Kết quả PCR phát hiện gen Ty-3 kháng virus xoăn vàng lá và gen chắn chậm rin

Một phần của tài liệu đánh giá, tuyển chọn một số giống cà chua có khả năng chín chậm và kháng virus xoăn vàng lá (Trang 66 - 89)

4.2.1. Kết quả PCR phát hiện gen Ty-3 kháng virus xoăn vàng lá

Việc phát hiện các mẫu giống mang gen kháng bệnh xoăn vàng lá có ý nghĩa rất quan trọng ựối với việc tạo giống cà chua kháng virus xoăn vàng lá. Trong nghiên cứu này, chúng tôi ựã tiến hành kiểm tra khả năng chứa gen kháng virus xoăn vàng lá Ty-3 trong tập ựoàn mẫu giống cà chua bằng cặp mồi P6-25F2/R5.

Cặp mồi P6-25F2/R5, ựược thiết kế dựa trên RFLP marker FER, là cặp mồi ựặc hiệu ựể phát hiện gen Ty-3. Theo Ji và cộng sự (2007e), sản phẩm PCR với cặp

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ

59

mồi P6-25-F2/R5 là một ựoạn 450 bp ở các dòng giống kháng mang gen Ty-3 bắt nguồn từ LA2779, một ựoạn 630bp ở các dòng giống kháng bắt nguồn từ LA1932, một ựoạn 660 bp ở các dòng giống kháng bắt nguồn từ LA1969 và một ựoạn 320 bp ở các dòng giống mang alen ty-3 từ S. lycopersicum. Cặp mồi này cũng cho phép phát hiện dễ dàng các cây lai dị hợp tử mang các alen tương ứng.

Hình 4.3. Ảnh ựiện di sản phẩm PCR gen Ty-3 bằng cặp mồi P6-25F2/R5

Giếng 1: 100 bp DNA lađer; Giếng 2: 157; Giếng 3: 154; Giếng 4: 18; Giếng 5: 28; Giếng 6: 41; Giếng 7: 71; Giếng 8: 73; Giếng 9: 79; Giếng 10: 80; Giếng 11: 82; Giếng 12: 110; Giếng 13: 111; Giếng 14: ựối chứng âm (nước cất).

Kết quả tiến hành phản ứng PCR với cặp mồi P6-25F2/R5 (hình 4.3) cho thấy chỉ có 2 mẫu giống có vạch khuếch ựại với kắch thước 450 bp là 157 và 754. Tất cả các mẫu giống còn lại ựều chỉ có một vạch với kắch thước 320 bp. đối chứng âm không có vạch khuếch ựại, chứng tỏ phản ứng PCR không bị ảnh hưởng của thành phần và nồng ựộ các hoá chất tham giạ Kết quả này cho thấy kắch thước các vạch băng ựược khuếch ựại bởi cặp mồi P6-25F2/R5 là ựúng như báo cáo của Ji và cộng sự (2007c).

Từ kết quả này có thể ựưa ra nhận ựịnh rằng trong số 51 mẫu giống cà chua nghiên cứu ựã phát hiện ựược 2 mẫu giống mang gen Ty-3 là 154 và 157. Các mẫu giống còn lại ựều không phát hiện thấy gen Ty-3. So sánh kết quả phát hiện gen kháng Ty-3 với kết quả ựiều tra tình hình nhiễm bệnh xoăn vàng lá trên ựồng ruộng cho thấy cả 154 và 157 ựều kháng tốt trên ựồng ruộng với chỉ số bệnh là 0.

4.2.2. Kết quả phát hiện gen chắn chậm rin

500 400 300

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ

60

Kết quả phát hiện gen chắn chậm rin bằng kỹ thuật PCR sử dụng cặp mồi C43F/R (Vrebalov và cộng sự, 2002) cho thấy chỉ có 3 mẫu giống có vạch băng ựược khuếch ựại với kắch thước 1500 bp là 59, 76 và 111, ựối chứng âm và các giếng khác không có vạch khuếch ựạị Kết quả này cho thấy kắch thước các vạch băng ựược khuếch ựại là ựúng như báo cáo của Vrebalov và cộng sự (2002).

