Trong hệ thống cơ quan tư pháp, Tòa án là cơ quan duy nhất thực hiện chức năng xét xử, nên việc hoàn thiện các quy định của BLTTDS về phiên tòa phúc thẩm phải gắn với việc đổi mới và hoàn thiện hệ thống Tòa án vì "Tòa án có vai trò trung tâm và xét xử là hoạt động trọng tâm" [9, tr. 3]. Hiện nay, hệ thống Tòa án địa phương đang được tổ chức theo các đơn vị hành chính, lãnh thổ: ở cấp tỉnh có TAND cấp tỉnh; ở cấp huyện có TAND cấp huyện. Mô hình tổ chức Tòa án theo đơn vị hành chính có ưu điểm là tạo điều kiện thuận lợi về điều kiện đi lại, chi phí đi lại cho người dân và việc xác minh, thu thập chứng cứ, nghiên cứu nắm bắt các tập quán của người tiến hành tố tụng trong quá trình giải quyết vụ án. Tuy vậy, lại có sự bất cập, bất hợp lý trong giải quyết công việc của từng Tòa án địa phương. Thực tế cho thấy, các Tòa án ở các thành phố lớn, khu vực đông dân cư hàng năm phải giải quyết một số lượng án lớn, luôn trong tình trạng quá tải. Trong khi đó, một số Tòa án ở các địa phương khác lại có số lượng ít án phải giải quyết dẫn đến tình trạng nơi có nhiều án thì để án quá hạn luật định, nơi có ít án vẫn tồn tại một bộ máy cơ
quan Tòa án để duy trì hoạt động tố tụng, tạo ra sự bất hợp lý. Bên cạnh đó, mô hình này còn ảnh hưởng đến tính độc lập và chỉ tuân theo pháp luật của việc xét xử do phải chịu sự chi phối của các cơ quan hành chính cùng cấp. Nghị quyết số 49/NQ-TƯ của Bộ Chính trị Ban Chấp hành Trung ương Đảng đã đề ra chiến lược cải cách tư pháp đến năm 2020, trong đó nhấn mạnh: "Tổ chức Tòa án theo thẩm quyền xét xử, không phụ thuộc vào đơn vị hành chính, gồm: Tòa sơ thẩm khu vực được tổ chức ở một hoặc một số đơn vị hành chính cấp huyện…" [10, tr. 5]. Việc hoàn thiện BLTTDS về phiên tòa phúc thẩm phải trên cơ sở phù hợp với việc đổi mới, xây dựng, tổ chức lại cơ quan Tòa án theo hướng quy định về thẩm quyền xét xử, cấp xét xử, không phụ thuộc vào đơn vị hành chính.