Ứng dụng chỉ thị phân tử liên kết gần trong chọn giống lúa chịu ngập chìm

... cứu Lúa Quốc tế đã xác định đƣợc một số các chỉ thị phân tử liên kết chặt với gen có thể ứng dụng trong chọn giống, sử dụng phƣơng pháp MABC để chọn giống chịu ngập chìm. Để góp phần tạo ra giống ... giống lúa có khả năng chịu ngập chìm ứng phó với biến đổi khí hậu trong thời gian tới, ứng dụng kết quả nghiên cứu vào sản xuất, chúng tôi thực hiện đề tài: Ứng dụng chỉ thị phân tử liên kết gần ... plant breeding genitics and Biotechnology division, IRRI. Ứng dụng chỉ thị phân tử liên kết gần trong chọn giống lúa chịu ngập chìm Vũ Thị Thu Hằng Trƣờng Đại học Khoa học Tự nhiên Khoa...

... PCR Để chọn tạo lúa lai hai dòng thành công thì dòng TGMS phải nhiều và phong phú,từ đó mới tạo ra được tổ hợp cho ưu thế lai cao.Hiện nay các dòng TGMS đang được sử  dụng như:103S,T1S­96,64S,287S,36S2,Kim 76S,Pair 64S và 25S.Các nhà khoa học đã tìm được 6 gen TGMS(tms1, tms2, tms3, tms4, tms5, tms6).Mỗi gen này có ngưỡng chuyển hóa hữu dục và bất dục khác nhau ,trong đó,gen tms2 có ngưỡng chuyển hóa hữu dục ổn định.Nhà chọn tạo giống đã sử dụng các gen TGMS này lai chuyển vào các dòng ,giống lúa triển vọng để tạo dòng TGMS tốt,có khả năng phối hợp cao,tạo ra nhiều tổ hợp lai mới cho ưu thế lai cao như TH3­3,Việt Lai 20,TH3­4,… Bằng  việc sử dụng ADN marker (chỉ thị phân tử)  thời gian chọn tạo ra các dòng mới được rút ngắn.Các chỉ thị liên kết chặt  với các tính trạng kiểu hình.Do đó,chúng ta có thể xác định được các tính trạng dựa trên sự có mặt của các gen mong muốn.Kỹ thuật này không chỉ có độ chính xác cao mà còn xác định được trên một lượng lớn vật liệu nghiên cứu. Để đáp ứng được mục tiêu chọn giống chúng tôi tiến hành đề tài: “Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử DNA chọn lọc gen tms2 để tạo ra các dòng TGMS mới”.1.2.Mục đích và yêu cầu:1.2.1.Mục đích:­Xác định gen tms2 trong tập đoàn các dòng TGMS bằng  chỉ thị phân tử. ­Nghiên cứu di truyền gen tms2. 1.2.2 Yêu cầu : ­Khảo sát một số đặc điểm nông sinh học của các tổ hợp lai F1­Chiết tách AND để tiến hành phản ứng PCR­Đánh giá được khả năng hữu – bất dục bằng phương pháp truyền thống của các tổ hợp lai F2.­Phát hiện gen tms2 ở các dòng TGMS và thế hệ F2 . ... PCR Để chọn tạo lúa lai hai dòng thành công thì dòng TGMS phải nhiều và phong phú,từ đó mới tạo ra được tổ hợp cho ưu thế lai cao.Hiện nay các dòng TGMS đang được sử  dụng như:103S,T1S­96,64S,287S,36S2,Kim 76S,Pair 64S và 25S.Các nhà khoa học đã tìm được 6 gen TGMS(tms1, tms2, tms3, tms4, tms5, tms6).Mỗi gen này có ngưỡng chuyển hóa hữu dục và bất dục khác nhau ,trong đó,gen tms2 có ngưỡng chuyển hóa hữu dục ổn định.Nhà chọn tạo giống đã sử dụng các gen TGMS này lai chuyển vào các dòng ,giống lúa triển vọng để tạo dòng TGMS tốt,có khả năng phối hợp cao,tạo ra nhiều tổ hợp lai mới cho ưu thế lai cao như TH3­3,Việt Lai 20,TH3­4,… Bằng  việc sử dụng ADN marker (chỉ thị phân tử)  thời gian chọn tạo ra các dòng mới được rút ngắn.Các chỉ thị liên kết chặt  với các tính trạng kiểu hình.Do đó,chúng ta có thể xác định được các tính trạng dựa trên sự có mặt của các gen mong muốn.Kỹ thuật này không chỉ có độ chính xác cao mà còn xác định được trên một lượng lớn vật liệu nghiên cứu. Để đáp ứng được mục tiêu chọn giống chúng tôi tiến hành đề tài: “Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử DNA chọn lọc gen tms2 để tạo ra các dòng TGMS mới”.1.2.Mục đích và yêu cầu:1.2.1.Mục đích:­Xác định gen tms2 trong tập đoàn các dòng TGMS bằng  chỉ thị phân tử. ­Nghiên cứu di truyền gen tms2. 1.2.2 Yêu cầu : ­Khảo sát một số đặc điểm nông sinh học của các tổ hợp lai F1­Chiết tách AND để tiến hành phản ứng PCR­Đánh giá được khả năng hữu – bất dục bằng phương pháp truyền thống của các tổ hợp lai F2.­Phát hiện gen tms2 ở các dòng TGMS và thế hệ F2 . ... ĐƯợC4.1.Kế hoạch:­01/2010,viết đề cương và bảo vệ đề cương­Gieo mạ:06/01/2010­Cấy:       10/02/2010­Từ          21/02/2010 khảo sát các đặc điểm nông sinh học,tiến hành phản ứng PCR và viết báo cáo tốt nghiệp. 4.2 .Kết quả:­Phát hiện được tổ hợp chứa gen tms2­Tìm được marker­PCR liên quan đến tính trạng nghiên cứu3.2. Nội dung và phương pháp nghiên cứu * Nội dung nghiên cứu +) Theo dõi đặc điểm nông sinh học : Các chỉ tiêu nông sinh học :+ Thời gian từ cấy đến bắt đầu trổ(10% số bông thoát khỏi lá đòng).+ Thời gian trổ từ khi bắt đầu trỗ(10% số bông thoát khỏi lá đòng) đến khi kết thúc trổ (85% thoát khỏi lá đòng) .+ Thời gian tự cấy đến chín(85% số hạt chắc màu vàng)+ Tổng thời gian sinh trưởng từ gieo đến khi thu hoạch .+ Chiều cao cây (cm) cuối cùng : đo từ mặt đất đến mút đầu bông dài nhất không kể râu .+ Chiều dài lá đòng : đo từ gối lá đến đầu mút lá , đo vào giai đoạn chín sáp. + Chiều rộng lá đòng. + Góc độ lá đòng .+ Chiều dài bông : đo từ cổ bông đến hết bông vào thời kì  chín chắc . Các giống lúa lai hiện nay cho có thể cho năng suất cao hơn 20­30% so với các giống lúa thường.Hiện nay,chúng ta đang sử dụng  hai hệ thống:hệ thống lúa lai hai dòng và hệ thống lúa lai ba dòng.Nhưng lúa lai hai dòng vượt trội hơn hẳn như:cơ hội chọn tạo các dòng bố lớn thuận lợi cho việc cải tạo chất lượng gạo,không có hiệu ứng đồng tế bào chất nên ít bị sâu hại hơn,năng suất cao hơn lúa lai ba dòng từ 5­10% ,chỉ cần hai dòng khác nhau về bản chất di truyền(một là dòng TGMS hoặc PGMS,hai là dòng cho phấn) nên giá thành giảm,tính trạng bất dục đực mẫn cảm với điều kiện môi trường(EGMS) chủ yếu do một cặp gen lặn điều khiển thuận lợi cho việc tạo giống mới. Chỉ tiêu các yếu tổ cấu thành năng suất:+ Tổng số nhánh(số nhánh max)+ Số nhánh hữu hiệu /khóm : đến toàn bộ số nhánh trổ thành bông .+ Tổng số hạt/bông. + Số hạt chắc/bông+ Khối lượng 1000 hạt .+ Số bông hữu hiệu/khóm: đến toàn bộ số bông  có từ 10 hạt chắc trở lên + Năng suất lý thuyết được tính theo công thức :NSLT = A x B x C x mật độ/đơn vị diện tích(g)  Trong đó: A: số bông hữu hiệu/khóm                 B: số hạt chắc/bông                 C: khối lượng 1000 hạtPHầN...

