Vi khuẩn y học dùng cho đào tạo bác sĩ và học viên sau đại học

LCG oe ' RY E S\ 3) Chi đạo biên soạn: VU KHOA HOC VA DAO TẠO ~ BỘ Y TẾ Chủ biên: PGS.TS LE VAN PHUNG 'Tham gia biên soạn: G§.TS LÊ HUY CHÍNH PGS TS DINH HOU DUNG PGS, TS BÙI KHẮC HẬU PGS TS LE HỒNG HINH PGS TS NGUYEN BINH MINH ‘TS PHAM HONG NHUNG PGS TS LÊ VĂN PHUNG PGS, TS NGUYEN VŨ TRUNG PGS, TS NGUYEN TH] TUYEN PGS TS NGUYEN THI VINH “Thư ký biên soạn: TS PHAM HONG NHUNG Tham gia tổ chức thải “th PHÍ VĂN THÂM ‘TS NGUYEN MANH PHA ' Bản thuộc Bộ Y tế (Vụ Khoa học va Đảo tạo) Mã số: 7K827Y9 ~ DAI 1040 — 2009/CXB/3 - 1960/GD LỜI GIỚI THIEU Nhằm bước nâng cao chất lượng đào tạo nhân lực y tế, tạo điểu kiện thuận lợi cho việc học tập học viên, sinh viên ngành Y, Bộ Ÿ tế tổ chức biên soạn cho xuất tài liệu dạy ~ học chuyên môn phục vụ cho công tác đào tạo đại học, cao đẳng, trung cấp dạy nghề ngành Y tế, Nay Bộ Y té tiếp tục che biên soạn tài liệu day ~ học chuyên dé va text book để kịp thời phục vu cho công tác tạo sau đại học đào tạo liên tục cho cân ngành Y tế Cuốn sách Vì khuẩn y học biên soạn dun vào chương trình đào tạo bác sĩ chuyên khoa thạc sĩ trưởng Đại học Y Hà Nội với phương châm: kiến thức bản, hệ thống; nội dung xác, khoa học, cập nhật tiến khoa học ~ kỹ thuật đại thực tiễn Việt Nam Cuốn sách Vi khuẩn y học biến soạn giáo sư, tiến sĩ, nhà giáo giàu kinh nghiệm chuyên ngành Vi sinh y học Sách Hội đồng chuyên môn thẩm định sách tài liệu dạy ~ học chuyên ngành Vĩ sinh y học Bộ Y tế thẩm dinh nam 2009, BO Y tế định ban hành tài liệu day — hoc đạt chuẩn chuyên môn ngành giai đoạn Trong trình sử dụng, sách chỉnh lý, bổ sung cập nhật Bộ Y tế xin chân thành cảm ơn nhà giáo, chun gia Bộ mơn Vì sinh y học, trường Đại học Ý Hà Nội đành nhiều cơng sức hồn thành sách Bộ Y tế xin cảm ơn G8.T§ Hồng Thủy Long, Chủ tịch Hội đồng; GS.TSKH Nguyễn Văn Dịp, PGS.TS Nguyễn Thanh Bảo phản biện ủy viên Hội đồng 4a dec dong gop nhiều ý kiến quý báu để sách hồn thiên, Vì lần dầu xuất bản, chúng tơi mong nhận ý kiến đồng góp đồng nghiệp, bạn sinh viên độc giả để sách hoàn chỉnh cho lần xuất sau, VY KHOA HOC VA DAO TẠO - BỘ Y TẾ LỜI NÓI ĐẦU © nude ta, bệnh nhiễm trùng bệnh có tỷ lệ mắc tử vong cao mơ hình bệnh tật tương lai gần Trong số cân nguyên gây bệnh nhiễm trùng, vi khuẩn đóng vai trị quan trọng tỷ lệ gây bệnh mức độ trầm trọng bệnh chúng gây Vì vậy, hiểu biết vi khuẩn có tẩm quan trọng y học (gọi tắt Ví khuẩn y học) nhu cầu cần thiết để có sở khoa học cho chẩn dốn, điều trị dự phịng bệnh nói trên, góp phần xứng đáng vào việc bảo vệ sức khoẻ nhân dân Dé dap tng mot phan nhu cầu đó, Bộ môn Vi sinh y hoe, Trường đại học Y Hà Nội biên soạn Vĩ khuẩn y học, dùng cho học viên sau đại học cần làm việc ngành có