Nhận dạng hợp chất tiềm năng trong điều trị rối loạn lipid máu thông qua molecular docking

BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH CHƯƠNG TRÌNH KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ CẤP CƠ SỞ BÁO CÁO TỔNG HỢP KẾT QUẢ ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU KHOA HỌC NHẬN DẠNG HỢP CHẤT TIỀM NĂNG TRONG ĐIỀU TRỊ RỐI LOẠN LIPID MÁU THÔNG QUA MOLECULAR DOCKING Cơ quan chủ trì nhiệm vụ (Khoa, Trung tâm, …): DƯỢC Chủ trì nhiệm vụ: TS Nguyễn Thụy Việt Phương Thành phố Hồ Chí Minh - 2021 CỘNG HỒ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập - Tự - Hạnh phúc Tp.HCM, ngày 19 tháng 04 năm 2021 BÁO CÁO THỐNG KÊ KẾT QUẢ THỰC HIỆN ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU KHOA HỌC I THÔNG TIN CHUNG Tên đề tài: Nhận dạng hợp chất tiềm điều trị rối loạn lipid máu thông qua molecular docking Thuộc lĩnh vực (tên lĩnh vực): Dược Chủ nhiệm nhiệm vụ: - Họ tên: Nguyễn Thụy Việt Phương - Ngày, tháng, năm sinh: 06/05/1980 - Học hàm, học vị: Tiến sĩ – Dược sĩ - Chức danh khoa học: Tiến sĩ - Điện thoại: Tổ chức: Nhà riêng: Mobile: 0919520708 - Fax: E-mail: ntvphuong@ump.edu.vn - Tên tổ chức công tác:.Bộ môn Công nghệ thông tin Dược - Địa tổ chức: 41 Đinh Tiên Hoàng – P.Bến Nghé – Quận – Tp.HCM - Địa nhà riêng: 4.09 Chung cư 52 Chánh Hưng – đường 332 Phạm Hùng – P.5 – Quận – Tp.HCM Nam/ Nữ: Nữ Chức vụ: Giảng viên Tổ chức chủ trì nhiệm vụ(1): - Tên tổ chức chủ trì nhiệm vụ: Khoa Dược - Đại Học Y Dược Tp.HCM - Điện thoại: 028 38295641 Fax: - E-mail: - Website: www.uphcm.edu.vn - Địa chỉ: 41 Đinh Tiên Hoàng – P.Bến Nghé – Quận – Tp.HCM Tên quan chủ quản đề tài: Đại học Y Dược thành phố Hồ Chí Minh II TÌNH HÌNH THỰC HIỆN Thời gian thực nhiệm vụ: - Theo Hợp đồng ký kết: từ tháng 11 năm 2019 đến tháng 11 năm 2020 Tên Khoa Trung tâm, đơn vị - nơi quản lý trực tiếp cá nhân làm chủ nhiệm đề tài iii - Thực tế thực hiện: từ tháng 11 năm 2019 đến tháng 11 năm 2020 - Được gia hạn (nếu có): Từ tháng 11 năm 2020 đến tháng 04 năm 2021 Kinh phí sử dụng kinh phí: a) Tổng số kinh phí thực hiện: 10 triệu đồng, đó: + Kính phí hỗ trợ từ ngân sách khoa học nhà trường: 10 triệu đồng + Kinh phí từ nguồn khác: tr.đ b) Tình hình cấp sử dụng kinh phí từ nguồn ngân sách khoa học: Từ 11/2020 đến tháng 04/2021 chưa nhận kinh phí đợt Số TT Theo kế hoạch Thời gian Kinh phí (Tháng, năm) (Tr.đ) 11/20190 11/2020 11/20200 04/2021 Thực tế đạt Thời gian Kinh phí (Tháng, năm) (Tr.