ°ợc sử dụng nh° sulfuric acid, phosphoric acid, trifluoroacetic acid, phosphorus pentachloride, phosphorus pentoxide hay thionyl chloride Ngoài ra, các
Trang 28dẫn xuất 2,5-diaryl(alkyl)-1,3,4-oxadiazole cũng đ°ợc tổng hợp dựa trên phản āng
ng°ng tụ giữa acylhydrazide với carboxylic acid (con đ°ßng c), hay phản āng oxy hóa đóng vòng cÿa acylhydrazone (con đ°ßng b) và phản āng cÿa dẫn xuất tetrazole với acid chloride (con đ°ßng d)
Năm 2003, Zheng đã sử dụng ph°¡ng pháp dehydrate hóa dẫn xuất
1,2-diacylhydrazine (9) sử dụng tác nhân POCl3 thu đ°ợc các dẫn xuất
2,5-disubstituted-1,3,4-oxadiazole (10) với hiệu suất rất cao (74-96%) (S¡ đồ 2.3) Tuy nhiên, ph°¡ng
pháp này đòi hßi tổng hợp chất trung gian 1,2-diacylhydrazine (9) từ tác nhân acid
chloride khá độc và giai đoạn đóng vòng tạo sản phẩm 1,3,4-oxadiazole bằng POCl3
khá nguy hiểm nên rất khó thực hiện (Zheng et al., 2003)
S¡ đồ 2.3: Tổng hợp các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole sử dụng POCl3
Năm 2007, Martin cũng đã sử dụng ph°¡ng pháp dehydrate hóa dẫn xuất
1,2-diacylhydrazide (11) bằng tác nhân thionyl chloride (SOCl2) với hiệu suất đạt từ 55% đến 80% (S¡ đồ 2.4) Phản āng sử dụng tác nhân dehydrate hóa là SOCl2 t°¡ng
đái độc nên đòi hßi sự cẩn thận trong quá trình thực hiện và theo dõi phản āng (Martin
et al., 2007)
S¡ đồ 2.4: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole từ diacylhydrazide
Năm 2006, Rajapakse đã tổng hợp thành công các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole từ
phản āng giữa carboxylic acid (13) và benzohydrazide (14) sử dụng tác nhân
1,1'-carbonyldiimidazole (CDI) và triphenylphosphine (Ph3P) (S¡ đồ 2.5) Hiệu suất thu
đ°ợc khá tát (52-73%) Tuy nhiên, tác nhân CDI khá đắt tiền và rất độc (Rajapaks et
al., 2006)
S¡ đồ 2.5: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole sử dụng tác nhân CDI và Ph3P
Trang 29T°¡ng tự công trình cÿa Rajapakse, Kangani (2006) cũng đã công bá quy trình tổng hợp các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole từ các tác chất là carboxylic acid và benzohydrazide nh°ng sử dụng tác nhân Deoxo-Fluor (S¡ đồ 2.6) Mặc dù hiệu suất tổng hợp đạt đ°ợc rất cao (79-95%) nh°ng ph°¡ng pháp này cũng có hạn chế là tác nhân Deoxo-Fluor khá đắt tiền và độc tính khá cao
S¡ đồ 2.6: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole sử dụng tác nhân Deoxo(-)Flour
Năm 2011, Guin cùng cộng sự sử dụng xúc tác Cu(OTf)2 để tổng hợp khung 1,3,4-oxadiazole từ N-arylidenearoylhydrazide (19) và base Cs2CO3 với hiệu suất đạt 85% (S¡ đồ 2.7) Do Cs2CO3 khá đắt tiền nên nghiên cāu này cũng cho biết có thể thay thế bằng các base khác nh° K2CO3 (Guin et al., 2011)
S¡ đồ 2.7: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole sử dụng Cu(OTf)2
