Đánh giá đa dạng di truyền quần thể thuốc thượng (phaeanthus vietnamensis ban) ở bán đảo sơn trà thành phố đà nẵng bằng chỉ thị phân tử rapd và issr

48 1 0
Đánh giá đa dạng di truyền quần thể thuốc thượng (phaeanthus vietnamensis ban) ở bán đảo sơn trà   thành phố đà nẵng bằng chỉ thị phân tử rapd và issr

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

ĐẠI HỌC ĐÀ NẴNG TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM KHOA SINH – MƠI TRƯỜNG KHĨA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN QUẦN THỂ THUỐC THƯỢNG (PHAEANTHUS VIETNAMENSIS BAN) Ở BÁN ĐẢO SƠN TRÀ - THÀNH PHỐ ĐÀ NẴNG BẰNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ RAPD VÀ ISSR NGÔ VŨ BẢO TRÂN Đà Nẵng, 2022 ĐẠI HỌC ĐÀ NẴNG TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM KHOA SINH – MÔI TRƯỜNG KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN QUẦN THỂ THUỐC THƯỢNG (PHAEANTHUS VIETNAMENSIS BAN) Ở BÁN ĐẢO SƠN TRÀ - THÀNH PHỐ ĐÀ NẴNG BẰNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ RAPD VÀ ISSR Ngành : Sư phạm Sinh học Khóa : 2018 - 2022 Sinh viên : Ngơ Vũ Bảo Trân Người hướng dẫn : TS Nguyễn Minh Lý Đà Nẵng, 2022 LỜI CAM ĐOAN Tôi cam đoan cơng trình nghiên cứu tơi thực hướng dẫn TS Nguyễn Minh Lý Các số liệu, kết nêu luận văn trung thực chưa công bố cơng trình khác Tác giả Ngơ Vũ Bảo Trân i LỜI CẢM ƠN Thưa thầy cô, song song với Thực tập Sư phạm, Khóa luận tốt nghiệp thực nghiệm kết trình học hỏi, trau dồi kiến thức, nỗ lực không ngừng nghỉ thân em Em may mắn nhận giúp đỡ, hỗ trợ tận tình từ q thầy cơ, gia đình bạn bè Qua đây, em xin gửi lời cảm ơn chân thành đến với tất người ln giúp đỡ, động viên, khích lệ em suốt thời gian vừa qua Đầu tiên, cho phép em gửi đến TS Nguyễn Minh Lý lời cảm ơn sâu sắc Thầy người trực tiếp hướng dẫn tận tình dạy, việc định hướng tư duy, cách làm việc khoa học để em xếp hợp lí thời gian Thực tập Sư phạm Khóa luận tốt nghiệp cho hiệu Cảm ơn thầy tạo điều kiện giúp em hồn thành khóa luận cách trọn vẹn Xin cảm ơn TS Trương Thị Thanh Mai, giáo viên chủ nhiệm người truyền cảm hứng lớn giúp em có tự tin đến với khóa luận tốt nghiệp Bài dạy Sư phạm cô thực tuyệt, cảm ơn cô nhiệt huyết thế! Em xin gửi lời cảm ơn đến tồn thể thầy trường Đại học Sư phạm – Đại học Đà Nẵng, đặc biệt thầy cô giáo Khoa Sinh – Môi trường Những học thầy cô giảng đường Sư phạm bốn năm qua, truyền đạt kinh nghiệm quý báu hành trang giúp chúng em vững bước tương lai Cảm ơn anh Bá Duy, chị Diễm Sương, bạn Đức Toàn bạn, anh chị phịng thí nghiệm, người hướng dẫn em thao tác đến với Sinh học phân tử Cũng nhờ hai anh chị bạn góp ý, chỉnh sửa giúp cho khóa luận em hồn thiện Cảm ơn Phiến – Dược liệu Sơn Trà nhiệt tình trao đổi thơng tin bổ ích thuốc Thượng với dẫn mà hôm thu mẫu em trở nên thuận lợi dễ dàng Cảm ơn bác bảo vệ cho phép chúng em lại thâu đêm suốt sáng làm việc, hôm ngủ bị gọi dậy mở cửa để tụi em có kết ngày hôm ii Và với tất lòng biết ơn, xin gửi đến ba mẹ em, gia đình em - nguồn động viên tinh thần lớn Cùng tất bạn bè em tập thể lớp 18SS Cảm ơn nhau, chia niềm vui nỗi buồn năm tháng Sư phạm Ai có lựa chọn riêng, lối riêng, hy vọng bạn hạnh phúc thành công Kiến thức nhận vơ vàn mà tiếp thu kiến thức em cịn có hạn chế định Khóa luận khơng tránh khỏi sai sót, kính mong dẫn, đóng góp thầy để khóa luận em hoàn thiện Sau em xin kính chúc thầy cơ, gia đình, bạn bè, người yêu thương em dồi sức khỏe thành công nghiệp Em xin chân thành cảm ơn! Đà Nẵng, ngày 23 tháng năm 2022 Sinh viên Ngô Vũ Bảo Trân iii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iv DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT VÀ KÝ HIỆU vi DANH MỤC BẢNG BIỂU vii DANH MỤC HÌNH ẢNH viii TÓM TẮT ix MỞ ĐẦU 1 Tính cấp thiết đề tài Mục tiêu Ý nghĩa 3.1 Ý nghĩa khoa học 3.2 Ý nghĩa thực tiễn Nội dung nghiên cứu CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU .3 1.1 Giới thiệu thuốc Thượng 1.2 Đặc điểm thực vật học 1.3 Giá trị dược liệu 1.4 Đánh giá đa dạng di truyền dựa thị phân tử RAPD ISSR 1.4.1 Kĩ thuật RAPD 1.4.2 Kĩ thuật ISSR CHƯƠNG VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 11 2.1 Vật liệu nghiên cứu 11 2.3 Phạm vi nghiên cứu 11 2.3 Phương pháp nghiên cứu 11 2.3.1 Phương pháp tách chiết DNA tổng số 11 2.3.2 Phương pháp PCR 12 2.3.3 Phương pháp điện di 13 2.3.4 Phương pháp xử lí liệu 14 iv CHƯƠNG KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN 15 3.1 Kết tối ưu hóa phản ứng PCR 15 3.1.3 Tối ưu hóa nồng độ mồi phản ứng PCR 16 3.2 Hiệu mồi RAPD ISSR đánh giá đa dạng di truyền 16 3.3 Mối quan hệ di truyền quần thể Thuốc Thượng dựa phân tích ISSR RAPD 20 3.3.1 Mối quan hệ di truyền quần thể thuốc Thượng dựa thị RAPD 20 3.3.2 Mối quan hệ di truyền quần thể thuốc Thượng dựa thị ISSR 22 3.3.3 Mối quan hệ di truyền quần thể thuốc Thượng dựa kết hợp thị RAPD ISSR 24 CHƯƠNG KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 26 5.1 Kết luận 26 5.2 Kiến nghị 26 TÀI LIỆU THAM KHẢO 27 PHỤ LỤC 33 Phụ lục Hình ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi