Phía các doanh nghiệp cần đổi mới quan niệm và tư tưởng về thủ tục HQĐT, nâng cao nhận thức về giá trị mà HQĐT mang lại như: giảm thời gian thông quan, giảm số lượng giấy tờ làm thủ tục, giảm tình trạng hối lộ, đút lót...
Doanh nghiệp cần tự ý thức nâng cấp cơ sở hạ tầng của chính công ty, cụ thể là các trang thiết bị máy móc và hệ thống đường truyền dữ liệu điện tử. Ngoài ra, cần chú ý trong việc sử dụng các phần mềm khai báo điện tử, các phần mềm quản lý khối lượng hàng hóa khác.
Chấp hành nghiêm túc luật pháp, thực hiện đúng tiến trình khai báo HQĐT, nộp thuế thông quan ngân hàng thương mại đúng thời hạn để đảm bảo thời gian thông quan lô hàng.
Tham gia đầy đủ các cuộc đối thoại của Hải quan- Doanh nghiệp để tìm ra những vấn đề còn khúc mắc và định hướng giải quyết.
4.3.3 Với Tổng cục Hải quan
Bổ sung và điều chỉnh một số quy định nghiệp vụ, phần mềm chương trình chưa thực sự hiệu quả trong thời gian thực hiện thí điểm thủ tục hải quan điện tử, đẩy mạnh hoạt động xây dựng cơ sở dữ liệu, tích hợp thông tin, thực hiện ưu tiên phân luồng và quản lý rủi ro đảm bảo minh bạch, rõ ràng.
Mở rộng các chế độ ưu đãi, tạo thuận lợi, hỗ trợ cho các doanh nghiệp, đại lý Hải quan trong khai báo, giải quyết các vướng mắc trong quá trình làm thủ tục hải quan điện tử nhằm tăng số lượng các lô hàng làm thủ tục hải quan điện tử. Xác định rõ trách nhiệm của nhà cung cấp dịch vụ VAN, doanh nghiệp cơ quan hải quan trong triển khai thủ tục hải quan điện tử để tạo triển khai đồng bộ, kịp thời, thực hiện nhanh chóng cho việc thông quan hàng hóa.
Thiết kế phần mềm làm thủ tục cho phương tiện xuất nhập cảnh. Hỗ trợ Chi cục Hải quan cửa khẩu cảng Đình Vũ xây dựng trụ sở, các khu kiểm tra hàng hóa tập trung, trang bị hệ thống máy soi container cố định, di động, camera giám sát, hoàn thiện hệ
thống mạng, cơ sở dữ liệu, phần mềm… để đẩy nhanh tiến độ, hoàn thành mô hình thông quan điện tử tập trung.