... sử dụng chỉ thị L05 và chỉ thị BADH2 chỉ thị L05 và chỉ thị BADH2 Kết quả sử dụng chỉ thị phân tử L05 và BADH2 trong Kết quả sử dụng chỉ thị phân tử L05 và BADH2 trong phân loại các giống ... 2000.KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬNKẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬNXác định chỉ thị phân tử ADN liên kết với gen thơm Xác định chỉ thị phân tử ADN liên kết với gen thơm fgr trong lúa fgr trong lúa  Kết quả ... giống lúa thơm trong thời gian trong công tác chọn tạo giống lúa thơm trong thời gian tới.tới. Kết quả của việc sử dụng chỉ thị phân tử BADH2 để Kết quả của việc sử dụng chỉ thị phân tử BADH2...

... thơm.+ Chỉ thị phân tử L05 có thể phân biệt được giữa các giống lúa thơm và không thơm, nhưng độ chính xác không cao.+ Chỉ thị phân tử BADH2 đã phân biệt chính xác 100% các giống lúa thơm ... thị phân tử liên kết với gen quy định mùi thơm fgr đã được tiến hành trên 40 dòng, giống lúa thơm và không thơm cho thấy:+ Các chỉ thị phân tử RG28, RM342 không phân biệt được các giống lúa ... chọn tạo giống lúa thơm Kết quả sử dụng chỉ thị phân tử L05 và BADH2: Đối với chỉ thị L05, sản phẩm điện di ADN của các giống khác nhau có sự đa hình: Các giống lúa không thơm như Q5 và 94-30...