RAPD mồi ISSR 33 Phụ lục Hệ số tương đồng di truyền 41 mẫu thuốc Thượng xử lý phần mềm NTSYSpc 2.1 34 v DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT VÀ KÝ HIỆU bp Base pair CTAB Cetyltrimethylammonium bromide ISSR Inter simple sequence repeat PCR Polemerase Chain Reaction PIC Polymorphic Information Content RAPD Random Amplified Polymorphic DNA SD Standard Deviation TBE Tris-borate-EDTA vi DANH MỤC BẢNG BIỂU Bảng 2.1 Tên bảng Thông tin mẫu thuốc Thượng sử dụng nghiên cứu Trang 11 2.2 Trình tự đoạn mồi ISSR sử dụng nghiên cứu 12 2.3 Trình tự đoạn mồi RAPD sử dụng nghiên cứu 13 3.1 Giá trị PIC phần trăm đoạn đa hình 41 mẫu thuốc Thượng với thị RAPD thị ISSR vii 17 DANH MỤC HÌNH ẢNH Tên hình vẽ Trang Một số hình ảnh hình thái Thuốc Thượng thu vườn dược Hình 1.1 1.2 1.3 liệu Sơn Trà Nguyên lý kỹ thuật RAPD-PCR (Arif cs) Một biểu diễn sơ đồ ISSR-PCR với mồi đơn (Reddy cs, 2002) 3.1 Tối ưu nhiệt độ mồi ISSR RAPD 15 3.2 Tối ưu nồng độ mồi ISSR RAPD 16 3.2 3.4 Ảnh điện di mẫu thuốc Thượng đại diện khuếch đại mồi ISSR Ảnh điện di mẫu thuốc Thượng đại diện khuếch đại mồi RAPD 18 19 Biểu đồ hình 41 cá thể thuốc Thượng nghiên cứu 3.5 khuếch đại mồi RAPD theo hệ số Jaccard kiểu 20 phân nhóm UPGMA Biểu đồ hình 41 cá thể thuốc Thượng nghiên cứu 3.6 khuếch đại mồi ISSR theo hệ số Jaccard kiểu phân 22 nhóm UPGMA Biểu đồ hình 41 cá thể thuốc Thượng nghiên cứu 3.7 khuếch đại mồi RAPD ISSR theo hệ số Jaccard kiểu phân nhóm UPGMA viii 24 Từ kết phân tích hình ảnh điện di sản phẩm ISSR nhận thấy 41 mẫu thuốc Thượng nghiên cứu khuếch đại mồi ISSR phân thành nhóm với hệ số tương đồng di truyền nằm khoảng từ 0,71 đến 0,98 Nhóm I gồm 29 mẫu thuốc Thượng, nhóm cá thể phân ly thành nhóm phụ Ia (9 cá thể) Ib (20 cá thể) hệ số tương đồng di truyền 0,8 Trong cá thể có hệ số tương đồng cao (8KIII 9KIII, 1KIV 2KIV (0.98)) nằm nhánh phụ thứ hai Ib Cá thể có hệ số tương đồng di truyền thấp 3KIV (0,848) Các cá thể cịn lại có hệ số tương đồng dao động từ 0,86 đến 0,93 Các cá thể có hệ số tương đồng di truyền 4KI, 5KI 9KI (0.91) Tuy nhiên 9KI lại nằm nhánh khác với cá thể cịn lại Kể đến, nhóm Ia chứa tất tháng tuổi; 2-3 năm tuổi 4-5 năm tuổi phân bổ nhóm Ib Nhóm II gồm 12 cá thể thuốc Thượng nằm khoảng cách di truyền xa (0.72 đến 0.92) chứa tất cá thể thuộc nhóm tuổi Chia thành nhánh với nhánh IIa gồm 11 cá thể, IIb cá thể 5KII Cá thể 8KII, 10KII có hệ số tương đồng di truyền cao (0.92) cá thể có hệ số tương đồng thấp 5KII Các cá thể có hệ số tương đồng di truyền 1KII, 2KII (0.93); 10KII, 11KII (0.92); 4KII, 7KII (0.85) Kết phân tích phân loại thuốc thượng khuếch đại từ mồi ISSR cho thấy đa dạng lớn cá thể quần thể Nguyên nhân trình sinh sản xảy biến dị, dẫn đến khác đặc điểm di truyền có nguồn gốc Các thuộc lứa tuổi khác nằm gần nhóm khác biệt Nhánh Ia tháng tuổi; nhánh II tuổi; – năm tuổi – năm tuổi tập trung nhánh Ib Khác với thị RAPD đến năm tuổi tập trung nhánh IIa (RAPD) với lứa năm tuổi Điều suy đốn thuộc nhóm khác đến từ nguồn khác thuộc khu vực phân bố vốn có thuốc Thượng trước đưa trồng Bán đảo Sơn Trà Chỉ thị RAPD phân tách rõ ràng lứa tuổi 23 3.3.3 Mối quan hệ di truyền quần thể thuốc Thượng dựa kết hợp thị RAPD ISSR Ia1 Ia2 Hình 3.7 Biểu đồ hình 41 cá thể thuốc Thượng nghiên cứu khuếch đại mồi ISSR RAPD theo hệ số Jaccard kiểu phân nhóm UPGMA 24 Kết phân tích cho thấy biểu đồ hình chia thành nhánh I II riêng biệt với hệ số tương đồng di truyền 0.716 đến 0.973 với tỉ lệ phần trăm 71,6% đến 97.3% độ tương đồng di truyền Nhánh I gồm tất cá thể thuộc lứa tháng tuổi (tương đồng với biểu đồ RAPD ISSR) Nhánh II gồm 31 cá thể cịn lại nằm nhánh IIa IIb Nhánh IIa gồm 10 cá thể thuộc lứa năm tuổi, nhánh Ia2 chứa cá thể 5KII hệ số 0.82, điều cho thấy mẫu có khác biệt di truyền lớn so với mẫu nhánh lại Nhánh IIb gồm 22 cá thể phân thành nhánh IIb1 IIb2 Nhánh IIb1 chứa hầu hết cá thể thuộc lứa đến năm tuổi, nhánh IIb2 chứa tất cá thể thuộc lứa đến năm tuổi Ở nhánh IIb1 cá thể 11KII 12KII với hệ số tương đồng di truyền cao 0.96 Cá thể có hệ số tương đồng di truyền thấp 8KIV 9KIV nằm hệ số 0.85, cá thể cịn lại có hệ số tương đồng nằm khoảng 0.83 đến 0.91 Ở nhánh IIb2, cá thể 8KIII 9KIII có hệ số tương đồng di truyền cao nhánh cao mẫu khảo sát 0.973 chiếm đến 97.3% tỉ lệ tương đồng di truyền, mẫu cịn lại có hệ số tương đồng di truyền nằm khoảng 0.834 đến 0.915 Cá thể có hệ số tương đồng di truyền thấp 10KII với hệ số 0.91 chiếm 91% Qua cho thấy tương đồng di truyền cự lớn cá thể thuộc lứa đến năm tuổi Kết phân tích biểu đồ di truyền quần thể thuốc Thượng dựa thị RAPD ISSR cho thấy lứa tuổi thuộc quần thể thuốc Thượng nghiên cứu xem phân thành nhóm riêng biệt So với biểu đồ RAPD biểu đồ kết hợp, biểu đồ ISSR phân tách cá thể không rõ ràng Điều chứng tỏ mẫu thuốc Thượng chuyển trồng bán Đảo Sơn Trà vốn có vùng sinh thái (Trung Việt Nam), chọn lọc tự nhiên tác động nhau, quan hệ họ hàng gần gũi Do có tương quan lớn mặt di truyền Các mẫu thuốc Thượng chuyển trồng bán Đảo Sơn Trà vốn có vùng sinh thái (Trung Việt Nam), chọn lọc tự nhiên tác động nhau, quan hệ họ hàng gần gũi Do có tương quan lớn mặt di truyền Và sử dụng nhiều thị mức độ đánh giá đa dạng di truyền hiệu 25 CHƯƠNG KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 5.1 Kết luận Kết phân tích cho thấy với 19 đoạn mồi RAPD 18 đoạn mồi ISSR chọn mồi RAPD phục vụ cho việc đánh giá đa dạng di truyền quần thể thuốc Thược thu Bán đảo Sơn Trà là: OPC-02; OPC-03; OPC-04; OPF-02; OPF-03 với phản ứng PCR tối ưu nhiệt độ bắt cặp mồi 36oC nồng độ mồi phản ứng PCR 10 pmol Và mồi ISSR: ISSR51, ISSR59, ISSR64 phản ứng PCR tối ưu nhiệt độ bắt cặp mồi 50oC nồng độ mồi phản ứng pmol/mồi Nghiên cứu đa hình dựa thị RAPD ISSR hệ số đa dạng di truyền thống kê dựa vào số PIC cao (trung bình 0.26 với thị RAPD 0.29 thị ISSR) số locus đa hình lớn cho thấy việc sử dụng thị RAPD ISSR hồn tồn có khả đánh giá đa dạng di truyền quần thể thuốc Thượng Biểu đồ hình thể mối quan hệ di truyền 41 mẫu thuốc Thượng phân tích qua thị RAPD ISSR, biểu đồ chia làm nhánh có hệ số tương đồng di truyền khoảng 0.71 đến Các mẫu thu địa điểm độ tuổi có phân tách di truyền có tương quan di truyền gần gũi với nhóm tuổi cịn lại thơng qua việc lứa tuổi nằm nhánh phụ riêng biệt 5.2 Kiến nghị Tiếp tục mở rộng nghiên cứu đặc điểm di truyền quần thể này, bao gồm việc phân tích trình tự gen lục lạp, nhằm đưa mối quan hệ rõ ràng loài thuốc thượng Việt Nam loài khác chi 26 TÀI LIỆU THAM KHẢO A R Chadegani, P P (2014) An in vitro study on the effect of vinca alkaloid, vinorelbine, on chromatin histone, HMGB proteins and induction of apoptosis in mice non-adherent bone marrow cells Drug and Chemical Toxicology doi:10.3109/01480545.2014.933347 Ajibade, S R (2000) Inter simple sequence repeat analysis of genetic relationships in the genus Vigna Euphytica, , 111(1), 47-55 Araujo, R C (2014) Evaluation of the anti-mycobacterium tuberculosis activity and in vivo acute toxicity of Annona sylvati BMC complementary and alternative medicine, 14(1), 1-10 doi:10.1186/1472-6882-14-209 Arif, I A., Bakir, M A., Khan, H A., Al Farhan, A H., Al Homaidan, A A., Bahkali, A H., & Shobrak, M (2010) A brief review of molecular techniques to assess plant diversity International Journal of Molecular Sciences, 11(5), 20792096 Azevedo, M I (2013) The antioxidant effects of the flavonoids rutin and quercetin inhibit oxaliplatin-induced chronic painful peripheral neuropathy Molecular pain doi:10.1186/1744-8069-9-53 Bermejo A, F B.-P (2005) Acetogenins from Annonaceae: recent progress in isolation, synthesis and mechanisms of action Bermejo, A., Figadère, B., ZafraPolo, M C., Barrachina, I., Estornell, E., & Cortes, D (2005) AcetogeninsNatural product reports, 22(2), 269-303 doi:10.1039/b500186m Beutler, J A (1998) Structure− activity requirements for flavone cytotoxicity and binding to tubulin Journal of medicinal chemistry, 41(13), 2333-2338 doi:10.1021/jm970842h Bhagyawant, S S (2008) Genetic fingerprinting of chickpea (Cicer arietinum L.) germplasm using ISSR markers and their relationships African Journal of Biotechnology, 7(24) Bùi Thanh Phong cs (2016) Tác dụng gây độc tế bào ung thư cao chiết từ thuốc thượng (Phaeanthus vietnamensis Ban) – Annonaceae Y Học TP Hồ Chí Minh, 20(Số 6) Carvalho, A M.-B.-P (2005) DNA fingerprint of F1 interspecific hybrids from the Triticeae tribe using ISSRs Euphytica, 143(1), 93-99 Chan, A L (2009) Evodiamine stabilizes topoisomerase I-DNA cleavable complex to inhibit topoisomerase I activity Molecules, 14(4), 1342-1352 doi:10.3390/molecules14041342 27 Eom, K S (2010) Berberine-Induced Apoptosis in Human Glioblastoma T98G Cells Is Mediated by Endoplasmic Reticulum Stress Accompanying Reactive Oxygen Species and Mitochondrial Dysfunction Biological and Pharmaceutical Bulletin, 33(10), 1644-1649 doi:10.1248/bpb.33.1644 Esselink, G S (2003) Identification of cut rose (Rosa hybrida) and rootstock varieties using robust sequence tagged microsatellite site markers Theoretical and Applied Genetics, 106(2), 277-286 doi:10.1007/s00122-002-1122-y F J Rohlf, NTSYSpc: Numerical Taxonomy System, Version 2.1, Exeter Publishing, Setauket, NY, USA, 2002 Fang, D K (1998) Phylogenetic relationships among selected Citrus germplasm accessions revealed by inter-simple sequence repeat (ISSR) markers Journal of the American Society for Horticultural science, 123(4), 612-617 Fang, D Q (1997) Identification of closely related citrus cultivars with inter-simple sequence repeat markers Theoretical and Applied Genetics, 95(3): 408- Fang, L K (2008) Design and synthesis of tacrine–ferulic acid hybrids as multipotent anti-Alzheimer drug candidates Bioorganic & medicinal chemistry letters, 18(9), 2905-2909 doi:10.1016/j.bmcl.2008.03.073 Formagio, A S (2013) Composition and evaluation of the anti-inflammatory and anticancer activities of the essential oil from Annona sylvatica A St.