Như vậy, nghiên cứu ựã phát hiện ựược 3 mẫu giống mang gen rin là 59, 76 và 111 bằng phản ứng PCR. Các mẫu giống này tiếp tục ựược ựánh giá kiểu hình chắn chậm của quả ựể có hướng sử dụng hợp lý ựối với từng giống.

Hình 4.4. Ảnh ựiện di sản phẩm PCR sử dụng cặp mồi C43F/R phát hiện gen rin

Giếng 1: 250 bp DNA lađer; Giếng 2: 59; Giếng 3: 76; Giếng 4: 111; Giếng 5: 28; Giếng 6: 117; Giếng 7: 71; Giếng 8: 73; Giếng 9: 79; Giếng 10: nước cất

4.3. đánh giá ựặc tắnh chắn chậm của quả

Trong nghiên cứu này, các mẫu giống 59, 76 và 111 mang gen chắn chậm rin

ựã ựược ựánh giá ựặc tắnh chắn chậm của quả và so sánh với ựặc tắnh chắn chậm của 3 mẫu giống không mang gen chắn chậm là 80, 125 và 141. đặc tắnh chắn chậm ựược ựánh giá trong ựiều kiện ựể chắn tự nhiên trên cây và trong ựiều kiện thu hoạch khi quả ựạt kắch thước tối ựa, ựặt trong nhà và ựể quả chắn.

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ

61

Bảng 4.7. đánh giá ựặc tắnh chắn chậm quả các giống cà chua mang gen rin

Trên cây Trong nhà

Nhóm MG Thời gian từ quả ựạt

kắch thước tối ựa ựến quả chắn (ngày)

Thời gian tồn trữ quả (ngày)

Thời gian từ quả ựạt kắch thước tối ựa ựến

quả chắn (ngày) Thời gian tồn trữ quả (ngày) 59 15.4 35.4 14.6 35.4 76 17.3 32.2 16.3 31.7 Mang gen rin 111 12.8 28.6 11.8 28.3 80 8.2 13.2 7.6 13.2 125 7.1 17.4 6.3 16.2 Không mang gen rin 141 6.6 16.6 6.2 15.4

Kết quả ựánh giá ựặc tắnh chắn chậm quả trình bày trong bảng 4.7 cho thấy các mẫu giống mang gen chắn chậm rin ựều thể hiện thời gan từ khi quả ựạt kắch thước tối ựa ựến khi chắn và thời gian tồn trữ quả dài hơn các mẫu giống không mang gen rin. Thời gian từ khi quả ựạt kắch thước tối ựa ựến khi quả chắn trong ựiều kiện ựể chắn tự nhiên trên cây dao ựộng từ 12.8 ựến 17.3 ngày, dài nhất ở mẫu giống 76, sau ựó là 59 và 111. Các mẫu giống không mang gen rin thì thời gian này ngắn hơn, dao ựộng từ 6.6 ựến 8.2 ngày, dài nhất là mẫu giống 80, tiếp theo là 125 và 141. Ở ựiều kiện thu hái, bảo quản trong nhà thì thời gian này ở cả các mẫu giống mang gen rin và không mang gen rin ựều ngắn hơn so với ựiều kiện ựể chắn tự nhiên trên cây một chút, dao ựộng từ 11.8 ựên 16.3 ngày, dài nhất là 76, tiếp ựến là 59 và 111. Thời gian tồn trữ quả trong ựiều kiện ựể chắn tự nhiên trên cây ở nhóm mang gen rin dao ựộng từ 28.6 ựến 35.4 ngày, dài nhất là ở mẫu giống 59, sau ựó là 76 và 111. Ở nhóm không mang gen rin thì thời gian này ngắn hơn nhiều, dao ựộng từ 13.2 ựến 17.4 ngày, dài nhất là 125, tiếp ựó là 141 và 80. Thời gian tồn trữ quả ở ựiều kiện thu hái bảo quản trong phòng ở cả hai nhóm nhìn chung ngắn hơn so với ựiều kiện ựể chắn tự nhiên trên cây một chút, nhóm mang gen rin dao ựộng từ 28.3 ựến 35.4 ngày, dài nhất là 59, sau ựó là 76 và 111; nhóm không mang gen rin dao ựộng từ 13.2 ựến 15.4 ngày, dài nhất là 125, tiếp ựến là 141 và 80. (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ

62

4.4. Khảo sát ựánh giá một số mẫu giống trong vụ xuân hè muộn (2011)

4.4.1. Các giai ựoạn sinh trưởng

Bảng 4.8. Thời gian các giai ựoạn sinh trưởng vụ xuân hè muộn 2011

Kết quả theo dõi các giai ựoạn sinh trưởng trình bày trong bảng 4.8 cho thấy:

Thời gian từ trồng ựến ra hoa: dao ựộng trong khoảng 21-28 ngày, trong ựó có mẫu giống 106 là ngắn nhất (21 ngày), mẫu giống có thời gian ra hoa dài nhất là 75, 111, 157 (28 ngày), ựối chứng H7 có thời gian ra hoa trung bình (25 ngày).

Thời gian từ trồng ựến thu quả ựợt 1: thời gian từ trồng ựến thu quả ựợt 1 của các mẫu giống trong vụ xuân hè muộn dao ựộng trong khoảng 50-66 ngàỵ Mẫu giống có thời gian từ trồng ựến thu quả ựợt 1 sớm nhất là 146 (50 ngày sau trồng), thấp hơn ựối chứng H7 là 13 ngàỵ Mẫu giống có thời gian từ trồng ựến thu quả ựợt 1 dài nhất là 131, 18, 76, 75 (66 ngày sau trồng), dài hơn ựối chứng H7 là 3 ngàỵ

Thời gian từ trồng ựến kết thúc thu hoạch: Nghiên cứu cho thấy trong vụ xuân hè muộn mẫu giống 125 có thời gian kết thúc thu hoạch sớm nhất (90 ngày), một số mẫu giống

Thời gian từ trồng ựến (ngày)

TT MG

Ra hoa Thu quả ựợt 1 Kết thúc thu hoạch

1 18 24 66 100 2 59 22 57 99 3 75 28 66 100 4 76 24 66 102 5 79 27 65 100 6 80 22 62 101 7 84 24 65 105 8 101 25 62 110 9 102 22 64 97 10 106 21 64 95 11 107 26 62 105 12 111 28 65 106 13 117 23 64 105 14 125 27 62 90 15 141 24 59 110 16 146 22 50 105 17 154 26 60 92 18 157 28 61 94 19 đC 25 63 94

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ

63

có thời gian kết thúc thu hoạch tương ựối sớm như 154 (92 ngày), 157, 131 và ựối chứng H7 (94 ngày). Các mẫu giống kết thúc thu hoạch muộn nhất khoảng 110 ngày sau trồng như 101, 141.

4.4.2. Một số ựặc ựiểm hình thái và cấu trúc cây

Kết quả nghiên cứu trình bà y trong bảng 4.9 cho thấy:

Chiều cao từ gốc tới chùm hoa thứ nhất của các mẫu giống dao ựộng trong khoảng 15.3 ựến 56.2 cm. Trong ựó mẫu giống có chiều cao từ gốc tới chùm hoa thứ nhất thấp nhất là 84 (15.3 cm), cao nhất là 18 (56.2 cm), ựối chứng H7 có chiều cao từ gốc tới chùm hoa thứ nhất là 28.4 cm.

Số ựốt dưới chùm hoa thứ nhất của các mẫu giống dao ựộng từ 6 ựến 10 ựốt. Các mẫu giống có số ựốt dưới chùm hoa thứ nhất thấp nhất là 75, 80, 117, 131 (6 ựốt). Số ựốt dưới chùm hoa thứ nhất cao nhất ở các mẫu giống 84, 125, 138,146, 111 (9-10 ựốt), ựối chứng H7 có 8.9 ựốt.

Chiều cao thân chắnh của các mẫu giống nhìn chung thấp hơn so với vụ ựông xuân, dao ựộng trong khoảng 80 ựến 190 cm. Trong ựó mẫu giống có chiều cao cây thấp nhất là 59 (80 cm), cao nhất là 107 (190 cm), ựối chứng H7 có chiều cao cây là 73.2 cm.

