Nghiên cứu đặc điểm bệnh lý chủ yếu của chó mắc bệnh care, đặc điểm sinh học và sinh học phân tử của virus care phân lập được tại một số tỉnh phía bắc việt nam

Trang 1 HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM TRẦN VĂN NÊN NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM BỆNH LÝ CHỦ YẾU CỦA BỆNH CARE TRÊN CHÓ, ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC VÀ SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA VIRUS CARE PHÂN LẬP ĐƯỢC TẠI MỘT

HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM àn h KT TRẦN VĂN NÊN n sĩ ng NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM BỆNH LÝ CHỦ YẾU CỦA BỆNH CARE TRÊN CHÓ, ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC VÀ SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA VIRUS CARE PHÂN LẬP ĐƯỢC Lu ận án tiế TẠI MỘT SỐ TỈNH PHÍA BẮC VIỆT NAM HÀ NỘI – 2017 HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM Trần Văn Nên NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM BỆNH LÝ CHỦ YẾU CỦA BỆNH KT CARE TRÊN CHÓ, ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC VÀ SINH HỌC àn h PHÂN TỬ CỦA VIRUS CARE PHÂN LẬP ĐƯỢC n sĩ ng TẠI MỘT SỐ TỈNH PHÍA BẮC VIỆT NAM tiế Chuyên ngành: Bệnh lý học chữa bệnh vật nuôi ận án Mã số: 62.64.01.02 Lu NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS TS NGUYỄN THỊ LAN PGS TS NGUYỄN VĂN THANH HÀ NỘI, NĂM 2017 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi, kết nghiên cứu đƣợc trình bày luận án trung thực, khách quan chƣa dùng để bảo vệ lấy học vị Tôi xin cam đoan giúp đỡ cho việc thực luận án đƣợc cám ơn, thơng tin trích dẫn luận án đƣợc rõ nguồn gốc Hà Nội, ngày… tháng… năm… àn h KT Tác giả luận án Lu ận án tiế n sĩ ng Trần Văn Nên i LỜI CẢM ƠN Trong suốt thời gian học tập, nghiên cứu hồn thành luận án, tơi nhận đƣợc hƣớng dẫn, bảo tận tình thầy giáo, giúp đỡ, động viên bạn bè, đồng nghiệp gia đình Nhân dịp hồn thành luận án, cho phép tơi đƣợc bày tỏ lịng kính trọng biết ơn sâu sắc PGS TS Nguyễn Thị Lan PGS TS Nguyễn Văn Thanh tận tình hƣớng dẫn, dành nhiều công sức, thời gian tạo điều kiện cho tơi suốt q trình học tập thực đề tài Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn chân thành tới Ban Giám đốc, Ban Quản lý đào tạo, KT Bộ môn Bệnh lý thú y, Bệnh viện thú y, Khoa Thú y - Học viện Nông nghiệp Việt àn h Nam tận tình giúp đỡ tơi q trình học tập, thực đề tài hồn thành luận án sĩ ng Tôi xin chân thành cảm ơn tập thể lãnh đạo, cán viên chức phòng thí nghiệm trọng điểm cơng nghệ sinh học thú y phịng thí nghiệm mơn bệnh lý giúp đỡ tạo điều kiện cho suốt trình thực đề tài n Xin chân thành cảm ơn gia