Với bờ biển dài 189km với nhiều đầm, vịnh mang vẻ đẹp tự nhiên, còn hoang sơ như: đầm Cù Mông, vịnh Xuân đài, đầm Ô Loan, vịnh Vũng Rô…; nhiều bãi tắm đẹp như: Bãi Bầu, Bãi Từ Nham, Bãi Xép, Bãi Long Thuỷ, Bãi Tiên, Bãi Môn…; có những gành đá và đảo đẹp như: Gành Đỏ, Thắng cảnh quốc gia Gành Đá Dĩa, Nhất Tự Sơn, Lao Mái Nhà, Hòn Yến, Hòn Chùa, Hòn Nưa…
Rừng núi Phú Yên có nhiều cảnh quan thiên nhiên kỳ vĩ, hấp dẫn. Trong đó, khu bảo tồn thiên nhiên Krông Trai và khu rừng cấm bắc Đèo Cả rộng hàng ngàn hecta là những bảo tàng thiên nhiên kỳ thú. Các nguồn nước khoáng nóng như: Phú Sen, Trà Ô, Lạc Sanh, Triêm Đức… và các hồ, thác , suối rất phù hợp cho du khách tổ chức các tour du lịch sinh thái, nghỉ dưỡng.
*Tài nguyên nhân văn
Phú Yên có nhiều di tích lịch sử - văn hoá có giá trị như: Đá Bia gắn với truyền thuyết về hành trình Nam tiến của vua Lê Thánh Tông; Vũng Rô với kỳ tích lịch sử đường Hồ Chí Minh trên biển; Mộ và đền Lương Văn Chánh, Lê Thành Phương là những danh nhân lịch sử; Tháp Nhạn cổ kính trên núi Nhạn nằm bên sông Đà Rằng là di tích kiến trúc nghệ thuật của người Chăm. Những công trình kiến trúc tiêu biểu như Hải đăng trên Mũi Đại Lãnh (Mũi Điện) là điểm cực đông trên đất liền của Tổ quốc, hiện nay đã có đường Phước Tân – Bãi Ngà đi ngang qua; Cầu Đà Rằng, công trình thuỷ nông Đồng Cam, hồ thuỷ điện Sông Ba Hạ, Nhà thờ Mằng Lăng, Di tích lịch sử quốc gia Chùa Đá Trắng. Phú Yên còn có nhiều lễ hội truyền thống như: Lễ cầu ngư, lễ hội đua thuyền Đầm Ô Loan, Lễ hội đâm trâu, lễ hội ngày mùa…