-Hil Journal of medicinal food, 16(1), 20-25 doi:10.1089/jmf.2011.0303 Formagio, A S (2013) The flavonoid content and antiproliferative, hypoglycaemic, anti-inflammatory and free radical scavenging activities of Annona dioica St Hill BMC Complementary and Alternative Medicine, 13(1), 1-8 doi:10.1186/1472-6882-13-14 Freitas, A F (2014) Effects of methanolic extracts of Annona species on the development and reproduction of Spodoptera frugiperda (JE Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) Neotropical entomology, 3(5), 446-452 Grünwald, N J., Everhart, S E., Knaus, B J., & Kamvar, Z N (2017) Best practices for population genetic analyses Phytopathology, 107(9), 1000-1010 Guasmi, F E (2012) The use of ISSR and RAPD markers for genetic diversity among south Tunisian barley International Scholarly Research Notices doi:10.5402/2012/952196 Huang, J C (2000) Genetic diversity and relationships of sweetpotato and its wild relatives in Ipomoea series Batatas (Convolvulaceae) as revealed by intersimple sequence repeat (ISSR) and restriction analysis of chloroplast DNA Theoretical and Applied Genetics,, 100(7), 1050-1060 28 Huong, L T (2018) Constituents of Essential Oils from Dasymaschalon bachmaensis and Phaeanthus vietnamensis 13(5) doi:10.1177/1934578X1801300526 Joshi, S P (2000) Genetic diversity and phylogenetic relationship as revealed by inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism in the genus Oryza Theoretical and Applied Genetics, 100(8), 1311-1320 K J Aliaga, P B.-B.-A (2011) Quercetin and rutin exhibit antiamyloidogenic and fibril-disaggregating effects in vitro and potent antioxidant activity in APPswe cells Life Sciences, 9:53 doi:10.1016/j.lfs.2011.09.023 Kuntz, S W (1999) Comparative analysis of the effects of flavonoids on proliferation, cytotoxicity, and apoptosis in human colon cancer cell lines European journal of nutrition, 38(3), 133-142 Lee, T J (2006) Caspase-dependent and caspase-independent apoptosis induced by evodiamine in human leukemic U937 cells Molecular cancer therapeutics, 5(9), 2398-2407 doi:10.1158/1535-7163.MCT-06-0167 Li, A & (2001) Genetic variation and clonal diversity of Psammochloa villosa (Poaceae) detected by ISSR markers Annals of Botany, 87(5), 585-590 doi:10.1006/anbo.2001.1390 Li, W L (2012) Biological activity evaluation and structure–activity relationships analysis of ferulic acid and caffeic acid derivatives for anticancer Bioorganic & medicinal chemistry letters, 22(19), 6085-6088 doi:10.1016/j.bmcl.2012.08.038 Lin, X C (2010) Crossbreeding of Phyllostachys species (Poaceae) and identification of their hybrids using ISSR markers Genetics and molecular research, 9(3), 1398-1404 doi:10.4238/vol9-3gmr855 Lu, J J (2012) Alkaloids isolated from natural herbs as the anticancer agents Evidence-based complementary and alternative medicine doi:10.1155/2012/485042 Lu, X L (2009) Cultivar identification and genetic diversity analysis of broccoli and its related species with RAPD and ISSR markers Scientia Horticulturae, 122(4), 645-648 doi:10.1016/j.scienta.2009.06.017 Lúcio, A S.-C (2015) Chapter Five - Alkaloids of the Annonaceae: Occurrence and a Compilation of Their Biological Activities The alkaloids: chemistry and biology, Chapter Five, 74, 233-409 doi:10.1016/bs.alkal.2014.09.002 Mishra, P K (2003) Inter-simple sequence repeat and aggressiveness analyses revealed high genetic diversity, recombination and longrange dispersal in 29 Fusarium culmorum Annals of Applied Biology, 143(3), doi:10.1111/j.1744-7348.2003.tb00297.x 291-301 Mohannad E Qazzaz, V J.-H.-S (2015) In vitro anticancer properties and biological evaluation of novel natural alkaloid Jerantinine B Cancer Letters, 370(2):185– 97 doi:10.1016/j.canlet.2015.10.013 Mojzis, J V (2008) Antiangiogenic effects of flavonoids and chalcones Pharmacological research, 57(4), 259-265 doi:10.1016/j.phrs.2008.02.005 Nagaoka, T & (1997) Applicability of inter-simple sequence repeat polymorphisms in wheat for use as DNA markers in comparison to RFLP and RAPD markers Theoretical and applied genetics, 94(5), 597-602 Ngân, L T (2014) Nghiên cứu chiết tách xác định thành phần hóa học Thuốc Thượng Quảng Nam Đà Nẵng số dịch chiết hữu Luận văn Thạc sỹ, Trường Đại học Sư phạm Đà nẵng, Đà Nẵng Nghia, N V (1991) "Alkaloids from leaves of Phaeanthus vietnamensis" Fitoterapia, 62, 315-318 Nguyễn Thị Ái Thuận cs (2017) Khảo sát đặc điểm vi học tác dụng chống oxy hóa thuốc thượng (Phaeanthus vietnamensis Ban) Tạp chí Nghiên cứu khoa học Phát triển kinh tế Trường Đại học Tây Đô, Số 01 Nguyễn Thị Đông Hằng cs (2020) Nghiên cứu khả kháng khuẩn kháng viêm cao chiết thuốc thượng (Phaeanthus vietnamensis Ban) (Doctoral dissertation, Trường Đại học Sư phạm-Đại học Đà Nẵng) Nguyễn Tiến Bân (2007) Sách đỏ Việt Nam - Phần II - Thực vật Hà Nội: NXB Khoa học tự nhiên công nghệ Nguyễn Tiến Bân cs (2000) Thực vật chí Việt Nam, Họ Na (Annonaceae Juss.) Hà Nội: NXB Khoa học kỹ thuật Nguyễn Trung Tường (2019) Nghiên cứu đặc điểm thực vật, thành phần hóa học số tác dụng sinh học thuốc thượng (Phaeanthus vietnamensis Ban, họ Na – Annonaceace) Luận văn tiến sĩ, 3-24 Nhiem, N X (2017) Chemical Components from Phaeanthus vietnamensis and Their Inhibitory NO Production in BV Cells Chemistry & biodiversity, 14(8) doi:10.1002/cbdv.201700013 Nordin, N M (2015) Liriodenine, an aporphine alkaloid from Enicosanthellum pulchrum, inhibits proliferation of human ovarian cancer cells through induction of apoptosis via the mitochondrial signaling pathway and blocking 30 cell cycle progression Drug doi:10.2147/DDDT.S77727 Design, Development and Therapy Obeed, R S.