đình, ngƣời thân, bạn bè, đồng nghiệp tạo án tiế điều kiện thuận lợi giúp đỡ tơi mặt, động viên khuyến khích tơi hoàn thành luận án./ ận Hà Nội, ngày tháng năm 20 Lu Tác giả luận án Trần Văn Nên ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT vi DANH MỤC BẢNG vii DANH MỤC HÌNH ix TRÍCH YẾU LUẬN ÁN xi PHẦN MỞ ĐẦU KT 1.1 TÍNH CẤP THIẾT CỦA ĐỀ TÀI h 1.2 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU CỦA ĐỀ TÀI àn 1.3 PHẠM VI NGHIÊN CỨU ng 1.4 NHỮNG ĐÓNG GÓP MỚI CỦA ĐỀ TÀI 1.5 Ý NGHĨA KHOA HỌC VÀ THỰC TIỄN CỦA ĐỀ TÀI sĩ 1.5.1 Ý nghĩa khoa học tiế n 1.5.2 Ý nghĩa thực tiễn PHẦN TỔNG QUAN TÀI LIỆU án 2.1 TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU BỆNH CARE TRONG VÀ NGỒI NƢỚC ận 2.1.1 Tình hình nghiên cứu bệnh Care nƣớc 2.1.2 Tình hình nghiên cứu bệnh Care nƣớc Lu 2.2 MỘT SỐ THÔNG TIN VỀ VIRUT CARE 2.2.1 Phân loại virus gây bệnh Care 2.2.2 Hình thái virus Care 2.2.3 Cấu trúc virus Care 2.2.4 Sức đề kháng virus Care 2.2.5 Cơ chế sinh bệnh 2.2.6 Đặc tính sinh học virus Care 11 2.2.7 Đặc tính sinh học phân tử virus Care 13 2.3 MỘT SỐ THÔNG TIN VỀ BỆNH CARE 18 2.3.1 Đặc điểm dịch tễ bệnh Care 18 2.3.2 Triệu chứng bệnh tích 20 iii 2.3.3 Chẩn đoán bệnh Care 22 2.3.4 Phòng điều trị bệnh 27 PHẦN VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 31 3.1 ĐỊA ĐIỂM NGHIÊN CỨU 31 3.2 THỜI GIAN NGHIÊN CỨU 31 3.3 ĐỐI TƢỢNG VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU 31 3.4 NỘI DUNG NGHIÊN CỨU 33 3.4.1 Nghiên cứu đặc điểm bệnh lý chủ yếu chó mắc bệnh Care 33 3.4.2 Nghiên cứu số đặc điểm sinh học chủng virus Care phân lập đƣợc 33 3.4.3 Nghiên cứu số đặc điểm sinh học phân tử chủng virus Care phân KT lập đƣợc 34 3.5 PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 34 h 3.5.1 Phƣơng pháp khám lâm sàng 34 àn 3.5.2 Phƣơng pháp mổ khám, quan sát bệnh tích đại thể 34 ng 3.5.3 Phƣơng pháp làm tiêu vi thể quan sát bệnh tích tiêu 35 sĩ 3.5.4 Phƣơng pháp nhuộm hóa mơ miễn dịch 38 n 3.5.5 Phƣơng pháp xét nghiệm tiêu máu 39 tiế 3.5.6 Phƣơng pháp nuôi cấy tế bào 39 3.5.7 Phƣơng pháp phân lập virus Care môi trƣờng tế bào Vero-DST 40 án 3.5.8 Phƣơng pháp xác định hiệu giá virus (TCID50/ml) 41 ận 3.5.9 Phƣơng pháp xác định đƣờng biểu biễn nhân lên virus 41 Lu 3.5.10 Phƣơng pháp xác định tính kháng nguyên virus Care 41 3.5.11 Phƣơng pháp ELISA 42 3.5.12 Phƣơng pháp RT-PCR PCR 42 3.5.13 Phƣơng pháp giải trình tự gene xử lý liệu giải trình tự gene 45 3.5.14 Xử lý số liệu 48 PHẦN KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 49 4.1 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM BỆNH LÝ CHỦ YẾU CỦA CHÓ MẮC BỆNH CARE 49 4.1.1 Kết chẩn đốn