Bảng 4.9. Một số ựặc ựiểm hình thái và cấu trúc cây vụ xuân hè muộn 2011

STT MG Chiều cao từ gốc tới chùm

hoa thứ nhất (cm)

Số ựốt dưới chùm hoa thứ nhất (cm)

Chiều cao thân chắnh (cm) 1 18 56.2 7 180.0 2 59 34.8 7 80.0 3 75 40.5 6 150.0 4 76 42.6 7 120.0 5 79 48.3 7 135.0 6 80 24.1 6 150.0 7 84 15.3 9 85.0 8 101 25.6 8 140.0 9 102 20.8 8 130.0 10 106 18.7 8 90.5 11 107 44.8 7 190.0 12 111 50.6 10 170.0 13 117 29.8 6 145.0 14 125 25.3 9 85.0 15 141 40.3 7 130.0 16 146 29.7 9 130.0 17 154 26.1 7 89.0 18 157 27.3 8 91.0

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ

64

19 đC 28.4 8.2 73.2

4.4.3. Cấu trúc chùm hoa và ựặc ựiểm nở hoa (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});

Kết quả theo dõi trình bày trong bảng 4.10 cho thấy:

Về ựặc ựiểm nở hoa: không thay ựổi so với vụ ựông xuân, có 12 mẫu giống nở hoa rải rác, HT7 và 9 mẫu giống còn lại nở hoa tập trung.

Kiểu chùm hoa: không có sự thay ựổi so với vụ ựông xuân, chủ yếu là ựơn giản chỉ có duy nhất mẫu giống 80 có kiểu chùm hoa trung gian, ựối chứng H7 cũng có kiểu chùm hoa ựơn giản.

Số hoa/chùm: dao ựộng trong khoảng 3.1 ựến 14.9, trong ựó mẫu giống có số hoa/chùm thấp nhất là 75 (3.1 hoa/ chùm), mẫu giống có số hoa/ chùm cao nhất là 141 (14.9 hoa/ chùm), ựối chứng H7 có 6.5 hoa/ chùm.

Bảng 4.10. Cấu trúc chùm hoa và ựặc ựiểm hoa và nở hoa vụ xuân hè muộn 2011

Chú thắch: như bảng 4.3

4.4.4. đánh giá tình hình nhiễm một số sâu bệnh hại chắnh

TT MG Kiểu chùm hoa đặc ựiểm nở hoa Số hoa/chùm

1 18 đG RR 7.1 2 59 đG TT 6.1 3 75 đG RR 3.1 4 76 đG RR 5.8 5 79 đG RR 7.2 6 80 TG RR 7.9 7 84 đG RR 6.8 8 101 đG RR 5.6 9 102 đG TT 7.8 10 106 đG TT 4.9 11 107 đG RR 4.2 12 111 đG RR 4.3 13 117 đG RR 4.2 14 125 đG TT 7.4 15 141 đG RR 14.9 16 146 đG RR 13.8 17 154 đG TT 6.8 18 157 đG TT 7.1 19 đC đG TT 6.5 Chú thắch: như bảng 4.2

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ

65

Trong vụ xuân hè muộn, do nhiệt ựộ từ giai ựoạn trồng cây con ra ruộng khá cao nên không thấy bệnh mốc sương xuất hiện gây hạị Bệnh héo xanh cũng ắt xuất hiện, gây hại không ựáng kể do cà chua ựược trồng trên ựất trồng lúạ Chỉ có bệnh virus xoăn vàng lá gây hại nặng. Do trong vụ xuân hè muộn nhiệt ựộ cao nên thời gian sinh trưởng của các mẫu giống ựược rút ngắn, do ựó tình hình nhiễm virus ựược ựánh giá lần ựầu sau trồng 40 ngày, lần hai sau trồng 50 ngày và lần cuối vào giai ựoạn sau trồng 60 ngàỵ Kết quả ựánh giá tình hình nhiễm virus xoăn vàng lá trên ựồng ruộng theo chỉ số DSI ựược quy ra chỉ số bệnh và ựược trình bày trong bảng 4.11.

