Luận án chọn tạo giống lúa hàm lượng amylose thấp bằng chỉ thị phân tử ssr trên quần thể lai hồi giao

i LỜI CẢM ƠN Tôi xin trân thành cảm ơn sâu sắc đến: Giáo viên hướng dẫn dành nhiều thời gian q báu, cơng sức tận tình dẫn thời gian thực luận án theo học trường Quý Thầy Viện NC&PT Công nghệ Sinh học tư vấn, động viên, hỗ trợ chuyên môn, giúp đỡ tạo điều kiện thuận lợi cho việc nghiên cứu học tập Viện Xin gửi lời biết ơn sâu sắc đến Ban Lãnh đạo, Quý thầy cô, anh chị em Bộ môn Di Truyền Chọn giống trồng Viện lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long; Ban lãnh đạo Viện NC&PT Công nghệ Sinh học trường Đại học Cần Thơ; xếp công việc tạo điều kiện thuận lợi thời gian sở vật chất để tơi hồn thành chương trình học tập luận án tiến độ Cuối cùng, thành công luận án khơng thể khơng kể đến đóng góp khơng nhỏ thành viên gia đình, tạo điều kiện thuận lợi Lãnh đạo quan đồng nghiệp quan, người ủng hộ, động viên giúp tơi vượt qua nhiều khó khăn thời gian học tập Chân thành cám ơn./ ii TÓM TẮT Gạo chất lượng cao nhu cầu cấp thiết cho nội tiêu xuất vùng đồng Sông Cửu Long Hàm lượng amylose tính trạng quan trọng liên quan trực tiếp đến phẩm chất hạt gạo Nghiên cứu giống lúa có hàm lượng amylose thấp thông qua kết hợp phương pháp lai tạo truyền thống chọn lọc đại thị phân tử cho phép rút ngắn thời gian tăng hiệu tạo chọn giống lúa có chất lượng ngon dẻo Trong nghiên cứu này, vật liệu bố mẹ đánh giá sử dụng phương pháp phân tích kiểu hình dựa hàm lượng amylose suất kết hợp đánh giá kiểu gen với gen mục tiêu waxy Các quần thể lai hồi giao tạo từ bố mẹ lựa chọn Chọn giống nhờ thị phân tử (MAS) ứng dụng chọn lọc tổ hợp lai với thị Wx cho gen mục tiêu, RM240, RM162, RM256 RM257 cho gen đánh dấu cá thể mẹ (gen tái tổ hợp) Các cá thể/dòng phù hợp chọn cho tự thụ đến hệ thứ hai (F2) Ở hệ này, đồ GGT thiết lập 12 nhiễm sắc thể để đánh giá mối quan hệ di truyền cá thể chọn qua tuyển lựa cá thể có tảng di truyền thích hợp với mục tiêu chọn giống Các cá thể triển vọng cuối chọn lọc dựa vào hàm lượng amylose thấp (~20%) suất cao (~7,0 tấn/ha) đồng ruộng Kết chọn lọc vật liêu lai cho thấy giống bố cho gen (donor) thích hợp Jasmine85, KDML105 OM7347, giống mẹ nhận gen (recipient) bao gồm OM6976, OM5930 OM6073 Khi phân tích hệ số di truyền (h2BS) hiệu chọn lọc (GA) hệ F2, có tổ hợp lai OM6976/Jasmine85, OM6976/KDML105 OM5930/OM7347 đánh giá có tiềm để tiếp tục phát triển Ba tổ hợp lai hồi giao (OM6976/Jasmine85//OM6976, OM6976/KDML105//OM6976 OM5930/OM7347//OM5930) chọn lọc đến hệ BC4 Ở hệ BC4F1, 10 cá thể tổ hợp OM6976/Jasmine85//OM6976, cá thể tổ hợp OM6976/KDML105//OM6976 cá thể tổ hợp OM5930/OM7347//OM5930 chọn dịng vừa mang gen waxy dị hợp tử vừa mang gen tái tổ hợp đồng hợp tử Phân tích đồ GGT hệ BC4F2 cho thấy tổ hợp OM6976/Jasmine85//OM6976 có dịng (BC4F2-1, BC4F2-3, BC4F2-20 BC4F2-25), tổ hợp OM6976/KDML105//OM6976 có dịng (BC4F2-44) tổ hợp OM5930/OM7347//OM5930 có dịng (BC4F2-16 BC4F2-40) mang gen waxy đồng hợp 100% đồng hợp tử gen tái tổ hợp 12 nhiễm sắc thể Ở hệ BC4F3, dòng lúa tiếp tục lựa chọn đồng ruộng, iii đó, dòng lúa D75, D131, D142, D150, D296, D233, D230 D397 triển vọng Các dịng có tiềm phát triển vùng đồng Sông Cửu Long nguồn vật liệu quý cho nghiên cứu Từ khóa: quần thể lai hồi giao, chọn giống nhờ thị phân tử (MAS), gen waxy, hàm lượng amylose, suất iv SUMMARY High quality rice is an imperative demand for domestic consumption and export of the Mekong Delta Amylose content is an important trait that directly relates to the quality of rice grains Research on the low amylose content in rice through a combination of traditional crossing and modern selection methods by molecular markers to shorten the time and increase the efficiency of selecting good quality rice varieties In this study, parent materials were firstly evaluated through phenotypic analysis based on amylose content and yield combined with genotypic analysis of the target gene “waxy” Backcross populations were generated from selected parents Marker-assisted selection (MAS) was applied in choosing individuals with Wx marker for the waxy gene, and markers, RM240, RM162, RM256 and RM257, for recombinant genes Selected individuals were selfed to the second generation (F2) In this generation, the GGT map was established on 12 chromosomes to assess the genetic relationships among selected individuals, and thereby candidating individuals with the most genetic background to match the breeding objective Finally, the most elite individuals were selected based on low amylose content (~ 20%) and high yield (~ 7.0 tons/ha) in the field As a result, the suitable donor genotypes were Jasmine85, KDML105 and OM7347, and recipient genotypes included OM6976, OM5930 and OM6073 Based on heritability (h2BS) as well as genetic advance (GA) in the F2 generation, three hybridizations, OM6976/Jasmine85, OM6976/KDML105 and OM5930/OM7347, were most potential to grow The three backcross populations (OM6976/Jasmine85//OM6976, OM6976/KDML105//OM6976 and OM5930/OM7347//OM5930) were selected untill to BC4 generation In the BC4F1 generation, 10 individuals of OM6976/Jasmine85/OM6976, individuals of OM6976/KDML105//OM6976 and individual of OM5930/OM7347//OM5930 were selected because these lines carried the heterozygote waxy gene and four homozygous recombinant genes The analysis of the GGT map at BC4F2 showed that the population of OM6976/ Jasmine85//OM6976 with lines (BC4F2-1, BC4F2-3, BC4F2-20 and BC4F225), the population of OM6976/KDML105//OM6976 with line (BC4F2-44), and the population of OM5930/OM7347//OM5930 with (BC4F2-16 and BC4F2-40) carried both of the target gene and 100% homozygous recombinant genes in all 12 chromosomes In the BC4F3 generation, the rice lines were selected on the field, in which, the eight best lines were D75, D131, D142, D150, D296, D233, D230 and D397 These rice lines were considered to be v ability to develop in the Mekong Delta as well as a valuable resource for further research Key word: backcross population, MAS, waxy gene, amylose content, yield vi MỤC LỤC Trang LỜI CAM ĐOAN………………………………………………………… i LỜI CẢM ƠN……………………………………………………… ii TÓM TẮT…………………………………………………………… iii SUMMARY………………………………………………………… v MỤC LỤC…………………………………………………………… vii DANH SÁCH BẢNG……………………………………………… xii DANH SÁCH HÌNH………………………………………………… xiii DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT………………………………… xvi Chương 1: GIỚI THIỆU…………………………………………… 1.1 Đặt vấn đề ……………………………………………………………… 1.2 Mục tiêu nghiên cứu …………………………………………………… 1.2.1 Mục tiêu tổng quát ………………………………………………………… 1.2.2 Mục tiêu nghiên cứu cụ thể ……………………………………………… 1.3 Nội dung nghiên cứu …………………………………………………… 1.3.1 Nội dung 1: Đánh giá vật liệu bố mẹ sử dụng nghiên cứu chọn tạo giống lúa phẩm chất cao có hàm lượng amylose thấp…………………………………………………………………………………… 1.3.2 Nội dung 2: Đánh giá hiệu di truyền tổ hợp lai………… 1.3.3 Nội dung 3: Chọn tạo quần thể lai hồi giao có hàm lượng amylose thấp thông qua MAS……………………………………………………………… 1.3.4 Nội dung 4: Chọn lọc quần thể hồi giao BCnF2 thông qua lập đồ GGT……………………………………………………………………………… 1.3.5 Nội dung 5: Đánh giá chọn lọc cá thể có hàm lượng amylose suất cao quần thể lai hồi giao BCnF3 ……………… 1.4 Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài ……………………………… 1.4.1 Ý nghĩa khoa học …………………………………………… 1.4.2 Ý nghĩa thực tiễn …………………………………………… vii 1.5 Tính khoa học đề tài ………………………………………… 1.6 Những đóng góp đề tài ………………………………… 1.7 Tính ứng dụng đề tài ……………………………………………… 1.8 Đối tượng phạm vi nghiên cứu ……………………………………… Chương 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU ……………………………… 2.1 Các tiêu phẩm chất hạt gạo …………………………………… 2.1.1 Hàm lượng amylose (AC) ………………………………………………… 2.1.2 Độ bền gel (GC) …………………………………………………………… 2.1.3 Độ trở hồ (GT) ……………………………………………………………… 2.2 Sơ lược hàm lượng amylose ………………………………………… 2.2.1 Sự hình thành tinh bột lúa ………………………………………… 2.2.2 Amylose amylopectin……………………… ………………………… 2.2.3 Cơ sở di truyền tính trạng hàm lượng amylose ………………………… 11 2.3 Phương pháp lai hồi giao chọn tạo giống lúa…………………… 14 2.3.1 Một số khái niệm phương pháp lai hồi giao …………………… 14 .2.3.2 Ưu điểm phương pháp lai hồi giao ………………………… 16 2.3.3 Ưu điểm phương pháp lai hồi giao ………………………… 16 2.4 Ứng dụng thị phân tử chọn tạo giống lúa …………………… 17 2.4.1 Sơ lược phương pháp chọn lọc thị phân tử ………… 17 2.4.2 Một số thành tựu thị SSR chọn giống lúa …………… 18 2.5 Chọn tạo giống phương pháp lai hồi giao kết hợp với thị phân tử…………………………………………………………………………… 19 2.5.1 Các giả thuyết mơ hình MAS ……………………………………………… 19 2.5.2 Điều kiện để ứng dụng MAS ……………………………………………… 20 2.5.3 Đối với tính kháng sinh học 22 2.5.4 Đối với tính kháng phi sinh học 23 2.5.5 Đối với đặc tính nơng học 23 2.6 Các kết nghiên cứu giống phẩm chất cao nước 23 viii Chương 3: PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU………………………… 26 3.1 Địa điểm thời gian nghiên cứu ………………………………………… 26 3.2 Vật liệu nghiên cứu ………………………………………………………… 26 3.3 Phương pháp nghiên cứu …………………………………………………… 27 3.3.1 Nội dung 1: Đánh giá vật liệu bố mẹ sử dụng nghiên cứu chọn tạo giống lúa phẩm chất cao có hàm lượng amylose thấp ………………………… 27 3.3.1.1 Đánh giá hàm lượng amylose ………………………………………………… 27 3.3.1.2 Đánh giá đặc tính nơng học, thành phần suất suất 27 3.3.1.3 Phân nhóm đa dạng di truyền kiểu hình ……………………… 28 3.3.1.4 Đa dạng nguồn gen giống lúa bố mẹ ……………………… 29 3.3.2 Nội dung 2: Đánh giá hiệu di truyền tổ hợp lai ……………… 31 3.3.2.1 Lai tạo lúa nhà lưới ……………………………………… 31 3.3.2.2 Đánh giá hiệu chọn lọc tính trạng mục tiêu dựa quần thể lai F2 ……………………………………………………………………………………… 33 3.3.3 Nội dung 3: Chọn tạo quần thể lai hồi giao có hàm lượng amylose thấp thông qua MAS ………………………………………………………………… 33 3.3.4 Nội dung 4: Chọn lọc quần thể hồi giao BCnF2 thông qua lập đồ GGT …………………………………………………………………………… 35 3.3.4.1 Kiểm tra kiểu gen quần thể lai 12 nhiễm sắc thể dựa thị phân tử đa hình bố mẹ ……………………………………… 35 3.3.4.2 Lập đồ GGT đánh giá di truyền quần thể lai, qua 35 chọn lọc cá thể mang gen mục tiêu mong muốn ……… 3.3.5 Nội dung 5: Đánh giá chọn lọc cá thể có hàm lượng amylose 36 suất cao quần thể lai hồi giao BCnF3 …………………………………… 3.3.5.1 Phương pháp bố trí thí nghiệm ……………………………………………… 36 3.3.5.2 Đánh giá kiểu hình kiểu gen liên quan hàm lượng amylose quần thể lai ………………………………………………………………………………… 37 3.3.5.3 Đánh giá thành phần suất suất để chọn lọc dòng lai ưu tú vừa có hàm lượng amylose thấp vừa có suất cao…………… 40 3.3.6 Phương pháp xử lý số liệu 40 ix Chương KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN……………………………… 41 4.1 Đánh giá vật liệu bố mẹ sử dụng nghiên cứu chọn tạo giống lúa phẩm chất cao có hàm lượng amylose thấp ……………………………… 41 4.1.1 Đánh giá hàm lượng amylose giống vật liệu lai …………………… 41 4.1.2 Đánh giá đặc tính nơng học giống lúa vật liệu lai ………… 42 4.1.3 Đánh giá thành phần suất suất giống lúa vật liệu lai ………………………………………………………………………… 43 4.1.4 Phân nhóm đa dạng di truyền kiểu hình giống lúa vật liệu lai……………………………………………………………………………………………… 44 4.1.5 Đa dạng nguồn gen giống lúa bố mẹ ……………………… 48 4.2 Đánh giá hiệu di truyền tổ hợp lai ……………………… 51 4.2.1Tạo quần thể F1 ……………………………………………………………… 51 4.2.2 Đánh giá hiệu chọn lọc tính trạng mục tiêu dựa quần thể lai F2 ……………………………………………………………………… 51 4.3 Chọn tạo quần thể lai hồi giao có hàm lượng amylose thấp thông qua