chó mắc bệnh Care phƣơng pháp RT-PCR 49 4.1.2 Triệu chứng lâm sàng chó mắc bệnh Care 50 4.1.3 Kết nghiên cứu số tiêu lâm sàng giống chó mắc bệnh Care 52 4.1.4 Kết nghiên cứu thay đổi tiêu máu giống chó mắc bệnh Care 55 iv 4.1.5 Biến đổi bệnh lý đại thể chó mắc bệnh Care 60 4.1.6 Biến đổi bệnh tích vi thể chó mắc bệnh Care 62 4.1.7 Kết ứng dụng kỹ thuật hóa mơ miễn dịch để xác định phân bố virus Care quan tổ chức chó bệnh 67 4.2 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC CỦA NHỮNG CHỦNG VIRUS CARE PHÂN LẬP ĐƢỢC 70 4.2.1 Thông tin chủng virus Care phân lập đƣợc sử dụng nghiên cứu 70 4.2.2 Khả gây bệnh tích tế bào (CPE) chủng virus Care phân lập đƣợc 70 4.2.3 Hiệu giá chủng virus Care phân lập đƣợc 73 4.2.4 Nghiên cứu xác định biểu đồ tăng trƣởng chủng virus Care phân lập đƣợc 74 KT 4.2.5 Nghiên cứu tính kháng nguyên chủng virus Care phân lập đƣợc 79 4.3 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA àn h NHỮNG CHỦNG VIRUS CARE PHÂN LẬP ĐƢỢC 84 ng 4.3.1 Kết giải trình tự gene chủng virus nghiên cứu 84 4.3.2 Kết so sánh trình tự nucleotide chủng virus nghiên cứu 85 sĩ 4.3.3 Kết so sánh trình tự amino acid chủng virus nghiên cứu 90 n 4.3.4 So sánh mức độ tƣơng đồng trình tự nucleotide chủng virus nghiên cứu 98 tiế 4.3.5 So sánh mức độ tƣơng đồng trình tự amino acid chủng virus án nghiên cứu 99 4.3.6 Kết xây dựng sinh học phân tử 101 ận PHẦN KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 106 Lu 5.1 KẾT LUẬN 106 5.2 KIẾN NGHỊ 107 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN 108 TÀI LIỆU THAM KHẢO 109 PHỤ LỤC 119 v DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT Nghĩa tiếng Việt Từ viết tắt Canine distemper virus (Virus gây bệnh Care chó) CPE Cytophathogenic Effect (khả gây bệnh tích tế bào) CPV Canine Parvovirus (Virus gây bệnh Parvo chó) RNA Ribonucleic acid (Axít ribonucleic) DAB 3,3-diaminobenzidine DNA Deoxyribonucleic acid (Axít deoxyribonucleic) KT CDV h àn sĩ ELISA Ethylene diamine tetra acetic acid (axít etylen diamin tetraaxetic) Enzyme-Linked Immuno Sorbent Assay (Phƣơng pháp miễn dịch gắn enzyme) ng EDTA Fetal Bovine Serum (Huyết thai bò) FCS Fetal Calf Serum (Huyết thai bê) MOI Multiplicity Of Infection (Bội số gây nhiễm) PBS Phosphate Buffered Saline (Dung dịch muối đệm phosphat) án ận Polymerase Chain Reaction (Phản ứng chuỗi Polymerase) Lu PCR tiế n FBS RT-PCR Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (Phản ứng tổng hợp chuỗi phiên mã ngƣợc) SLS Sample loading solution (Dung dịch pha mẫu) TCID50 Tissue Culture Infective fifty percent Dose (Liều gây nhiễm 50% môi trƣờng nuôi cấy mô) vi DANH MỤC BẢNG TT Tên bảng Trang 2.1 Các virus thuộc giống Morbillivirus bệnh chúng gây 2.2 Danh sách loại vacxin phòng bệnh Care đƣợc lƣu hành Việt Nam 29 3.1 Mồi sử dụng cho phản ứng RT-PCR giải trình tự gene P H 33 3.2 Chó mắc bệnh Care theo giống chó khác 31 3.3 Chó mắc bệnh Care theo địa phƣơng nghiên cứu khác 32 3.4 Các chủng tham chiếu sử dụng để xây dựng sinh học phân tử 46 4.1 Kết chẩn đoán phƣơng pháp RT-PCR PCR 49 KT 4.2 Triệu chứng lâm sàng chủ yếu chó mắc bệnh Care 50 4.3 Các tiêu lâm sàng giống chó Phú Quốc mắc bệnh Care 52 àn h 4.4 Các tiêu lâm sàng giống chó H’Mơng Cộc mắc bệnh Care 53 4.5 Các tiêu lâm sàng giống chó Bắc Hà mắc bệnh Care 53 ng 4.6 Các tiêu lâm sàng giống chó lai Becgie mắc bệnh Care 53 sĩ 4.7 Các tiêu lâm sàng giống chó Fox mắc bệnh Care 53 n 4.8 Các tiêu lâm sàng giống chó Rottweiler mắc bệnh Care 53 tiế 4.9 Một số tiêu máu giống chó Phú Quốc mắc bệnh Care 55 án 4.10 Một số tiêu máu giống chó H’Mơng Cộc mắc bệnh Care 55 4.11 Một số tiêu máu giống chó Bắc Hà mắc bệnh Care 56 ận 4.12 Một số tiêu máu giống chó lai Becgie mắc bệnh Care 56 Lu 4.13 Một số tiêu máu giống chó Fox mắc bệnh Care 57 4.14 Một số tiêu máu giống chó Rottweiler mắc bệnh Care 57 4.15 Các tổn thƣơng đại thể chó mắc Care 60 4.16 Biến đổi vi thể số quan chó mắc bệnh Care 63 4.17 Kết nhuộm hóa mơ miễn dịch 67 4.18 Thông tin chủng virus Care sử dụng nghiên cứu 70 4.19 Kết nghiên cứu khả gây bệnh tích tế bào chủng virus Care chủng virus vacxin Onderstepoort 71 4.20 Hiệu giá chủng virus Care sử dụng nghiên cứu 73 4.21 Kết kiểm tra hàm lƣợng kháng thể chó thí nghiệm trƣớc tiêm vacxin Care vô hoạt 80 vii 4.22 Các triệu chứng lâm sàng chó thí nghiệm sau công cƣờng độc 83 4.23 Kết phân lập virus CDV lơ chó thí nghiệm 84 4.24 Các vị trí sai khác nucleotide gene P chủng virus nghiên cứu với chủng virus vacxin 87 4.25 Các vị trí sai khác nucleotide gene H chủng virus nghiên cứu với chủng virus vacxin 88 4.26 Các vị trí sai khác amino acid mã hóa từ gene H chủng virus Care nghiên cứu chủng virus vacxin 97 4.27 Các vị trí sai khác amino acid mã hóa từ gene P chủng virus Care nghiên cứu chủng virus vacxin 97 KT 4.28 Sự tƣơng đồng trình tự nucleotide gene H chủng virus Care nghiên cứu với mẫu virus vacxin Ond-VX (%) 99 àn h 4.29 Sự tƣơng đồng trình tự nucleotide gene P chủng virus Care ng nghiên cứu với mẫu virus vacxin Ond-VX (%) 99 4.30 Sự tƣơng đồng amino acid mã hóa từ gene H chủng virus Care sĩ nghiên cứu với chủng virus vacxin (%) 100 n 4.31 Sự tƣơng đồng amino acid mã hóa từ gene P chủng virus Care Lu ận án tiế nghiên cứu với chủng virus vacxin (%) 101 viii PHỤ LỤC ng àn h KT