Các trình tự gen 16S mtDNA của 22 loài cá nước ngọt ĐBSCL sau khi được kết nối bằng chương trình Geneious (ver 7) (https://support.geneious.com/) và dóng hàng bằng phần mềm BioEdit 7.2.5 (Hall, 1997) sẽ được so sánh sự khác biệt di truyền. Kết quả được thể hiện ở Bảng 3.3.
Sự khác biệt di truyền của 22 loài cá nằm trong khoảng 1,4% (8/560 nucleotide) – 29,9% (167/560 nucleotide), trong đó sự khác biệt lớn nhất là giữa loài Brachirus panoides và Notopterus notopterus, sự khác biệt nhỏ nhất là giữa loài Pangasius krempfi và Pangasius sp.
Sự khác biệt di truyền của các loài trong bộ Cypriniformes nằm trong khoảng 5,1% (29/560 nucleotide) – 14,6% (82/560 nucleotide), trong đó sự khác biệt lớn nhất là giữa loài Henicorhynchus lobatus và Acantopsis sp., sự khác biệt nhỏ nhất là giữa loài Syncrossus helodes và Yasuhikotakia modesta.
Sự khác biệt di truyền của các loài trong bộ Perciformes nằm trong khoảng 2,8% (16/560 nucleotide) – 19,2% (108/560 nucleotide), trong đó sự khác biệt lớn
nhất là giữa loài Toxotes chatareus và Pristolepis fasciata, sự khác biệt nhỏ nhất là giữa loài Trichopodus pectoralis và Trichopodus trichopterus.
Sự khác biệt di truyền của các loài trong bộ Siluriform nằm trong khoảng 1,4% (8/560 nucleotide) – 10% (56/560 nucleotide), trong đó sự khác biệt lớn nhất là giữa loài Mystus mysticetus và Ompok bimaculatus, sự khác biệt nhỏ nhất là giữa loài Pangasius krempfi và Pangasius sp.
Sự khác biệt di truyền của các loài trong giống Trichopodus nằm trong khoảng 2,8% (16/560 nucleotide) – 3,9% (22/560 nucleotide), trong đó sự khác biệt lớn nhất là giữa loài Trichopodus trichopterus và Trichopodus microlepis, sự khác biệt nhỏ nhất là giữa loài Trichopodus pectoralis và Trichopodus trichopterus. Sự khác biệt di truyền trong giống Pangasius nằm trong khoảng 1,4% (8/560 nucleotide) – 2,8% (16/560 nucleotide), trong đó sự khác biệt lớn nhất là giữa loài Pangasius krempfi và Pangasius macronema, sự khác biệt nhỏ nhất là giữa loài Pangasius krempfi và Pangasius sp.
Sự khác biệt di truyền trong họ Cobotidae nằm trong khoảng 5,1% (29/560 nucleotide) – 8,8% (49/560 nucleotide), trong đó sự khác biệt lớn nhất là giữa loài
Acantopsis sp. và Syncrossus helodes, sự khác biệt nhỏ nhất là giữa loài Syncrossus helodes và Yasuhikotakia modesta.
Bảng 3.3 – Sự khác biệt về trình tự 16S mt DNA của 22 loài cá nước ngọt phổ biến ở ĐBSCL
Đơn vị:%
Chú thích : 1 – Pangasius krempfi; 2 – Pangasius macronema; 3 – Pangasius sp.; 4 – Mystus mysticetus; 5 – Henicorhynchus lobatus; 6 – Acantopsis
sp.; 7 – Toxotes chatareus; 8 – Cynoglossus feldmanni; 9 – Clupeoides borneensis; 10 – Pristolepis fasciata; 11 – Datnioides polota; 12 – Trichopodus pectoralis; 13 – Trichopodus trichopterus; 14 – Trichopodus microlepis; 15 – Brachirus panoides; 16 – Syncrossus helodes; 17 – Yasuhikotakia modesta; 18 – Coilia rebentischii; 19 – Mastacembelus favus; 20 – Notopterus notopterus; 21 – Ompok bimaculatus; 22 – Paralaubuca typus.
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 1 ID 2,8 1,4 7 17,9 16,9 22,5 24 19,2 20,9 20,9 20,5 20,4 20,5 21,8 16 15,4 17,7 24,1 27,2 7,6 16,1 2 ID 2,6 7 18,8 17,3 22,7 24,6 19,4 21,5 20,4 20,9 20,5 21 22 15,8 16 17,5 23,9 26,9 8,2 16,5 3 ID 2,8 17,9 17,1 22,3 24,2 19,1 20,5 20,5 20 20,2 20,3 22,1 15,8 15,6 17,9 24,1 27,2 7,6 16,3 4 ID 19 17,3 22,3 24,8 20,4 20,7 20,9 21,5 20,6 20,7 21,8 16,7 16,2 19,6 24 27,4 10 17,1 5 ID 14,6 23,2 23,6 21,5 22,3 24,6 23,6 23,4 24,7 23,4 13,2 13,1 22,2 25,7 24,8 19,6 11,2 6 ID 22,5 24 20,9 22 23,8 21,9 21,2 21,5 22,5 8,8 8,1 22,8 23,2 27,7 17,6 10,2 7 ID 25,5 24,5 19,2 17,2 19,1 13,8 18 16,3 23,2 23,3 26,2 21,3 28,9 23,6 22 8 ID 25,1 23,6 25,4 25 24,5 25,3 23,4 22,3 22,3 25,6 23,7 29,8 24 24 9 ID 22,7 23,5 22,4 22,1 22,4 24,6 19,6 18,9 16,6 25 26,7 20,2 20,2 10 ID 14 8,5 8 9,1 19,2 20,7 19,9 23 13,2 28,9 21,6 20,8 11 ID 14,6 14,3 13,3 17,9 23,5 23,3 25 18,4 28,5 22 22,6 12 ID 2,8 3,7 17,3 21,5 20,7 20,1 14 28,8 20,3 22,1 13 ID 3,9 17,2 20,8 20,4 21,5 12,8 29,1 20,4 22 14 ID 16,8 21,1 20,8 22,6 14,2 28,8 20,5 22,6 15 ID 21,4 22,1 23,3 18,9 29,9 21 22,1 16 ID 5,1 19,8 22,4 25,6 16,5 9,9 17 ID 19,9 22,1 26 16,6 9,1 18 ID 23,9 28,6 20 20,7 19 ID 28,9 24,5 23,3 20 ID 27,6 25 21 ID 18,1 22 ID