- Khí hậu Cao Bằng nói chung và Thạch An nói riêng mang tính nhiệt đới gió mùa lục địa núi cao và có đặc trưng riêng so với các tỉnh miền núi khác thuộc vùng Đông Bắc. Khí hậu chia làm hai mùa rõ rệt: mùa mưa và mùa khô.
Mùa mưa: bắt đầu từ tháng 4 và kết thúc vào tháng 9 hàng năm. Lượng mưa trung bình mùa mưa là 200 - 250 mm. Nhiệt độ trung bình mùa mưa là 20oC – 24oC và độ ẩm không khí trung bình là 80% - 90%.
Mùa khô: kéo dài từ tháng 10 năm trước tới tháng 3 năm sau. Các tháng giá rét thường kéo dài từ tháng 12 đến tháng 2. Lượng mưa trung bình mùa
khô là 20 – 40 mm; thấp nhất: 10 - 20 mm. Nhiệt độ trung bình mùa khô 8oC –
15oC và độ ẩm trung bình hàng tháng là 70% - 80%.
- Lượng mưa trung bình hàng năm dao động từ 1.500 mm đến 2.000 mm.
Đức Thông có nhiều suối và khe lạch nhỏ. Nguồn nước phục vụ cho sản xuất và sinh hoạt của nhân dân trong xã được khai thác từ hai nguồn nước mặt và nước ngầm, cụ thể:
+ Nguồn nước mặt: Xã có 43,09 ha đất sông suối và mặt nước chuyên dùng, gồm toàn bộ hệ thống, sông, suối, hồ, ao như: suối Nà Hén, suối Nà Pò,..., ngoài ra còn có các đập thủy lợi, các mỏ nước cấp nước sinh hoạt, sản xuất.
+ Nguồn nước ngầm: Nguồn nước ngầm hiện tại chưa khảo sát đầy đủ, song trong thực tế nhiều khu vực có thể khai thác được nước ngầm, để đưa vào phục vụ cho đời sống của nhân dân trong vùng (giếng đào, giếng khoan).