MỘT SỐ HÌNH ẢNH VỀ TRIỆU CHỨNG LÂM SÀNG CỦA CHÓ MẮC BỆNH CARE Lu ận án tiế n sĩ Hình 3.1 Có nhiều dử mắt, dử mũi Hình 3.2 Chó có biểu mệt mỏi, ủ rủ 121 PHỤ LỤC Hình 4.2 Khí quản chó bị xuất huyết Lu ận án tiế n sĩ Hình 4.1 Xuất huyết đại não tiểu não ng àn h KT MỘT SỐ HÌNH ẢNH VỀ BỆNH TÍCH ĐẠI THỂ CỦA CHĨ MẮC BỆNH CARE Hình 4.3 Phổi bị sung huyết Hình 4.4 Xoang ngực tích nƣớc 122 PHỤ LỤC Hình 5.2 Thâm nhiễm tế bào viêm phổi (HE 10X) Lu ận án tiế n sĩ Hình 5.1 Xuất huyết tim (HE 10X) ng àn h KT MỘT SỐ HÌNH ẢNH VỀ BIẾN ĐỔI BỆNH TÍCH VI THỂ CỦA CHĨ MẮC BỆNH CARE Hình 5.3 Xuất huyết, thâm nhiễm tế bào viêm gan (HE 40X) Hình 5.4 Xuất huyết lan tràn hạch lympho (HE 10X) 123 PHỤ LỤC h KT KẾT QUẢ SẢN PHẨM PHẢN ỨNG RT-PCR VỚI GENE H VÀ P CỦA CHỦNG VIRUS NGHIÊN CỨU àn Hình 6.1 Kết điện di sản phẩm phản ứng RT-PCR với gene H ng Ghi chú: Giếng 1, 2, 3, 4, tƣơng ứng với chủng virus nghiên cứu Giếng 6: Đối chứng âm nƣớc khử Lu ận án tiế n sĩ ion Giếng 7: Đối chứng dƣơng RNA virus vacxin Onderstepoort Hình 6.2 Kết điện di sản phẩm phản ứng RT-PCR với gene P Ghi chú: Giếng 1, 2, 3, 4, tƣơng ứng với chủng virus nghiên cứu Giếng 6: Đối chứng âm nƣớc khử ion Giếng 7: Đối chứng dƣơng RNA virus vacxin Onderstepoort 124 PHỤ LỤC Lu ận án tiế n sĩ ng àn h KT GIẢN ĐỒ GIẢI TRÌNH TỰ GENE TỰ ĐỘNG ĐOẠN GENE H VÀ P CỦA CHỦNG VIRUS CDV-VNUA-768 Hình 7.1 Giản đồ giải trình tự gene tự động đoạn gene Haemagglutinin chủng virus CDV-VNUA-768 125 KT h àn ng sĩ n tiế án ận Lu Hình 7.2 Giản đồ giải trình tự gene tự động đoạn gene Phosphor chủng virus CDV-VNUA-768 126 PHỤ LỤC KẾT QUẢ SO SÁNH TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE CỦA CHỦNG VIRUS CARE NGHIÊN CỨU 8.1 Kết so sánh trình tự nucleotide đoạn gene H chủng virus Care nghiên cứu - Chủng CDV-VNUA-768 có 126 vị trí sai khác với chủng CDV-HUA02H lần lƣợt là: 87, 96, 111, 139, 162, 166, 182, 186, 189, 202, 211, 225, 228, 232, 243, 252, 267, 348, 369, 387, 426, 432, 453, 466, 469, 479, 486, 511, 533, 552, 555, 591, 594, 606, 630, 635, 653, 660, 666, 679, 696, 700, 721, 733, 735, 741, 765, 792, 828, 830, 840, 846, 876, 937, 939, 940, 957, 958, 981, 985, 993, KT 1009, 1017, 1026, 1029, 1032, 1041, 1056, 1072, 1076, 1094, 1108, 1116, 1118, 1119, 1128, 1140, 1179, 1182, 1194, 1202, 1212, 1218, 1243, 1272, 1281, 1290, ng àn h 1299, 1305, 1325, 1356, 1362, 1375, 1377, 1386, 1392, 1422, 1434, 1437, 1455, 1458, 1474, 1476, 1539, 1557, 1564, 1589, 1590, 1591, 1599, 1608, 1632, 1644, 1683, 1728, 1738, 1743, 1747, 1750, 1752, 1755, 1758, 1776, 1779, 1780, 1809 Lu ận án tiế n sĩ - Chủng CDV-VNUA-768 có 131 vị trí sai khác với chủng CDV-HUA03R