Tiền gửi của các tổ chức tín dụng là nguồn vốn mang lại hiệu quả đáng kể cho các NHTM trong đó có NHNo&PTNT Quảng Bình, nguồn vốn này được gửi tại Ngân hàng khi có tổ chức tín dụng bao gồm các NHTM Nhà nước, các NHTM ngoài quốc doanh, Ngân hàng cổ phần, liên doanh, Ngân hàng nước ngoài, quỹ tín dụng... chưa sử dụng hoặc tạm thời nhàn rỗi và khả năng rủi ro khi gửi vốn vào các NHTM Nhà nước là khó xãy ra.
Nguồn vốn huy động từ các tổ chức tín dụng đều là nguồn vốn không kỳ hạn và đều được quy đổi ra VNĐ. Trong những năm qua, 2004 – 2006 nguồn vốn huy động từ các tổ chức tín dụng có sự tăng trưởng không đồng đều.
Năm 2005 đạt 52.669 (triệu đồng) tăng 48.929 (triệu đồng), chiếm 6,48% tổng nguồn vốn huy động.
Năm 2006 đạt 20.933 (triệu đồng), giảm 31.736 (triệu đồng), chiếm 2,58% tổng nguồn vốn huy động.
Năm 2007 đạt 24.556 (triệu đồng), tăng 3.623 (triệu đồng), chiếm 11,86% tổng vốn huy động.
Có thể nói mặc dù nguồn vốn huy động từ các tổ chức tín dụng không có sự tăng trưởng đồng đều qua các năm nhưng đây cũng là những thành công bước đầu của NHNo&PTNT Quảng Bình trong chính sách huy động vốn của Ngân hàng.
Ngân hàng không có nguồn ngoại tệ gửi các tổ chức tín dụng, chủ yếu là quỹ hỗ trợ phát triển điều này chứng tỏ hoạt động của Ngân hàng là có hiệu quả, không dư thừa nguồn vốn nhàn rỗi, nguồn vốn của Ngân hàng là khá ổn định và có sự tăng trưởng qua các năm. Tuy nhiên, Ngân hàng cũng cần phải duy trì công tác giao dịch với các tổ chức tín dụng nhằm huy động ngày càng nhiều hơn lượng vốn huy động, đặc biệt là huy động được nguồn vốn trung và dài hạn từ các tổ chức tín
dụng, để từng bước đưa hoạt động kinh doanh nói chung và hoạt động huy động vốn của Ngân hàng nói riêng ngày càng phát triển.