MAS………………………………………………………………… 56 4.3.1 Kết lai tạo quần thể hồi giao OM6976/Jasmine85//OM6976 ………… 56 4.3.2 Kết lai tạo quần thể hồi giao OM6976/KDML//OM6976 … 64 4.3.3 Kết lai tạo quần thể hồi giao OM5930/OM7347//OM5930 …………… 67 4.4 Chọn lọc quần thể hồi giao BC4F2 thông qua lập đồ GGT………… 69 4.4.1 Chọn lọc cá thể BC4F2 quần thể lai hồi giao OM6976/ Jasmine85// OM6976 ………………………………………………………………………… 69 4.4.2 Chọn lọc cá thể BC4F2 quần thể lai hồi giao OM6976/ KDML105// OM6976 ………………………………………………………… 71 4.4.3 Chọn lọc cá thể BC4F2 quần thể lai hồi giao OM5930/ OM7347// OM5930 ……………………………………………………… 72 4.5 Đánh giá chọn lọc cá thể có hàm lượng amylose thấp suất cao quần thể lai hồi giao BC4F3 …………………………………………… 75 4.5.1 Đánh giá chọn lọc cá thể có hàm lượng amylose thấp suất cao quần thể lai hồi giao BC4F3 tổ hợp 75 OM6976/Jasmine85//OM6976………………………………………………… x Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 1 1 1 1 10 1 11 1 12 1 13 1 14 15 16 1 17 1 18 19 20 21 1 22 23 24 1 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 25 26 27 1 28 1 29 1 30 1 31 1 32 33 34 1 35 36 1 37 1 38 39 40 1 41 1 42 1 43 44 45 1 46 47 1 48 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 49 1 50 51 1 52 53 54 1 55 1 56 1 57 58 59 1 60 1 61 62 63 64 1 65 1 66 1 67 68 69 70 1 71 1 72 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 73 74 75 1 0 76 77 1 78 79 80 1 81 82 83 84 85 86 87 1 88 89 90 91 92 1 93 94 95 96 Wx P1 P2 97 220 bp 1 210 bp Chú thích: P1: OM7347; P2: OM5930; 1: thể băng hình; 0: khơng thể băng hình Bảng 6.21 Kết kiểu gen BC1F1 quần thể OM5930/ OM7347// OM5930 khuếch đại thông qua thị RM240, RM162, RM256 RM257 RM240 200 bp 150 bp RM162 300 bp 250 bp RM256 200 bp 100 bp P1 P2 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 10 1 11 1 1 12 1 1 13 1 1 16 1 1 17 1 150 21 1 1 24 1 1 26 1 1 28 1 1 29 1 1 30 1 1 1 31 1 1 34 1 1 36 1 1 37 1 1 40 1 1 41 1 1 1 42 1 1 RM257 250 bp 150 bp 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 P1 P2 45 47 49 54 55 56 59 60 64 65 66 70 RM240 200 bp 1 0 1 0 1 0 1 1 1 1 1 150 bp RM162 300 bp 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 250 bp RM256 200 bp 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 100 bp RM257 250 bp 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 150 bp Chú thích: P1: OM7347; P2: OM5930; 1: thể băng hình; 0: khơng thể băng hình 1 1 1 1 1 71 1 1 1 77 1 1 1 80 1 1 1 87 1 1 1 92 1 1 1 97 1 1 1 1 1 3.3 Thế hệ BC2 Bảng 6.22 Kết kiểu gen BC2F1 quần thể OM5930/ OM7347// OM5930 khuếch đại thông qua thị Wx Wx P1 P2 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 0 1 1 1 0 1 1 0 220 bp 1 1 1 1 1 1 0 1 1 210 bp 20 1 21 1 22 1 23 1 24 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 25 26 1 27 1 28 29 30 31 32 33 1 34 1 35 36 37 38 39 1 40 1 41 1 42 43 44 1 45 46 47 48 1 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 49 1 50 51 1 52 53 54 55 56 57 58 59 1 60 1 61 1 62 1 63 1 64 65 66 67 68 1 69 70 71 72 Wx P1 P2 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 151 220 bp 210 bp 0 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 1 1 97 98 99 1 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 0 1 1 100 101 102 103 104 105 1 1 1 1 0 Chú thích: P1: OM7347; P2: OM5930; 1: thể băng hình; 0: khơng thể băng hình Bảng 6.23 Kết kiểu gen BC2F1 quần thể OM5930/ OM7347// OM5930 khuếch đại thông qua thị RM240, RM162, RM256 RM257 14 16 20 21 22 23 26 27 33 34 39 40 41 44 48 49 P1 P2 RM240 200 bp 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150 bp RM162 300 bp 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 250 bp RM256 200 bp 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 100 bp RM257 250 bp 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 150 bp RM240 200 bp 150 bp RM162 300 bp 250 bp RM256 200 bp 100 bp RM257 250 bp 150 bp P1 P2 0 1 1 0 1 0 51 1 1 1 59 1 1 1 60 1 1 61 1 1 1 62 1 1 1 63 1 1 1 68 1 1 1 78 1 1 1 82 1 1 1 93 1 1 1 1 101 102 103 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 Chú thích: P1: OM7347; P2: OM5930; 1: thể băng hình; 0: khơng thể băng hình 152 3.4 Thế hệ BC3 Bảng 6.24 Kết kiểu gen BC3F1 quần thể OM5930/ OM7347// OM5930 khuếch đại thông qua thị Wx Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 1 1 1 1 1 10 11 1 12 1 13 14 15 16 17 1 18 1 19 20 21 1 22 23 1 24 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 25 1 26 1 27 1 28 1 29 1 30 31 32 33 34 35 36 37 1 38 1 39 1 40 41 42 43 44 45 46 1 47 48 1 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 49 50 51 52 53 54 55 1 56 1 57 1 58 1 59 1 60 1 61 1 62 63 64 65 66 67 68 69 70 1 71 72 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 73 1 74 75 76 77 78 1 79 80 81 82 1 83 1 84 1 85 1 86 1 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 97 1 98 1 99 1 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 0 1 1 1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1 1 119 120 1 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 1 1 1 0 1 0 1 0 1 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 1 0 144 153 Wx P1 P2 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 1 1 1 0 0 1 220 bp 0 0 1 0 1 1 1 0 210 bp Chú thích: P1: OM7347; P2: OM5930; 1: thể băng hình; 0: khơng thể băng hình Bảng 6.25 Kết kiểu gen BC3F1 quần thể OM5930/ OM7347// OM5930 khuếch đại thông qua thị RM240, RM162, RM256 RM257 RM240 200 bp 150 bp RM162 300 bp 250 bp RM256 200 bp 100 bp RM257 250 bp 150 bp P1 P2 0 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 12 1 1 1 17 1 1 1 18 1 1 21 1 1 1 23 1 1 1 25 1 1 1 26 1 1 1 27 1 1 1 28 1 1 29 1 1 1 37 1 1 0 38 1 1 1 RM240 200 bp 150 bp RM162 300 bp 250 bp RM256 200 bp 100 bp RM257 250 bp 150 bp P1 P2 0 1 1 0 1 0 57 1 1 1 58 1 1 1 59 1 1 0 60 1 1 61 1 1 70 1 1 73 1 1 1 78 1 1 1 82 1 1 83 1 1 0 84 1 1 1 85 1 1 1 86 1 1 1 97 1 1 1 98 1 1 99 1 1 100 109 117 120 121 123 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 RM240 200 bp P1 P2 124 125 141 142 150 159 1 1 154 39 1 1 46 1 1 1 48 1 1 1 55 1 1 1 56 1 1 168 1 1 150 bp RM162 300 bp 1 1 1 1 1 1 250 bp RM256 200 bp 1 0 1 1 1 100 bp RM257 250 bp 0 1 1 1 1 150 bp Chú thích: P1: OM7347; P2: OM5930; 1: thể băng hình; 0: khơng thể băng hình 3.5 Thế hệ BC4 Bảng 6.26 Kết kiểu gen BC4F1 quần thể OM5930/ OM7347// OM5930 khuếch đại thông qua thị Wx Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 1 10 1 11 1 12 13 14 1 15 1 16 1 17 1 18 1 19 1 20 1 21 1 22 23 24 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 25 26 27 1 28 29 30 31 1 32 1 33 1 34 35 1 36 1 37 1 38 1 39 1 40 41 42 43 44 45 46 47 48 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 49 50 51 1 52 53 54 55 1 56 1 57 1 58 1 59 1 60 1 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 1 71 1 72 Wx 220 bp 210 bp P1 P2 0 73 74 1 75 1 76 1 77 78 79 80 81 1 82 1 83 84 85 86 87 88 1 89 1 90 1 91 92 93 94 1 95 96 Wx P1 P2 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 155 1 1 1 1 1 1 1 0 220 bp 0 0 1 0 1 0 1 210 bp Chú thích: P1: OM7347; P2: OM5930; 1: thể băng hình; 0: khơng thể băng hình Bảng 6.27 Kết kiểu gen BC4F1 quần thể OM5930/ OM7347// OM5930 khuếch đại thông qua thị RM240, RM162, RM256 RM257 P1 P2 10 11 14 15 16 17 18 19 20 21 27 31 32 33 35 36 37 38 39 51 55 RM240 200 bp 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 150 bp RM162 300 bp 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 250 bp RM256 200 bp 1 1 0 1 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 100 bp RM257 250 bp 0 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 150 bp P1 P2 57 58 59 60 70 71 74 75 76 81 82 88 RM240 200 bp 1 1 1 0 1 1 0 1 