tạo giống lúa thuần khoáng rầy nâu bằng công nghệ chỉ thị phân tử

BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT VIỆN KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM CHƯƠNG TRÌNH CÔNG NGHỆ SINH HỌC NÔNG NGHIỆP BÁO CÁO TỔNG HỢP KẾT QUẢ KHOA HỌC CÔNG NGHỆ ĐỀ TÀI TẠO GIỐNG LÚA THUẦN KHÁNG RẦY NÂU BẰNG CÔNG NGHỆ CHỈ THỊ PHÂN TỬ Cơ quan chủ trì đề tài : Viện Di truyền Nông nghiệp Chủ nhiệm đề tài : TS. Lưu Thị Ngọc Huyền 8641 Hà Nội - 2010 TẠO GIỐNG LÚA THUẦN KHÁNG RẦY NÂU BẰNG CÔNG NGHỆ CHỈ THỊ PHÂN TỬ Hà Nội - 2010 BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT VIỆN KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM CHƯƠNG TRÌNH CÔNG NGHỆ SINH HỌC NÔNG NGHIỆP BÁO CÁO TỔNG HỢP KẾT QUẢ KHOA HỌC CÔNG NGHỆ ĐỀ TÀI TẠO GIỐNG LÚA THUẦN KHÁNG RẦY NÂU BẰNG CÔNG NGHỆ CHỈ THỊ PHÂN TỬ Cơ quan chủ trì đề tài : Viện Di truyền Nông nghiệp Chủ nhiệm đề tài : TS. Lưu Thị Ngọc Huyền Hà Nội - 2010 1 VIỆN KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM VIỆN DI TRUYỀN NÔNG NGHIỆP __________________ CỘNG HOÀ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập - Tự do - Hạnh phúc Hà Nội, ngày 30 tháng 10 năm 2010 BÁO CÁO THỐNG KÊ KẾT QUẢ THỰC HIỆN ĐỀ TÀI/DỰ ÁN SXTN I. THÔNG TIN CHUNG 1. Tên đề tài/dự án: Tạo giống lúa thuần kháng rầy nâu bằng công nghệ chỉ thị phân tử Mã số đề tài, dự án: Thuộc: “Chương trình Công nghệ sinh học Nông nghiệp, Thủy sản” 2. Chủ nhiệm đề tài/dự án: Họ và tên: Lưu Thị Ngọc Huyền Ngày, tháng, năm sinh: 1958 Nam/ Nữ: Nữ Học hàm, học vị: Tiến sĩ Chức danh khoa học: Nghiên cứu viên chính Điện thoại: T ổ chức: 04-38363061 Nhà riêng: 04-38329739 Mobile: 0904 374 057 Fax: 04-37543196 E-mail: huyenluu116@gmail.com Tên tổ chức đang công tác: Viện Di truyền Nông nghiệp Địa chỉ tổ chức: km2, đường Phạm Văn Đồng, Từ Liêm, Hà Nội Địa chỉ nhà riêng: Số 20, ngõ 718, Hoàng Hoa Thám, Tây Hồ, Hà Nội 3. Tổ chức chủ trì đề tài/dự án: Tên tổ chức chủ trì đề tài: Viện Di truyền Nông nghiệp Điện thoại: 04-38363061 Fax: 04-37543196 E-mail: vdt@agi.ac.vn Website: Địa chỉ: km2, đường Phạ m Văn Đồng, Từ Liêm, Hà Nội. Họ và tên thủ trưởng tổ chức: PGS.TS. Lê Huy Hàm Số tài khoản: : 301.01.035.01.16 2 Ngân hàng: Kho bạc Nhà nước huyện Từ Liêm Tên cơ quan chủ quản đề tài: Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn II. TÌNH HÌNH THỰC HIỆN 1. Thời gian thực hiện đề tài/dự án: - Theo Hợp đồng đã ký kết: từ tháng …./ năm ….đến tháng …/ năm… - Thực tế thực hiện: từ tháng 01 /năm 2007 đến tháng 12/năm 2010 - Được gia hạn (nếu có): không 2. Kinh phí và sử dụng kinh phí: a) Tổng số kinh phí thực hiện: 3.560.000 tr.đ, trong đó: + Kính phí hỗ trợ từ SNKH: 3.560.000 tr.