Hyper-V hỗ trợ một số tùy chọn lưu trữ khác nhau, bao gồm cả các thiết bị lưu trữ trực tiếp (DAS) như SATA hoặc SAS và lưu trữ SAN, như FC, iSCSI. Sau khi các máy chủ Hyper-V đã được kết nối để lưu trữ, có thể được cung cấp cho máy ảo theo nhiều cách khác nhau.
Sau khi lưu trữ đã được kết nối với máy chủ Hyper-V, việc lưu trữ hệ điều hành khách có thể được thực hiện như sau:
Tạo một đĩa cứng ảo (VHD) trên một ổ đĩa của máy chủ Hyper-V, các đĩa cứng đơn giản là một tập tin được lưu trữ trên một ổ đĩa lưu trữ của máy chủ Hyper-V. Có hai loại đĩa cứng ảo là Dynamic và Fixed. Kích thước tối đa của một tập tin VHD là 2048 GB.
Sử dụng đĩa Passthrough cho phép truy cập vào ổ đĩa trực tiếp. Trước khi cấu hình máy ảo với đĩa Passthrough, đĩa phải được đặt ở trạng thái Offline để không bị tranh chấp giữa các máy ảo và máy chủ Hyper-V.
Có 3 loại kết nối đến các ổ đĩa đến các máy ảo, dựa vào các trình điều khiển sau:
IDE : cho phép các ổ đĩa lên đến 2048 GB, cung cấp hiệu suất cao ngang với SCSI. Bộ điều khiển IDE hỗ trợ một trong hai đĩa cứng ảo hoặc đĩa
Passthrough. Các máy ảo có thể được tối đa bốn đĩa IDE (2 bộ điều khiển với 2 đĩa). Trong Hyper-V, có thể khởi động một máy ảo bằng từ một đĩa ảo được kết nối thông qua giao diện IDE. Khởi động từ SCSI ảo thì không được hỗ trợ.
SCSI :là một thiết bị tổng hợp. Có thể có đến bốn bộ điều khiển SCSI cho mỗi máy ảo. Mỗi bộ điều khiển hỗ trợ 64 đĩa, tổng cộng thì có 256 đĩa cho mỗi máy ảo. Mỗi máy ảo không được cấu hình để khởi động từ một bộ điều khiển SCSI.
iSCSI : máy ảo kết nối với một mạng vật lý có thể tận dụng lợi thế của lưu trữ iSCSI. Máy ảo kết nối trực tiếp đến thiết bị lưu trữ iSCSI qua mạng iSCSI, bỏ qua việc kết nối đến máy chủ Hyper-V. Tất cả những gì cần thiết là cấu hình thích hợp trong các máy ảo và iSCSI chạy một nơi nào đó trên mạng và có thể truy cập máy ảo. Không có giới hạn số lượng đĩa iSCSI được hỗ trợ trên máy ảo.