lần lƣợt là: 54, 87, 96, 111, 139, 162, 166, 182, 186, 189, 202, 211, 225, 228, 243, 252, 267, 348, 369, 387, 426, 432, 453, 466, 469, 479, 486, 511, 533, 552, 555, 591, 594, 606, 630, 635, 653, 660, 666, 673, 675, 679, 696, 700, 711, 721, 733, 735, 741, 765, 792, 828, 830, 840, 846, 876, 937, 939, 940, 957, 958, 981, 985, 993, 1009, 1017, 1026, 1029, 1032, 1041, 1056, 1072, 1076, 1094, 1108, 1116, 1118, 1119, 1128, 1140, 1179, 1182, 1194, 1202, 1212, 1218, 1239, 1243, 1272, 1281, 1290, 1299, 1305, 1325, 1329, 1356, 1362, 1375, 1377, 1386, 1392, 1422, 1434, 1437, 1455, 1458, 1474, 1476, 1539, 1557, 1564, 1589, 1590, 1591, 1599, 1608, 1632, 1644, 1683, 1728, 1738, 1743, 1747, 1750, 1752, 1755, 1758, 1776, 1779, 1780, 1809 04H 369, 525, 678, 819, 999, - Chủng CDV-VNUA-768 có 154 vị trí sai khác với chủng CDV-HUAlần lƣợt là: 36, 54, 61, 87, 90, 96, 108, 115, 133, 136, 139, 162, 291, 330, 387, 426, 432, 436, 465, 466, 469, 475, 479, 484, 493, 494, 507, 511, 522, 528, 531, 533, 538, 552, 555, 556, 590, 591, 594, 606, 609, 630, 639, 660, 679, 687, 696, 712, 717, 721, 723, 733, 735, 739, 756, 765, 772, 792, 801, 828, 830, 864, 868, 876, 894, 903, 926, 937, 958, 963, 970, 990, 991, 996, 1009, 1024, 1031, 1047, 1053, 1056, 1059, 1074, 1076, 1094, 1095, 1096, 127 Lu ận án tiế n sĩ ng àn h KT 1100, 1116, 1119, 1126, 1127, 1128, 1140, 1156, 1164, 1182, 1194, 1201, 1212, 1243, 1248, 1249, 1272, 1275, 1281, 1299, 1305, 1336, 1356, 1362, 1365, 1375, 1378, 1379, 1399, 1422, 1423, 1424, 1437, 1476, 1491, 1494, 1500, 1505, 1515, 1517, 1528, 1539, 1550, 1557, 1572, 1578, 1584, 1587, 1588, 1590, 1599, 1608, 1644, 1645, 1683, 1711, 1714, 1728, 1738, 1750, 1755, 1756, 1758 - Chủng CDV-VNUA-768 có 16 vị trí sai khác với chủng CDV-HUA-05P lần lƣợt là: 91, 322, 339, 369, 462, 591, 679, 877, 981, 1182, 1557, 1608, 1619, 1683, 1728, 1755 - Chủng CDV-HUA-02H có vị trí sai khác với chủng CDV-HUA-03R lần lƣợt là: 54, 232, 673, 675, 711, 1239, 1329 - Chủng CDV-HUA-02H có 153 vị trí sai khác với chủng CDV-HUA04H lần lƣợt là: 36, 54, 61, 90, 108, 111, 115, 133, 136, 166, 182, 186, 189, 202, 211, 225, 228, 232, 243, 252, 267, 291, 330, 348, 369, 436, 453, 465, 466, 475, 484, 486, 493, 494, 507, 522, 525, 528, 531, 538, 556, 590, 609, 635, 639, 653, 666, 678, 687, 700, 712, 717, 723, 735, 739, 741, 756, 772, 801, 819, 840, 846, 864, 868, 894, 903, 926, 939, 940, 957, 963, 970, 981, 985, 990, 991, 993, 996, 999, 1017, 1024, 1026, 1029, 1031, 1032, 1041, 1047, 1053, 1059, 1072, 1074, 1095, 1096, 1100, 1108, 1118, 1126, 1127, 1140, 1156, 1164, 1179, 1201, 1202, 1218, 1248, 1249, 1275, 1290, 1325, 