Quét lại hoặc bắt đầu quy trình quét mớ

Một phần của tài liệu nextseq-550dx-research-mode-instrument-reference-guide-1000000041922-vie (Trang 54 - 55)

1 Chọn Rescan (Quét lại) để quét các mẫu chứa đoạn không quét được. 2 Nếu vẫn không quét được, bạn hãy chấm dứt việc quét.

3 Tháo BeadChip và adapter ra rồi kiểm tra xem BeadChip có dính bụi hay mảnh vụn không. Sử dụng bình xịt bụi khí nén hoặc phương pháp xịt bụi nén khí khác để loại bỏ mảnh vụn. 4 Nạp lại BeadChip rồi bắt đầu quy trình quét mới.

Khi bắt đầu quy trình quét mới, phần mềm sẽ thực hiện các bước sau:

u Quét toàn bộ BeadChip.

u Tạo các tệp đầu ra trong một thư mục đầu ra mới.

u Tăng tổng số lần quét thêm 1 dựa trên số lần quét của lần quét lại gần nhất. Thay thế tệp phiếu kê khai và tệp cụm

1 Truy cập trang hỗ trợ của Illumina(support.illumina.com) dành cho BeadChip bạn đang sử dụng rồi nhấp vào tab Downloads (Tải xuống).

2 Tải xuống các tệp cần thay thế hoặc cập nhật, rồi sao chép các tệp đó vào vị trí mạng mong muốn.

LƯU Ý Đảm bảo bạn chọn các tệp phiếu kê khai và tệp cụm tương thích với hệ thống thiết bị NextSeq 550Dx. Các tệp tương thích có cụm NS550 trong tên tệp.

3 Cập nhật vị trí trên màn hình BeadChip Scan Configuration (Cấu hình quét BeadChip) theo cách sau (nhưng chỉ cập nhật trong trường hợp vị trí đã thay đổi):

a Từ màn hình Home (Chính) của NCS, chọn Manage Instrument (Quản lý thiết bị). b Chọn System Configuration (Cấu hình hệ thống).

c Chọn BeadChip Scan Configuration (Cấu hình quét BeadChip). 4 Chọn Browse (Duyệt) rồi tìm đến vị trí tệp được thay thế hoặc cập nhật. Thư mục công thức và công thức tùy chỉnh

Không sửa đổi công thức gốc. Luôn tạo bản sao công thức gốc với tên mới. Nếu công thức gốc bị sửa đổi, trình cập nhật phần mềm sẽ không thể nhận dạng công thức đó cho những lần cập nhật sau được nữa và các phiên bản mới hơn cũng sẽ không được cài đặt.

Lưu trữ công thức tùy chỉnh trong thư mục công thức phù hợp. Các thư mục công thức được sắp xếp như sau.

Custom

High: Các công thức tùy chỉnh được dùng với bộ kit hiệu suất cao. Mid: Các công thức tùy chỉnh được dùng với bộ kit hiệu suất trung bình. High: Các công thức gốc được dùng với bộ kit hiệu suất cao.

Mid: Các công thức gốc được dùng với bộ kit hiệu suất trung bình. Wash: Chứa công thức rửa thủ công.

Một phần của tài liệu nextseq-550dx-research-mode-instrument-reference-guide-1000000041922-vie (Trang 54 - 55)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(76 trang)