đ) 11/20190 11/2020 11/20200 04/2021 Ghi (Số đề nghị tốn) Khơng có Khơng có c) Kết sử dụng kinh phí theo khoản chi: Đơn vị tính: Triệu đồng Số TT Theo kế hoạch Nội dung khoản chi Tổng Trả công lao động 9,897 (khoa học, phổ thông) Nguyên, vật liệu, lượng Thiết bị, máy móc Xây dựng, sửa chữa nhỏ Chi khác 0,103 Tổng cộng 10 Thực tế đạt Tổng NSKH 9,897 Nguồn khác 9,897 9,897 Nguồn khác 0,103 10 0 0,103 10 0,103 10 0 NSKH - Lý thay đổi (nếu có): Tổ chức phối hợp thực nhiệm vụ: Số TT Tên tổ chức đăng ký theo Thuyết minh Tên tổ chức tham gia thực Nội dung tham gia chủ yếu - Lý thay đổi (nếu có): iv Sản phẩm chủ yếu đạt Ghi chú* Cá nhân tham gia thực nhiệm vụ: (Người tham gia thực đề tài thuộc tổ chức chủ trì quan phối hợp, không 10 người kể chủ nhiệm) Tên cá nhân đăng ký theo Thuyết minh Nguyễn Thụy Việt Phương Tên cá nhân tham gia thực Nguyễn Thụy Việt Phương Nguyễn Lê Trà Giang Nguyễn Lê Trà Giang Trần Thị Bích Liên Trần Thị Bích Liên Số TT Nội dung tham gia Thu thập tài liệu-chọn cấu trúc protein cho thụ thể liên quan đến trình điều trị rối loạn lipid máu ligand, phân tích kết docking, động lực học phân tử - viết báo Thu thập tài liệu, thực phần docking, động lực học phân tử - phân tích kết Thu thập tài liệu, tổng hợp kết Sản phẩm chủ yếu đạt Tài liệu liên quan đến đề tài - cấu trúc protein, ligand - kết docking - báo Ghi chú* Tài liệu liên quan đến đề tài - kết docking Tài liệu liên quan đến đề tài - Lý thay đổi ( có): Tình hình hợp tác quốc tế: Số TT Theo kế hoạch (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm, tên tổ chức hợp tác, số đồn, số lượng người tham gia ) Thực tế đạt (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm, tên tổ chức hợp tác, số đoàn, số lượng người tham gia ) Ghi chú* - Lý thay đổi (nếu có): Tình hình tổ chức hội thảo, hội nghị: Theo kế hoạch Thực tế đạt Số (Nội dung, thời gian, kinh phí, (Nội dung, thời gian, TT địa điểm ) kinh phí, địa điểm ) v Ghi chú* - Lý thay đổi (nếu có): Tóm tắt nội dung, cơng việc chủ yếu: (Nêu mục .của đề cương, không bao gồm: Hội thảo khoa học, điều tra khảo sát nước nước ngồi) Số TT Các nội dung, cơng việc chủ yếu (Các mốc đánh giá chủ yếu) Thời gian (Bắt đầu, kết thúc - tháng … năm) Theo kế Thực tế đạt hoạch 1/11/20191/11/201902/2020 02/2020 Nội dung Chọn lựa thụ thể quan trọng liên quan đến trình hạ lipid máu Nội dung Nghiên cứu khả gắn kết thông qua molecular docking hợp chất tự nhiên thụ thể liên quan đến hạ lipid máu – khảo sát trình động lực học phân tử độ ổn định gắn kết Nội dung Xác định hợp chất tiềm cho thử nghiệm tác động hạ lipid máu 02/202006/2020 02/202006/2020 06/202008/2020 06/202008/2020 Nội dung Tổng hợp – Phân tích kết - Viết