Ấn Độ và Indonesia có những mục tiêu chiến lược về an ninh quốc phòng dường như là tương đồng trong khu vực, cả hai đã tiến hành những hợp tác bao gồm chống khủng bố, an ninh ở eo biển Malacca, và về lâu dài xây dựng một trật tự hoà bình ở khu vực.
Hợp tác chống khủng bố
Khả năng Indonesia trở thành một nguồn gây ra bất ổn khu vực - được nhấn mạnh bởi các vụ đánh bom ở Bali và Marriott vào năm 2002 và 2003, điều này đã chứng kiến hai nước xích lại gần nhau trong các vấn đề tình báo. Sau các cuộc tấn cơng, New Delhi trở nên lo ngại về sự gia tăng của các phần tử Hồi giáo ở Indonesia. Sau đó, khi có tin tức cho biết nhiều phần tử Hồi giáo Indonesia đang được huấn luyện ở Pakistan, Ấn Độ đã tăng cường hỗ trợ cho Indonesia. Cả hai hiện làm việc chặt chẽ với nhau về các vấn đề tình báo và vào năm 2011, đã ký một số thỏa thuận nhằm tạo điều kiện thuận lợi cho việc chia sẻ thơng tin.
Eo biển Malacca
Tình hình an ninh ở eo biển Malacca khó khăn hơn. Eo biển, nơi gần phân chia ranh giới Indonesia và Malaysia, là một trong những tuyến đường vận chuyển nhộn nhịp nhất trên thế giới. Nó khơng chỉ chiếm 1/3 thương mại tồn cầu mà cịn đóng vai trị là một liên kết chính giữa Ấn Độ Dương và Thái Bình Dương tạo điều kiện thuận lợi cho việc cung cấp năng lượng từ Trung Đơng đến Đơng Á. Về phần mình, Ấn Độ, với tư cách là cường quốc hải quân thống trị ở Khu vực Ấn Độ Dương, đã tìm cách bảo hộ an ninh ở Eo biển. Điều này không chỉ mang lại uy tín quốc tế cho New Delhi và cho phép New Delhi thể hiện ảnh hưởng của mình trong khu vực, mà cịn cho phép họ đóng một vai trị lớn hơn trong việc giải quyết nạn cướp biển và khủng bố.
Tuy nhiên, tình trạng của eo biển rất phức tạp. Tuyến đường vận chuyển chủ yếu nằm trong vùng biển Indonesia, Malaysia và Singapore. Do đó, về mặt pháp lý, Ấn Độ khơng có quyền thực hiện các cuộc tuần tra vũ trang mà khơng có sự đồng ý của các quốc gia đó. Do không tin tưởng trong khu vực về các tranh chấp lãnh thổ lâu đời, Indonesia và Malaysia từ lâu đã bảo vệ chủ quyền quốc gia của họ và thường từ chối đề nghị hỗ trợ tuần tra Eo biển của các quốc gia khác.
Năm 2004, Indonesia, Malaysia và Singapore đồng ý thực hiện các cuộc tuần tra hải quân phối hợp. Trong khi sáng kiến được hoan nghênh, lực lượng hải quân hạn chế hơn của Indonesia và Malaysia có nghĩa là chương trình đã khơng thành cơng như mong
đợi ban đầu. Trên thực tế, người ta ước tính rằng chỉ một phần tư trong số 120 tàu hải quân lẻ của Indonesia có thể hoạt động cùng một lúc.
