Chương 2: Protein Sinh học và môi trường

Chương 2: PROTEIN  Axit amin  Công thức chung  Phân loại aa  Tính chất lý hóa  Peptide  Cấu tạo và tính chất  Cấu tạo và tính chất  Một số peptide quan trọng  Protein  Định nghĩa, chức năng protein  Liên kết hóa học trong phân tử protein  Cấu trúc phân tử protein  Phân loại protein  Sự biến tính protein α- Axit amin • Chức năng – Đơn vị cấu trúc của protein – Chất dẫn truyền thần kinh (neurotransmitter) • Cấu trúc chung – Nhóm carboxylic – Nhóm Amine – Nhóm ngoại R – Tại vị trí C α • Có 20 axit amin tham gia vào cấu trúc protein α-axit amin • Phân loại axit amin dựa vào: – Tính phân cực (polarity) – Nhóm chức năng (functional groups) – Tính axit - bazơ - trung tính – Tính axit - bazơ - trung tính [...]... c p aa cho s phát tri n c a phôi Protein • Tính ch t – Phân t lư ng l n – Ch t đi n li lư ng tính (nhóm ngo i R) – pI là pH mà t i đó t ng s đt(-) = đt(+), protein trung hòa v đi n • pHC═O ; ∆G = -3kJ/mol – Liên k t đơn, có ý nghĩa l n trong đ i phân t • T o c u hình không gian và hoat tính sinh h c đ c trưng – Liên k t y u, hình thành và b gãy m t cách d dàng nhi t đ bình thư ng • Ch t trùng h p (protein và. .. bi hydrat hóa, v hydrat có b dày 3Å d ch keo • Pp th m tích tinh s ch protein • Đ b n dung d ch keo phu thu c: – S tích đi n cùng d u c a protein (pH ≠ pI) – L p v hydrat bao quanh phân t protein • (?) K t t a protein dung Kh i lương phân t và pI c a m t s protein Protein Xitocrom C Ribonuclease Tripxin Pepsin Hemoglobin Albumin huy t thanh M, dalton pI 11 600 12 700 24 000 36 000 64 500 69 000 10.6... đ i phân t sinh h c không th thay th c a cơ th s ng – Protein có th g m m t hay nhi u chu i polypeptide s p x p theo m t tr t t xác đ nh – Chu i polypeptide là m t polymer v i đơn v c u trúc là các phân t axit amin Protein • Ch c năng – Xúc tác: enzyme – V n t i: hemoglobin – Chuy n đ ng • S co cơ: chuy n đ ng trư t lên nhau c a 2 l o s i protein: s i tomiozin, s i m nh-actin,troponiozin và troponin... ch t – Ph n ng Biure Protein Peptide (≥ 3 aa) Cu2+ OH- Peptide • M t s peptide quan tr ng – Carnosine • Dipeptide: beta-alanin-L-histidine • Mô cơ và não • Anti-oxidant, anti-glycation, chelator of metal cation (Cu2+) – Glutathion • • • • Tripeptide có công th c: γ-glutamyl-cysteinyl-glycin Nhóm ho t đ ng: nhóm SH c a cystein Tham gia vào h oxy hóa-kh Có nhi u gan, th n, lá lách Protein • Đ nh nghĩa... peptide (peptide bonds) – Liên k t c ng hóa tr quan tr ng nh t, ∆G = -300 ~ -400 kJ/mol – T o khung cho chu i protein Các lo i liên k t hóa h c trong phân t protid (tt) • Liên k t disulfit (disulfit bonds) – Liên k t công hóa tr quan trong th 2, gi vai trò t o hình và ch c năng cho phân t protein – Liên k t chéo hình thành ngay c gi a các ph n khác nhau c a cùng 1 chu i polypeptide ho c 2 chu i khác... Tính ch t lý h c – Tính tan trong dung môi phân c c: nư c, ethanol 75-80%,… – Không h p thu bư c sóng Vis ho c UV có λ > 240nm, ngo i tr các aa vòng như tryptophan, tyrosin, histidin, phenylalanin – Thư ng có v ng t ki u đư ng • Tính ch t hóa h c – Ph n ng do nhóm α-carboxyl và α-amin – Ph n ng c a nhóm α-amin – Ph n ng c a nhóm α-carboxyl Ph n ng do nhóm α-carboxyl và α-amin • Ph n ng Ninhydrin – – –... phân t protein t n t i sao cho năng lương t do (G) c a h th ng đ t c c ti u C u trúc b c 2 thư ng g p C u trúc xo n c: xo n α, απ, γ, 310 n α : tương t lò xo 3.6 aa/vòng ~ 18 aa/5vòng xo n Góc xo n: 26o, bư c xo n: 0.54nm Xo n ph i/ xo n ph i Liên k t hydro t i đa: nhóm –NH– c a lk peptide này v i nhóm –CO– c a lk peptide th 3 k v i nó • C u trúc có tr t t và r t b n v ng Xo n απ, γ thì có 4.4 và 5.2... trong đi u ki n c th • Tính b o t n và bi n d trong di truy n Các lo i liên k t hóa h c trong phân t protid (tt) • L c Van der Waal – L c h p d n gi a các nguyên t – Xu hư ng kéo các nguyên t đ n g n nhau hơn Các lo i liên k t hóa h c trong phân t protid (tt) • Tương tác k nư c – Th hi n xu hư ng liên h p c a nh ng nhóm k nư c v i nhau – Lo i nư c ra kh i phân t protein tăng entropy (S) – Nhóm ngo... nhóm α-carboxyl và α-amin • Ph n ng Ninhydrin – – – – Nhi t đ cao ~100oC NH3, các peptide ph n ng ch m hơn so v i axit amin Prolin, hydroprolin t o ph c màu vàng v i Ninhydrin Phát hi n α-axit amin (phương pháp s c kí gi y) Ph n ng do nhóm α-carboxyl và α-amin (tt) • Ph n ng ngưng t t o liên k t peptide – α-amin c a aa này v i αcarboxyl c a aa khác – T o chu i peptide Ph n ng c a nhóm α-amin • Ph n ng . 2. 32 9.76 6.64 Serine 2. 21 9.15 5.68 Threonine 2. 63 10.43 6.16 Asparagine 2. 02 8.80 5.41 Tryptophan 2. 38 9.39 5.88 Valine 2. 29 9. 72 6 . 00 Valine 2. 29 9. 72 6 . 00 Glutamine. 2. 29 9. 72 6 . 00 Glutamine 2. 17 9.13 5.70 Methionine 2. 28 9 .21 5.74 Phenylalanine 2. 58 9 .24 5.91 Proline 2. 00 10.60 6.30 Aspartic acid 2. 09 9. 82 3.86 2. 80 Glutamic