báo 08/202010/2020 08/202010/2020 Người, quan thực Nguyễn Thụy Việt Phương – Nguyễn Lê Trà Giang – Trần Thị Bích Liên Nguyễn Thụy Việt Phương – Nguyễn Lê Trà Giang – Trần Thị Bích Liên Nguyễn Thụy Việt Phương – Nguyễn Lê Trà Giang – Trần Thị Bích Liên Nguyễn Thụy Việt Phương – Nguyễn Lê Trà Giang - Lý thay đổi (nếu có): III SẢN PHẨM KH&CN CỦA ĐỀ TÀI Sản phẩm KH&CN tạo ra: a) Sản phẩm Dạng I: khơng có Số TT Tên sản phẩm tiêu chất lượng chủ yếu Đơn vị đo Số lượng vi Theo kế hoạch Thực tế đạt - Lý thay đổi (nếu có): b) Sản phẩm Dạng II: Số TT Tên sản phẩm Các hợp chất tự nhiên tiềm điều trị rối loạn lipid máu Mô hình gắn kết (molecular docking) cho chất tự nhiên tiềm thụ thể liên quan Mơ hình động lực học phân tử cho chất gắn kết tiềm thụ thể Yêu cầu khoa học cần đạt Theo kế hoạch Thực tế đạt Cơ sở liệu rõ ràng, đạt độ tin cậy cao Mô hình đạt độ tin cậy cao Mơ hình đạt độ tin cậy cao Ghi Đạt Đạt Đạt - Lý thay đổi (nếu có): c) Sản phẩm Dạng III: Số TT Tên sản phẩm Bài báo khoa học Yêu cầu khoa học Số lượng, nơi cần đạt công bố (Tạp chí, nhà Theo Thực tế xuất bản) kế hoạch đạt Đạt chất lượng Đạt chất lượng đăng tạp chí MedPharmRes - Lý thay đổi (nếu có) d) Kết đào tạo: Khơng có Số TT Cấp đào tạo, Chuyên ngành đào tạo Thạc sỹ Tiến sỹ Số lượng Theo kế hoạch Thực tế đạt Ghi (Thời gian kết thúc) - Lý thay đổi (nếu có): đ) Tình hình đăng ký bảo hộ quyền sở hữu công nghiệp: Không có Số TT Tên sản phẩm đăng ký Kết Theo kế hoạch - Lý thay đổi (nếu có): vii Thực tế đạt Ghi (Thời gian kết thúc) MỤC LỤC ĐẶT VẤN ĐỀ CHƯƠNG TỔNG QUAN .3 1.1 HỘI CHỨNG CHUYỂN HÓA – RỐI LOẠN LIPID MÁU VÀ MỐI LIÊN QUAN HỌ THỤ THỂ PPARS 1.1.1 Giới thiệu 1.1.2 Vai trò PPARs rối loạn lipid máu .4 1.1.3 Điều trị 1.2 THỤ THỂ PPARS 1.2.1 Cấu tạo thụ thể PPARs 1.2.2 Cơ chế tác động thụ thể PPARs 1.2.3 Vai trị loại thụ thể PPAR 1.3 HỢP CHẤT TỰ NHIÊN 11 1.3.1 Cấu trúc hóa học 11 1.3.2 Công dụng hợp chất tự nhiên rối loạn chuyển hóa 12 1.4 CÁC KỸ THUẬT IN SILICO .14 1.4.1 Gắn kết phân tử (Molecular docking) .14 1.4.2 Động lực học phân tử 17 1.5 TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU TRONG VÀ NGỒI NƯỚC 21 1.5.1 Trên giới 21 1.5.2 Tại Việt Nam 22 CHƯƠNG ĐỐI TƯỢNG – PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .23 2.1 ĐỐI TƯỢNG NGHIÊN CỨU .23 2.1.1 Protein mục tiêu 23 2.1.2 Ligand .23 2.2 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .27 2.2.1 Trang thiết bị phần mềm 27 2.2.2 Molecular docking 27 2.2.3 Mô động lực học phân tử .28 CHƯƠNG KẾT QUẢ 30 3.1 GẮN KẾT PHÂN TỬ 30 ix 3.1.1 PPARα .30 3.1.2 PPARγ .39 3.1.3 PPARδ .45 3.2 MÔ PHỎNG ĐỘNG LỰC HỌC PHÂN TỬ 48 3.2.1 RMSD .49 3.2.2 RMSF 51 3.2.3 Bán kính quay 52 3.2.4 Tần suất diện liên kết hydro .53 3.2.5 Diện tích tiếp xúc bề mặt dung môi 55 CHƯƠNG KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 60 4.1 KẾT LUẬN 60 4.1.1 Gắn kết phân tử .60 4.1.2 Mô động lực học phân tử .60 4.2 ĐỀ NGHỊ .60 TÀI LIỆU THAM KHẢO 61 PHỤ LỤC x PHỤ LỤC A1 9.1 ± 0.3 µM A2 > 30 µM A3 7.3 ± 0.2 µM A4 > 30 µM A5 13.0 ± 3.3 µM A6 9.7 ± 1.0 µM A7 > 30 µM A8 10.9 ± 1.7 µM A9 1.1 ± 1.6 µM A10 10.4 ± 1.2 µM A11 3.0 ± 0.6 µM A12 0.7 ± 0.2 µM A13 5.6 ± 1.1 µM A14 12.4 ± 2.4 µM A15 18.0 ± 1.5 µM A16 10.9 ± 2.3 µM A17 >30 µM A18 12.8 ± 1.4 µM A19 1.6 ± 0.4 µM A20 21.6 ± 2.1 µM A21 2.5 ± 0.6 µM A22 10.9 ± 1.1 µM A23 4.7 ± 0.8 µM A24 16.8 ± 1.7 µM A25 17.6 ± 1.5 µM 81 A26 7.0 ± 1.0 µM A27 10.4 ± 1.5 µM A28 5.2 ± 1.3 µM A29 1.2 ± 0.5 µM A30 0.30 ± 0.06 µM A31 9.9 ± 1.7 µM A32 6.2 ± 0.8 µM A33 1.7 ± 0.4 µM A34 10.3 ± 1.7 µM A35 >60 µM A36 >60 µM A40 28.0 ± 2.5 µM A41 20.3 ± 2.9 µM A44 37.88 ± 2.12 µM A45 107.80 ± 2.72 µM A3 A37 20.9 ± 1.5 µM A43 2.0 ± 0.3 µM A38 4.3 ± 0.7 µM >60 µM A43 1.05 ± 0.15 µM 82 A46 123.80 ± 2.66 µM A47 130.20 ± 1.85 µM A51 16.84 ± 2.34 µM A52 22.76 ± 1.68 µM A56 89.12 ± 3.11 µM A48 112.06 ± 2.33 µM A49 30.01 ± 1.07 µM A50 2.07 ± 1.73 µM A53 98.50 ± 2.67 µM A54 103.56 ± 2.56 µM A55 67.31 ± 2.03 µM A57 5.4 ± 0.7 µM A58 31.6 ± 4.5 µM A59 49.7 ± 6.6 µM A60 9.2 ± 1.1 µM A61 19.7 ± 2.5 µM A62 24.4 ± 3.8 µM 83 A63 1.6 ± 0.3 µM A64 8.3 ± 0.8 µM 84 PHỤ LỤC F16 F35 F38 F44 F56 F73 F74 F75 F93 F96 F100 F121 F131 F147 F149 F151 F168 F183 F81 F292 F300 F206 F215 F277 F306 F307 F309 85 F316 F321 F325 F380 F382 F446 F465 F470 F496 F504 F551 F553 F420 F477 F516 86 F441 F549 PHỤ LỤC F3 F14 F17 F21 F70 F73 F98 F99 F109 F112 F113 F131 F159 F169 F182 F229 F268 F273 F300 F301 F304 F305 F310 F311 F354 F356 F363 F369 87 F381 F383 F398 F400 F401 F413 F440 F441 F442 F453 F456 F458 F484 F496 F549 F556 F559 F586 F624 F637 F510 F504 F569 88 PHỤ LỤC F73 F21 F312 F401 F119 F175 F212 F404 F412 F435 F477 F553 F483 F564 F634 89 F510 F637 F639 PHỤ LỤC 10 Mã số Điểm gắn Liên kết Hydro Met220, Ser280, His440, Thr279 277 -10.9 420 -10.7 His440, Ile447, Glu451 465 -10.5 His440, Tyr314 551 553 -10.5 -10.2 75 -9.9 131 -9.9 292 35 -9.8 -9.7 Tyr314, Tyr464, His440 His440, Tyr464, Tyr314 Tyr464, Ser280, Phe273, Val444 Thr279, Cys276, Ser280, Tyr464, Tyr314, Ala455 Tyr464, Thr279 Tyr464, Tyr314 121 -9.7 Ser280, Tyr464, Tyr314 168 -9.7 549 44 -9.7 -9.6 Tyr464, Ser280, Ala455, Tyr314 Tyr314, His440, Tyr464 Tyr464, Ser280 