Năm 2013, Yu và cộng sự đã tổng hợp thành công dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole bằng tác nhân oxy hóa iodine (I2) trong môi tr°ßng base (S¡ đồ 2.8) Các base đ°ợc nghiên cāu sử dụng bao gồm K2CO3, Cs2CO3, NEt3 và DBU Hiệu suất phản āng khá cao và điều kiện phản āng t°¡ng đái dễ thực hiện Tác nhân I2 rẻ tiền và khá thân thiện
với môi tr°ßng (Yu et al., 2013)
S¡ đồ 2.8: Tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole sử dụng tác nhân iodine
Năm 2000, Jiang đã tổng hợp thành công các dẫn xuất
2,5-diaryl-1,3,4-oxadiazole từ 4-methoxyphenyltetrazole (22) và 4-tert-butylbenzoyl chloride (23) sử
dụng dung môi pyridine (S¡ đồ 2.9) Quy trình tổng hợp đạt hiệu suất rất cao (96%)
(Jiang et al., 2000)
S¡ đồ 2.9: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole từ tetrazole với dung môi pyridine
Trang 30Năm 2004, Baranov đã tổng hợp thành công khung 1,3,4-oxadiazole từ tác nhân
tetrazole và dẫn xuất acid chloride trong dung môi o-xilene (S¡ đồ 2.10) Hiệu suất
tổng hợp đạt đ°ợc rất cao (93%) trong điều kiện phản āng êm dịu và dễ thực hiện
(Baranov et al., 2004)
S¡ đồ 2.10: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole từ tetrazole với dung môi o-xileno
Nhìn chung, các ph°¡ng pháp tổng hợp các dẫn xuất oxadiazole khá phong phú và đa dạng và trong đa sá tr°ßng hợp đều cho hiệu suất khá cao Trong sá đó, phổ biến nhất là sự ng°ng tụ giữa các tác nhân acylhydrazone sử dụng các chất oxy hóa khác nhau Tuy nhiên, đa sá các tr°ßng hợp đều dùng các loại xúc tác đắt tiền, hoặc xúc tác kim loại trong khi I2 đ°ợc biết đến là một tác nhân oxy hóa phổ biến và ít độc Vì vậy, việc sử dụng I2 làm tác nhân oxy hóa trong phản āng đóng vòng tạo khung 1,3,4-oxadiazole là khả thi và có thể khảo sát thực hiện
2,5-diaryl(alkyl)-1,3,4-2.1.2.2 Ph°¢ng pháp tång hÿp dÁn xuÃt 1,3,4-oxadiazole-2-thiol
Các hợp chất 1,3,4-oxadiazole mang nhóm thế thiol tại vị trí C-2 có thể phát triển thành các hợp chất dị vòng kết hợp thông qua cầu nái thioether có tiềm năng kháng khuẩn, kháng ung th° (Vani, 2016 và Hassanzadeh, 2019) Con đ°ßng chính để tổng hợp các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole-2-thiol(thione) là phản āng giữa acylhydrazide và carbon disulfide (CS2) trong môi tr°ßng kiềm (S¡ đồ 2.11) Nhiều dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole đ°ợc tổng hợp bằng ph°¡ng pháp này trong những năm gần đây Cấu trúc sản phẩm có thể tồn tại dạng tautomer hóa giữa thiol-thione Ph°¡ng pháp tổng hợp dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole mang cầu nái thiol là ph°¡ng pháp phù hợp trong định h°ớng thực hiện tổng hợp các dẫn xuất mang khung kết hợp chāa nhân 1,3,4-oxadiazole
S¡ đồ 2.11: Tổng hợp 1,3,4-oxadiazole-2-thiol
Năm 2002, Maslat và cộng sự đã tổng hợp các dẫn xuất bis-(1,3,4-oxadiazole)
bằng phản āng giữa dihydrazide (31) với carbon disulfide trong môi tr°ßng kiềm