Do đó, sự hiện diện nhỏ và hạn chế của Ấn Độ ở Eo biển đã được phép kể từ năm 2006, nói chung là một phần của các cuộc tuần tra chung. Tuy nhiên, thật khơng may cho New Delhi, Indonesia và Malaysia khơng có khả năng ký kết về sự hiện diện lớn của Ấn Độ ở eo biển này trong những thập kỷ tới. Jakarta và Kuala Lumpur không chỉ muốn bảo vệ chủ quyền của mình, họ cịn lưu ý rằng sự hiện diện ngày càng tăng của Ấn Độ ở eo biển này có thể gây phản cảm đối với Trung Quốc, quốc gia phụ thuộc vào đường thủy với gần 80% nguồn cung cấp năng lượng. Do đó, việc hợp tác có thể được xem xét trong từng trường hợp, và hạn chế với sự hỗ trợ hàng hải của Ấn Độ theo yêu cầu của Indonesia và Malaysia.
Xây dựng biên giới khu vực
Với việc Trung Quốc ngày càng tỏ ra quyết đoán, cả ở Ấn Độ Dương và Biển Đông, Ấn Độ và Indonesia đều bày tỏ mong muốn xây dựng một trật tự khu vực hịa bình, mặc dù vì những lý do hơi khác nhau.
Đối với Ấn Độ, những lo ngại về những nỗ lực của Trung Quốc nhằm bao vây Đông Nam Á như một phần của "Chuỗi ngọc trai" được sử dụng để biện minh cho việc xây dựng sự hiện diện hải quân lớn hơn trong khu vực. Hai thập kỷ qua, ảnh hưởng của Trung Quốc ngày càng gia tăng ở Myanmar, việc xây dựng một số cơ sở hải quân quan trọng ở Ấn Độ Dương và quyền kiểm soát hoạt động của Trung Quốc đối với cảng Gwardar ở Pakistan, thường được coi là lý do để tiếp tục chính sách “Hướng Đơng”. Điều này đã chứng tỏ Ấn Độ mở rộng phạm vi chiến lược và chính trị của mình sang Đơng Nam Á, tiến hành ngoại giao hải quân liên tục và quảng bá mình như một nhà cung cấp hịa bình an ninh hàng hải trong khu vực. Khơng có gì ngạc nhiên khi Indonesia đã trở thành một cộng tác viên quan trọng về mặt này, với việc Thủ tướng Singh mô tả Indonesia là 'một trong những đối tác có giá trị nhất của Ấn Độ trong Chính sách Hướng Đơng của chúng tơi', vào tháng 10 năm 2013.
Trong khi đó, Indonesia bớt lo lắng về khả năng có hải quân Trung Quốc tăng cường ở Ấn Độ Dương. Tuy nhiên, Indonesia vẫn hoan nghênh sự hiện diện ngày càng tăng của hải quân Ấn Độ trong khu vực. Đối với Jakarta, một đội quân Ấn Độ hùng hậu là yếu tố quan trọng để cân bằng sự hiện diện của hải quân Trung Quốc và Hoa Kỳ trong khu vực. Điều này được hy vọng sẽ thúc đẩy một trật tự khu vực cân bằng và hịa bình hơn, đặc biệt là khi Ấn Độ đã khẳng định ủng hộ hàng hải và tầm quan trọng của việc tuân thủ luật pháp quốc tế.
Như Bộ trưởng Ngoại giao Indonesia Ali Alatas đã tuyên bố ngay từ năm 1991, "Chúng tôi không thể loại bỏ bốn cường quốc [Mỹ, Trung Quốc, Ấn Độ và Nhật Bản] ra khỏi khu vực. Nhưng phải có sự cân bằng giữa họ và Đơng Nam Á”. Mặc dù các kế hoạch hiện đại hóa hải quân Indonesia đang được tiến hành, nhưng lực lượng này vẫn là một trong những lực lượng được trang bị kém nhất ở Đơng Nam Á. Do đó, Ấn Độ sẽ tiếp tục cung cấp hỗ trợ an ninh hạn chế ở eo biển Malacca và các tuyến đường thủy khác trong khu vực. Hợp tác an ninh hơn nữa giữa hai bên có thể sẽ nâng cao vị thế của Indonesia, giúp nước này đạt được mục tiêu dài hạn là trở thành một cường quốc lớn trong khu vực. Nói chung, Indonesia nghiêng về hợp tác nhiều hơn với Ấn Độ, chủ yếu được thúc đẩy bởi mong muốn xây dựng một trật tự khu vực hịa bình, bổ sung cho các mục tiêu chiến lược của chính Ấn Độ. Do đó, có thể mong đợi sự hợp tác chặt chẽ hơn trong lĩnh vực này.
