Vào những năm 1960, một số người ựã có ý tưởng mô hình hoá không gian lưu trữ vào máy tắnh, ựó là một bản ựồ ựơn giản có thể mã hoá, lưu trữ trong máy tắnh, sữa chửa khi cần thiết, có thể hiển thị trên màn hình và in ra giấy. Thời gian ựầu, bản ựồ ựiện toán (computer cartography) thể hiện những ựiểm, các ựường thẳng (vector) & vùng (text). Các ựồ thị phức tạp có thể ựược xây dựng từ những yếu tố này. Tuy nhiên, khi xã hội càng phát triển, và các loại bản ựồ ngày càng ựa dạng trong việc thể hiện các ựối tượng khác nhau trên bề mặt trái ựất, các nhà quy hoạch nhận thức ựược sự cần thiết trong xử lý ựồng thời nhiều hơn một bản ựồ ựể có thể quy hoạch và lập quyết ựịnh một cách toàn diện nhất.
Vào lúc này thuật ngữ ỘBản ựồ máy tắnhỢ ựược thay thế bởi thuật ngữ ỘHệ thống thông tin ựịa lýỢ (Geographical Information System). Hệ thống thông tin ựịa lý ựầu tiên xuất hiện vào năm 1964 thuộc dự án Ộ Rehabilitation and Development Agency ProgramỢ của chắnh phủ Canada. Cơ quan ỘHệ thống thông tin ựịa lý Canada Ờ CGISỢ ựã thiết kế ựể phân tắch, kiểm kê ựất
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 24 nhằm trợ giúp cho chắnh phủ trong việc sử dụng ựất nông nghiệp. Dự án CGIS hoàn thiện vào năm 1971 và phần mềm vẫn sử dụng tới ngày nay. Dự án CGIS gồm nhiều ý tưởng sáng tạo mà ựược pha triển trong những phần mềm sau này.
Giữa những năm 60 Ờ 70 của thế kỷ XX, hệ thống thông tin ựịa lý phát triển chủ yếu trong Chắnh phủ và các phòng thắ nghiệm. Năm 1964, ông Howard Fisher thành lập ỘPhòng thắ nghiệm ựồ hoạ máy tắnh HarvardỢ, phòng dẫn ựầu về công nghệ mới. Phòng thắ nghiệm Harvard ựã tạo ra một loạt các ứng dụng chắnh trong hệ thống thông tin ựịa lý, bao gồm: SYMAP (Synagrphic Mapping System), CALFORM, SYMVU, GRID, POLYRVRT, và ODYSSEY. đặc biệt, ODYSEY là mô hình vector ựầu tiên trong hệ thống thông tin ựịa lý và nó trở thành chuẩn cho các phần mềm thương phẩm.
Hệ thống bản ựồ tự ựộng ựã ựược phát triển bởi CIA (Cơ quan tình báo Mỹ) trong những năm cuối của thập niên 60 của thế kỷ trước. Dự án này tạo ra ỘNgân hàng dữ liệu Thế Giới của CIAỢ, thu thập thông tin ựường bờ biển, con sông, ranh giới hành chắnh và phần mềm trọn gói CAM tạo ra những bản ựồ tỉ lệ khác nhau từ dữ liệu này. đây là một hệ thống cơ sở dữ liệu bản ựồ ựầu tiên trên Thế Giới.
Hai công trình có giá trị khác là ỘHệ thông tin sử dụng ựất New York (1967)Ợ và ỘHệ thông tin quản lý ựất (Minnesota Ờ 1969)Ợ.
Năm 1969, Jack Dangermond, một người trong nhóm nghiên cứu tại phòng thắ nghiệm Harvard, cùng với vợ là Laura ựã sáng lập ESRI. Những năm sau này ESRI trở nên vượt trội trong thị trường hệ thống thông tin ựịa lý và tạo ra các sản phẩm phần mềm ArcInfo và ArcView.
Hội nghị hệ thống thông tin ựịa lý ựược tổ chức lần ựầu tiên vào 1970, tổ chức bởi Roger Tomlinson (CGIS) và Duane Marble (giáo sư tại Northwestern University)
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 25 Trong những năm của thập niên 80 - 90 của thế kỷ XX, nhiều ứng dụng ựược phát triển là những gói phần mềm phát triển bởi các công ty tư nhân
như: ArcInfo, ArcView, MapInfo, SPANS GIS, PAMAP GIS,
INTERGRAPH, và SMALLWORLD. Và rất nhiều ứng dụng ựã chuyển từ hệ máy lớn vào sử dụng trong máy tắnh cá nhân.