Bên cạnh những ưu điểm đã nêu ở trên thì công ty cũng gặp phải những khó khăn và hạn chế trong thời gian tới cần phải khắc phục là:
Hạn chế trong hoạt động kế toán- tài chính: Bộ phận kế toán – tài chính trong công ty đều là những người có trách nhiệm, kiến thức và nghiệp vụ cơ bản về kế toán. Tuy nhiên hoạt động kế toán còn gặp phải một số hạn chế như chưa cập nhật kịp thời các chế độ, thong tin mới, việc luân chuyển chứng từ và đối chiếu giữa các bộ phận còn rời rạc. Tình trạng trên gây ảnh hưởng không nhỏ tới kết quả kinh doanh của công ty vấn đề bảo toàn giá vốn và quản lý chi phí của DN.
Qua tìm hiểu thực tế tại công ty TNHH Châu Á Linh trong bản báo cáo cuối mỗi năm bộ phận kế toán tài chính cũng có đề cập tới mục tiêu phấn đấu lợi nhuận và
doanh thu năm tới.Tuy nhiên chỉ dừng lại ở mức đọ con số mà chưa vạch ra kế hoạch lợi nhuận và doanh thu cụ thể còn kế hoạch chi phí không thấy đề cập đến. Các phân tích tình hình doanh thu, chi phí, lợi nhuận và các nhân tố ảnh hưởng cũng không được tiến hành. Như vậy công tác quản lý cả ba hoạt động: kế hoạch lợi nhuận, doanh thu và chi phí của công ty chưa đạt hiệu quả thể hiện ở việc hoạt động tài chính và phân tích tài chính không mấy được quan tâm, bộ phận kế toán không vạch ra những nguyên nhân và tồn tại về thực trang HD SXKD để đề ra xuất các giải pháp khắc phục một cahs đúng đắn nhất.
-Cùng với giá vốn bán hàng thì chi phí bán hàng, chi phí quản lý DN cũng không ngừng tăng qua các năm ngoài nguyên nhân chính là DN mở rộng phạm vi hoạt động kinh doanh thì hiện tượng lãng phí, mua sắm,chi tiêu vượt quá mức quy định.Đó là do DN chưa có sự kiểm soát chặt chẽ chưa lập dự toán chi phí chi tiết hàng năm để theo dõi. Đồng thời DN cũng nên xây dựng các định mức về lao đọng, chế đọ lương, thưởng,trợ cấp, định mức tiêu hao nguyên vật liệu hợp lý hơn, rà soát chặt chẽ, quản lý các khoản chi về hội họp,tiếp khách,tránh các khoản chi không đúng mục đích.
-Công tác quản lý nguyên vật liệu đầu vào: Công ty chưa xây dựng được định mức vật tư cho từng đơn vị sản phẩm do đó dễ dẫn đến tình trạng sử dụng vật tư tùy tiện không tiết kiệm.
Những vấn đề còn tồn tại nêu trên buộc các nhà quản trị và toàn thể DN cần nhìn nhận lại để từ đó có những phương pháp thực tế,nỗ lực phấn đấu hơn nữa nhằm đạt mục tiêu nâng cao lợi nhuận.