Xây dựng tuyến phịng thủ
Bất chấp lợi ích an ninh, quan hệ quốc phịng nhìn chung giữa Ấn Độ và Indonesia vẫn ở mức khiêm tốn. Kể từ quan hệ Đối tác Chiến lược năm 2005, sự hợp tác hạn chế, bao gồm các cuộc tuần tra phối hợp, các cuộc diễn tập quân sự quy mô nhỏ và cứu trợ nhân đạo và thảm họa đã là những điểm nổi bật của hoạt động hợp tác quốc phòng.
Đối với việc tuần tra hàng hải, hai nhà nước đã hợp tác trong các vấn đề hàng hải. Brewster nói rằng, 'ngay cả trước Chiến tranh Lạnh, Ấn Độ đã bắt đầu thực hiện các biện pháp xây dựng lòng tin trong an ninh hàng hải, bao gồm tổ chức các cuộc tập trận hải quân chung với Indonesia và các đối tác khu vực khác.' Gần đây, hai nước đã tiến hành
các cuộc tập trận hàng hải quốc tế nhiều nước. Các hoạt động như vậy, bao gồm tuần tra chung ở eo biển Malacca, được tổ chức hàng năm vào tháng 4 và tháng 10. Theo The Hindu, chúng liên quan đến ‘tuần tra các vùng biển chống lại cướp biển, cướp có vũ trang, săn trộm, nhập cư bất hợp pháp, buôn bán ma túy và buôn người.’
Trong một cuộc phỏng vấn gần đây với The Diplomat, sĩ quan chỉ huy tàu ngầm Indonesia, Trung tá Amrin Rosihan, giải thích rằng mục đích của các cuộc tập trận hải quân chung là để ‘giúp phát triển khả năng tương tác và tăng cường mối quan hệ giữa hải quân với hải quân’. Theo thời gian, nhiều khả năng các cuộc tập trận như vậy sẽ gia tăng, đặc biệt là trong bối cảnh các vấn đề an ninh xuyên biên giới trong khu vực.
Bên cạnh đó, Ấn Độ và Indonesia tuyên bố rằng họ sẵn sàng tìm hiểu sự hợp tác trong việc mua bán và hợp tác sản xuất thiết bị quốc phòng, Indonesia đã thể hiện sự quan tâm sâu sắc đến nhập khẩu các mặt hàng như pin cho ngư lôi, động cơ cho lớp Parchim tàu hộ tống, cơ sở sửa chữa cho Kiểu 209 tàu ngầm, v.v. Tuy nhiên việc chuyển giao vũ khí và cơng nghệ quốc phịng vẫn ở mức tối thiểu. Điều này có thể được giải thích bởi hai yếu tố chính. Thứ nhất, Indonesia gần đây có thể đã cơng bố kế hoạch tăng chi tiêu quốc phòng, nhưng ngân sách quốc phòng của nước này vẫn còn khiêm tốn trong điều kiện toàn cầu và các vấn đề trong nước tiếp tục thu hút sự chú ý của Jakarta.
Thứ hai, New Delhi từ lâu đã cảnh giác khi bán hệ thống vũ khí cho các nước khác trong khu vực, bao gồm Indonesia, vì họ lo ngại rằng thơng tin hoặc cơng nghệ có thể được chuyển cho Pakistan hoặc Trung Quốc. Brewster nói: “Do đó, có vẻ như việc hợp tác trong lĩnh vực cung cấp quốc phòng sẽ vẫn còn hạn chế.”