(dung dịch KOH trong ethanol) (S¡ đồ 2.12) Sản phẩm thu đ°ợc đạt hiệu suất khá cao (75%) Phản āng tổng hợp này cho thấy tiềm năng phát triển các nhóm thế khác nhau trên nhân 1,3,4-oxadiazole thông qua cầu nái thioether Tuy nhiên, tác nhân carbon
Trang 31disulfide khá độc nên cần rất cẩn thận khi thực hiện phản āng này (Maslat et al.,
2002)
S¡ đồ 2.12: Tổng hợp dẫn xuất bis-(1,3,4-oxadiazole)
2.1 3 Ho¿t tính sinh hác căa các dÁn xuÃt 1,3,4-oxadiazole
Các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole đ°ợc āng dụng rộng rãi trong ngành hóa d°ợc bái
dị vòng này có nhiều hoạt tính đáng quý bao gồm hoạt tính giảm đau, cháng viêm
(Manjunatha et al., 2010), hạ huyết áp (Lelyukh et al., 2020), cháng co giật (Kashaw
et al , 2010), đặc biệt là kháng khuẩn, kháng nấm (Kumar et al., 2010), kháng virus (Johns et al., 2009) và kháng ung th° (Liu et al., 2012), Một sá thuác dùng trong trị
liệu có cấu trúc chāa nhân 1,3,4-oxadiazole (Hình 2.3) nh°: Tiodazosin (dùng trong điều trị cao huyết áp hay các triệu chāng hậu chấn tâm lý), Zibotentan (thuác điều trị ung th°), Furamizole (kháng sinh), Nesapadil (thuác chẹn kênh calci), Raltegrvir
(kháng virus) (Paruch et al., 2020)
Hình 2.3: Cấu trúc một sá thuác có khung 1,3,4-oxadiazole
2.1.3.1 Ho¿t tính kháng khu¿n căa các dÁn xuÃt 1,3,4-oxadiazole
Năm 2012, De Oliveira đã công bá hoạt tính cháng tụ cầu (Staphylococcus aureus) đề kháng methicillin và amino glycoside cÿa các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazoline
33-37 (Hình 2.4) Giá trị MIC cÿa các hợp chất từ 4 ¿g/mL đến 32 ¿g/mL, mạnh gấp
2–8 lần so với chất đái chāng d°¡ng Chloramphenicol (De Oliveira et al., 2012)
Trang 32Hình 2.4: Các cấu trúc 1,3,4-oxadiazole kháng Staphylococcus aureus
Năm 2002, _ahin đã tổng hợp và đánh giá hoạt tính kháng khuẩn cÿa các dẫn
xuất 1,3,4-oxadiazole mang nhóm thế 1-/2-naphtyloxymetyl 38 (Hình 2.5) Tất cả các
hợp chất đều có hoạt tính kháng S aureus, E coli, P aeruginosa, C albicans và C parapsilosis với giá trị MIC trong khoảng 64-256 ¿g/mL (_ahin et al., 2002)
Hình 2.5: Cấu trúc 1,3,4-oxadiazole có hoạt tính kháng khuẩn
Năm 2010, Patel đã đánh giá hoạt tính kháng khuẩn cÿa dẫn xuất
4-[5-(2-chlorophenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]benzenamine 39 trên một sá chÿng vi
khuẩn Gram d°¡ng (S aureus và S pyogenes) và Gram âm (E coli và P aeruginosa),
sử dụng Ampicillin làm chất đái chāng d°¡ng (Hình 2.6) Kết quả cho thấy hợp chất
khảo sát có hoạt tính mạnh h¡n Ampicilin khoảng 2 đến 5 lần (Patel et al., 2010)
Hình 2.6: Dẫn xuất 4-[5-(2-chlorophenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]benzenamine
có hoạt tính kháng khuẩn
Nghiên cāu hoạt tính kháng khuẩn và kháng nấm cÿa hợp chất 40 và 41 (Hình
2.7) cho thấy cả hai hợp chất này đều có khả năng kháng hai chÿng vi khuẩn Gram
d°¡ng (Streptococcus aureus và Bacillus subtilis) và hai chÿng vi khuẩn Gram âm (Klebsiella pneumoniae và Escherichia coli) và hai loài nấm (Aspergillus Niger và