liên quan đến vi khuẩn gây bệnh Mục tiêu Vi khuẩn y học phục vụ cho đối tượng sau đại học, chuyên ngành Vì sinh y học, người học qua mơn Vì sinh bậc đại học, Vì vậy, vi khuẩn, tác giả trình bày dạng mô tả tỉ mỉ tỉnh chất sinh học quan trọng chúng; sở để định danh dựa tính chất hình thể, ni cấy, sinh vật hố học, kháng ngun, gen đặc hiệu sở để nghiên cứu độc lực; khả năng, chế gây bệnh kháng thuốc; sản xuất vác xin, huyết chế phẩm sinh học đặc hiệu Co chế gây bệnh, chuyển dịch tế học, độc tính đặc biệt ý mô tả để làm sở khoa học cho biện pháp phòng diéu trị đặc hiệu bệnh chúng gây Cuốn Vi khuẩn y học để cập đến hầu hết vi khuẩn gây bệnh chủ yếu nước ta Trong vi khuẩn, chúng tơi cố gắng trình bày kiến thức trở thành kinh điển thời gian gần (không phải kết nghiên cứu chúng) Vì vậy, sách mang tính chất giáo khoa chật chẽ tài liệu tham khảo có giá trị cơng tác ngày đối tượng có liên quan Vi khuẩn y học tập sách giáo khoa hoàn chỉnh, gồm tập, Vi sinh y học: Đại cương Vi sinh y học, Vi khuẩn y học Virus y học Vi vậy, kiến thức chung vi khuẩn tìm hiểu tập có liên quan mà khơng dược trình bày lại Vi khuẩn y học Sach Vi khuẩn y học có phần, phân cách tương đối theo hình thể, tính chất bắt màu vi khuẩn nhuộm Qram số đạc điểm sinh học đặc trưng: Phan 1: Đại cương vi khuẩn Phần 9: Câu khuẩn Gram dương Phần 3: Câu khuẩn Gram âm Phần 4: Trục khuẩn Gram dương Phần 6: Vì khuẩn Gram âm Phân 6: Xoắn khuẩn Phần 7: Vì khuẩn ky khí Phần 8: Vì khuẩn ký sinh nội bào bắt buộc Sách Vì khuẩn v học Trường đại học Y Hà Nội Bộ Y tế phi duyệt, cho phép dùng làm tài liệu giảng dạy cho đổi tượng sau đại học, chuyên ngành Vì sinh y hoe Mặc du cổ găng ích biên soạn, xuất lấn đầu bàn, chê kiến thúc, ehản sách cên nhiều thiếu sót, Chúng tơi xin chân thành cảm ơn góp ÿ quý báu bạn đọc, để lân xuất sau, sách hoàn thiện Xin chân thành cảm ơn Bộ Y tế (Vụ Khoa học - Đào tạo), Hội đồng thẩm định sách Bộ số đơn vị giúp đỡ để sách bạn đọc, phục vu dao tao nhụ cầu tham khảo chuyên ngành Vĩ sinh ý học Chủ biên PGS TS LE VAN PHUNG MỤC LỤC Lai giới thiệu Lai nai đầu Phần Đại cương khuẩn Phần Cầu khuẩn Gram dương Streptococei Streptococeus pneumoniae Staphylococci Phản Cầu khuẩn Gram âm Moraxella catarrhalis Neisseria meningitidis Neisseria gonorrhoeae Phén 4, Trực khuẩn Gram dương Corynebacterium diphtheriae Bacillus subtilis Bacillus cereus Bacillus anthracis Listeria Mycobacterium tuberculosis Mycobacterium leprae Mycobacterium khing dién hình Actinomycetes hidu ki Nocardia spp Actinomycetes khắc Phan Vi khuẩn Gram âm Enterobacteriaceae Escherichia coli Salmonella Shigella Yersinia Một số vi khuẩn đường ruột gây nhiễm trùng hội thường gập Tế Văn Phủng Nguyễn Thị Tuyến Tê Huy Chính Lê Huy Chính Nguyễn Võ Trung Tê Văn Phùng 18 Hồng Hình 68 68 79 98 Lé Huy Chink Bùi Khắc Hậu Bài Khác Hậu Bài Khắc Hậu Lê Văn Phủng Lê Huy Chính Tê Huy Chính Tê Huy Chính Phạm Héng Nhung Phạm Hồng Nhung Phạm Hồng Nhung 106 106 136 139) 141 148 164 177 178 180 180 193 Đình Dinh Đỉnh Dinh Dink Dung Dung Dung Dung Dung 198 198 211 220 289 341 Đình Hữu Dung 247 Hữu Hitu Hữu Hitu Hitu Vibrionaceae Aeromonas va Plesiomonas spp Pseudomonas aeruginosa Burkholderia Acinetobacter Haemophilus influenzae Bordetella Bruceiin Actinobacillus actinomycetemcomitans Rartoneita Mycoplasma Legionelia Metieubacter pylar’ Gampstobacter Phản Xoẫn khuẩn Leptospira Treponema Borrelia Phdn Vi khuan ky bat bude Cấu khuẩn Gram đương, ky khí Clostridium Clostridium tetani Phan 8, Vi khudin kg sinh bào bắt buộc Rickettsia Một số Rickettsia thing gap Chiamydia Coxiella burnetii Phu ban Tra cứu (Index) Nguyễn Dinh Minh Nguyễn Bình Minh Tê Văn Phủng Lê Văn Phủng Nguyễn Vũ Trung: Dinh Hitu Dung La Van Phing Bui Khắc Hậu Nguyễn Vũ Trung Phạm Hồng Nhung Nguyễn Thị Vinh 260 271 290 Nguyễn Thị Tuyến Bai Khắc Hiệu Bui Kade Hậu Nguyễn Thị Vinh Nguyễn Thị Vinh Nguyễn Thị Vinh 432 489 443 456 Nguyễn Thị Vinh 468 469 Nguyễn Thị Vinh 475 Nguyễn Thị Vinh Bài Khắc Hậu Bùi Khắc Hậu Nguyễn Thị Vink Lé Van Phiing 470 481 489 401 494 au 51T 529 Phan DAI GUONG VI KHUAN PHAN LOAI VI KHUAN 1, GIỚI THIỆU CHUNG Lịch sử phân loại vi khuẩn bắt đầu với đồi kính hiển vị, Antony van Leeuwenhoek phat minh, vao nam 1653 Ha Lan Neay 7/9/1674, bing chiée kính hiển vi đơn giản (so với ngày nay), Leeuwenhoek da mhin thay va m6 td nhing sinh vật nhỏ bổ wuee animalcules", ngày gọi øỉ khuẩn), sống nước hổ, mà mắt thường khơng thấy Đó thời điểm đánh đấu phát loài người gidi vi sinh vat Nga sau nhìn thấy vi khuẩn, Leeuwenhoek mơ tả vẽ loại hình thể phố biến chúng mà ơng quan sát xếp thành nhóm mà ngày chủng ta gọi cứu khuẩn, trực khuẩn xoắn khuẩn Cơ thể coi phân loại khuẩn lồi người, phân loại dựa đặc điểm hình thể bơn chứng, Tuy vậy, phải sau thể kỷ, năm 1778, Mũllar người có cãi nhìn có ý thức thực phân loại vị khuẩn, Sau đó, phải thêm kỷ nữa, nhố phát n khoa học công nghệ, vi khuẩn hiểu biết sâu sắc hơn, nôn phan loại khuẩn tới đạt trình đ ÿ nghĩa Hệ thống phân loại cổ điển hai rào cản chính: 1) Dựa chủ yếu vào hình thể vi khuẩn Đương thời, người ta tin rằng, hình thể vị khuẩn tiêu chuẩn quan trọng để phân loại chúng, ví dụ tất cầu khuẩn đếu vào họ khuẩn xu hướng ngược cầu khuẩn methane, xếp chưng vào nhóm (họ bộ), trực khuẩn mủ xanh xếp đường ruột hay bạch hầu với P, aenes!, Tuy vậy, có lại, dựa nhiều vào tính chất sinh lý vi khuẩn, ví dụ lên men tách khỏi loại quang hợp (photosynthetic), sinh khử nitơ 3) Chưa có kỹ thuật ni cấy Kỹ thuật phát triển