Đa hình di truyền NPHS2

Một phần của tài liệu Xác định mối liên quan giữa đa hình đơn RS3738423 của gen NPHS2 với chỉ số protein creatinin niệu ở bệnh nhân mắc hội chứng thận hư tiên phát tại bệnh viện nhi trung ương (Trang 20 - 24)

1.2.1 Vị trí, cấu trúc, vai trò gen NPHS2

Năm 2000, Boute và cộng sự đã xác định được vị trí gen NPHS2 ở người (MIM # 604766, GenBank NM 014625.2). Gen dài khoảng 25 Kb, có 8 exon, nằm trên vai dài nhiễm sắc thể số 1 (1q25-q31). [20]. ( Hình 1.2)

Hình 1.2. Gen NPHS2 trên vai dài nhiễm sắc thể số 1 ở vị trí 25.2 . ( Nguồn: Genome Decoration Page/ NCBI)

Gen NPHS2 mã hóa cho podocin, một protein được tạo thành từ 383 acid amin với trọng lượng phân tử là 42 kD. Podocin là protein gắn màng, cấu trúc hình kẹp tóc, có cả hai đầu N- và C- đều nằm trong tế bào chất [49]. Podocin được tìm thấy chủ yếu ở thận, là cơ quan có nhiệm vụ lọc các chất thải từ máu và loại bỏ chúng qua nước tiểu. Cụ thể, podocin được tìm thấy trong các tế bào gọi là podocyte, tồn tại dưới dạng oligo trên màng lipid kép và tập trung nhiều ở khu vực slit diagram để có thể dễ dàng tương tác với các protein khác như CD2AP hay nephrin [25].

Podocyte là các tế bào biểu mô có chân hình các tua nhỏ, tạo thành các khe lọc nhỏ (slit diagram) có đường kính khoảng 70- 75 A0. Đây là hàng rào cuối cùng, là 1 trong 3 lớp cấu thành nên màng lọc cầu thận cùng với lớp tế bào nội mô mao mạch và màng đáy [29]. Trong những năm gần đây, các đột biến di truyền gây bệnh ở tế bào podocyte ngày càng được quan tâm và chứng minh là nguyên nhân hàng đầu, liên quan chặt chẽ đến hội chứng thận hư kháng corticosteroid.

Copyright @ School of Medicine and Pharmacy, VNU

12

Hình 1.3. Cấu trúc màng lọc cầu thận [24]

Ở lớp tế podocyte, các protein podocin, CD2AP và nephrin tập trung ở khu vực slit diagram và tương tác với nhau để điều hòa chức năng lọc tại đây.

Đến nay, các nhà khoa học đã phát hiện 24 đột biến đơn gen có liên quan đến HCTH kháng corticosteroid, có thể kể đến như NPHS1, NPHS2, PLCe1

[38]. Nhiều nghiên cứu đã chỉ ra rằng, đột biến gen NPHS2 là đột biến hay gặp nhất ở các bệnh nhân mắc hội chứng thận hư kháng corticosteroid, với tỷ lệ từ 10- 30% [22]. Trong nghiên cứu của Sadowski và cộng sự, ông nhận thấy rằng có tới 29,5% các gia đình có hội chứng thận hư kháng corticosteroid có mang đột biến đơn gen và 1/3 trong số đó nằm trên gen NPHS2 [47]. Năm 2017, trong nghiên cứu của Joshi trên các bệnh nhi Ấn Độ mắc HCTHTP kháng corticosteroid , tỷ lệ đột biến gen NPHS2 lên đến 35,3 % [31]. Các nhà khoa học đã xác định được 126 đột biến trên gen NPHS2, trong đó có 53 đột biến sai nghĩa, 17 đột biến vô nghĩa, 11 đột biến thêm đoạn, 26 đột biến mất đoạn, 16 đột biến ở vị trí cắt nối, 2 đột biến mất và 1 đột biến ở mã kết thúc [19].

Phần lớn các đột biến nằm tập trung từ exon 1 đến exon 6, được chứng minh là có liên quan chặt chẽ đến HCTHTP, các đột biến khác trên exon 7 và 8 chưa thấy mối liên quan thật sự rõ ràng [50].