đ. + Kinh phí từ các nguồn khác: 0 tr.đ. + Tỷ lệ và kinh phí thu hồi đối với dự án (nế u có): Không b) Tình hình cấp và sử dụng kinh phí từ nguồn SNKH: Theo kế hoạch Thực tế đạt được Số TT Thời gian (Tháng, năm) Kinh phí (Tr.đ) Thời gian (Tháng, năm) Kinh phí (Tr.đ) Ghi chú (Số đề nghị quyết toán) 1 2007 900 2007 890 890 2 2008 1260 2008 795.6 795.6 3 2009 700 2009 1.104,4772 1.104,4772 4 2010 700 2010 697,915 697,915 Tổng số 3.5560 Tổng số 3.487,9922 3.487,9922 - Lý do thay đổi: Tổng chênh lệch kinh phí 72.007.800 đồng + Nộp lại NS năm 2007 : 10.000.000 đồng + Tiết kiệm năm 2008 : 54.400.000 đồng + Đấu thầu H/C 2009 giảm: 122.800 đồng + Đấu thầu TB năm 2009 giảm: 5.400.000 đồng + Đấu thầu H/C 2010 giảm: 75.000 đồng + Hội nghị đầu bờ 2010 giảm: 2.010.000 đồng 3 c) Kết quả sử dụng kinh phí theo các khoản chi: Đối với đề tài: Đơn vị tính: Triệu đồng Theo kế hoạch Thực tế đạt được Số TT Nội dung các khoản chi Tổng SNKH Ng. khác Tổng SNKH Ng. khác 1 Trả công lao động (khoa học, phổ thông) 870,1 870,1 0 849,74 7 849,74 7 2 Nguyên, vật liệu, năng lượng 1453,25 1453,2 5 0 1.422,2219 1.422,2219 3 Thiết bị, máy móc 610 61 0 0 604, 6 604, 6 0 4 Xây dựng, sửa chữa nhỏ 113 113 0 113 113 0 5 Chi khác 513,65 513,6 5 0 498,4233 498,4233 0 Tổng cộng 3.560 3.56 0 0 3.487,9922 3.487,9922 - Lý do thay đổi: Tổng chênh lệch kinh phí 72.007.800 đồng + Nộp lại NS năm 2007 : 10.000.000 đồng + Tiết kiệm năm 2008 : 54.400.000 đồng + Đấu thầu H/C 2009 giảm: 122.800 đồng + Đấu thầu TB năm 2009 giảm: 5.400.000 đồng + Đấu thầu H/C 2010 giảm: 75.000 đồng + Hội nghị đầu bờ 2010 giảm: 2.010.000 đồng Đối với dự án: Đơn vị tính: Triệu đồng Theo kế hoạch Thực tế đạt được Số TT Nội dung các khoản chi Tổng SNKH Nguồn khác Tổng SNKH Nguồn khác 1 Thiết bị, máy móc mua mới 2 Nhà xưởng xây dựng mới, cải tạo 3 Kinh phí hỗ trợ công nghệ 4 Chi phí lao động 5 Nguyên vật liệu, năng lượng 6 Thuê thiết bị, nhà 4 xưởng 7 Khác Tổng cộng - Lý do thay đổi (nếu có): 3. Các văn bản hành chính trong quá trình thực hiện đề tài/dự án: (Liệt kê các quyết định, văn bản của cơ quan quản lý từ công đoạn xác định nhiệm vụ, xét chọn, phê duyệt kinh phí, hợp đồng, điều chỉnh (thời gian, nội dung, kinh phí thực hiện nếu có); văn bản của tổ chức chủ trì đề tài, dự án (đơn, kiến nghị điều chỉnh nếu có) Số TT Số, thời gian ban hành văn bản Tên văn bản Ghi chú 1 Quyết định số 3876 QĐ/BNN- KHCN ngày 19 tháng 12 năm 2006 Phê duyệt tổ chức, cá nhân,mục tiêu, dự kiến kết quả, kinh phí và thời gian thực hiện các đề tài thực hiện từ năm 2007 của “Chương trình trọng điểm phát triển và ứng dụng công nghệ sinh học trong lĩnh vực nông nghiệp và phát triển nông thôn đến năm 2020” 2 Số 3451/ BNN-KHCN