1 1 150 bp RM162 300 bp 1 0 1 1 1 1 0 1 0 1 1 250 bp RM256 200 bp 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 100 bp RM257 250 bp 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 150 bp Chú thích: P1: OM7347; P2: OM5930; 1: thể băng hình; 0: khơng thể băng hình 156 89 0 1 0 90 1 1 94 1 1 1 99 1 1 102 103 104 109 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 56 1 1 1 PHỤ LỤC KẾT QUẢ KIỂU GEN CỦA QUẦN THỂ CON LAI BC4F2 Tổ hợp OM6976/ Jasmine85// OM6976 60,1 RM162 122,3 RM1031 68,5 RM1204 88,3 RM6152 72,2 RM339 101,5 RM256 37,6 RM257 51,1 RM6051 73,0 RM304 91,9 RM228 9,3 RM7557 16,2 RM167 43,2 RM512 75,5 RM463 A B A A A A A A A A A A A A A A A A B A A A A B A A H A A H B B A A A B A B A A A A H A A A A A A A A A B A A A A A B A A H A H B A H A A B A H A A H A A A A B B H A A H A B A A A A H A H A A A B A A H A A B A A A B A A A B A A A A H H A A B A A A A A A A H A A A H B A B A B B A B H B H A B H B A H H A B A B A A A A B A A A A A H A A A A A B A A A A A A A A A A A A A A A A B A A A H H A A B A B A A H A H A B A A A A A A A B B B A A A A A A B A A A A A A B A A A A A A B A A B A A A H A A H A B B A H A A A A B A A A A A A A A A A A A A A A A B A A A A A A A A A A A A A A A A B A A A A B B A A A A H H B B A A B A A A A A A A A B A A A A B A A B A A A A A A A A A A A B A A A A B A A A A A A A H A A A A A A A A B A A A A A H A A A A B A A B A A B A B A A A H A A H B A A A A A A B A B A A B A A H A A A A H A B Wx A B A B A A B A A H H A B A A A H RM469 A B A A A A A H A B A A B A A H A RM6 25,6 RM402 NST12 8,2 NST11 2,3 NST10 114,3 RM1024 NST9 55,6 RM440 NST8 106,2 RM211 NST7 67,9 RM471 NST6 43,8 RM7345 NST5 31,8 RM347 NST4 18,6 RM240 A A A B B NST3 7,2 A B A H A A B A H A A NST2 79,1 RM583 Vị trí (cM) OM6976 Jasmine85 10 11 12 13 14 15 RM1 Chỉ thị NST1 14,5 NST 157 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 B H H A A A B A A A A B A H A A H H H A B A A A B A A H A A H A A A A H A A A A A A A B A A A A A B A A H A A B A A A B A A B A A H A A H A A B H A A B H A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H A A A A A A B A A A A H A A H B A A A A A H A B A A H H A A H H H A A A A H A B A A A A H H B A A A A A A B A A A A H A A A A H A A H A A A H A A A A A H A A A A A A A A H B A A B A A A B A A A A A B A A H H B H A A A H A H A A A A H H A A A H A A A B A A A A A A A H A B A A A A A A A A A H H H B H A A H A A A H H A H A H A A A H A A A A A H A A H H A H A B A A A A B H A H B H A B H H H A B H H H A B B A H A H A B H A H A H 158 A A A A A A B A A A A A H A A A B A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A B H A A A A A A A A A A A A B H A B A A A A A A A A A A A B A A A A A A A A A A A A A B A A A A A A B A A A A A A A A A A A B A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A B A A A A A A A A A A A B A A A B H A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H H H A A A H A A A H H H H B A A B A A A A H A A B A A A A A A A B A A A A A A A A A B B A A A A A A A A A A A B A A A A B A A A A A A A B A A A A A A A A B A A A A A A A A A A A A A A B A H A A H H A A B H A A A H H A H A A A B B A A H A A A A A H H H B A A A H H A A H A A A A H A A H A A B H A A H A B A H A A A H H A B A A H A A A H A A A H A A A H A A A A B A A H A A B A 43 H A A A A A A A H A A H A A A A B H A A A A 44 H A A A H A B A A B B A A A H A A H A A A A 45 A H A A A B H A A A A H H A A A A A A A B B 46 A A H A A A B A H A A A A A A B A A A A A A 47 A A H A A A A A B A A B A A A A A H A A A A 48 B A H A A A A A A A B H A A A A A A A A A A 49 H H A A B H B A H A H A H A B A B H A A H A 50 A B A A A A H H A B H A B A A A A A A A A A Chú thích: NST: Nhiễm sắc thể; A: kiểu gen mẹ (OM6976); B: kiểu gen bố (Jasmine85); H: kiểu gen dị hợp tử A A A A A A A A B A A A B A A A H