Bảng 4.11. Tình hình nhiễm virus xoăn vàng lá trên ựồng ruộng vụ xuân hè muộn 2011

Chỉ số bệnh sau trồng

STT MG

40 ngày 50 ngày 60 ngày

1 18 0.08 0.13 0.25 2 59 0.11 0.21 0.26 3 75 0.10 0.16 0.24 4 76 0.09 0.15 0.35 5 79 0.03 0.13 0.19 6 80 0.09 0.11 0.16 7 84 0.06 0.11 0.26 8 101 0.11 0.24 0.31 9 102 0.05 0.18 0.21 10 106 0.11 0.15 0.26 11 107 0.06 0.14 0.21 12 111 0.16 0.25 0.25 13 117 0.08 0.14 0.20 14 125 0.00 0.05 0.08 15 141 0.09 0.11 0.16 16 146 0.09 0.18 0.24 17 154 0.00 0.00 0.00 18 157 0.00 0.00 0.00 19 đC 0.04 0.09 0.18

Kết quả trình bày trong bảng 4.11 cho thấy:

Giai ựoạn sau trồng 40 ngày: các mẫu giống 125, 154, 157 chưa có cây biểu hiện triệu trứng. Các mẫu giống còn lại ựều biểu hiện triệu chứng nhiễm virus với chỉ số bệnh từ 0.03 ựến 0.16, cao nhất ở mẫu giống 111 (0.16) và 1066 (0.11).

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ

66

Giai ựoạn sau trồng 50 ngày: các mẫu giống 154, 157 vẫn chưa có cây nhiễm virus, mẫu giống 125 có 2 cây nhiễm virus với chỉ số DSI là 2, qui ra chỉ số bệnh là 0.05. Chỉ số bệnh ở các mẫu giống còn lại tăng mạng so với giai ựoạn 40 ngày sau trồng, dao ựộng từ 0.09 ựến 0.25, cao nhất ở các mẫu giống 111 (0.25) và 101 (0.24).

Giai ựoạn sau trồng 60 ngày: chỉ số bệnh ở mẫu giống 125 tăng lên là 0.08, mẫu giống 154 và 157 không biểu hiện triệu trứng. Chỉ số bệnh ở các mẫu giống còn lại tiếp tục tăng, dao ựộng từ 0.16 ựến 0.35, cao nhất ở mẫu giống 76 (0.35) và 101 (0.31).

Như vậy, kết quả này cho thấy mẫu giống 125 nhiễm virus rất nhẹ, 154 và 157 không biểu hiện triệu chứng nhiễm virus. Các mẫu giống còn lại ựều có cây nhiễm virus, tỷ lệ nhiễm virus nhìn chung cao hơn nhiều so với vụ ựông xuân.

4.4.5. Năng suất và các yếu tố cấu thành năng suất

Kết quả nghiên cứu bảng 4.12 cho thấy:

Tỷ lệ ựậu quả dao ựộng từ 27.7 ựến 78.7 %, trong ựó thấp nhất là 76 (27.7 %), cao nhất là 59 (78.7 %), ựối chứng H7 là 74.7 %. Nhìn chung tỷ lệ ựậu quả vụ xuân hè muộn thấp hơn nhiều so với vụ ựông xuân do nhiệt ựộ cao ảnh hưởng rất lớn ựến quá trình thụ phấn, thụ tinh.

Số chùm quả/ cây dao ựộng từ 3.0 ựến 23.7 chùm, trong ựó mẫu giống có số chùm nhiều nhất là 125 (23.7 chùm), ắt nhất là 79 (3.0 chùm), ựối chứng H7 là 7.8 chùm.

Số quả trung bình/ cây dao ựộng trong khoảng 8.5 ựến 149.7 quả/ cây, ắt nhất là 76 (8.5 quả/ cây), nhiều nhất là 146 (149.7 quả/ cây), ựối chứng H7 là 37.9 quả/ câỵ Tổng số quả trung bình/ cây bao gồm số quả lớn và số quả nhỏ / câỵ Số quả lớn dao ựộng từ 7.2 ựến 132.2 quả/ cây, nhiều nhất là 146, ắt nhất là 107, ựối chứng H7 có 29.3 quả/ câỵ Số quả nhỏ dao ựộng trong khoảng 1.2 ựến 17.5 quả/ cây, ắt nhất là 76, nhiều nhất là 146, ựối chứng H7 có số quả nhỏ là 8.6 quả/ câỵ

Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});

Một phần của tài liệu đánh giá, tuyển chọn một số giống cà chua có khả năng chín chậm và kháng virus xoăn vàng lá (Trang 66 - 89)