Nhà trường tập trung thống nhất trong quản lý phân bổ tài chính và kiểm soát chi.
* Các hạng mục chi của trường
Chi từ nguồn kinh phí nhà nước cấp được chi theo loại, khoản mục do nhà nước quy định bao gồm chi thường xuyên cho đào tạo đại học và sau đại học; chi nghiên cứu khoa học; chi chương trình mục tiêu; chi đào tạo công chức và lưu học sinh; chi xây dựng cơ bản
Chi từ các nguồn ngoài kinh phí ngân sách cấp bao gồm chi tiền lương, tiền công, các khoản trích nộp theo lương và phụ cấp, công tác phí; hội nghị hội thảo; sử dụng thông tin liên lạc; văn phòng phẩm; mua sắm thiết bị vật tư, nhiên liệu; chi nghiệp vụ thường xuyên
* Cơ cấu chi của trường, cân đối thu chi và trích lập quỹ
Theo số liệu năm 2010, chi thường xuyên hiện chiếm 68%, chi không thường xuyên chiếm 32% trong tổng chi của trường. Trong chi thường xuyên, chi cho con người chiếm 74% (chi lương và các khoản có tính chất lương chiếm gần 67%, chi cho sinh viên chiếm 4,7%), chi hoạt động nghiệp vụ chiếm 20%, chi mua sắm sửa chữa tài sản cố định chiếm 1%, còn lại là chi thường xuyên khác. Trong chi không thường xuyên, chi đầu tư xây dựng cơ bản là chủ yếu chiếm 89% còn lại là chi thực hiện các nhiệm vụ khoa học công nghệ chiếm 11%.
* Quản lý chi tài chính của trường
- Nhà trường thống nhất quản lý chi tài chính theo loại, khoản mục chi ngân sách nhà nước.
Về chi lương, quỹ tiền lương tối đa được xác định theo thông tư 25/2002/TT-BTC. Quỹ tiền lương thực tế hàng năm dựa trên cơ sở thực trạng tài chính hàng năm của trường và không vượt quá quỹ tiến lương tối đa. Lương cá nhân trong biên chế và hợp đồng bao gồm lương nhà nước chi trả
theo ngạch bậc và lương nhà trường chi trả. Lương nhà trường chi trả phụ thuộc vào mức lương tối thiểu do nhà nước quy định, hệ số ngạch bậc, và hệ số điều chỉnh tăng 31hem. Ngoài ra việc trả lương còn được dựa trên chấp hành kỷ luật lao động.
Về các định mức chi khác nhà nước không quy định hoặc nhà nước cho phép các đơn vị tự chủ thì Hiệu trưởng nhà trường quyết định mức chi tuỳ theo hạng mục và nội dung chi
- Đối với chi của các đơn vị có thu: các đơn vị có thu tự đảm bảo mọi chi phí hoạt động nghiệp vụ chuyên môn và các chi phí về sử dụng tài sản được giao sử dụng (trừ nhà cửa), chi phí về điện, cước phí thông tin, tiền công tác phí lái xe, các loại thuế nếu có, tự trang trải phần lương tương ứng với phần lương tăng 31hem do trường chi trả cho lao động trong đơn vị mình. Các đơn vị được thuê lao động hợp đồng và tự trang trải lương và các khoản phụ cấp lương cho họ.
- Các đơn vị khác thực hiện dịch vụ với bên ngoài tự quản lý kinh phí thực hiện dịch vụ và trang trải mọi khoản chi phí hoạt động.