... PCR Để chọn tạo lúa lai hai dòng thành công thì dòng TGMS phải nhiều và phong phú,từ đó mới tạo ra được tổ hợp cho ưu thế lai cao.Hiện nay các dòng TGMS đang được sử  dụng như:103S,T1S­96,64S,287S,36S2,Kim 76S,Pair 64S và 25S.Các nhà khoa học đã tìm được 6 gen TGMS(tms1, tms2, tms3, tms4, tms5, tms6).Mỗi gen này có ngưỡng chuyển hóa hữu dục và bất dục khác nhau ,trong đó,gen tms2 có ngưỡng chuyển hóa hữu dục ổn định.Nhà chọn tạo giống đã sử dụng các gen TGMS này lai chuyển vào các dòng ,giống lúa triển vọng để tạo dòng TGMS tốt,có khả năng phối hợp cao,tạo ra nhiều tổ hợp lai mới cho ưu thế lai cao như TH3­3,Việt Lai 20,TH3­4,… Bằng  việc sử dụng ADN marker (chỉ thị phân tử)  thời gian chọn tạo ra các dòng mới được rút ngắn.Các chỉ thị liên kết chặt  với các tính trạng kiểu hình.Do đó,chúng ta có thể xác định được các tính trạng dựa trên sự có mặt của các gen mong muốn.Kỹ thuật này không chỉ có độ chính xác cao mà còn xác định được trên một lượng lớn vật liệu nghiên cứu. Để đáp ứng được mục tiêu chọn giống chúng tôi tiến hành đề tài: “Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử DNA chọn lọc gen tms2 để tạo ra các dòng TGMS mới”.1.2.Mục đích và yêu cầu:1.2.1.Mục đích:­Xác định gen tms2 trong tập đoàn các dòng TGMS bằng  chỉ thị phân tử. ­Nghiên cứu di truyền gen tms2. 1.2.2 Yêu cầu : ­Khảo sát một số đặc điểm nông sinh học của các tổ hợp lai F1­Chiết tách AND để tiến hành phản ứng PCR­Đánh giá được khả năng hữu – bất dục bằng phương pháp truyền thống của các tổ hợp lai F2.­Phát hiện gen tms2 ở các dòng TGMS và thế hệ F2 . ... PCR Để chọn tạo lúa lai hai dòng thành công thì dòng TGMS phải nhiều và phong phú,từ đó mới tạo ra được tổ hợp cho ưu thế lai cao.Hiện nay các dòng TGMS đang được sử  dụng như:103S,T1S­96,64S,287S,36S2,Kim 76S,Pair 64S và 25S.Các nhà khoa học đã tìm được 6 gen TGMS(tms1, tms2, tms3, tms4, tms5, tms6).Mỗi gen này có ngưỡng chuyển hóa hữu dục và bất dục khác nhau ,trong đó,gen tms2 có ngưỡng chuyển hóa hữu dục ổn định.Nhà chọn tạo giống đã sử dụng các gen TGMS này lai chuyển vào các dòng ,giống lúa triển vọng để tạo dòng TGMS tốt,có khả năng phối hợp cao,tạo ra nhiều tổ hợp lai mới cho ưu thế lai cao như TH3­3,Việt Lai 20,TH3­4,… Bằng  việc sử dụng ADN marker (chỉ thị phân tử)  thời gian chọn tạo ra các dòng mới được rút ngắn.Các chỉ thị liên kết chặt  với các tính trạng kiểu hình.Do đó,chúng ta có thể xác định được các tính trạng dựa trên sự có mặt của các gen mong muốn.Kỹ thuật này không chỉ có độ chính xác cao mà còn xác định được trên một lượng lớn vật liệu nghiên cứu. Để đáp ứng được mục tiêu chọn giống chúng tôi tiến hành đề tài: “Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử DNA chọn lọc gen tms2 để tạo ra các dòng TGMS mới”.1.2.Mục đích và yêu cầu:1.2.1.Mục đích:­Xác định gen tms2 trong tập đoàn các dòng TGMS bằng  chỉ thị phân tử. ­Nghiên cứu di truyền gen tms2. 1.2.2 Yêu cầu : ­Khảo sát một số đặc điểm nông sinh học của các tổ hợp lai F1­Chiết tách AND để tiến hành phản ứng PCR­Đánh giá được khả năng hữu – bất dục bằng phương pháp truyền thống của các tổ hợp lai F2.­Phát hiện gen tms2 ở các dòng TGMS và thế hệ F2 . ... ĐƯợC4.1.Kế hoạch:­01/2010,viết đề cương và bảo vệ đề cương­Gieo mạ:06/01/2010­Cấy:       10/02/2010­Từ          21/02/2010 khảo sát các đặc điểm nông sinh học,tiến hành phản ứng PCR và viết báo cáo tốt nghiệp. 4.2 .Kết quả:­Phát hiện được tổ hợp chứa gen tms2­Tìm được marker­PCR liên quan đến tính trạng nghiên cứu3.2. Nội dung và phương pháp nghiên cứu * Nội dung nghiên cứu +) Theo dõi đặc điểm nông sinh học : Các chỉ tiêu nông sinh học :+ Thời gian từ cấy đến bắt đầu trổ(10% số bông thoát khỏi lá đòng).+ Thời gian trổ từ khi bắt đầu trỗ(10% số bông thoát khỏi lá đòng) đến khi kết thúc trổ (85% thoát khỏi lá đòng) .+ Thời gian tự cấy đến chín(85% số hạt chắc màu vàng)+ Tổng thời gian sinh trưởng từ gieo đến khi thu hoạch .+ Chiều cao cây (cm) cuối cùng : đo từ mặt đất đến mút đầu bông dài nhất không kể râu .+ Chiều dài lá đòng : đo từ gối lá đến đầu mút lá , đo vào giai đoạn chín sáp. + Chiều rộng lá đòng. + Góc độ lá đòng .+ Chiều dài bông : đo từ cổ bông đến hết bông vào thời kì  chín chắc . Các giống lúa lai hiện nay cho có thể cho năng suất cao hơn 20­30% so với các giống lúa thường.Hiện nay,chúng ta đang sử dụng  hai hệ thống:hệ thống lúa lai hai dòng và hệ thống lúa lai ba dòng.Nhưng lúa lai hai dòng vượt trội hơn hẳn như:cơ hội chọn tạo các dòng bố lớn thuận lợi cho việc cải tạo chất lượng gạo,không có hiệu ứng đồng tế bào chất nên ít bị sâu hại hơn,năng suất cao hơn lúa lai ba dòng từ 5­10% ,chỉ cần hai dòng khác nhau về bản chất di truyền(một là dòng TGMS hoặc PGMS,hai là dòng cho phấn) nên giá thành giảm,tính trạng bất dục đực mẫn cảm với điều kiện môi trường(EGMS) chủ yếu do một cặp gen lặn điều khiển thuận lợi cho việc tạo giống mới. Chỉ tiêu các yếu tổ cấu thành năng suất:+ Tổng số nhánh(số nhánh max)+ Số nhánh hữu hiệu /khóm : đến toàn bộ số nhánh trổ thành bông .+ Tổng số hạt/bông. + Số hạt chắc/bông+ Khối lượng 1000 hạt .+ Số bông hữu hiệu/khóm: đến toàn bộ số bông  có từ 10 hạt chắc trở lên + Năng suất lý thuyết được tính theo công thức :NSLT = A x B x C x mật độ/đơn vị diện tích(g)  Trong đó: A: số bông hữu hiệu/khóm                 B: số hạt chắc/bông                 C: khối lượng 1000 hạtPHầN...