1336, 1365, 1377, 1378, 1379, 1386, 1392, 1399, 1423, 1424, 1434, 1455, 1458, 1474, 1491, 1494, 1500, 1505, 1515, 1517, 1528, 1550, 1564, 1572, 1578, 1584, 1587, 1588, 1589, 1590, 1591, 1632, 1645, 1711, 1714, 1743, 1747, 1752, 1756, 1776, 1779, 1780, 1809 - Chủng CDV-HUA-02H có 124 vị trí sai khác với chủng CDV-HUA-05P lần lƣợt là: 87, 91, 96, 111, 139, 162, 166, 182, 186, 189, 202, 211, 225, 228, 232, 243, 252, 267, 322, 339, 348, 387, 426, 432, 453, 462, 466, 469, 479, 486, 511, 533, 552, 555, 594, 606, 630, 635, 653, 660, 666, 696, 700, 721, 733, 735, 741, 765, 792, 828, 830, 840, 846, 876, 877, 909, 937, 939, 940, 957, 958, 981, 985, 993, 1009, 1017, 1026, 1029, 1032, 1041, 1056, 1072, 1076, 1094, 1108, 1116, 1118, 1119, 1128, 1140, 1179, 1194, 1202, 1212, 1218, 1243, 1272, 1281, 1290, 1299, 1305, 1325, 1356, 1362, 1375, 1377, 1386, 1392, 1422, 1434, 1437, 1455, 1458, 1474, 1476, 1539, 1564, 1589, 1590, 1591, 1599, 1619, 1632, 1644, 1738, 1743, 1747, 1750, 1752, 1758, 1776, 1779, 1780, 1809 - Chủng CDV-HUA-03R có 156 vị trí sai khác với chủng CDV-HUA-04H lần lƣợt là: 36, 61, 90, 108, 111, 115, 133, 136, 166, 182, 186, 189, 202, 211, 225, 228, 243, 252, 267, 291, 330, 348, 369, 436, 453, 465, 466, 475, 484, 486, 128 Lu ận án tiế n sĩ ng àn h KT 493, 494, 507, 522, 525, 528, 531, 538, 556, 590, 609, 635, 639, 653, 666, 673, 675, 678, 687, 700, 711, 712, 717, 723, 735, 739, 741, 756, 772, 801, 819, 840, 846, 864, 868, 894, 903, 926, 939, 940, 957, 963, 970, 981, 985, 990, 991, 993, 996, 999, 1017, 1024, 1026, 1029, 1031, 1032, 1041, 1047, 1053, 1059, 1072, 1074, 1095, 1096, 1100, 1108, 1118, 1126, 1127, 1140, 1156, 1164, 1179, 1201, 1202, 1218, 1239, 1248, 1249, 1275, 1290, 1325, 1329, 1336, 1365, 1377, 1378, 1379, 1386, 1392, 1399, 1423, 1424, 1434, 1455, 1458, 1474, 1491, 1494, 1500, 1505, 1515, 1517, 1528, 1550, 1564, 1572, 1578, 1584, 1587, 1588, 1589, 1590, 1591, 1632, 1645, 1711, 1714, 1743, 1747, 1752, 1756, 1776, 1779, 1780, 1809 - Chủng CDV-HUA-03R có 128 vị trí sai khác với chủng CDV-HUA-05P lần lƣợt là: 54, 87, 91, 96, 111, 139, 162, 166, 182, 186, 189, 202, 211, 225, 228, 243, 252, 267, 322, 339, 348, 387, 426, 432, 453, 462, 466, 469, 479, 486, 511, 533, 552, 555, 594, 606, 630, 635, 653, 660, 666, 673, 675, 696, 700, 711, 721, 733, 735, 741, 765, 792, 828, 830, 840, 846, 876, 877, 909, 937, 939, 940, 957, 958, 981, 985, 993, 1009, 1017, 1026, 1029, 1032, 1041, 1056, 1072, 1076, 1094, 1108, 1116, 1118, 119, 1128, 1140, 1179, 1194, 1212, 1218, 1239, 1243, 1272, 1281, 1290, 1299, 1305, 1325, 1329, 1356, 1362, 1375, 1377, 1386, 1392, 1422, 1434, 