-M (2008) Fruit properties and genetic diversity of five ber (Ziziphus mauritiana Lamk.) cultivars Pak J Biol Sci, 11(no 6), 888-893 Ogasawara, M M (2002) Anti-invasive and metastatic activities of evodiamine Biological and Pharmaceutical Bulletin doi:doi.org/10.1248/bpb.25.1491 Podolak, I G (2010) Saponins as cytotoxic agents: a review Phytochemistry Reviews, 9(3), 425-474 doi:10.1007/s11101-010-9183-z Qian, W G (2001) Genetic variation within and among populations of a wild rice Oryza granulata from China detected by RAPD and ISSR markers Theoretical and Applied Genetics, 102(2), 440-449 Quy, V (1995) Conservation of flora, fauna and endangered species in Vietnam Tropical Forest Ecosystem BIOTROP Special Publication, 55, 634-639 Ratnaparkhe, M B (1998) Inter-simple-sequence-repeat (ISSR) polymorphisms are useful for finding markers associated with disease resistance gene clusters Theoretical and Applied Genetics, 97(4), 515-519 Reddy MP, SarlaN, Siddiq EA (2002) Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding Euphytica 128: 9–17 Reddy, M P (2002) Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding Euphytica, , 128(1), 9-17 Salimath, S S (1995) Assessment of genome origins and genetic diversity in the genus Eleusine with DNA markers Genome, 38(4), 757-763 doi:10.1139/g95096 Sedmera, P N (1990) A new bisbenzylisoquinoline alkaloid from Phaeanthus vietnamensis and its antibacterial activity Heterocycles (Sendai), 30(1), 205209 doi:10.3987/COM-89-S2 Shyu, K G (2006) Evodiamine inhibits in vitro angiogenesis: Implication for antitumorgenicity Life Sciences, 78(19), 2234-2243 doi:10.1016/j.lfs.2005.09.027 Sneath, P.H.A., Sokal, R.R., 1973 Numerical Taxonomy Freeman San Francisco, pp 573 Sun, C Z (2016) Evodiamine inhibits the proliferation of leukemia cell line K562 by regulating peroxisome proliferators-activated receptor gamma (PPAR γ) 31 pathway Journal of Receptors and Signal Transduction, 36(4), 422-428 doi:10.3109/10799893.2015.1122040 Szwajgier, D & (2012) Phenolic acids from malt are efficient acetylcholinesterase and butyrylcholinesterase inhibitors Journal of the Institute of Brewing, 118(1), 40-48 doi: 10.1002/jib.5 Tu, D N (2021) Stereochemical assignment of three new benzylisoquinoline alkaloids from Phaeanthus vietnamensis by NMR study combined with CD spectroscopy Magnetic resonance in chemistry: MRC, 59(11), 1160-1164 doi:10.1002 / mrc.5203 Võ Duy Lê Sơn (2012) Định tính - Định lượng - Chiết tách khảo sát hoạt tính kháng khuẩn hợp chất alcaloid thuốc thượng (Phaeanthus vietnamensis Ban) Khóa luận tốt nghiệp, Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Võ Văn Chi (1997) Từ điển thuốc Việt Nam NXB Y học, Hà Nội Wolff, K &.-R (1998) PCR markers distinguish Plantago major subspecies Theoretical and Applied Genetics, 96(2), 282-286 doi:10.1007/s001220050737 Y Sun, K X (2009) A systematic review of the anticancer properties of berberine a natural product from Chinese herbs Anti-Cancer Drugs, 20:757–769 doi:10.1097/CAD.0b013e328330d95b 32 PHỤ LỤC Phụ lục Hình ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi RAPD mồi ISSR KI-ISSR51 KII-ISSR51 KIII-ISSR51 KIV-ISSR51 Hình Ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi ISSR51 KI-ISSR59 KII-ISSR59 KIIIISSR59 KIVISSR59 Hình Ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi ISSR59 KI-ISSR64 KII-ISSR64 KIII-ISSR64 KIV-ISSR64 Hình Ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi ISSR64 KI-OPC02 KII-OPC02 KIII-OPC02 KIV-OPC02 Hình Ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi OPC-02 33 KI-OPC03 KII-OPC03 KIII-OPC03 KIV-OPC03 Hình Ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi OPC-03 KI-OPC04 KII-OPC04 KIII-OPC04 KIV-OPC04 Hình Ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi OPC-04 KI-OPF02 KIII-OPF02 KII-OPF02 KIV-OPF02 Hình Ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi OPF-02 KI-OPF03 KII-OPF03 KIII-OPF03 KIV-OPF03 Hình 10 Ảnh điện di 41 mẫu thuốc Thượng với mồi OPF-03 Phụ lục Hệ số tương đồng di truyền 41 mẫu thuốc Thượng xử lý phần mềm NTSYSpc 2.1 34 35 0.90 0.94 0.94 0.92 1.00 0.87 0.87 0.84 0.86 0.84 1.00 0.85 0.88 0.86 0.86 0.87 0.86 1.00 0.83 0.77 0.79 0.81 0.78 0.87 0.78 1.00 7KI 8KI 9KI 0.75 0.75 0.68 0.71 0.77 0.75 0.81 0.79 0.82 0.72 0.74 0.83 0.83 0.75 0.78 0.75 0.81 0.73 0.90 2KIII 0.68 0.70 0.69 0.71 0.71 0.63 