B A A A A A B B H H H A B A A H H A A A A B A Tổ hợp OM6976/ KDML105// OM6976 60,1 RM162 122,3 RM1031 68,5 RM1204 88,3 RM6152 72,2 RM339 101,5 RM256 37,6 RM257 51,1 RM6051 73,0 RM304 91,9 RM228 9,3 RM7557 16,2 RM167 43,2 RM512 75,5 RM463 A B B A A A H A A A A B A A A A A A A A A B A B A A A A B A A B A A B A A H A A A B H H H A A B B A A B A A H B A A A A A B A A A B A A B A A B A A A A B B A B A B H B A B H A A A A B A B A H A H H B A B B H A A A B H A A B A A A A A A A A A B H H H H A A B A A B B H H H H H A A A B A A A A B A B A A B A B A B A H B A A B A A A A A A A A A B A A A A A A A A A B A H A A A B B H A B H A B A H A A A A B H A A B A A H A A B B B A A A B A A A B A A A A A A A B A B A B H H B A B A A B A A A A A A A A Wx A B A A A H A B H A RM469 A B A H B A A A A H RM6 25,6 RM402 NST12 8,2 NST11 2,3 NST10 114,3 RM1024 NST9 55,6 RM440 NST8 106,2 RM211 NST7 67,9 RM471 NST6 43,8 RM7345 NST5 31,8 RM347 NST4 18,6 RM240 NST3 7,2 NST2 79,1 RM583 Vị trí (cM) OM6976 KDML105 RM1 Chỉ thị NST1 14,5 NST 159 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 H H H H H B H A A A A A B A B A A H B B A A A H B A A A A H H A A B B H A A A H B A A A H A H A H A B A A H A B H A A A B H H A A B A B H A A A A A B H H H A B A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H B A A H H A A A A A B A A A A A A A H A A A H A B A A A A A A A B A A A A A H A A A A A A A A B A A H A A B H A A A H B A H H B A A A A A A H H H A A A A A B A A A H A B H A A A A B B B H A A A A A A A B H B A A A A A B B A A A A A A B B A B A A A B A A A B A B A A B A A A A A A A A A B A A B A A A A A A B A A A B A A H A H H B A B B A A A A H B A A A A H H A B A A B A A H A B B H H B B H B H B H H B B B H B A H H H H B A H 160 B H A A H A B A H A A A B A H A A A A B A A B A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A B A A H A B B A A H A A B A A B A A H A A A A A B A B A A B B A A A B A A H A A A B A A A H A A B A A A A H H A A A B B A A B B H A A A A A A B H B A H A A A B H A B A A A H B A A A A B A A A H A B A H B B B A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H A A B B A A A A B A A A H A B A A H H A A B B A A A B B A A H H H B A B B A A A H A A H A A H H H A H H A A A B A B A H A A A A B A B A A A H B A A A A A H H A B A A H A A A A A A B A A B A A A A B A H A A B H A A H H H A A H H A H A A A A A A A A A A A A A H A A A A A H B A B A A B A A A B B A A A A H A A B A A B A A B A H A A A H H A A B A A A A H H A A B A B H H H H A A A A A A B A A A A A B A A A A A A A A A A 36 B A A A A A A A A A A H B A A H H B A A A A 37 A A A A A A A A A A A B A A A A A H A A A A 38 A A A A A A H A A A A H A A A H A A A A H A 39 A B H A A H H A B A H A H A A H B A A A B A 40 A A B A A H A A B A A H A A H H A H A A A B 41 H A A A A H A B B A A A B A H B A A A A A H 42 B A A A B A A H A A H H A A A B H A A A A H 43 A A A A A A A A A A A B A A A A A A A A A A 44 A A A A A A A A A A B B H A B H B A A A A A 45 A B H A H A H A A B H H A A A H B A A A A A 46 H B A A H A A A A B A B B A A B A B A A B H 47 B A A A A B B A B A H H A A A A A H A A A A 48 A A B A A A A A A A A B A A A A A A A A A A 49 H A A A B A B A A A B A H A B B A H A A B A 50 Chú thích: NST: Nhiễm sắc thể; A: kiểu gen mẹ (OM6976); B: kiểu gen bố (KDML105); H: kiểu gen dị hợp tử Tổ hợp OM5930/ OM7347// OM5930 60,1 RM162 122,3 RM1031 68,5 RM1204 88,3 RM6152 72,2 RM339 101,5 RM256 37,6 RM257 51,1 RM6051 73,0 RM304 91,9 RM228 9,3 RM7557 16,2 RM167 43,2 RM512 75,5 RM463 A B H H A B A A A B A H A B B B A B H H A B A B A B A A A B A H A B H B A B B B A B A A A B A A A B H A A B B B A B A A A B A A A B A A A B A A A B A A A B H A A B A H A B A H A B H A A B H H A B A A Wx A B B A RM469 A B A B RM6 25,6 RM402 NST12 8,2 NST11 2,3 NST10 114,3 RM1024 NST9 55,6 RM440 NST8 106,2 