446 -9.6 Tyr314, Tyr464 81 -9.5 93 -9.5 206 -9.5 Tyr314, Tyr464, Glu451, Ile447, His440 Ser280, Tyr314, Tyr464, Val444 His440, Tyr464, Tyr314 300 -9.5 His440, Tyr464, Gln277 380 96 -9.5 -9.4 Tyr464 Leu456, Ser280, Tyr464 441 -9.4 His440, Tyr464 74 -9.3 147 -9.1 151 -9.1 183 -9.1 309 -9.1 316 -9.1 Leu456, Ser280, Tyr464, Tyr314 His440, Ser280 Ala455, Tyr314, Tyr464, Ser280 Ala455, Gln277, Tyr464, His440 Ser280, Tyr314, Tyr464, Ala455 Ala455, Cys276, Tyr314, 90 Tương tác kỵ nước Val324, Leu321, Cys276, Val444, Ile447, Phe273 Leu460, Val444, Leu456, Ala454, Ile447 Leu321, Cys276, Leu456, Val444, Ile447 Phe273, Val444, Cys276, Leu321 Phe273, Val444, Cys276, Leu321 Val444, Ala454, Leu456, Leu460, Ile447 Leu321, Val444, His440 Ala454, Val444, Cys276 Val444, Leu456, Ile447 Lys448, Ala454, Leu456, Val444, Cys276, Leu321 Cys276, Met355, Val270, Ala454, Phe273, Val444 Phe273, Cys276 Ile447, Ala454, Leu456 Ile447, Leu456, Ile354, Val444, Met355, His440 Cys276, Ile447, Leu456, Val444 Ile447, Leu456, Ala454 Phe273, Cys276 Phe351, Ile447, Phe273, Ala454, His274, Cys276 Ala454, Leu456, Val444, Cys276 Ile447, Ala454, Leu456 Cys276, Phe273, Ile447, Val444, Leu456 Ala454, Ile447, Leu456, His440, Phe318, Tyr314 Ala454, Val270 Ala454, Leu456, Cys276, His440 Ala454, Phe273 Val270, Ala454 Ala454, Val270, Ile447, His274, Tyr464 325 -9.1 His440, Tyr464 477 -9.1 Phe273, Tyr464 56 -9.0 Tyr314, His440 307 -9.0 Ser280, Tyr464, Tyr314, Ala455 73 -8.9 Glu451, Tyr464, Tyr314 149 -8.9 Ala455, Ser280, Tyr464, Tyr314 470 -8.9 Tyr314, Tyr464, Glu451 100 -8.8 306 321 215 38 496 -8.8 -8.8 -8.7 -8.6 -8.5 382 -8.4 504 -8.0 516 -7.5 Leu456, Val444, Tyr464, Ser280, Tyr314 Tyr464, Tyr314 His440, Tyr464 His440, Tyr464 Tyr314, Tyr464 Tyr464, Thr279 Ala455, Tyr464, Tyr314, Ser280 Thr279, Cys276, Ser280, Tyr464 His440, Tyr464, Cys276, Ala333, Tyr334, Glu286 91 Val444, Leu456, Cys276 Ile447, Phe273, Val444, His274, Ala454, Cys276 Leu321 Met320, Ile317, Leu321, Cys276, Phe273, Ile447 Phe318, Leu456, Ala454, Val270, His440 Leu456, Ala454, Lys448, Ile447, Leu460, Val444, His440 Leu456, Ala454, His440 Val444, Leu456, Ile447, Ala454, Lys448, Leu460, His440 Val270, Lys448, Phe351, Ala454, Leu456, Ile447 Ala454, Leu456, Cys276, His440 Leu456, Ala454, Cys276 Ile447, Ala454, Met355, Cys276 Leu456, Cys276 Val270, Ala454, Val444, His440 Ala454, Ile447, Cys276, Met355, Val444, Phe318, Leu456, His440 Val444, Ile354, Val270, Ala454 Leu321 PHỤ LỤC 11 Mã số 556 510 559 569 401 413 273 369 Điểm gắn -10.7 -10.2 -10.1 -9.9 -9.7 -9.7 -9.5 -9.5 Liên kết