Theo Thông tư 79/2009/TT- BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành thuế suất khẩu, thuế nhập khẩu. Hàng hoá xuất nhập khẩu trong các trường hợp sau đây được xét miễn thuế:
quốc phòng
- Hàng hoá nhập khẩu là hàng chuyên dùng trực tiếp phục vụ cho nghiên cứu khoa học
- Hàng hoá nhập khẩu là hàng chuyên dùng trực tiếp cho giáo dục, đào tạo và một số loại hàng hoá nhập khẩu khác.
Để được xét miễn thuế, mỗi loại hàng hoá cần có thủ tục hồ sơ nhất định. Trên cơ sở hồ sơ quy định, Tổng cục Hải quan xem xét và ra quyết định miễn thuế đối với từng trường hợp. Cơ quan Hải quan nơi làm thủ tục nhập khẩu căn cứ quyết định miễn thuế của Tổng cục Hải quan, kiểm tra đối chiếu với hồ sơ gốc lô hàng nhập khẩu để thực hiện việc thanh khoản số thuế nhập khẩu được miễn.
Trong thời gian qua, thực hiện Thông tư 79/2009/TT- BTC của Bộ Tài chính, cán bộ Hải quan tại Chi cục đã hướng dẫn các chủ hàng mà có hàng hoá nhập khẩu thuộc dạng xét miễn thuế làm thủ tục, hồ sơ giấy tờ theo đúng quy định của Bộ Tài chính. Đối với những hàng hoá mà chủ hàng đã làm thủ tục, cán bộ Hải quan đã căn cứ vào hồ sơ doanh nghiệp nộp, đối chiếu với các quy định hiện hành để thực hiện việc miễn giảm thuế cụ thể cho từng lô hàng. Công tác quản lý xét miễn giảm thuế được tiến hành nhánh chóng, theo đúng quy trình thủ tục và thời gian mà Thông tư hướng dẫn. Điều này đã làm cho các chủ hàng rất hài lòng, hàng hoá nhập khẩu qua cửa khẩu được nhanh chóng hơn.
Đối với trường hợp đối tượng nộp thuế kê khai không đúng với quy định hiện hành thì các cán bộ tại Chi cục làm thủ tục Hải quan tính lại và thông báo số thuế phải nộp cho đối tượng nộp thuế, đồng thời xử phạt vi phạm về thuế theo quy định hiện hành.
2.2.5. Tình hình công tác thanh tra, kiểm tra thuế xuất nhập khẩu
Công tác thanh tra, kiểm tra thuế là một khâu quan trọng không thể thiếu của quá trình quản lý thu thuế hiện nay, nó có quan hệ chặt chẽ với các khâu khác tạo thành một thể thống nhất của quy trình quản lý thu thuế. Công tác thanh tra, kiểm tra thuế sẽ đảm bảo cho hoạt động của các khâu khác phát huy tác dụng và nâng cao hiệu quả trong quá trình quản lý thu thuế đồng thời khắc phục những lệch lạc, sai sót của đối tượng nộp thuế và cán bộ thuế trong việc thực hiện quyền và nghĩa vụ trước pháp luật và trong công tác quản lý thu thuế. Đối tượng của
thanh tra, kiểm tra thuế không chỉ là đối tượng nộp thuế mà còn cả nội bộ cơ quan Hải quan.
Trong thời gian qua, thực hiện theo sự chỉ đạo của Cục Hải quan Cao Bằng, Chi cục Hải quan Cửa khẩu Bí Hà đã đẩy mạnh và nâng cao công tác tự kiểm tra, thực hiện đầy đủ các nội dung kiến nghị về nghiệp vụ của các đoàn thanh tra cấp trên. Do chấp hành tốt các quy định của chỉ thị cấp trên nên Chi cục đã đạt được các kết quả đáng khích lệ. Chi cục không ngừng phấn đấu trở thành một đơn vị trong sạch, vững mạnh về mọi mặt.
Đối với công tác thanh tra, kiểm tra đối tượng nộp thuế, Chi cục cũng đã thực hiện rất tốt công tác kiểm tra sau thông quan. Công tác kiểm tra sau thông quan là một phương pháp kiểm tra hải quan hiện đại do đó Chi cục đã luôn coi trọng công tác kiểm tra sau thông quan, nghiêm túc triển khai thực hiện Thông tư số 96/2003/TT- BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn về việc thi hành kiểm tra sau thông quan đối với hàng hoá nhập khẩu, các quyết định của Tổng cục Hải quan. Các cán bộ Hải quan tại Chi cục đã căn cứ vào hồ sơ nhập khẩu, chọn những mặt hàng nhạy cảm, có thuế suất cao, lợi nhuận lớn để thực hiện công tác kiểm tra sau thông quan nhờ đó mà đã phát hiện một số sai phạm từ phía chủ hàng cũng như từ các khâu khác.
Theo quy trình quản lý thuế mới thì việc tính thuế và nộp thuế là nghĩa vụ của doanh nghiệp đối với Nhà nước, song các cán bộ tại Chi cục thường xuyên kiểm tra, giám sát công tác này, dựa vào số liệu mà doanh nghiệp báo cáo và số lượng hàng hoá thực tế đã kiểm tra làm căn cứ tính toán xác định lại số thuế mà doanh nghiệp phải nộp. Đó cũng là tiền đề cho công tác miễn thuế, giảm thuế và hoàn thuế sau này.
Bên cạnh những mặt đã làm được, vẫn còn một số nguyên nhân khiến cho công tác kiểm tra chưa phát huy hết hiệu quả như mong muốn:
- Số lượng cán bộ kiểm tra tại Chi cục còn thiếu, trình độ chuyên môn lại hạn chế, chưa đáp ứng được nhu cầu tình hình hiện nay, đặc biệt là đối với công tác kiểm tra sau thông quan là một khâu nghiệp vụ mới và phức tạp.
- Công tác phúc tập hồ sơ tại Chi cục triển khai chưa được hiệu quả, việc phối hợp cung cấp thông tin liên quan tới dấu hiệu vi phạm của doanh nghiệp còn hạn chế. Tình trạng nể nang, sợ mất thành tích trong nội bộ Chi cục dẫn đến
không dám cung cấp dấu hiệu vi phạm của doanh nghiệp cho lực lượng kiểm tra sau thông quan vẫn còn tồn tại.
Để công tác kiểm tra có hiệu quả, chống thất thu thuế cho Nhà nước và thực hiện tốt nhiệm vụ mà cơ quan cấp trên giao cho thì Chi cục phải khắc phục được những hạn chế này.