0.67 0.63 0.65 0.73 0.74 0.71 0.74 0.71 0.73 0.75 0.76 0.75 3KIII 0.70 0.70 0.69 0.71 0.71 0.63 0.67 0.64 0.67 0.73 0.74 0.72 0.74 0.73 0.75 0.75 0.76 0.76 4KIII 0.63 0.65 0.64 0.64 0.64 0.56 0.61 0.58 0.60 0.67 0.69 0.69 0.71 0.68 0.71 0.69 0.70 0.68 5KIII 0.63 0.67 0.64 0.66 0.66 0.58 0.63 0.58 0.63 0.70 0.67 0.71 0.71 0.68 0.70 0.71 0.70 0.70 6KIII 0.67 0.69 0.68 0.71 0.71 0.62 0.67 0.63 0.67 0.74 0.71 0.73 0.75 0.71 0.72 0.75 0.74 0.75 7KIII 0.65 0.67 0.66 0.69 0.69 0.60 0.64 0.61 0.63 0.73 0.72 0.72 0.74 0.70 0.71 0.75 0.73 0.73 8KIII 0.73 0.75 0.74 0.77 0.77 0.67 0.72 0.69 0.71 0.78 0.79 0.77 0.79 0.75 0.76 0.82 0.81 0.81 9KIII 0.71 0.73 0.72 0.75 0.75 0.66 0.71 0.67 0.70 0.76 0.77 0.75 0.77 0.71 0.75 0.80 0.79 0.79 10KIII 0.72 0.77 0.76 0.78 0.81 0.70 0.73 0.70 0.72 0.77 0.78 0.78 0.81 0.74 0.77 0.83 0.80 0.79 1KIV 0.71 0.74 0.75 0.73 0.76 0.68 0.70 0.67 0.66 0.74 0.70 0.71 0.71 0.69 0.72 0.75 0.72 0.72 2KIV 0.64 0.67 0.67 0.68 0.71 0.60 0.63 0.60 0.63 0.69 0.67 0.68 0.68 0.64 0.67 0.71 0.69 0.71 3KIV 0.73 0.76 0.75 0.79 0.80 0.69 0.74 0.71 0.73 0.76 0.75 0.77 0.79 0.73 0.78 0.82 0.81 0.79 4KIV 0.73 0.78 0.77 0.79 0.82 0.71 0.74 0.71 0.73 0.78 0.77 0.79 0.80 0.75 0.79 0.83 0.81 0.79 5KIV 0.68 0.71 0.69 0.71 0.74 0.63 0.66 0.63 0.65 0.71 0.71 0.71 0.71 0.68 0.71 0.75 0.71 0.73 6KIV 0.71 0.75 0.74 0.74 0.77 0.67 0.71 0.67 0.71 0.75 0.75 0.74 0.75 0.71 0.75 0.80 0.76 0.78 7KIV 0.67 0.70 0.67 0.72 0.71 0.63 0.67 0.63 0.68 0.70 0.71 0.71 0.72 0.68 0.70 0.75 0.73 0.75 8KIV 0.73 0.76 0.75 0.79 0.80 0.69 0.74 0.71 0.75 0.75 0.74 0.77 0.77 0.71 0.76 0.82 0.79 0.78 9KIV 0.68 0.71 0.71 0.71 0.74 0.66 0.67 0.64 0.68 0.70 0.74 0.74 0.74 0.70 0.73 0.77 0.73 0.71 10KIV 0.81 0.84 0.83 0.87 0.88 0.77 0.82 0.79 0.81 0.84 0.83 0.85 0.87 0.79 0.84 0.90 0.89 0.87 0.75 0.75 0.72 0.79 0.75 0.69 0.71 0.72 0.70 0.86 0.85 0.85 0.88 0.84 0.87 0.88 0.90 1.00 9KII 0.75 0.73 0.75 0.74 0.79 0.77 0.69 0.72 0.71 0.71 0.90 0.88 0.91 0.93 0.87 0.90 0.93 1.00 8KII 1KIII 0.65 0.67 0.66 0.67 0.67 0.60 0.64 0.60 0.63 0.70 0.71 0.69 0.71 0.68 0.70 0.72 0.73 0.73 0.74 0.77 0.76 0.79 0.79 0.71 0.73 0.71 0.72 0.90 0.86 0.89 0.92 0.87 0.91 1.00 7KII 0.90 0.71 0.73 0.71 0.75 0.74 0.67 0.67 0.69 0.67 0.89 0.88 0.91 0.93 0.90 1.00 6KII 0.90 0.65 0.67 0.66 0.69 0.69 0.61 0.63 0.63 0.62 0.87 0.87 0.91 0.90 1.00 5KII 12KII 0.81 0.84 0.83 0.87 0.88 0.77 0.82 0.79 0.81 0.84 0.83 0.85 0.87 0.79 0.84 0.90 0.89 0.87 0.71 0.74 0.73 0.76 0.76 0.68 0.70 0.68 0.69 0.93 0.89 0.92 1.00 4KII 1.00 0.69 0.72 0.71 0.73 0.75 0.65 0.68 0.67 0.67 0.90 0.90 1.00 3KII 11KII 0.81 0.84 0.83 0.87 0.88 0.77 0.82 0.79 0.81 0.84 0.83 0.85 0.87 0.79 0.84 0.90 0.89 0.87 0.71 0.72 0.71 0.73 0.75 0.65 0.68 0.67 0.69 0.88 1.00 2KII 10KII 0.73 0.75 0.74 0.79 0.79 0.69 0.72 0.71 0.71 0.83 0.82 0.85 0.87 0.79 0.83 0.87 0.89 0.92 0.73 0.76 0.75 0.79 0.79 0.72 0.72 0.72 0.68 1.00 1KII 10KI 0.83 0.86 0.82 0.85 0.85 0.88 0.83 0.82 1.00 0.90 0.91 0.89 1.00 1.00 0.83 0.90 0.83 0.86 0.83 0.92 0.92 0.80 0.82 0.91 0.87 0.89 0.81 0.83 0.78 0.76 0.83 0.83 0.79 1.00 1.00 1.00 0.79 0.83 0.83 0.73 0.75 0.90 0.75 0.78 0.83 0.73 0.73 0.86 0.73 0.73 0.83 0.68 0.70 0.92 0.75 0.76 0.92 0.75 0.76 0.80 0.74 0.71 0.82 0.67 0.71 0.91 0.85 0.88 0.87 0.90 0.92 0.89 0.89 0.92 0.81 0.92 0.92 0.83 0.91 0.90 0.78 0.90 0.89 0.76 0.89 0.89 0.83 0.92 0.94 0.83 0.95 1.00 0.79 1.00 1.00 0.83 0.76 0.79 0.75 0.75 0.70 0.76 0.76 0.72 0.71 0.85 0.89 0.90 0.89 0.90 0.89 0.87 1.00 0.76 0.70 0.71 0.65 0.65 0.65 0.71 0.71 0.64 0.66 0.83 0.86 0.84 0.89 0.85 0.90 1.00 0.78 0.71 0.75 0.71 0.71 0.70 0.71 0.71 0.71 0.67 0.82 0.87 0.86 0.92 0.91 1.00 0.83 0.75 0.79 0.77 0.77 0.72 0.77 0.77 0.76 0.71 0.86 0.88 0.88 0.93 1.00 0.81 0.75 0.76 0.73 0.73 0.70 0.75 0.75 0.71 0.69 0.87 0.92 0.90 1.00 0.89 0.81 0.81 0.79 0.81 0.78 0.84 0.84 0.77 0.79 0.93 0.97 1.00 0.87 0.78 0.79 0.78 0.79 0.76 0.83 0.83 0.77 0.77 0.91 1.00 0.91 0.80 0.83 0.75 0.80 0.77 0.87 0.85 0.76 0.76 1.00 0.82 0.80 0.83 0.79 0.82 0.80 0.85 0.85 0.87 0.87 0.88 0.88 0.87 0.85 0.87 0.87 0.83 1.00 1.00 0.92 0.83 0.89 0.86 0.89 0.87 0.95 1.00 0.92 0.83 0.86 0.84 0.87 0.87 1.00 0.83 0.83 0.84 0.87 0.92 1.00 0.86 0.84 0.86 0.89 1.00 0.83 0.86 0.86 1.00 0.90 0.87 1.00 0.83 1.00 1.00 9KI 10KI 1KII 2KII 3KII 4KII 5KII 6KII 7KII 8KII 9KII 10KII 11KII 12KII 1KIII 2KIII 3KIII 4KIII 5KIII 6KIII 7KIII 8KIII 9KIII 10KIII 1KIV 2KIV 3KIV 4KIV 5KIV 6KIV 7KIV 8KIV 9KIV 10KIV 6KI 8KI 0.91 0.91 1.00 7KI 5KI 6KI 0.90 1.00 5KI 4KI 4KI 3KI 3KI 1.00 2KI 2KI Bảng P1 Hệ số tương đồng di truyền 41 mẫu thuốc Thượng khuyết đại thị ISSR 36 2KI 3KI 4KI 5KI 6KI 7KI 8KI 9KI 10KI 1KII 2KII 3KII 4KII 5KII 6KII 7KII 8KII 9KII 10KII 11KII 12KII 1KIII 2KIII 3KIII 4KIII 5KIII 6KIII 7KIII 8KIII 9KIII 10KIII 1KIV 2KIV 3KIV 4KIV 5KIV 6KIV 7KIV 8KIV 9KIV 10KIV 2KI 1.00 0.85 0.88 0.80 0.75 0.80 0.80 0.83 0.80 0.63 0.56 0.64 0.68 0.61 0.58 0.59 0.54 0.58 0.58 0.59 0.68 0.73 0.76 0.69 0.69 0.69 0.73 0.71 0.73 0.75 0.71 0.68 0.69 0.64 0.71 0.71 0.68 0.69 0.64 0.63 