C Pannical) Các thử nghiệm cho thấy các hoạt tính gần nh° t°¡ng đ°¡ng với các
chất đái chāng d°¡ng dùng trong điều trị nh° Streptomycin và Griseofulvin (Kumar et
al., 2011)
Trang 33Hình 2.7: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole có hoạt tính kháng khuẩn và kháng nấm
Hợp chất 42 (Hình 2.8) thể hiện hoạt tính kháng Mycobacterium tuberculosis
H37RV á nồng độ āc chế tái thiểu là 6.25 ¿g/mL (Yar, 2007) Hoạt tính kháng Mycobacterium tuberculosis H37RV cũng đ°ợc Kumar và cộng sự nghiên cāu đái với
một loạt các dẫn xuất oxadiazole 43 chāa nhóm thiazole Dẫn xuất chāa nhóm Cl trên
vòng benzene cÿa hợp chất 43 cho kết quả tát, với nồng độ āc chế tái thiểu là 4 ¿g/mL
(Kumar et al., 2010)
Hình 2.8: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole có hoạt tính kháng lao
2.1 3.2 Ho¿t tính kháng virus căa các dÁn xuÃt 1,3,4-oxadiazole
Raltegravir (Hình 2.9) là thuác có cấu trúc chāa khung 1,3,4-oxadizole có tác dụng kháng retrovirus HIV-1 bằng cách āc chế enzyme integrase (Temesgen, 2008) Dựa trên cấu trúc Raltegravir, Wang và cộng sự đã tổng hợp một loạt các dẫn xuất
Raltegravir (44) bằng cách sửa đổi nhóm 5-hydroxy trên vòng pyrimidine và đánh giá
hoạt tính kháng virus HIV Sự biến đổi cấu trúc này đã làm tăng đáng kể hoạt tính cÿa các hợp chất Cấu trúc hợp chất mang nhóm thế benzoyl với giá trị IC50 d°ới picomolar là chất kháng virus HIV mạnh nhất trong sá tất cả các dẫn xuất đ°ợc tổng
hợp và đ°ợc xem là dẫn xuất tiềm năng kháng HIV mới và mạnh (Wang et al., 2012)
Hình 2.9: Dẫn xuất t°¡ng tự Raltegravir có khả năng kháng virus HIV-1
Hoạt tính āc chế virus HIV-1 cÿa các hợp chất 45 và 46 (Hình 2.10) đ°ợc xác
định bằng cách sử dụng thử nghiệm XTT trên tế bào MT-4 Hợp chất 46 với nhóm R =
Cl có hoạt tính mạnh nhất trong sá các hợp chất đ°ợc thử nghiệm với phần trăm āc
chế là 62%, 21% và 14% á các nồng độ lần l°ợt là 50, 25 và 5 ¿g/mL (Iqbal et al.,
2006)
Trang 34Hình 2.10: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole có tác dụng kháng virus HIV-1
Indinavir, một chất āc chế protease khác cũng đ°ợc sử dụng nh° một thành phần cÿa liệu pháp kháng virus để điều trị nhiễm HIV và AIDS (Hình 2.11) Kim và cộng sự
đã tổng hợp và đánh giá hoạt tính āc chế protease cÿa một loạt các dẫn xuất oxadiazole
47 có cấu trúc t°¡ng tự nh° Indinavir Tất cả các hợp chất điều chế đ°ợc đều āc chế hoạt tính cÿa protease á nồng độ picomolar (IC50), mạnh h¡n Indinavir (Kim et al.,
cÿa vòng quinolone cho thấy tiềm năng āc chế protease NS3 cÿa virus viêm gan siêu
vi C với IC50 = 12 nM và EC50 = 200 nM (Llinàs-Brunet et al., 2004)
Trang 35Hình 2.13: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole có hoạt tính kháng virus HCV
2.1 3.3 Ho¿t tính kháng ung th° căa các dÁn xuÃt 1,3,4-oxadiazole
Hợp chất 50 (Hình 2.14) đã đ°ợc tổng hợp và xác định hoạt tính cháng lại tế bào
bệnh bạch cầu á ng°ßi (dòng HL-60) bằng thử nghiệm MTT với giá trị IC50 tìm đ°ợc