Copyright @ School of Medicine and Pharmacy, VNU

13

Hình 1.4. Một số đột biến trên gen NPHS2 [53].

Cấu trúc hai chiều của protein podocin. Vùng tương đồng với stomatin được mô tả bằng màu đen. Các đột biến chưa xác định được in nghiêng, các đột

biến vô nghĩa được gạch chân.

1.2.2 Đa hình đơn rs3738423 của gen NPHS2

Đa hình đơn rs3738423 (tên khác là S96S hay 288C>T) là sự thay thế nucleotide C thành nucleotide T tại vị trí 16170 trên exon 2 của gen NPHS2. Chính sự thay thế này đã tạo nên đa hình rs3738423 có 3 kiểu gen: kiểu gen đồng hợp kiểu dại (CC), kiểu gen dị hợp tử (CT) và kiểu gen đồng hợp tử đột biến (TT). Đa hình này lần đầu được phát hiện bởi Mei- Chen Wu và cộng sự vào năm 2001.

Nghiên cứu của ông cho thấy tần số alen C và T của đa hình này trên quần thể người Đài Loan khỏe mạnh là 0,94 và 0,06. Tần số kiểu gen CC: CT: TT lần lượt là 0,88: 0,12: 0,0. Sự phân số này tuân theo định luật Hardy Weinberg [57]. Đa hình rs3738423 cũng có tần số tương tự ở những bệnh nhi ở châu Âu [34].

Trong một nghiên cứu khác trên 44 bệnh nhân mắc HCTH đã được chẩn đoán mô bệnh học thể FSGS của Caridi năm 2001 tại Italia thì tần số alen đột biến T là 0,06 ở vị trí SNP 288C>T [22].

Copyright @ School of Medicine and Pharmacy, VNU

14

Năm 2005, Zihua Yu đã nghiên cứu trên 23 trẻ HCTH kháng thuốc và phát hiện 1 trẻ kiểu gen đồng hợp TT và 1 trẻ kiểu gen dị hợp CT ở SNP rs3738423.

Ông không thấy có sự khác biệt về kiểu gen và tần số alen giữa 23 trẻ này và 53 trẻ đối chứng khác [58].

Năm 2009, nghiên cứu của Spyridon Megremis trên 22 trẻ mắc HCTH kháng thuốc ở Hy Lạp thấy rằng tỷ lệ alen đột biến T của SNP rs3738423 là 2,2%.

Trong khi đó, tỷ lệ này ở nhóm chứng 100 bệnh nhân là 1% [39].

Cũng cùng năm 2009, Li Zhu nghiên cứu trên 214 trẻ mắc HCTH vùng phía Bắc Trung Quốc có chẩn đoán đoán mô bệnh học là MCD thấy rằng có 35 trường hợp dị hợp tử CT và 5 trường hợp đồng hợp tử TT ở SNP rs3738423. Ông chỉ ra rằng rs3738423 không ảnh hưởng đến mô bệnh học MCD và không liên quan đến protein niệu quả bệnh nhân [59].

Năm 2012, trên 97 bệnh nhi HCTH, Jun Li thấy có 7 trường hợp dị hợp tử CT và 1 trường hợp dị hợp tử TT ở SNP rs3738423. Jun Li và các cộng sự thấy rằng rs3738423 dường như có tác dụng bảo vệ những bệnh nhân gốc Trung Quốc, nhưng tác dụng này không thấy có ở nhóm bệnh nhân gốc Malaysia [32].

Năm 2015, nghiên cứu của Dedi Rachmadi trên 59 bệnh nhi HCTH ở Indonesia thì có 4 trường hợp có kiểu gen dị hợp tử CT ở SNP rs3738423. Đa hình này không liên quan đến lâm sàng hay tình trạng kháng thuốc của bệnh nhân HCTH [44].

Copyright @ School of Medicine and Pharmacy, VNU

15

Một phần của tài liệu Xác định mối liên quan giữa đa hình đơn RS3738423 của gen NPHS2 với chỉ số protein creatinin niệu ở bệnh nhân mắc hội chứng thận hư tiên phát tại bệnh viện nhi trung ương (Trang 20 - 24)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(65 trang)