ngày 03/7/2007 Thông báo: Điều chỉnh đề tài thuộc Chương trình CNSH năm 2006 và 2007 3 Số 784/ KHNN-KH ngày 27/7/2007 Thông báo: Nội dung và kinh phí năm 2007 4 Số 381/ HĐ-BNN-KHCN ngày 26/11/2007 Hợp đồng trách nhiệm thực hiện đề tài nghiên cứu khoa học công nghệ 5 Số 421/ CV/VDT-KH Ngày 24/10/2007 Công văn về việc thay đổi danh mục mua thiết bị năm 2007 6 Số 5847/ BNN-KHCN Ngày 05/11/2007 Công văn về việc thay đổi thiết bị mua sắm của đề tài thuộc Chương trình CNSH nông nghiệp 7 Số 123/ KHNN-KH Ngày 22/2/2008 Thông báo: Kế hoạch vốn sự nghiệp khoa học đợt 1 năm 208 8 Số 108/ KHNN-KH Ngày 11/2/2009 Thông báo: Kế hoạch khoa học công nghệ đợt 1 năm 2009 9 Số 239/ KHNN-KH Thông báo: Kế hoạch khoa học công nghệ năm 2010 5 Ngày 04/3/2010 10 Số 1776/QĐ- BNN-KHCN ngày 23/6/2010 Quyết định: Điều chỉnh nhiệm vụ KHCN thực hiện trong giai đoạn 2006-2010 thuộc “Chương trình trọng điểm phát triển và ứng dụng công nghệ sinh học trong lĩnh vực nông nghiệp và phát triển nông thôn đến năm 2020” 4. Tổ chức phối hợp thực hiện đề tài, dự án: Số TT Tên tổ chức đăng ký theo Thuyết minh Tên tổ chức đã tham gia thực hiện Nội dung tham gia chủ yếu Sản phẩm chủ yếu đạt được Ghi chú* 1 Viện Lúa Đồng bằng Sông Cửu Long Viện Lúa Đồng bằng Sông Cửu Long - Tuyển chọn và đánh giá vật liệu, tính kháng rầy, tiến hành lai và hồi giao. - Chọn giống nhờ chỉ thị phân tử và quy tụ gen phục vụ chọn tạo giống lúa kháng rầy nâu cho ĐB sông Cửu Long - 2 giống lúa gửi khảo nghiệm - 15 dòng lúa triển vọng 2 Viện Bảo vệ Thực vật Viện Bảo vệ Thực vật - Phối hợp đánh giá tính kháng rầy nâu (Theo hợp đồng với chủ nhiệm đề tài) -Kết quả đánh giá tính kháng rầy nâu của quần thể lập bản đồ -Kết quả đánh giá tính kháng rầy nâu của các dòng chọn lọc, dòng triển vọng và giố ng khảo nghiệm 6 3 Viện Cây Lương thực và cây thực phẩm - Lý do thay đổi (nếu có): Viện Di truyền Nông nghiệp và Viện Lúa Đồng Bằng sông Cửu Long có thể thực hiện thí nghiệm đánh giá các đặc tính nông sinh học của các dòng chọn lọc, dòng triển vọng mà không cần sự tham gia của Viện Cây Lương thực và cây thực phẩm. 5. Cá nhân tham gia thực hiện đề tài, dự án: (Người tham gia thực hiện đề tài thuộc tổ chức chủ trì và cơ quan phối hợp, không quá 10 người kể cả chủ nhiệm) Số TT Tên cá nhân đăng ký theo Thuyết minh Tên cá nhân đã tham gia thực hiện Nội dung tham gia chính Sản phẩm chủ yếu đạt được Ghi chú* 1 TS. Lưu Thị Ngọc Huyền TS. Lưu Thị Ngọc Huyền Xây dựng thuyết minh, báo cáo kết quả. Tổ chức thực hiện đề tài. Tham gia tất cả các nội dung của đề tài. Sản phẩm khoa học chính của đề tài Chủ nhiệm đề tài 2 PGS. TS. Vũ Đức Quang PGS. TS. Vũ Đức Quang Xây dựng bản đồ liên kết phân