0.63 1.00 0.83 0.78 0.80 0.81 0.78 0.78 0.81 0.75 0.68 0.63 0.66 0.66 0.56 0.64 0.56 0.59 0.59 0.64 0.69 0.75 0.71 0.71 0.75 0.71 0.78 0.69 0.75 0.76 0.69 0.69 0.71 0.73 0.73 0.73 0.66 0.68 0.63 0.68 0.68 3KI 1.00 0.92 0.80 0.85 0.88 0.88 0.88 0.68 0.64 0.73 0.73 0.66 0.59 0.68 0.59 0.63 0.66 0.68 0.76 0.75 0.85 0.75 0.78 0.75 0.81 0.80 0.81 0.83 0.80 0.76 0.78 0.73 0.83 0.76 0.73 0.78 0.69 0.71 0.71 4KI 1.00 0.88 0.93 0.90 0.86 0.90 0.73 0.69 0.75 0.71 0.68 0.61 0.69 0.64 0.64 0.68 0.69 0.78 0.73 0.83 0.73 0.80 0.73 0.80 0.78 0.80 0.81 0.78 0.75 0.76 0.75 0.81 0.75 0.71 0.76 0.68 0.76 0.73 5KI 1.00 0.95 0.88 0.81 0.88 0.75 0.71 0.73 0.73 0.69 0.63 0.71 0.63 0.66 0.69 0.71 0.80 0.78 0.81 0.75 0.81 0.75 0.81 0.80 0.81 0.83 0.80 0.80 0.78 0.80 0.83 0.76 0.73 0.78 0.69 0.81 0.78 6KI 1.00 0.90 0.86 0.90 0.73 0.69 0.75 0.71 0.71 0.61 0.69 0.64 0.64 0.68 0.69 0.78 0.76 0.83 0.73 0.80 0.73 0.80 0.78 0.80 0.81 0.78 0.75 0.76 0.75 0.81 0.75 0.71 0.76 0.68 0.80 0.73 7KI 1.00 0.90 0.93 0.69 0.69 0.75 0.75 0.75 0.64 0.73 0.68 0.68 0.71 0.73 0.81 0.76 0.83 0.73 0.76 0.76 0.83 0.81 0.83 0.85 0.81 0.78 0.80 0.75 0.85 0.78 0.75 0.80 0.71 0.76 0.73 8KI 1.00 0.93 0.66 0.63 0.71 0.71 0.64 0.61 0.66 0.61 0.64 0.64 0.66 0.75 0.76 0.83 0.76 0.80 0.76 0.83 0.78 0.80 0.81 0.81 0.75 0.76 0.71 0.81 0.75 0.71 0.76 0.68 0.69 0.69 9KI 1.00 0.73 0.69 0.71 0.75 0.68 0.64 0.69 0.64 0.68 0.68 0.69 0.78 0.76 0.83 0.73 0.80 0.76 0.83 0.81 0.83 0.85 0.81 0.78 0.80 0.78 0.85 0.78 0.75 0.80 0.71 0.76 0.76 1.00 0.93 0.75 0.81 0.75 0.71 0.76 0.68 0.75 0.71 0.73 0.75 0.73 0.76 0.76 0.76 0.76 0.83 0.81 0.80 0.81 0.75 0.75 0.76 0.78 0.75 0.78 0.71 0.73 0.68 0.69 0.76 1.00 0.75 0.81 0.75 0.75 0.73 0.75 0.81 0.75 0.76 0.75 0.69 0.73 0.73 0.73 0.73 0.80 0.78 0.76 0.78 0.71 0.71 0.73 0.75 0.71 0.71 0.68 0.69 0.64 0.66 0.73 1.00 0.80 0.73 0.73 0.81 0.69 0.73 0.83 0.81 0.83 0.75 0.81 0.78 0.75 0.78 0.85 0.83 0.81 0.83 0.76 0.73 0.75 0.73 0.76 0.76 0.73 0.75 0.69 0.71 0.75 1.00 0.69 0.80 0.85 0.76 0.83 0.83 0.81 0.83 0.78 0.78 0.75 0.71 0.78 0.85 0.83 0.85 0.86 0.80 0.80 0.81 0.73 0.80 0.80 0.80 0.81 0.76 0.71 0.75 1.00 0.66 0.71 0.66 0.73 0.73 0.75 0.80 0.75 0.71 0.68 0.64 0.71 0.78 0.76 0.75 0.76 0.69 0.69 0.71 0.66 0.73 0.73 0.69 0.68 0.63 0.68 0.68 1.00 0.81 0.80 0.83 0.76 0.71 0.69 0.68 0.64 0.64 0.61 0.64 0.71 0.73 0.71 0.73 0.69 0.73 0.75 0.66 0.69 0.73 0.73 0.71 0.66 0.64 0.68 1.00 0.71 0.71 0.78 0.80 0.78 0.73 0.73 0.69 0.66 0.73 0.80 0.78 0.80 0.81 0.75 0.75 0.76 0.71 0.75 0.78 0.75 0.76 0.71 0.73 0.73 1.00 0.80 0.80 0.78 0.69 0.61 0.61 0.58 0.58 0.61 0.68 0.66 0.68 0.69 0.66 0.59 0.61 0.59 0.63 0.63 0.59 0.61 0.56 0.61 0.61 1.00 0.86 0.85 0.83 0.71 0.68 0.64 0.64 0.68 0.75 0.73 0.75 0.76 0.73 0.69 0.71 0.66 0.73 0.73 0.69 0.68 0.63 0.64 0.68 1.00 0.92 0.90 0.75 0.71 0.71 0.64 0.71 0.78 0.80 0.78 0.80 0.73 0.73 0.75 0.66 0.76 0.76 0.73 0.71 0.66 0.68 0.68 1.00 0.88 0.73 0.73 0.66 0.66 0.73 0.80 0.75 0.80 0.81 0.75 0.71 0.73 0.68 0.75 0.75 0.71 0.73 0.68 0.69 0.69 1.00 0.85 0.81 0.78 0.75 0.81 0.88 0.86 0.88 0.90 0.83 0.83 0.85 0.76 0.86 0.86 0.83 0.81 0.76 0.78 0.78 1.00 0.83 0.83 0.80 0.86 0.90 0.88 0.86 0.88 0.85 0.81 0.83 0.75 0.85 0.88 0.85 0.80 0.78 0.76 0.76 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 0.93 0.86 0.86 0.88 0.80 0.81 0.75 0.81 0.80 0.81 0.81 0.78 0.75 0.73 0.68 0.66 0.76 1.00 0.86 0.86 0.85 0.80 0.81 0.78 0.81 0.80 0.85 0.81 0.75 0.71 0.76 0.68 0.73 0.80 1.00 0.93 0.88 0.90 0.88 0.81 0.81 0.83 0.81 0.81 0.81 0.85 0.83 0.78 0.76 0.83 1.00 0.92 0.93 0.95 0.88 0.85 0.86 0.85 0.88 0.88 0.85 0.86 0.81 0.80 0.86 1.00 0.88 0.90 0.86 0.86 0.88 0.80 0.90 0.86 0.83 0.85 0.76 0.78 0.81 1.00 0.98 0.92 0.85 0.86 0.81 0.92 0.88 0.88 0.90 0.85 0.83 0.86 1.00 0.93 0.86 0.88 0.83 0.93 0.90 0.86 0.88 0.86 0.85 0.88 1.00 0.83 0.85 0.76 0.90 0.83 0.80 0.85 0.80 0.81 0.81 1.00 0.98 0.86 0.86 0.86 0.90 0.88 0.83 0.81 0.85 1.00 0.85 0.88 0.88 0.92 0.90 0.85 0.83 0.83 1.00 0.83 0.83 0.83 0.78 0.80 0.81 0.88 1.00 0.90 0.83 0.85 0.83 0.81 0.81 1.00 0.90 0.85 0.86 0.78 0.81 1.00 0.88 0.86 0.81 0.81 1.00 0.88 0.83 0.83 1.00 0.85 0.88 1.00 0.90 1.00 10KI 1KII 2KII 3KII 4KII 5KII 6KII 7KII 8KII 9KII 10KII 11KII 12KII 1KIII 2KIII 3KIII 4KIII 5KIII 6KIII 7KIII 8KIII 9KIII 10KIII 1KIV 2KIV 3KIV 4KIV 5KIV 6KIV 7KIV 8KIV 9KIV 10KIV Bảng P2 Hệ số tương đồng di truyền 41 mẫu thuốc Thượng khuyết đại thị RAPD 37 0.85 0.90 0.89 0.91 1.00 0.84 0.85 0.84 0.88 0.88 1.00 0.83 0.85 0.86 0.87 0.88 0.87 1.00 0.83 0.77 0.82 0.83 0.79 0.87 0.82 1.00 7KI 8KI 9KI 0.66 0.71 0.69 0.72 0.74 0.66 0.69 0.65 0.69 0.90 1.00 0.68 0.69 0.72 0.74 0.74 0.68 0.70 0.68 0.69 0.85 0.85 1.00 0.70 0.71 0.73 0.75 0.75 0.69 0.71 0.69 0.71 0.89 0.86 0.88 1.00 0.64 0.66 0.66 0.69 0.69 0.64 0.66 0.63 0.64 0.83 0.83 0.85 0.83 1.00 0.67 0.68 0.67 0.71 0.70 0.65 0.66 0.66 0.66 0.83 0.84 0.85 0.89 0.83 1.00 0.69 0.73 0.74 0.76 0.77 0.71 0.73 0.70 0.71 0.85 0.82 0.86 0.90 0.82 0.88 1.00 0.67 0.69 0.69 0.74 0.72 0.68 0.71 0.68 0.69 0.83 