Khoảng 55% dân cư đang sinh sống trên địa bàn Thủ Đức là công nhân, người lao động nhập cư từ các vùng nông thôn trên cả nước, đời sống thu nhập còn thấp nên ý thức chấp hành pháp luật, nếp sống văn minh đô thị, ý thức kỷ luật lao động chưa cao. Bên cạnh đó do xuất thân từ nhiều địa phương, vùng miền khác nhau nên tính cố kết cộng đồng không cao. Mặt khác bị ảnh hưởng bởi những phong tục, tập quán, lối sống riêng nên việc hòa nhập lối sống của người dân đôi lúc chưa phù hợp, thậm chí nảy sinh mâu thuẫn. Những tác động mặt trái của kinh tế thị trường trong điều kiện đời sống vất chất, tinh thần của một bộ phận nhân dân chưa cao đã ảnh hưởng quá trình xây dựng đời sống văn hóa tinh thần nhân dân, việc bảo tồn, phát huy các giá trị văn hóa truyền thống.
Đô thị hóa nhanh dẫn tới tình trạng dân cư tập trung đông, đặc biệt là khi sáp nhập 3 quận để thành lập thành phố Thủ Đức càng khiến áp lực dân số cao. Tuy cả 3 quận trước đây có nhiều nỗ lực song điều kiện về cơ sở hạ tầng kỹ thuật, các thiết chế văn hóa, kết quả thực hiện phong trào toàn dân đoàn kết xây dựng đời sống văn hóa còn không ít hạn chế, bất cập, chưa đáp ứng kịp thời nhu cầu nâng cao đời sống văn hóa tinh thần của nhân dân. Mặt khác những vấn đề chăm lo an sinh xã hội, thực hiện công bằng, phát huy dân chủ ở cơ sở, huy động sức mạnh trong nhân dân triển khai chưa thật sự đồng đều, còn nhiều điểm bất cập.
Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh và các trường đại học trên địa bàn với kỳ vọng trở thành trung tâm nghiên cứu, đào tạo nguồn nhân lực chất lượng cao song điều kiện vật chất, hạ tầng kỹ thuật theo hướng hiện đại được triển khai khá chậm. Định hướng phát triển trung tâm công nghệ cao, hiện đại, trong khi trình độ dân trí, chất lượng nguồn nhân lực chưa đáp ứng kịp. Quy hoạch kết nối giao thông, hạ tầng viễn thông mới chỉ triển khai bước đầu, chưa đồng bộ, hiện phải điều chỉnh nên chưa phát huy vai trò kết nối vùng. Việc tiếp cận, ứng dụng các thành tựu khoa học công nghệ, đặc biệt là công nghệ thông tin gặp thách thức không nhỏ.
Mục tiêu hợp nhất ba quận thành lập thành phố Thủ Đức nhằm tạo điều kiện phát triển kinh tế xã hội nhanh, bền vững, biến nơi đây trở thành một đô thị sáng tạo, tương tác cao, là động lực phát triển của thành phố Hồ Chí Minh và vùng kinh tế trọng điểm phía Nam. Tuy nhiên năng lực lãnh đạo điều hành của hệ thống chính trị, bộ máy chính quyền, trình độ của đội ngũ cán bộ công chức chưa đảm bảo điều kiện để vận hành, quản lý đô thị với quy mô dân số hơn một triệu người… Thực tế hiện nay, vấn đề hiện hóa nền hành chính đáp ứng yêu cầu quản lý dân cư nói riêng, phát triển kinh tế, văn hóa, xã hội nói chung còn bất cập, hạn chế.
Những vấn đề tồn động của cả 3 quận trước đây trong công tác bồi thường giải phóng mặt bằng, tái định cư thực hiện các dự án, điển hình như khu đô thị Thủ Thiêm, khu Công nghệ cao, Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh… các dự án treo, vẫn chưa được giải quyết triệt để, còn nhiều bức xúc trong một phận dân cư. Tình hình tội phạm trộm cắp, cướp giật, tệ nạn xã hội ma túy, mại dâm, tín dụng đen… tiềm ẩn nhiều yếu tố phức tạp khiến nhân dân chưa an tâm tin tưởng vào chính quyền.
Mặt khác, nhiệm vụ xây dựng hệ thống chính trị, chính quyền gần dân, sát dân trong điều kiện thu hẹp đầu mối tổ chức, tinh giản biên chế của thành phố Thủ Đức cũng cần phải cân nhắc hết sức kỹ lưỡng. Hệ thống chính trị của thành phố
Thủ Đức cần phải nỗ lực rất lớn để thực hiện mục tiêu xây dựng chính quyền của dân, gần dân, sát dân, phát huy dân chủ cơ sở. Quá trình cơ cấu lại tổ chức bộ máy, sắp xếp đội ngũ cán bộ phải hết sức chú ý yếu tố tâm tư tình cảm, quyền lợi vì dễ phát sinh tư tưởng cục bộ, tiêu cực, lợi ích nhóm.
Chất lượng sinh hoạt tại nhiều tổ dân phố chưa cao, còn hình thức, nhân dân chưa tích cực, chủ động phát huy quyền làm chủ, tham gia bàn bạc, quyết định các vấn đề quan trọng ở địa phương. Một số người dân chỉ quan tâm đến quyền lợi bản thân, gia đình mà xem nhẹ lợi ích cộng đồng dân cư. Cá biệt có trường hợp lợi dụng dân chủ để vi phạm pháp luật, nhất là lĩnh vực đất đai, giải phóng mặt bằng, trật tự đô thị… chưa thể hiện được tinh thần trách nhiệm, nghĩa vụ công dân trong việc tham gia góp ý phát triển địa phương, thậm chí chống đối, cản trở thi hành công vụ bị truy tố trước pháp luật.