là 17.33 ¿M (Shamsuzzaman et al., 2012)
Hình 2.14: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole kháng tế bào ung th° bạch cầu
Một sá dẫn xuất phenylene
2-chloro-1,4-bis-(1,3,4-oxadiazol-2-ylmethyleneoxy)phenylene 51a-b (Hình 2.15) có hoạt tính kháng ung th° in vitro trên
dòng tế bào NCI-60 Đây là dòng tế bào ung th° á ng°ßi thuộc các loại ung th° khác nhau bao gồm bệnh bạch cầu, ruột kết, thần kinh trung °¡ng, phổi, khái u ác tính, buồng trāng và ung th° vú Hai hợp chất này cho thấy hoạt tính đáng kể cháng lại
nhiều dòng tế bào ung th° á nồng độ nhß h¡n 100 ¿M, đặc biệt hợp chất 51b āc chế
các dòng tế bào HL-60, RPMI-8226, SR và UACC-62 á nồng độ GI50 lần l°ợt là 3.52, 9.51, 0.03 và 4.65 ¿M (Holla et al., 2005)
Hình 2.15: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole kháng dòng tế bào ung th° NCI-60
Hợp chất 52 (Hình 2.16) đã đ°ợc tổng hợp và đánh giá hoạt tính kháng ung th°
Kết quả cho thấy hợp chất này thể hiện hoạt tính mạnh trên các dòng tế bào UACC-62
và NCI-460 với nồng độ GI50 lần l°ợt là 0.88 và 1.01 mmol/L (Savariz et al., 2010)
Trang 36Hình 2.16: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole kháng dòng tế bào UACC-62 và NCI-460 Dẫn xuất 2-(benzylthio)-5-aryloxadiazole 53 (Hình 2.17) cho thấy hoạt tính āc chế các dòng tế bào MCF-7 và EGFR với nồng độ āc chế IC50 lần l°ợt là 1.09 ¿M và 1.51 ¿M (Liu et al., 2012)
Hình 2.17: Dẫn xuất 2-(5-(benzylthio)-1,3,4-oxadiazol-2-yl)aniline kháng ung th° Các dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole 54 (Hình 2.18) mang nhóm thế sulfonamide thể hiện hoạt tính kháng các dòng tế bào ung th° á ng°ßi NCI-58 cÿa 9 loại ung th° khác nhau trong thử nghiệm in vitro Hợp chất mang nhóm p-methoxy benzene sulfonamido
cho thấy giá trị phần trăm āc chế trung bình cao nhất trong 58 dòng tế bào á nồng độ
10 ¿M Đặc biệt hợp chất mang nhóm thế R1 = Cl, R2 = 4-OMe-Ph āc chế các dòng tế
bào ung th° SR, SK-MEL-5, UACC-257, T-47D, MDA-MB-468 á nồng độ 10 ¿M với phần trăm āc chế lần l°ợt là 81.6%, 84.3%, 76.7%, 90.5%, 84.8% (El-Din et al.,
2015)
Hình 2.18: Dẫn xuất 1,3,4-oxadiazole chāa nhóm thế sulfonamide kháng ung th°
2.2 Hÿp chÃt dß vòng benzimidazole
2.2 1 Giái thiãu chung vÁ hÿp chÃt dß vòng benzimidazole
Benzimidazole (còn đ°ợc gọi 1H-benzo[d]imidazole hay 1,3-benzodiazole) là
loại hợp chất hữu c¡ dị vòng th¡m đ°ợc cấu thành từ một dị vòng imidazole ng°ng tụ
với một vòng benzene tại vị trí 4 và 5 trên vòng imidazole (Hình 2.19) (Ingle et al.,
2011)
Trang 37Benzimidazole là một phần cÿa cấu trúc vitamin B12 Hiện nay cấu trúc dị vòng này đang đ°ợc nghiên cāu rất nhiều trong thiết kế tổng hợp thuác mới do có phổ hoạt tính sinh học khá rộng, bao gồm hoạt tính kháng viêm, kháng nấm, kháng oxy hóa
cũng nh° kháng ung th° (Keri et al., 2015 và Kaur et al., 2010) Dẫn xuất
