Việc chuyển gen bằng súng bắn gen có nhiều ưu ựiểm: rút ngắn thời gian chuyển gen, gen ựược chuyển vào tế bào chắnh xác và có khả năng di truyền cho thế hệ sau. Tuy nhiên phương pháp có nhược ựiểm là: trang thiết bị ựắt tiền, trình ựộ kỹ thuật cao nên khó có thể áp dụng rộng rãi.
Trên thực tế phương pháp sử dụng rộng rãi, có hiệu quả ở nhiều nước trong việc chọn tạo giống lúa kháng bệnh bạc lá là lai Backross kết hợp với chọn lọc bằng chỉ thị phân tử DNA. Phương pháp này tiến hành lai giữa các dòng ựẳng gen chứa gen kháng hữu hiệu với các giống lúa ựịa phương có ựặc ựiểm nông sinh học tốt nhưng khả năng kháng bệnh kém, kết hợp với chọn lọc những cây ưu tú chứa gen kháng bằng phương pháp PCR ở quần thể phân ly F2. Nếu
chọn ựược cây có ựặc ựiểm giống với cây bố tốt và chứa gen kháng thì tiếp tục lai hồi giao với những cây có ựặc ựiểm nông sinh học tốt, qua 7 - 8 thế hệ sẽ ựươc giống mới vừa chứa gen kháng bệnh bạc lá, vừa có ựặc ựiểm nông sinh học tốt (Bùi Chắ Bửu và cộng sự, 2002).
Dựa trên các ựoạn trình tự DNA liên kết với gen kháng và sử dụng kỹ thuật PCR, ta có thể xác ựịnh ựược các gen kháng một cách chắnh xác, hiệu quả và rút ngắn ựược thời gian chọn tạo giống. Vắ dụ: gen Xa21 là gen có phổ kháng rộng với các nòi vi khuẩn bạc lá, gen này ựã ựược chuyển thành công vào ỘMinghui 63Ợ là một dòng phục hồi ựược sử dụng rộng rãi trong quy trình sản xuất lúa lai 3 dòng ở Trung Quốc (Mizukami T. và Murayama Y., 1960).
Tại viện nghiên cứu lúa quốc tế IRRI, khoảng 71,6% số cặp lai ựược tiến hành ựể tạo giống lúa kháng bệnh bạc lá (Devadath, 1985). Tại trường đHNN Hà Nội, Phan Hữu Tôn và cộng sự ựã tiến hành lai tạo ựược rất nhiều tổ hợp giữa các dòng giống có chứa gen kháng bệnh bạc lá hữu hiệu với giống lúa có tiềm năng năng suất cao kết hợp với sử dụng chỉ thị phân tử DNA.
PHẦN III: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU