Trong Quyết định số 125/QĐ-SKH&CN ngày 3/3/2009 của Sở Khoa học và Công nghệ Hà Nội đã quy định vị trí chức năng, nhiệm vụ và quyền hạn của Trung tâm nhƣ sau:
2.2.1. Vị trí và chức năng
Trung tâm CNSH&CNTP trực thuộc Sở Khoa học và Công nghệ Hà Nội là đơn vị sự nghiệp có thu, tự bảo đảm một phần chi phí hoạt động thƣờng xuyên. Trung tâm có tƣ cách pháp nhân, có con dấu và tài khoản riêng để giao dịch, hoạt động theo quy định của pháp luật.
Trung tâm CNSH&CNTP có chức năng nghiên cứu, triển khai ứng dụng và chuyển giao công nghệ về lĩnh vực công nghệ sinh học và công nghệ thực phẩm.
2.2.2. Nhiệm vụ và quyền hạn
- Tổ chức nghiên cứu, tham mƣu với Giám đốc Sở quy hoạch và các chính sách nhằm phát triển công nghệ sinh học, công nghệ thực phẩm của Thành phố;
- Triển khai thực hiện các chƣơng trình, dự án, đề tài nghiên cứu thuộc lĩnh vực công nghệ sinh học, công nghệ thực phẩm phục vụ phát triển kinh tế - xã hội của thành phố Hà Nội;
- Tiếp nhận, hoàn thiện và chuyển giao các kết quả nghiên cứu về khoa học và công nghệ trong lĩnh vực công nghệ sinh học và công nghệ thực phẩm vào thực tiễn sản xuất và đời sống;
- Tổ chức nghiên cứu thiết kế, chế tạo trang thiết bị phục vụ ngành theo lĩnh vực đƣợc phân công;
- Tham gia tƣ vấn, đánh giá, giám định công nghệ và thiết bị, phân tích, kiểm tra chất lƣợng nguyên liệu và sản phẩm phục vụ các hoạt động ứng dụng công nghệ, vệ sinh an toàn thực phẩm, xử lý môi trƣờng trong lĩnh vực công nghệ, vệ sinh an toàn thực phẩm, xử lý môi trƣờng trong lĩnh vực công nghệ sinh học và công nghệ thực phẩm;
- Hợp tác với các tổ chức, cá nhân trong nƣớc và quốc tế phục vụ nghiên cứu khoa học, ứng dụng, chuyển giao công nghệ trong lĩnh vực công nghệ sinh học và công nghệ thực phẩm;
- Tiếp nhận và chuyển giao các công nghệ, các chƣơng trình đầu tƣ viện trợ của nƣớc ngoài về công nghệ sinh học và công nghệ thực phẩm do Sở và Thành phố giao;
- Thực hiện các nhiệm vụ khác theo sự phân công của Giám đốc Sở Khoa học và công nghệ.