Việc triển khai chính sách thanh tra ngành Nội vụ từ Trung ương đến địa phương là nhiệm vụ quan trọng và thường xuyên của các cơ quan quản lý Nhà nước về lĩnh vực nội vụ. Sự lãnh đạo, chỉ đạo, điều hành phân cơng của đơn vị chủ trì thực hiện chính sách thanh tra ngành Nội vụ ở Trung ương là Bộ Nội vụ. Đối với Cao Bằng, do Thanh tra Sở Nội vụ tiến hành. Do đó, trong tổ chức và thực hiện thanh tra cần đảm bảo sự phối hợp đồng bộ, nhịp nhàng giữa các cơ quan thực hiện chức năng thanh tra ngành Nội vụ.
Công tác phối hợp giữa cơ quan, đơn vị trong nội bộ ngành Nội vụ trong việc triển khai thực hiện chính sách thanh tra ngành Nội vụ, đó là việc phối hợp giữa cácđơn vị chức năng trong ngành Nội vụ, giữa các đơn vị nội bộ cơ quan tham mưu quản lý nhà nước về thanh tra, giữa Thanh tra ngành nội vụ với cơ quan thực hiện công tác tham mưu quản lý nhà nước về thanh tra hay nói cách khác là cơng tác phối hợp giữa Thanh tra Bộ Nội vụ với Thanh tra Sở Nội vụ. Điều này nhằm đảm bảo hoạt động thanh tra, vừa tuân thủ pháp luật, đồng thời đảm bảo tính chun mơn, chun nghiệp trong thanh tra vì có sự tham gia của cả cơng chức hiện chính sách thanh tra cộng tác viên phối hợp thực hiện chính sách thanh tra. Cơ quan được giao thực hiện chính sách thanh tra rất rõ ràng từ Trung ương đến địa phương Thanh tra Bộ Nội vụ được giao tham mưu cho Bộ Nội vụ, Bộ trưởng Bộ Nội vụ tổ chức thực hiện chính sách thanh tra ngành Nội vụ tại các bộ, ngành các cơ quan tương đương và Ủy ban nhân dân các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương còn Thanh tra Sở Nội vụ tham mưu cho Sở Nội, Giám đốc Sở Nội vụ tổ chức thực hiện chính thanh tra ngành Nội vụ tại các sở, ban ngành, các cơ quan tương đương, Ủy ban nhân dân các huyện. Vì vậy, khơng có sự chồng chéo giữa việc thực hiện chính sách thanh ngành Nội vụ ở địa phương với cơ quan thực hiện chính sách thanh tra ở cơ quan Trung ương.