Ảnh điện di sản phẩm cắt đoạn 10398 với enzyme DdeI

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) phân tích đột biến gen tARN và ND3 của AND ty thể ở bệnh nhân ung thư đại trực tràng (Trang 51 - 52)

(điện di trên gel polyacrylamide 6%, nhuộm ethidium bromide).

Từ kết quả thu đƣợc trong hình chúng tơi nhận thấy sản phẩm PCR sau khi cắt bằng DdeI trên bản điện di ở giếng số 6 xuất hiện băng kích thƣớc 196 bp. Nhƣ vậy ở giếng này là 10398A. Mặt khác ở các giếng số 2, 4 sản phẩm PCR sau khi cắt xuất hiện các băng 158bp, 50bp, 38bp. Đây là những mẫu mang alen G ở vị trí 10398. Chúng tôi đã tiến hành cắt enzym với 61 cặp mẫu và đã thu đƣợc kết quả trong đó có 28 cặp mẫu mang alen A ở vị trí 10398 và 33 cặp mẫu mang alen G ở vị trí này.

3.2.3. Kết quả giải trình tự đoạn gen mang đột biến A10398G

Sử dụng kỹ thuật RFLP, chúng tôi đã xác định đƣợc đột biến A10398G ở một số cặp mẫu. Để khẳng định kết quả, chúng tôi đã tiến hành tinh sạch sản phẩm PCR. Sản phẩm PCR sau tinh sạch đƣợc lấy ra kiểm tra sự hiện diện của băng Giếng 1: Thang chuẩn ADN 100bp.

Giếng 3, 5: sản phẩm PCR từ mẫu mang alen G ở vị trí 10398.

Giếng 7: sản phẩm PCR từ mẫu mang alen A ở vị trí 10398.

Giếng 2, 4: sản phẩm sau cắt bằng DdeI từ mẫu mang alen G ở vị trí 10398.

Giếng 6: sản phẩm sau cắt bằng DdeI từ mẫu mang alen A ở vị trí 10398.

ng/µl. Lƣợng ADN này đủ sạch và có đủ lƣợng để đem giải trình tự. Sử dụng phần mềm Sequence Scanner để ph ân tích kết quả giải trình tƣ̣ và sƣ̉ du ̣ng chƣơng trình BLAST để so sánh trình t ự thu đƣơ ̣c v ới trình tự ADN chuẩn của ty thể đã đƣợc công bố trên ngân hàng gen NCBI (NC_012920), chúng tôi đã xác định đƣợc đi ểm đột biến trên hệ gen ty thể.

Với đoạn gen 10398, chúng tôi đã gửi đi giải trình tự 4 mẫu (gồm hai mẫu không đột biến và hai mẫu đột biến) (xem phụ lục 2). Kết quả giải trình tự mẫu khơng mang đột biến đƣợc biểu diễn trên hình 12.

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) phân tích đột biến gen tARN và ND3 của AND ty thể ở bệnh nhân ung thư đại trực tràng (Trang 51 - 52)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(86 trang)