Các công ty Ấn Độ như Wipro, SBI, Bajaj, Royal Enfield và Tata Motors đã sở hữu hồn tồn các cơng ty con tại Indonesia trong lĩnh vực chăm sóc sức khỏe, các cơng ty như Macleods và Nephorplus đã liên kết với các doanh nghiệp Indonesia để mở rộng hoạt động. Dòng đầu tư từ Indonesia sang Ấn Độ trong thời gian từ tháng 4 năm 2000 đến tháng 3 năm 2020 ước tính đạt 638 triệu đơ la Mỹ. Về phía Ấn Độ, đầu tư của quốc gia này vào Indonesia được ước tính là đã đạt 15 tỷ đơ la Mỹ tính tới năm 2020. Theo Ban Điều phối Đầu tư, các khoản đầu tư của Ấn Độ vào Indonesia đạt 82,2 triệu đô la Mỹ trong năm 2018, so với 286,6 triệu đô la Mỹ năm 2017. (Theo Bhardwaj, 2020)
Mặt khác, đầu tư của Indonesia vào Ấn Độ khá thấp và đứng thứ 36 về dòng vốn FDI vào Ấn Độ. Mặc dù ngày càng có nhiều sự tham gia của các nhóm người Indonesia, đặc biệt là ở Tây Bengal, môi trường quản lý nghiêm ngặt ở Ấn Độ được coi là yếu tố cản trở chính đối với các cơng ty Indonesia muốn đầu tư theo cách lớn. Các chuyến bay trực tiếp hạn chế giữa hai quốc gia và các yêu cầu hạn chế về thị thực của Ấn Độ càng chứng tỏ là một trở ngại cho sự tham gia nhiều hơn của Indonesia vào Ấn Độ.
Nhìn chung quan hệ kinh tế giữa Ấn Độ và Indonesia trong thập niên thứ hai của thế kỉ XXI đã đạt được nhiều thành tựu vượt bậc so với các năm trước nhưng vẫn chưa tương xứng với mối quan hệ chính trị tốt đẹp cũng như tiềm năng kinh tế của cả hai bên. Để đẩy mạnh hợp tác tồn diện hai bên cần tích cực tìm ra ngun nhân cản trở mối quan hệ này và đồng thời cũng đề ra những giải pháp cho cả đôi bên.