tử cuối kỷ XIX Røbert Kock Tiến kỹ thuật đồng vai trò quan trọng dé phát triển quy trình dại việc hệ thống hố khuẩn Ni cấy giống mẫu (sample) riêng rõ thực vật học, cịn có nhiều cơng dụng giữ tỉnh trạng séng (viable state}, cấy chuyển, đổi tượng khơng hạn chế số lượng cho thư nghiêm, chuyển từ nơi đến nơi khác cách để dang Tất điều dã tao điều kiện thuận lợi cho sy phát triển không ngưng phân loại học Thước cố trợ giúp máy tính (phân loại sổ) sau sinh học phân tử, phương phấp phân loại khuẩn truyền thống déu thoo công thúc: 0m, cảng nhiều cảng tốt, đạc điểm chúng øau đố xốp chủng dưa vào điểu trực giác nhà hệ thổng học (svstematis0) Vì vậy, tơn nhiều ø đổ phân loại khác dựa trõn trực giấc khác nhà nhân loại khảo mã đến ngày khea học hi dại phải xem xét lại cách kỹ lường, Các nhà hệ thông học thường biết rat xô đối tượng (vị khuẩn) sap x chúng trực giác dựa sự, phong phú thơng tìn mà cá nhân thu thập dược Những số liệu họ, chưa xử lý máy tỉnh xử lý óc "lớn" họ nêu tương đối xác mối quan hệ dang tổn xì khuẩn Phân loại phải dựa vào tập hợp tính chất, khơng tính chất nào, dù "điển hình" hay "đặc trưng" đến khơng có giá trị phần loại tuyệt đối Vi dy, Li năm 1944, người ta di nhận thấy tẩm quan trọng số vi khuẩn thuộc ho khuẩn dưỡng ruột (n/erobacteriaceae) khơng lên men lactose, giống Salmonella hay Shigella, chắn khong phai 1a Salmonella va vi vay, d& eo tmọt "Paraaolubaetrami", để xuất (sau Shigella; xuất Hergev's Manual 7", 1957) dựa đặc điểm "hông lên men duing lactose” Tuy vay, sau người ta chứng minh, biến thể (variand coli théng thưởng mã thôi, Vào cuối năm 50 kỷ XX, khái niệm “Phản loại sổ" (Numerical taxonomy) hình thành với đời phát triển nhanh chóng máy tính điện tử (computes) Phân loại trước dựa tính chất hình thể, sinh lý, sinh hố vi khuẩn nhờ óc "lớn cach chủ quan, dẫn đến tình trạng phúc tạp, lộn xộn kể trên; vi vậy, phân loại số phát triển nhằm cung cấp phương pháp đánh giá khách quan đặc tính vi khuẩn để phân loại xác hơn, khách quan so với phương pháp kinh điển Ví dụ, vi khuẩn đường ruột có 21 tỉnh chất sau: 10 PHU BAN é ™ “, oe Hình P1 Hình ảnh liên cầu Hình P2 Hình ảnh khuẩn lạc tiêu nhuộm Gram cẩu khuẩn Gram dương xếp chuỗi liên cẩu tan máu ƒ thạch máu S agalactiae S pyogenes Vùng ức chế Hinh P4 Hinh ảnh khuẩn lạc liên cầu tan máu y thạch mau Hình P3 Test Bacitracin: phân biệt liên cầu nhỏm a với liên cầu tan máu J) khác 3) Hinh P5 Hinh ảnh § pneumoniae nhuộm Gram (a) va nhuộm bãng phương pháp nhuộm vỏ (b) Phế cầu cầu khuẩn Gram dương hinh nến, Xếp thành đôi chuỗi tiêu nhuộm Gram Trên tiêu nhuộm vỏ nhìn rõ vỏ phể cấu (võng sảng) xung quanh vi khuẩn hình nến xếp thành đôi, nằm bên :rong, 39 ÝNHhẨNhọc 517 c) trang, shud! sống (c) tiem phế 