tử cho 1 gen kháng rầy nâu. Xây dựng quy trình chọn tạo dòng lúa kháng rầy nâu bằng công nghệ chỉ thị phân tử Bản đồ liên kết phân tử cho gen BphZ Quy trình chọn tạo dòng lúa kháng rầy nâu bằng công nghệ chỉ thị phân tử 3 KS Nguyễn Trịnh Toàn TS. Thiều Văn Đường - Lai tạo và chọn dòng lúa kháng rầy nâu - Một số dòng lúa kháng rầy nâu 7 4 TS. Lưu Minh Cúc TS. Lưu Minh Cúc Xây dựng thuyết minh, báo cáo kết quả. Tham gia lập bản đồ, chọn tạo các dòng lúa, quy tụ gen kháng, nhân dòng và thử nghiệm. Bản đồ liên kết phân tử cho gen BphZ Kết quả chọn tạo các dòng lúa bằng chỉ thị phân tử kết hợp chọn giống truyền thống Thư ký đề tài 5 Ths. Đinh Văn Thành Ths. Đinh Văn Thành Đánh giá kiểu hình các cá thể của quần thể lập bản đồ. Đánh giá tính kháng rầy nâu của các dòng chọn lọc, các dòng triển vọng. Kết quả đánh giá tính kháng rầy nâu của quần thể LBĐ và các dòng chọn lọc, các dòng triển vọng. 6 KS. Nguyễn Thị Hiền Ths. Trần Thị Thanh Lai tạo các dòng F1, BC của quần thể lập bản đồ và quần thể chọn giống Kết quả lai tạo các tổ hợp lai trong đề tài 7 KS. Doãn Thị Hoà CN. Vũ Thị Thu Hằng Đánh giá kiểu gen của các cá thể quần thể lập bản đồ Số liệu đánh giá kiểu gen bằng chỉ thị SSR 8 KS. Nguyễn Thị Tân Phương KS. Nguyễn Tân Phương Đánh giá kiểu gen của các cá thể quần thể lập bản đồ Số liệu đánh giá kiểu gen bằng chỉ thị SSR 9 PGS.TS. Nguyễn Thị Lang PGS.TS. Nguyễn Thị Lang - Chọn dòng lúa kháng rầy nâu bằng chỉ thị phân tử 02 dòng đã đưa đi khảo nghiệm 14 dòng triển vọng 10 CN. Phạm Thị Minh Hiền CN. Phạm Thị Minh Hiền Lai tạo các dòng F1, BC của quần thể lập bản đồ và Các thế hệ tổ hợp lai trong đề tài và kết quả chọn tạo 8 quần thể chọn giống. Tham gia chọn tạo các dòng lúa, quy tụ gen kháng, nhân dòng và thử nghiệm. các dòng lúa bằng chỉ thị phân tử kết hợp chọn giống truyền thống - Lý do thay đổi ( nếu có): KS. Nguyễn Trịnh Toàn chuyển sang thực hiện chính đề tài “Chọn tạo giống lúa thuần kháng bệnh bạc lá bằng công nghệ chỉ thị phân tử”. KS. Doãn Thị Hòa về hưu. KS. Nguyễn Thị Hiền tham gia một phần thí nghiệm nhỏ. 6. Tình hình hợp tác quốc tế: Số TT Theo kế hoạch (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm, tên tổ chức hợp tác, số đoàn, số lượng người tham gia ) Thực tế đạt được (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm, tên tổ chức hợp tác, số đoàn, số lượng người tham gia ) Ghi chú* 1 Học tập phương pháp lập bản đồ gen, QTL và phương pháp nghiên cứu di truyền ngược trong quần thể lập bản đồ, chọn giống -Thời gian: 01 tháng -Kinh phí: 150 triệu đồng -Trung tâm nghiên cứu Hermitage, Australia -1 đoàn và 2 người thực hiện Học tập phương pháp lập bản đồ gen, QTL và phương pháp nghiên