TKT ơn hịa (temperate phage) là TKT mà trong quá trình ký sinh của chúng có diễn ra chu trình tiềm tan. Bộ gen của thực khuẩn thể sẽ tích hợp vào bộ gen của vi khuẩn, tại đó gen của TKT được sao chép bị động khi bộ gen vi khuẩn tái bản, lúc này TKT tương đối vơ hại, thậm chí có thể xem chúng như một plasmid. TKT sẽ không hoạt động cho đến khi môi trường sống của vi khuẩn trở nên xấu đi (thiếu chất dinh dưỡng, nhiều độc chất,…) sau đó, thể tiền phage (prophages) sẽ bắt đầu chu trình phân giải để hình thành TKT mới và giết chết tế bào ký chủ. Ở giai đoạn tiềm tan, vi khuẩn vẫn còn tồn tại và sinh sản, chúng chỉ bị biến đổi các đặc tính di truyền (Hình 2.8) (Kutter & Sulakvelidze, 2004).
Để phân biệt được TKT độc hay ơn hịa, phương pháp giải trình tự bộ genome của TKT được áp dụng, TKT ơn hịa sẽ có sự hiện hiện gen quy định enzyme intergrase giúp TKT chèn nucleic acid của chúng vào bộ sợi nhiễm sắc thể của vi khuẩn (Sabour & Griffiths, 2010).
19
2.3.4 Phân loại thực khuẩn thể
Trong tự nhiên, các TKT đa dạng về virion, bộ gen, cách thức tồn tại,… Ủy ban Quốc tế về phân loại virus (ICTV: International Committee on Taxonomy of Viruses) đã phân loại thực khuẩn thể dựa trên hình thái và acid nucleic. Có tất cả 19 họ được ICTV cơng nhận là có khả năng ký sinh trên vi khuẩn và vi khuẩn cổ. Trong số đó, chỉ có 2 họ có bộ gen là ARN, 5 họ được bao bọc bên ngồi (có vỏ ngồi). Trong số những họ có vật liệu di truyền là ADN thì chỉ có hai họ là sợi đơn; 8 họ có bộ gen là dạng vịng trong khi 9 họ cịn lại là ADN dạng thẳng. Có 9 họ khơng gây bệnh trên vi khuẩn cổ, 9 họ chỉ gây bệnh trên vi khuẩn cổ và riêng họ Tectiviridae là gây bệnh trên cả vi khuẩn và vi khuẩn cổ (Hình 2.9) (Grath & Sinderen, 2007).