Hydro His:323, Tyr473 Ser342, Tyr473, Met364 Ser289, Tyr473, Cys285, Arg280, Glu259, Ser342 Phe282, His323 Tyr473 Cys285, Arg288, Ser342 His449, Tyr327, Ser289, Tyr473 Tyr327, Tyr473, Ser289 Ser342, Ser289 -9.5 383 549 159 -9.4 -9.3 Tyr473 Ile281, Gln286, Tyr473 Cys285, Tyr473, Met364 -9.2 363 504 -9.2 Tyr473, Tyr327, Cys285, Gln286, Phe282 Met364, Tyr473, His449 -8.9 311 453 624 21 169 182 -9.1 -9.1 -9.0 -9.0 -9.0 Tyr473, Phe363, Met364 Ser342, Tyr473, Ser289 Ser342, Tyr473, Ser289 Ser289 Leu340, Tyr327, Tyr473, Phe282 Tyr473, Met364 -9.0 301 304 -9.0 Tyr473 92 Tương tác kỵ nước Glu291, Arg288, Ile341, Cys285, Val339 Arg288, Phe282, Ile341, Leu330, Met364 Arg288, Ile341, Gly284, Leu270, Ile281 Val339, Ile341, Arg288, Leu330, Cys285 Met364, Lys367, Leu330, Cys285, His449 Lys367, Cys285, Val339, Leu330 Arg288, Leu330, Lys367, Phe282, Cys285 Ile341, Arg288, Leu330, Val339 Phe282, Leu330, Leu333, Arg288, Ile341, Leu270, Val339 Leu330, Arg288, Cys285 Met348, Ile341, Leu330 Cys285, Phe282, Leu469, His323, Val339, Lys367, Leu330, His449, Tyr473 Leu330, Met364, Arg288, Ile341 Lys367, Leu330, Val339, His232, Leu469, Tyr473, His449 Cys285 Leu469, His449, Leu330, Lys367, Met364, Cys285 Arg288, Ile341, His323, Leu330 His323, Cys285, Tyr327, Ile341 His449, Arg288, Cys285, Leu330, Val339 Ile341, Met348, Leu330, Arg288 Phe282, His323, Leu469, His449, Val339, Lys367, Leu330, Met364 Met364, Val339, Phe282, Leu330, Cys285 Tyr473, His323 -9.0 484 Tyr473 -8.9 300 Met364, Tyr473, His449 -8.9 310 Ser289, His323, Tyr473 -8.9 398 400 -8.9 -8.8 Tyr473, Phe363, Met364 Ser342, His449, Tyr327, Tyr473 268 Tyr473 -8.8 586 Met364, His449, Tyr473 -8.8 637 73 131 305 441 442 456 576 -8.7 -8.7 -8.7 -8.7 -8.7 -8.7 -8.7 Tyr473, Phe363 Tyr327, Tyr473, His323, Gln286, Ile281 Tyr473, Met364 Tyr473 Tyr473 Tyr473 Cys285, Arg288, Gly284, Met364, Tyr473 Tyr473 -8.5 14 229 354 440 -8.5 -8.4 -8.4 His323, Tyr473 Tyr473 His323 93 Cys285, Lys367, Leu330, Ile326, Met329, Arg288, Ala292 Met364, Val339, Phe282, Leu330, Cys285, Tyr473, Leu469, His323, His449, Lys367 Lys367, Leu330, Val339, His323, Leu469, His449, Cys285 Ile326, Arg288, Cys285, Leu330, Lys367, Met364, His449 Leu330, Cys285, Lys367 Arg288, Val339, Ile341, Leu330, Lys367, Met364, Cys285 Ile341, Leu330, Lys367, Met364, Cys285, Phe282, Tyr473, His449, Tyr327, His323, Leu469 Val339, Met364, Leu330, His449, Met348, Ile341, Leu465, His323, Leu469 Leu330, Cys285, Met329, Ile326, Ala292, Arg288 Me348, Leu270, Ile341, Lys367, Leu330, Cys285 Val339, Met364, Lys367, Leu330, His449, Tyr473 