cứu di truyền ngược trong quần thể lập bản đồ, chọn giống -Thời gian: 01 tháng -Kinh phí: 147,5723 tri ệu đồng -Trung tâm nghiên cứu Hermitage, Australia -1 đoàn và 2 người thực hiện 7. Tình hình tổ chức hội thảo, hội nghị: Số TT Theo kế hoạch (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm ) Thực tế đạt được (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm ) Ghi chú* 1 Hội nghị đầu bờ Giới thiệu một số giống lúa kháng rầy nâu Thời gian 10/2010 Kinh phí 7.710 Địa điểm: Duy Tiên – Hà Nam Hội nghị đầu bờ Giới thiệu một số giống lúa kháng rầy nâu Thời gian 10/2010 Kinh phí 5.700 Địa điểm: Duy Tiên – Hà Nam 2 [...]... tác chọn giống lúa kháng rầy nâu thì việc sử dụng chỉ thị phân tử liên kết với các gen kháng rầy nâu được coi là hiệu quả và ưu việt Chính vì vậy chúng tôi tiến hành đề tài Tạo giống lúa thuần kháng rầy nâu bằng công nghệ chỉ thị phân tử Mục tiêu của đề tài - Lập bản đồ phân tử chi tiết cho 1 gen kháng rầy nâu hiệu quả - Sử dụng công nghệ chọn giống nhờ chỉ thị phân tử để tạo 3-4 dòng lúa thuần ưu... giống lúa kháng rầy nâu hiện trồng ở các 1.2.2 tỉnh phía Nam Chỉ thị phân tử ADN 1.3 Chỉ thị SNP 1.3.1 Chỉ thị STS 1.3.2 Chỉ thị SSR 1.3.3 Ứng dụng của chỉ thị phân tử 1.4 Phân tích đa dạng di truyền 1.4.1 Tìm chỉ thị phân tử liên kết gen và lập bản đồ gen ở lúa 1.4.2 Chọn giống nhờ chỉ thị phân tử (Marker Assisted Selection –MAS) 1.4.3 Những nghiên cứu xác định chỉ thị phân tử liên kết gen kháng rầy. .. sản phẩm 1 Bản đồ phân tử chi tiết cho 1 gen kháng hiệu quả với rầy nâu 2 Quy trình sử dụng công nghệ chỉ thị phân tử để tạo giống lúa kháng rầy nâu Yêu cầu khoa học cần đạt Theo kế Thực tế hoạch đạt được 6-8 chỉ thị 6-8 chỉ thị phân tử liên phân tử liên kết gần ở cả 2 kết gần ở cả 2 phía của gen phía của gen kháng rầy kháng rầy nâu, trong đó nâu, trong đó 3-4 chỉ thị có 3-4 chỉ thị có khoảng cách... kháng rầy nâu BphZ trên nhiễm sắc thể lúa thông qua phân tích bulk segregant analyis (BSA) Khảo sát đa hình ADN của cây bố mẹ trên NST số 4 Lập bản đồ phân tử chi tiết cho locus gen kháng rầy nâu BphZ Chọn giống lúa kháng rầy nâu bằng chỉ thị phân tử kết hợp với chọn giống truyền thống Kết quả thiết lập các quần thể chọn giống lúa kháng rầy nâu Sử dụng chỉ thị phân tử trong chọn giống lúa kháng rầy nâu. .. kháng rầy nâu bằng công nghệ chỉ thị phân tử, có thể áp dụng để quy tụ các gen khác trên lúa Kết quả của đề tài đã khằng định hiệu quả của việc áp dụng công nghệ chỉ thị trong chọn giống lúa thuần kháng rầy nâu Đề tài đã xây dựng được một bản đồ phân tử chi tiết cho gen kháng rầy nâu hiệu quả BphZ trong đó 6-8 chỉ thị phân tử liên kết gần ở cả 2 phía của gen kháng rầy nâu, trong