10\Tiềm đông thớt anế trang, chudt Hình P7 Sơ đồ giải thích chế biến nạp ADN phế cầu =——==== SE ww Hinh P8 Hình ảnh tụ cẩu tiêu nhuộm Gram câu khuẩn Gram dương, có đường kinh 0,8—1,0 im đứng thành đảm hình chùm nho 518 COXGUE ASE ` Hình P9 Test coagulase phân biệt tụ cầu vàng với tụ cầu khác Tụ cầu vàng có coagulase nên gây đông huyết tương thỏ (trái) Những vi khuẩn khác khơng có coagulase, khơng gãy đơng huyết tương (phải) Hinh P10 Ty cau vang moc môi trường Chapman Tụ cầu vàng có khả lên men mannitol sinh acid làm thay đổi chất thị màu đỏ phenol trortg môi trường từ đỏ chuyển thành vàng, Hinh P12 Moraxella catarrhalis nhuöm Gram la cac song cau Gram âm hình hạt phê úp hai mầt dẹt vào kích thước Hinh P11 Test novobiocin phan biét S saprophyticus với CONS khác $ saprophyticus (trai, kháng Novobiocin), S øpidermidis (phải, nhạy cảm với Novobiocin) Hình P13 Test DNase: xác định vi khuẩn có hay khơng enzym DNase Vi khuẩn có enzyme sé thuy phan ADN va két hop từ 0:5-1,5 ¡m, đứng thành đi, bổn với xarth methyl môi trưởng tạo quảng Hình P14 Khuẩn lạc não mơ cẩu mơi Hinh P15 Vi khuẩn lậu tiêu đảm nhỏ sảng xung quanh nơi vi khuẩn mọc trường thạch máu cừu 5% khuẩn lạc trịn, bóng, nhuộm Gram Hinh ảnh điển hỉnh song cầu có vẻ, kịch thước 1-1,5 mm, không tan máu bash cau da nhan trung tinh thoai hoa lấp lãnh, đục có mảu xám dạng nhay Gram âm, hình hạt cà phê đứng lèn chặt vào 519 €ytoplasm Ribosomes eg Nucleoid Plasina membrane Peptidoglycan we ——— membrai Capsule Hinn P16 Hình P17 Khuân lac lậu cầu môi trương chocolat Khuẩn lạc dạng S mau xảm, Cau trac vi khuan lau văng, - không tan máu = đc ` Hinh P18 Hinh anh C, diphtheriae Hình P19 Hình ảnh khuẩn lạc tiêu nhuộm Gram € diphtheriae môi trường thạch máu Hình P20 Màng giả bệnh bạch hầu Hinh P21 B subtilis tiêu 520 nhuộm Gram Hình P22 Khuan lac cua B subtilis mơi trường thạch máu Hình P24 Tiêu nhuộm Ziehl-Neelsen trực khuẩn lao Hinh P26, Khuẩn lạc trực khuẩn lao môi trường Middlebrook Hinh P23 Khuan lac cia Listeria trường thach mau Hinh P25, Khuẩn lạc trực khuẩn lao mơi trưởng Lowenstein —Jensen Hình P27 Tiêu nhuộm Z2iehl-Neslsen trực khuân phong $21 Hinh P29 Khuan lạc Nocardia asteroides trưởng BCYE Ñ Hinh P28 Khuan lac cua Nocardia asteroides trường thạch mau B A Hinh P30 Hinh ảnh nhuộm Gram vi khuẩn đường ruột A E coli, B Proteus vulgaris Hinh P31 Hinh ảnh nhuộm Gram _ pneumoniae bénh phẩm đờm Có the nhìn rõ vỏ vi khuẩn vùng sảng quanh vi khuẩn tương phản với mâu tiêu Hinh P32 Khuẩn lạc K pneumoniae mơi trường MacConkey nhầy, bóng, lấp lánh có vỏ Hình P34, Profeus mọc lan môi trường Hinh P33 Khuẩn lạc Y pestis trường đặc thành lớp sóng đống tâm thạch mâu sau 48-72h 7@ fi Increosed ⁄ c=lergÀcla cyclone mmmmmmmnnmmb, T