benzimidazole cũng đ°ợc tìm thấy trong những ph°¡ng pháp điều trị nấm, cháng nhiễm trùng, kháng virus (Hue, B T B., 2020)
Hình 2.19: Cấu trúc cÿa imidazole và benzimidazole Benzimidazole th°ßng á dạng chất rắn, có nhiệt độ nóng chảy cao (khoảng
170 oC) Các benzimidazole th°ßng tan trong dung môi phân cực và ít tan trong các dung môi hữu c¡ kém phân cực Benzimidazole tan trong n°ớc nóng nh°ng khó tan
trong ether và không tan trong benzene và ligroin (Wright et al., 1951)
2.2 2 Các ph°¢ng pháp tång hÿp dÁn xuÃt benzimidazole
Các phản āng cÿa Hoebrecker và Ladenburg thực hiện vào thế kỉ XIX là những phản āng đầu tiên trong nghiên cāu tổng hợp các hợp chất dị vòng benzimidazole,
theo đó các dẫn xuất 2,5-dimethylbenzimidazole (57) đ°ợc tổng hợp thông qua quy
trình hai b°ớc bao gồm khử và dehydrate hóa 2-nitro-4-methylacetanilide (55)
(Hoebrecker, 1872) Quy trình tổng hợp nh° sau theo đ°ợc trình bày trong S¡ đồ 2.13
S¡ đồ 2.13: Tổng hợp 2,5 (hoặc 2,6)-dimethylbenzimidazole từ acetanilide
Hiện nay, nhiều ph°¡ng pháp tổng hợp dẫn xuất benzimidazole đã đ°ợc phát triển thành công từ nhiều loại tác chất và sử dụng nhiều loại tác nhân phản āng khác nhau Các ph°¡ng pháp này có thể đ°ợc tóm tắt nh° trong S¡ đồ 2.14 Theo đó, ph°¡ng pháp phổ biến để tổng hợp dị vòng benzimidazole là phản āng ng°ng tụ giữa
o-phenylenediamine với các tác nhân thân điện tử nh° aldehyde, carboxylic acid hay
các dẫn xuất cÿa carboxylic acid sử dụng các chất oxy hóa khác nhau (con đ°ßng a)
Ngoài ra, các dẫn xuất benzimidazole cũng có thể đ°ợc tổng hợp từ sự ng°ng tụ giữa 2-haloaniline (azidoaniline) và aldehyde (con đ°ßng b) hay từ aryl amidine (con
đ°ßng c)
Trang 38S¡ đồ 2.14: Các ph°¡ng pháp tổng hợp dị vòng benzimidazole
2.2.2.1 Tång hÿp benzimidazole tć o-phenylenediamine
Năm 2009, Lopez tổng hợp dẫn xuất 2-aryl-1H-benzimidazole sử dụng tác nhân
oxy hóa hydrogen sulfite (NaHSO3) đạt hiệu suất từ 62 đến 95% (S¡ đồ 2.15) Thßi gian thực hiện phản āng ngắn (khoảng 10 phút) với sự hỗ trợ cÿa vi sóng thay vì gia
nhiệt cổ điển (Lopez et al., 2009)
S¡ đồ 2.15: Tổng hợp dẫn xuất 2-aryl-1H-benzimidazole
Năm 2014, Birajdar và cộng sự đã thực hiện phản āng giữa o-phenylenediamine
và aldehyde tạo thành dẫn xuất benzimidazole có nhóm thế á vị trí C-2 (S¡ đồ 2.16) Quá trình oxy hóa/đóng vòng diễn ra trong sự có mặt cÿa dioxane dibromide trong dung môi acetonitrile với thßi gian phản āng 30-60 phút á nhiệt độ phòng (Birajdar et
al., 2014)
S¡ đồ 2.16: Tổng hợp dẫn xuất benzimidazole bằng dioxane dibromide
Năm 2015, Rithe đã tổng hợp thành công nhiều dẫn xuất benzimidazole với hiệu suất cao bằng cách cho benzen-1,2-diamine phản āng với nhiều dẫn xuất carboxylic acid mang các nhóm thế khác nhau (S¡ đồ 2.17) Các phản āng đ°ợc thực hiện trong
điều kiện gia nhiệt cổ điển (Rithe et al., 2015)
S¡ đồ 2.17: Phản āng tổng hợp benzimidazole từ carboxylic acid
Trang 39Năm 2015, Meshram đã tổng hợp thành công dẫn xuất benzimidazole dựa trên