RM211 NST7 67,9 RM471 NST6 43,8 RM7345 NST5 31,8 RM347 NST4 H A B A A A A B A A A B A H H 18,6 RM240 NST3 A A A B A H A A A A A A A A B 7,2 NST2 A B A A A A A A A A B A A A A 79,1 RM583 Vị trí (cM) OM5930 OM7347 RM1 Chỉ thị NST1 A B A B H A A A A A A A B A H 14,5 NST A A A B A A A A A A B A H A A 161 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 A A B B A A H A B B B A A A A A B A B H H A B B A H A H H H A A A B B A H A A B A H H A B A A A H H H B A A A A A A A H H H A B A B B A H B A A H H A H A B B A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A B B H B B A A B B A A H H H H A B A A B H H H A A H B B A A H A A H H B A A A A B A H H H A B A A B H H H H A A A B A H A H B A A B H H A A A A H A A B H B A A B B B A A H H A A B A B A A A A A H A B B A H A A H H A A B B A A H A A A A A A A H A A A A A H H H A A A H A A A A A B B B A A A H A H A A H A A B A A A A H A A A B A H A A A A A H A A A A A B H H B A A A A H H A H H H B B B B H H A H B A A H H A H B A H H A H A 162 A A A B A H H H A A B A A A A B A A A A A A A A B B A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A B B A A H H H A A B B A H H H H A A B A A A A A A H B A A A H H A A H B B B A H B B B H H H H A B B B B A A H A B H A B A H A A A A A H H A B B A A B B A H H A A A A A A B H A H A H A A A H H H A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H H H H B B B H H H A H A A H H B B H H A H H H A A H H A B B B B B B A A A H H A A A H H H H A H A H A H A A A B A A H H H H H H H A A A B A H H H H H H A A A A H H A B H A H A A A B H A A H A A A A H A A A A H A H A B B B B B A A A A A A A A A A H A A A B B B A A A A H A B A B A A B A A H A A A A H A B B A A A A H H A A H H A B A A A H H B B A B A A A A A A A H A A A H H A H A A A A B A H A A B A B A A H H H A A H H 30 B A H A A B A A A A B B A A A A A A A A H H 31 B B H A A A H B H A B H A A B A A A A A A H 32 H B H A H A A A A H B H A A B A A B A A H H 33 H A B A H A H A A A A H B A A A B B A A A H 34 B A B A A H B A A A A H H A A H B A A A A A 35 A A A A A H B A B A A B A A H B B H A A A A 36 A H A A B B A H A A A A A A A H H A A A H A 37 A A H A B A A H A H A H A A B A H H A A H A 38 B A A A A A H A A B A H A A A H H A A A H B 39 A A A A A A A A A A A B A A A A A A A A A A 40 A H A A B H H B A H B H H A B A B H A A A A 41 H A B A A A A A A H A B H A H A A H A A A A 42 Chú thích: NST: Nhiễm sắc thể; A: kiểu gen mẹ (OM5930); B: kiểu gen bố (OM7347); H: kiểu gen dị hợp tử 163 A A H H A A B B A A A A H B A H H H A B A A B A B B B A A A A H A H A A A H A A H A B H A B A A H A H A A B A A A B A A H A A B H Luận án tiến sĩ khóa 2013-2017 Trường Đại học Cần Thơ PHỤ LỤC QUÁ TRÌNH TẠO CHỌN CÁC TỔ HỢP LAI HỒI GIAO Đông Xuân 2013-2014 Đánh giá chọn lọc bố mẹ Hè Thu 2014 Lai tạo đánh giá quần thể F1 Thu Đông 2014 Đánh giá quần thể F2 Đông Xuân 2014-2015 Lai tạo đánh giá quần thể BC1F1 Hè Thu 2015 Lai tạo đánh giá quần thể BC2F1 Thu Đông 2015 Lai tạo đánh giá quần thể BC3F1 Đông Xuân 2015-2016 Lai tạo đánh giá quần thể BC4F1 Hè Thu 2016 Đánh giá chọn lọc quần thể BC4F2 Đông Xuân 2016-2017 Đánh giá chọn lọc quần thể BC4F3 Hình 8.1 Sơ đồ chọn tạo quần thể lai hồi giao có hàm lượng amylose thấp 164 ... 3.3.3 Nội dung 3: Chọn tạo quần thể lai hồi giao có hàm lượng amylose thấp thơng qua MAS Lai tạo chọn lọc quần thể lai hồi giao nhờ thị phân tử 34 Giống (BC1Fmẹ 1- BCnF1 (giống nhận gen X RP) -... quần thể lai hồi giao có hàm lượng amylose thấp thông qua MAS Lai tạo chọn lọc quần thể lai hồi giao nhờ thị phân tử (BC1F1- BCnF1) 1.3.4 Nội dung 4: Chọn lọc quần thể hồi giao BC nF2 thông qua... có hàm lượng amylose cao (AC>25%), 37% giống lúa có hàm lượng amylose trung bình (AC: 21-25%), 11% nhóm lúa có hàm lượng amylose thấp (20-10%) Chỉ có 4% giống lúa thuộc nhóm giống lúa có hàm lượng