đó 3-4 chỉ thị có khoảng... TN1xGC9 Chỉ thị phân tử RM1223 Kết quả điện di sản phẩm PCR của thí nghiệm genotyping các cá thể F2 của tổ hợp TN1xGC9 Chỉ thị phân tử RM3367 Bản đồ phân tử chi tiết gen kháng rầy nâu BphZ Minh họa thí nghiệm thiết kế chỉ thị phân tử trợ giúp trong chọn giống lúa kháng rầy Bên trái: cặp mồi RM3524; bên phải: cặp mồi RM588 Minh họa thí nghiệm thiết kế chỉ thị phân tử trợ giúp trong chọn giống lúa kháng rầy. .. giống lúa ưu việt Phương pháp lập bản đồ phân tử gen kháng rầy nâu Chuẩn bị và thiết lập quần thể lập bản đồ Phân tích genotyping các cá thể F2 phối hợp với đánh giá phenotyping các họ F3 Định vị nhóm liên kết gen kháng rầy nâu trên nhiễm sắc thể lúa Lập bản đồ phân tử chi tiết cho locus gen kháng rầy nâu Phương pháp chọn tạo các dòng lúa kháng rầy nâu trên cơ sở sử dụng công nghệ chỉ thị phân tử Chọn tạo. .. kháng rầy nâu trên hai loài lúa hoang ( Oryza Rufipogon và Oryza Officinalis tại Việt Nam Chọn giống lúa Có ý nghĩa kháng rầy nâu bằng khoa học và chỉ thị vi vệ tinh được đăng Có ý nghĩa khoa học và được đăng 3 Ứng dụng chỉ thị Có ý nghĩa phân tử trong chọn khoa học và giống lúa kháng rầy được đăng nâu Có ý nghĩa khoa học và được đăng 4 Đánh giá tínhkháng rầy nâu ở một số dòng, giống lúa tại Đồng bằng. .. Thị kháng rầy nâu trên nhiễm sắc 12/2008 12/2008 Ngọc Huyền thể lúa thông qua thí nghiệm và cs Viện bulk segregant analyis DTNN (BSA) Lập bản đồ phân tử chi tiết 1/20091/2009- TS Lưu Thị cho locus gen kháng rầy nâu 12/2010 11/2010 Ngọc Huyền và cs Viện DTNN Nội dung 3: Chọn tạo các dòng lúa kháng rầy nâu trên cơ sở sử dụng công nghệ chỉ thị phân tử Chọn tạo các dòng lúa ưu tú 1/20071/2007- TS Lưu Thị. .. cho gen BphZ kháng rầy nâu hiệu quả - Nhân dòng để chuẩn bị hạt gửi khảo nghiệm của 2 dòng lúa kháng rầy - Tiếp tục chọn lọc 30 dòng triển vọng Đề tài thực hiện đúng tiến độ các nội dung nghiên cứu đã đề ra: - Hoàn thiện quy trình chọn tạo giống lúa thuần kháng rầy nâu bằng công nghệ chỉ thị phân tử - Lập bản đồ phân tử chi tiết cho gen BphZ - Gửi khảo nghiệm thêm 2 dòng lúa kháng rầy nâu là DTC1-3 và . kết phân tử cho 1 gen kháng rầy nâu. Xây dựng quy trình chọn tạo dòng lúa kháng rầy nâu bằng công nghệ chỉ thị phân tử Bản đồ liên kết phân tử cho gen BphZ Quy trình chọn tạo dòng lúa. thành công công nghệ chỉ thị phân tử trong chọn tạo giống lúa thuần kháng rầy nâu đã rút ngắn thời gian chọn tạo, Cho đến nay, kết quả chính của đề tài là chọn tạo được 4 dòng lúa kháng rầy nâu. thiện quy trình chọn tạo giống lúa thuần kháng rầy nâu bằng công nghệ chỉ thị phân tử - Lập bản đồ phân tử chi tiết cho gen BphZ - Gửi khảo nghiệm thêm 2 dòng lúa kháng rầy nâu là DTC1-3 và