phản āng giữa o-phenylenediamine và lactic acid trong trong môi tr°ßng acid HCl 4N
(S¡ đồ 2.18) (Meshram et al., 2015)
S¡ đồ 2.18: Tổng hợp dẫn xuất benzimidazole từ benzendiamine và lactic acid Năm 2020, Sankar đã tổng hợp thành công nhiều dẫn xuất benzimidazole với hiệu suất cao bằng cách cho benzen-1,2-diamine phản āng với nhiều loại aldehyde khác nhau (S¡ đồ 2.19) Các phản āng đ°ợc thực hiện trong điều kiện gia nhiệt với sự xúc tác cÿa hợp chất khung c¡ kim NH2-MIL-125(Ti) MOF (Sankar et al., 2020)
S¡ đồ 2.19: Tổng hợp dẫn xuất benzimidazole bằng xúc tác c¡ kim
Có thể thấy, các ph°¡ng pháp tổng hợp dị vòng benzimidazole đ°ợc thực hiện do
sự ng°ng tụ giữa benzenediamine và các tác nhân thân điện tử có sự tham gia cÿa các chất oxy hóa khác nhau đều cho hiệu suất khá cao Đặc biệt, sự ng°ng tụ với tác nhân thân điện tử là các dẫn xuất carboxylic acid tạo ra sản phẩm có sự đa dạng về nhóm chāc thế trên vòng benzimidazole
2.2 2.2 Tång hÿp benzimidazole tć aryl amidine
Năm 2013, Alla đã tổng hợp thành công dẫn xuất benzimidazole từ tác chất
N ''-phenyl-N'-tosylacatamidine (70) Phản āng đóng vòng nội phân tử đ°ợc thực hiện
sử dụng tác nhân oxy hóa là PhI và mCPBA trong dung môi
1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol (HFIP) (S¡ đồ 2.20) Hiệu suất tổng hợp đạt đ°ợc khá cao (42-91%) (Alla et
Trang 40nội phân tử đ°ợc thực hiện trong môi tr°ßng kiềm (KOH), sản phẩm thu đ°ợc đạt hiệu
suất rất tát (65-91%) (Baars et al., 2014)
S¡ đồ 2.21: Tổng hợp benzimidazole từ tác nhân aryl amidine trong môi tr°ßng kiềm
2.2 2.3 Tång hÿp benzimidazole tć 2-haloaniline (azidoaniline) và aldehyde
Năm 2011, Kim đã tổng hợp thành công dẫn xuất benzimidazole dựa trên quy trình one-pot từ tác chất 2-haloaniline, aldehyde và NaN3 sử dụng xúc tác là CuCl trong dung môi TMEDA (S¡ đồ 2.22) Quy trình tổng hợp đạt hiệu suất rất cao (62-98%) (Kim, 2011) Ph°¡ng pháp này khắc phục đ°ợc nh°ợc điểm trong phản āng tổng hợp cÿa Shen và Driver năm 2008 từ tác chất azidoaniline (S¡ đồ 2.23), theo đó quy trình tổng hợp phải trải qua 4 b°ớc từ tác chất ban đầu là nitroaniline và aldehyde sử dụng xúc tác FeBr2 với hiệu suất cÿa hai b°ớc cuái đạt 65-90% (Shen và Driver , 2008)
S¡ đồ 2.22: Tổng hợp benzimidazole từ 2-haloaniline và aldehyde
S¡ đồ 2.23: Tổng hợp benzimidazole từ azidoaniline và aldehyde
Nhìn chung, có nhiều ph°¡ng pháp khác nhau để tổng hợp dẫn xuất benzimidazole từ nhiều tác chất khác nhau, tuy nhiên con đ°ßng tổng hợp dựa trên sự
ng°ng tụ giữa tác chất o-phenylenediamine và các acid carboxylic hoặc các dẫn xuất
carboxylic acid, đặc biệt là với aldehyde, là t°¡ng đái dễ thực hiện và cho hiệu suất khá tát Các tác nhân oxy hóa sử dụng trong các phản āng này t°¡ng đái đa dạng, trong đó iodine là một trong những tác nhân tiềm năng nhß đặc tính phổ biến cũng nh° thân thiện với môi tr°ßng