PHẦN IV KÉT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 4.1 Kết quả xác định sự hiện diện của WSSV trong các mẫu tôm
4.2.3Mối liên hệ giữa số vùnglặp lại thuộc ORF94 và ORF
Bảng 4.5: Kết quả PCR-genotyping khuyếch đại vùng lặp lại thuộc ORF94, ORF125 Số ao phân tíchSố vùng lặp lại thuộc ORF94 Số vùng lặp lại thuộc ORF125
PCR-genotyping
CM1 5 vùng lặp lại 6 vùng lặp lại.
CM2 6 vùng lặp lại 3 mẫu có 6 vùng lặp lại.
1 mẫu có 6 và 5 vùng lặp lại. 1 mẫu có 6 và 8 vùng lặp lại
CM3 5 vùng lặp lại 3 mẫu có 6 vùng lặp lại. 1 mẫu có 5 vùng lặp lại. 1 mẫu có 5 và 6 vùng lặp lại CM4 3 mẫu có 5 vùng lặp lại. 2 mẫu có 5 vùng lặp lại.
1 mẫu có 10 vùng lặp lại. 3 mẫu có 6 vùng lặp lại. 1 mẫu có cả 5 và 8 vùng lặp
lại.
CM5 4 vùng lặp lại. 6 vùng lặp lại.
CM6 3 mẫu có 7 vùng lặp lại. 4 mẫu có 6 vùng lặp lại. 2 mẫu có 8 vùng lặp lại 1 mẫu có 5 và 6 vùng lặp lại.
CM7 6 vùng lặp lại 5 vùng lặp lại
CM8 4 mẫu có 7 vùng lặp lại. 6 vùng lặp lại 1 mẫu có cả 6 và 7 vùng lặp
lại.
CM9 4 mẫu có 8 vùng lặp lại. 3 mẫu có 8 vùng lặp lại. 1 mẫu có cả 8 và 10 vùng lặp 1 mẫu có 7 và 8 vùng lặp lại.
lại 1 mẫu có 4 và 8 vùng lặp lại
CM10 6 vùng lặp lại 4 vùng lặp lại.
CM11 8 vùng lặp lại 4 vùng lặp lại
CM12 3 mẫu có 8 vùng lặp lại.
1 mẫu có cả 4 và 9 vùng lặp 3 mẫu có 5 vùng lặp lại.
lại. 2 mẫu có 4 và 5 vùng lặp lại.
1 mẫu có 4 và 7 vùng lặp lại.
Trong cùng một ao CM2, CM3 số vùng lặp lại thuộc ORF125 khác nhau (ao CM2 có 5, 6, 8 vùng lặp lại, ao CM3 có 5 và 6 vùng lặp lại) đôi khi có hai vùng lặp lại trong cùng một mẫu. Như vậy là trong cùng một con tôm có thể nhiễm hai dòng WSSV khác nhau (hiện tượng nhiễm kép). Theo Tran Thi Tuyet Hoa et al., (2005)
cho rằng sự cảm nhiễm cùng lúc nhiều kiểu gen (genotype) WSSV trên tôm sú là phổ biến. Trong khi đó số vùng lặp lại của hai ao CM2 và CM3 thuộc ORF94 lại hoàn toàn giống nhau (ao CM2 có 6 vùng lặp lại, CM3 có 5 vùng lặp lại) điều này cho thấy có thể có sự biến đổi số vùng lặp lại thuộc ORF125 mà số vùng lặp lại thuộc ORF94 không thay đổi, hay là trong ao tồn tại hai dòng WSSV mà số vùng lặp lại thuộc ORF125 khác nhau còn số vùng lặp lại thuộc ORF94 thì giống nhau và ngược lại.
Các ao CM2, CM7, CM10 có số vùng lặp lại thuộc ORF94 giống nhau đều có 6 vùng lặp lại nhưng số vùng lặp lại thuộc ORF125 của 3 ao này là khác nhau (ao CM2 có 6 vùng lặp lại, CM7 có 5 vùng lặp lại, CM 10 có 4 vùng lặp lại) và ngược lại ở các ao CM1, CM5, CM8 thì có số vùng lặp lại thuộc ORF125 là giống nhau trong khi đó số vùng lặp lại thuộc ORF94 lại khác nhau cả 3 ao. Kết quả này rất giống với nghiên cứu của Pradeep et al., (2007), đã sử dụng ADN ly trích từ tôm hậu ấu trùng, tôm nuôi có nhiễm WSSV, đồng thời sử dụng cả tôm tự nhiên và cua của Ân Độ. Nghiên cứu tìm hiểu sự thay đổi trên các vùng lặp lại của WSSV đã tìm ra trước đây, bao gồm ORF94, ORF125 và ORF75. Kết quả nghiên cứu cho thấy trong đó các mẫu có cùng số lần lặp lại trên một ORF thì có số lần lặp lại không giống nhau trên một hoặc cả hai ORF khác.