1437, 1455, 1458, 1474, 1476, 1539, 1564, 1589, 1590, 1591, 1599, 1619, 1632, 1644, 1738, 1743, 1747, 1750, 1752, 1758, 1776, 1779, 1780, 1809 - Chủng CDV-HUA-04H có 154 vị trí sai khác với chủng CDV-HUA-05P lần lƣợt là: 36, 54, 61, 87, 90, 91, 96, 108, 115, 133, 136, 139, 162, 291, 322, 330, 339, 369, 387, 426, 432, 436, 462, 465, 466, 469, 475, 479, 484, 493, 494, 507, 511, 522, 525, 528, 531, 533, 538, 552, 555, 556, 590, 594, 606, 609, 630, 639, 660, 678, 687, 696, 712, 717, 721, 723, 733, 735, 739, 756, 765, 772, 792, 801, 819, 828, 830, 864, 868, 876, 877, 894, 903, 909, 926, 937, 958, 963, 970, 981, 990, 991, 996, 999, 1009, 1024, 1031, 1047, 1053, 1056, 1059, 1074, 1076, 1094, 1095, 1096, 1100, 1116, 1119, 1126, 1127, 1128, 1140, 1156, 1164, 1194, 1201, 1212, 1243, 1248, 1249, 1272, 1275, 1281, 1299, 1305, 1336, 1356, 1362, 1365, 1375, 1378, 1379, 1399, 1422, 1423, 1424, 1437, 1476, 1491, 1494, 1500, 1505, 1515, 1517, 1528, 1539, 1550, 1572, 1578, 1584, 1587, 1588, 1590, 1599, 1619, 1644, 1645, 1711, 1714, 1738, 1750, 1756, 1758 129 Lu ận án tiế n sĩ ng àn h KT 8.2 Hình ảnh minh họa kết so sánh trình tự nucleotide chủng virus Care nghiên cứu Hình 8.1 So sánh trình tự nucleotide đoạn gene H chủng virus Care nghiên cứu Ghi chú: Các vị trí nucleotide giống đƣợc biểu thị dấu (.); vị trí có sai khác đƣợc biểu thị nucleotide tƣơng ứng chủng virus 130 KT h àn ng sĩ n tiế án ận Lu Hình 8.1 So sánh trình tự nucleotide đoạn gene H chủng virus Care nghiên cứu (tiếp theo) Ghi chú: Các vị trí nucleotide giống đƣợc biểu thị dấu (.); vị trí có sai khác đƣợc biểu thị nucleotide tƣơng ứng chủng virus 131 KT h àn ng sĩ n tiế án ận Lu Hình 8.1 So sánh trình tự nucleotide đoạn gene H chủng virus Care nghiên cứu (tiếp theo) Ghi chú: Các vị trí nucleotide giống đƣợc biểu thị dấu (.); vị trí có sai khác đƣợc biểu thị nucleotide tƣơng ứng chủng virus 132 KT h àn ng sĩ n tiế án ận Lu Hình 8.1 So sánh trình tự nucleotide đoạn gene H chủng virus Care nghiên cứu (tiếp theo) Ghi chú: Các vị trí nucleotide giống đƣợc biểu thị dấu (.); vị trí có sai khác đƣợc biểu thị nucleotide tƣơng ứng chủng virus 133 KT h ng àn Hình 8.1 So sánh trình tự nucleotide đoạn gene H chủng virus Care nghiên cứu (tiếp theo) Lu ận án tiế n sĩ Ghi chú: Các vị trí nucleotide giống đƣợc biểu thị dấu (.); vị trí có sai khác đƣợc biểu thị nucleotide tƣơng ứng chủng virus 134 KT h àn ng sĩ n tiế án ận Lu Hình 8.2 So sánh trình tự nucleotide đoạn gene P chủng virus Care nghiên cứu Ghi chú: Các vị trí nucleotide giống đƣợc biểu thị dấu (.); vị trí có sai khác đƣợc biểu thị nucleotide tƣơng ứng chủng virus 135