... hoá hồ- Trong 26 giống lúa tẻ địa phương có 15 giống có độ phân huỷ trong kiềm thấp và nhiệt độ hoá hồ cao, và 10 giống có độ phân huỷ trong kiềm cao, nhiệt độ hoá hồ thấp, chỉ có giống 10115 ... 10115 có độ phân huỷ trong kiềm và nhiệt hoá hồ trung bình .- Trong 14 giống lúa nếp địa phương có 8 giống độ phân huỷ trong kiềm và nhiệt hoá hồ trung bình, 6 giống có độ phân huỷ trong kiềm ... Amylose- Trong 26 giống lúa tẻ đựơc khảo sát có 2 giống hàm lượng Amylose rất thấp: 645; 10067, một giống AC thấp, một giống AC trung bình, còn lại 22 giống có AC cao.- Trong 14 giống lúa nếp...

... 40 dòng, giống lúa thơm và không thơm cho thấy:+ Các chỉ thị phân tử RG28, RM342 không phân biệt được các giống lúa mang gen thơm và không mang gen thơm.+ Chỉ thị phân tử L05 có thể phân biệt ... LUẬNXác định chỉ thị phân tử ADN liên kết với gen thơm fgr trong lúa - Kết quả đánh giá sự đa hình của sản phẩm điện di ADN của các giống lúa thơm và không thơm bằng chỉ thị RG28 và RM342 kết quả ... giữa các giống lúa thơm và không thơm, nhưng độ chính xác không cao.+ Chỉ thị phân tử BADH2 đã phân biệt chính xác 100% các giống lúa thơm và không thơm. Đây là chỉ thị cần được sử dụng trong...

... hoá hồ- Trong 26 giống lúa tẻ địa phương có 15 giống có độ phân huỷ trong kiềm thấp và nhiệt độ hoá hồ cao, và 10 giống có độ phân huỷ trong kiềm cao, nhiệt độ hoá hồ thấp, chỉ có giống 10115 ... 10115 có độ phân huỷ trong kiềm và nhiệt hoá hồ trung bình .- Trong 14 giống lúa nếp địa phương có 8 giống độ phân huỷ trong kiềm và nhiệt hoá hồ trung bình, 6 giống có độ phân huỷ trong kiềm ... Amylose- Trong 26 giống lúa tẻ đựơc khảo sát có 2 giống hàm lượng Amylose rất thấp: 645; 10067, một giống AC thấp, một giống AC trung bình, còn lại 22 giống có AC cao.- Trong 14 giống lúa nếp...

... các chỉ thị như: chỉ thị sinh hóa, chỉ thị hình thái, chỉ thị phân tử Những chỉ thị này từ lâu ñã là những công cụ hữu hiệu trong chương trình chọn giống. Chỉ thị sinh hóa là loại chỉ thị ... cs, 1995) [5]. Vì thế, cần kết hợp chỉ thị hình thái và các chỉ thị khác nhằm mang lại hiệu quả cao trong quá trình chọn giống. Chỉ thị phân tử AND là những chỉ thị có bản chất ña hình AND, ... rõ trên ñồng ruộng giúp cho nhà chọn giống có thể lựa chọn bố mẹ một cách dễ dàng. Vì vậy, cần sử dụng kết hợp chỉ thị hình thái và chỉ thị phân tử SSR trong phân tích di truyền cây bông nhằm...

...  3.4.2  th phân t liên kt vi gen kháng b BC1F1 Kxl ... 2. Trong quá  2 ...  3.3.2 Nghiên cu lp b  di truyn ca cây bông c s dng ch th SSR và qun th phân ly F2 2...