Leu330, Met364, Lys367, His449 Leu330, Leu469, His449, Met364, Cys285 Leu330, Lys367, Cys285, Met364, His449, Leu469 Cys285, Met348, Ile341, Arg288 Val339, Met334, Leu330, Met329, Ile326, Ala292, Arg288 Cys285, His449, Val339, Lys367, Leu330 Leu333, Val339, Cys285, Arg288, Cys285 Cys285, Lys367, Met364, -8.4 496 -8.3 99 -8.3 112 -8.3 356 -8.3 381 70 -8.2 -8.2 458 -8.0 35 Tyr473, Phe282 Tyr473, His323, Phe282 Tyr473, His323, Phe282, Tyr327 Tyr473, His323 Tyr473 Tyr473, Tyr327, Phe282 Tyr473 Tyr473, Tyr327 Ser289, Tyr327 -8.0 98 -8.0 113 Cys285, Ser289, Tyr473, Tyr327 Tyr473, Arg288, Met329 -7.9 17 109 -7.9 Cys285, Ser289 Leu330 Ile341, Arg288, Met348, Leu330, Met364 Leu330, Met334, Cys285, Lys367 Leu330, Met334, Val339, Cys285, Arg288, Ile341 Cys285, Leu330, Met364, Lys367 Val339, Leu330, Leu333, Arg288 Val339, Ile341, Leu330 Cys285, Leu330, Met364, Lys367 Cys285, Leu330, His449, Lys367, Met364 Phe282, Met364, His449, Phe363, Cys285, Leu330, Arg288 Ile341, Arg288, Leu330 His449, Leu469, Leu453, Leu465, Ala292, Leu330, Glu295 Ile341, Arg288, His323, Cys285 PHỤ LỤC 12 Mã số Điểm gắn Liên kết Hydro 553 -9.9 His323 404 -9.6 Tyr473, His323 510 -9.4 Ile364, His449, Thr288 634 -9.2 His323, Ile363 401 -9.1 Tyr473 73 -9.0 His449, His323, Tyr473 21 -8.8 Ser332, Met228, Glu295, Cys287 Met329, Ala342, Trp264 639 -8.8 Ile363, His323, Tyr473 Leu330, Val341, Cys285, His449, Met453, Ile364, Lys367, Leu330, His449 94 Tương tác kỵ nước Leu330, Leu339, Val281, Val341, Val348, Arg284, Cys285, His449 Leu330, Ile364, Lys367, Leu330, His449, Cys285, Met453, His449 Lys367, Leu330, Cys285, Val348, Val341, Ile364 Cys285, Leu330, Ile364, Lys367, His449 Ile364, Lys367, Leu330, Cys285, Met453, His449 Leu330, Cys285, Val348, Val281, Val341, Arg284 477 -8.7 His449, Ile364 483 -8.7 His449 212 -8.5 Thr289 175 -8.2 Thr289, His449, Arg284 637 -8.2 Ile363, Tyr473 119 -8.1 His449, Tyr473 435 -8.1 Tyr473, His323 564 -8.1 Tyr473 312 -8.0 Tyr473 412 -7.8 Tyr473, His323, Ile363 95 Val348, Cys285, Lys367, Leu330, Leu339, His449, Val281, Leu255, Arg284, Ile364, Ile249 Val348, Arg284, Val281, Leu339, Leu330, Ile364, Val341 Val334, Phe368, Leu339, Lys367, Leu330, Ile364, Val281, Cys285, His449 Leu330, Val341 Lys367, Ile364, Leu330, Cys285, Met453, His323, Leu469, Tyr473, His449 Leu339, Ile363, Ile364, Cys285, His449 Ile364, Lys367, Leu330, Cys285, His449 Leu339, Val341, Leu330, Cys285, Met453, Leu469, His323, Tyr473, His449 Leu333, Leu339, Leu330, Val341, Met453, Leu469, Tyr473, His323, Cys285, His449 Ile364, Lys367, Leu330, Leu339, Cys285, His449