0.84 0.84 0.88 0.81 0.87 0.86 1.00 0.69 0.70 0.69 0.74 0.72 0.68 0.70 0.70 0.69 0.82 0.84 0.81 0.86 0.81 0.86 0.83 0.87 1.00 2KII 3KII 4KII 5KII 6KII 7KII 8KII 9KII 1.00 0.96 0.77 0.79 0.77 0.73 0.76 0.82 0.79 0.86 0.85 0.86 0.78 0.78 0.84 0.86 0.80 0.81 0.79 0.83 0.78 0.90 11KII 0.74 0.78 0.78 0.81 0.83 0.75 0.79 0.75 0.77 0.81 0.81 0.84 0.85 0.78 0.80 0.86 0.85 0.86 0.91 12KII 0.77 0.79 0.81 0.84 0.85 0.77 0.82 0.77 0.80 0.81 0.81 0.84 0.85 0.79 0.79 0.86 0.83 0.86 0.90 1KIII 0.68 0.69 0.69 0.69 0.71 0.65 0.68 0.65 0.68 0.71 0.70 0.71 0.73 0.70 0.69 0.72 0.69 0.72 0.75 2KIII 0.71 0.70 0.74 0.75 0.74 0.69 0.72 0.69 0.71 0.74 0.74 0.74 0.75 0.71 0.70 0.75 0.71 0.72 0.74 3KIII 0.70 0.70 0.71 0.71 0.72 0.66 0.69 0.68 0.69 0.74 0.74 0.74 0.74 0.71 0.71 0.74 0.70 0.72 0.74 4KIII 0.65 0.68 0.69 0.69 0.70 0.64 0.66 0.65 0.66 0.70 0.70 0.71 0.71 0.67 0.68 0.68 0.66 0.67 0.67 5KIII 0.65 0.68 0.68 0.68 0.69 0.63 0.67 0.64 0.68 0.72 0.69 0.73 0.73 0.69 0.68 0.71 0.67 0.69 0.71 6KIII 0.69 0.72 0.72 0.74 0.75 0.68 0.72 0.70 0.72 0.77 0.74 0.77 0.78 0.73 0.72 0.76 0.72 0.75 0.77 7KIII 0.67 0.68 0.70 0.72 0.72 0.65 0.70 0.66 0.69 0.76 0.74 0.76 0.77 0.72 0.72 0.76 0.71 0.73 0.76 8KIII 0.73 0.75 0.76 0.78 0.78 0.71 0.76 0.72 0.75 0.78 0.78 0.78 0.81 0.75 0.75 0.81 0.77 0.79 0.80 9KIII 0.72 0.74 0.76 0.77 0.78 0.71 0.75 0.72 0.75 0.78 0.77 0.78 0.80 0.73 0.74 0.81 0.76 0.78 0.79 10KIII 0.72 0.75 0.77 0.78 0.81 0.72 0.76 0.74 0.75 0.76 0.76 0.77 0.81 0.72 0.75 0.80 0.76 0.77 0.79 1KIV 0.70 0.72 0.75 0.74 0.77 0.70 0.72 0.69 0.70 0.74 0.70 0.72 0.74 0.69 0.72 0.75 0.68 0.71 0.72 2KIV 0.66 0.69 0.70 0.71 0.74 0.65 0.69 0.65 0.68 0.71 0.69 0.70 0.72 0.66 0.70 0.73 0.66 0.71 0.74 3KIV 0.70 0.75 0.75 0.77 0.80 0.71 0.74 0.71 0.75 0.77 0.75 0.76 0.77 0.71 0.74 0.78 0.74 0.75 0.77 4KIV 0.72 0.76 0.79 0.79 0.82 0.74 0.77 0.74 0.77 0.77 0.75 0.78 0.80 0.74 0.76 0.81 0.75 0.77 0.81 5KIV 0.69 0.72 0.71 0.72 0.75 0.66 0.70 0.66 0.69 0.74 0.71 0.72 0.74 0.70 0.72 0.76 0.69 0.73 0.75 6KIV 0.70 0.72 0.74 0.73 0.76 0.69 0.72 0.69 0.72 0.74 0.73 0.74 0.77 0.71 0.74 0.78 0.71 0.75 0.76 7KIV 0.68 0.69 0.71 0.74 0.73 0.67 0.71 0.67 0.72 0.71 0.70 0.72 0.75 0.68 0.70 0.76 0.69 0.72 0.74 8KIV 0.70 0.72 0.74 0.75 0.77 0.69 0.73 0.70 0.74 0.72 0.71 0.75 0.77 0.69 0.73 0.78 0.72 0.73 0.76 9KIV 0.66 0.70 0.71 0.72 0.76 0.70 0.70 0.66 0.71 0.70 0.71 0.73 0.73 0.69 0.70 0.76 0.69 0.69 0.71 10KIV 0.75 0.79 0.79 0.82 0.85 0.76 0.79 0.76 0.79 0.82 0.80 0.82 0.83 0.76 0.79 0.84 0.80 0.81 0.83 10KII 0.68 0.70 0.71 0.75 0.76 0.69 0.72 0.69 0.70 0.79 0.79 0.84 0.85 0.77 0.81 0.84 0.86 0.90 1.00 0.70 0.76 0.73 0.77 0.77 0.72 0.71 0.70 0.70 1.00 1KII 10KI 0.82 0.84 0.84 0.86 0.86 0.89 0.86 0.85 1.00 0.86 0.87 0.90 1.00 0.93 0.78 0.82 0.81 0.77 0.79 0.84 0.81 0.88 0.88 0.81 0.74 0.75 0.73 0.71 0.73 0.77 0.76 0.82 0.80 0.86 0.76 0.77 0.76 0.70 0.76 0.79 0.76 0.82 0.82 0.82 0.75 0.76 0.74 0.69 0.75 0.80 0.77 0.83 0.81 0.85 0.77 0.75 0.75 0.67 0.76 0.79 0.76 0.83 0.82 0.84 0.75 0.74 0.72 0.68 0.74 0.77 0.75 0.81 0.81 0.90 0.78 0.80 0.78 0.75 0.75 0.81 0.79 0.86 0.86 0.87 0.75 0.78 0.78 0.76 0.75 0.79 0.76 0.83 0.83 0.82 0.77 0.75 0.75 0.69 0.75 0.79 0.76 0.80 0.81 0.82 0.72 0.74 0.74 0.71 0.72 0.76 0.75 0.81 0.80 0.89 0.85 0.87 0.82 0.82 0.82 0.86 0.86 0.92 0.92 0.88 0.90 0.91 0.86 0.84 0.88 0.90 0.91 0.97 1.00 0.89 0.88 0.90 0.87 0.83 0.87 0.90 0.90 1.00 0.83 0.91 0.92 0.89 0.88 0.91 0.92 1.00 0.85 0.91 0.90 0.89 0.85 0.92 1.00 0.79 0.89 0.89 0.88 0.89 1.00 0.76 0.86 0.90 0.89 1.00 0.81 0.89 0.92 1.00 0.82 0.91 1.00 0.81 1.00 1.00 0.88 0.81 0.82 0.78 0.80 0.79 0.88 0.82 0.79 0.78 1.00 0.83 0.83 0.82 0.86 0.88 0.88 0.86 0.86 0.88 1.00 0.81 0.80 0.82 0.86 0.88 0.88 0.86 0.86 1.00 0.91 0.82 0.86 0.83 0.87 0.86 0.91 1.00 0.89 0.82 0.85 0.84 0.86 0.88 1.00 0.82 0.81 0.85 0.86 0.91 1.00 0.84 0.83 0.86 0.89 1.00 0.83 0.85 0.86 1.00 0.90 0.86 1.00 0.85 1.00 1.00 9KI 10KI 1KII 2KII 3KII 4KII 5KII 6KII 7KII 8KII 9KII 10KII 11KII 12KII 1KIII 2KIII 3KIII 4KIII 5KIII 6KIII 7KIII 8KIII 9KIII 10KIII 1KIV 2KIV 3KIV 4KIV 5KIV 6KIV 7KIV 8KIV 9KIV 10KIV 6KI 8KI 0.90 0.89 1.00 7KI 5KI 6KI 0.89 1.00 5KI 4KI 4KI 3KI 3KI 1.00 2KI 2KI Bảng P3 Hệ số tương đồng di truyền 41 mẫu thuốc Thượng khuyết đại thị RAPD VÀ ISSR ... RAPD ISSR đánh giá đa dạng di truyền 16 3.3 Mối quan hệ di truyền quần thể Thuốc Thượng dựa phân tích ISSR RAPD 20 3.3.1 Mối quan hệ di truyền quần thể thuốc Thượng dựa thị RAPD. .. HỌC ĐÀ NẴNG TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM KHOA SINH – MƠI TRƯỜNG KHĨA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN QUẦN THỂ THUỐC THƯỢNG (PHAEANTHUS VIETNAMENSIS BAN) Ở BÁN ĐẢO SƠN TRÀ - THÀNH PHỐ ĐÀ NẴNG... hiệu thị phân tử RAPD ISSR đánh giá đa dạng di truyền; - Nội dung 3: Xác định mối quan hệ di truyền quần thể thuốc Thượng thị RAPD ISSR CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Giới thiệu thuốc Thượng Phân

Ngày đăng: 20/02/2023, 21:45

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan