Tệp đầu ra giải trình tự

Một phần của tài liệu nextseq-550dx-research-mode-instrument-reference-guide-1000000041922-vie (Trang 64)

Cấu trúc thư mục đầu ra 62

Tệp đầu ra quét 63

Cấu trúc thư mục đầu ra quét 63

Tệp đầu ra giải trình tự

Loại tệp Mô tả, vị trí và tên tệp Các tệp phát hiện

base

Mỗi ô được phân tích đều được đưa vào một tệp phát hiện base, được tổng hợp thành 1 tệp cho mỗi làn và mỗi chu kỳ. Tệp tổng hợp chứa phát hiện base và điểm chất lượng được mã hóa cho mỗi cụm của làn đó.

Data\Intensities\BaseCalls\L00[X]: Các tệp được lưu trữ trong 1 thư mục cho mỗi làn.

[Chu kỳ].bcl.bgzf, trong đó [Chu kỳ] thể hiện số chu kỳ có 4 chữ số. Các tệp phát hiện base được nén bằng phương thức nén gzip theo khối.

Tệp chỉ thị phát hiện base

Với mỗi làn, tệp chỉ thị nhị phân liệt kê thông tin ô gốc trong một cặp giá trị của từng ô, tức là gồm số ô và số lượng cụm trong ô đó.

Tệp chỉ thị phát hiện base được tạo vào lần đầu tạo tệp phát hiện base cho làn đó.

Data\Intensities\BaseCalls\L00[X]: Các tệp được lưu trữ trong 1 thư mục cho mỗi làn.

s_[Làn].bci

Tệp vị trí cụm Với mỗi ô, tọa độ XY của tất cả các cụm được tổng hợp vào 1 tệp vị trí cụm cho mỗi làn. Tệp vị trí cụm là kết quả của việc tạo mẫu.

Data\Intensities\L00[X]: Các tệp được lưu trữ trong 1 thư mục cho mỗi làn.

s_[làn].locs

Tệp bộ lọc Tệp bộ lọc chỉ định xem một cụm có đi qua bộ lọc hay không. Thông tin bộ lọc được tổng hợp vào 1 tệp bộ lọc cho mỗi làn và đoạn đọc.

Các tệp bộ lọc được tạo ở chu kỳ 26 bằng 25 chu kỳ dữ liệu.

Data\Intensities\BaseCalls\L00[X]: Các tệp được lưu trữ trong 1 thư mục cho mỗi làn.

s_[làn].filter

Tệp InterOp Tệp báo cáo nhị phân. Các tệp InterOp được cập nhật trong suốt lần chạy. Thư mụcInterOp

Tệp cấu hình RTA Được tạo ra khi bắt đầu lần chạy, tệp cấu hình RTA liệt kê chế độ cài đặt của lần chạy.

[Thư mục gốc],RTAConfiguration.xml

Tệp thông tin lần chạy

Liệt kê tên lần chạy, số lượng chu kỳ trong mỗi đoạn đọc, việc đoạn đọc có phải là đoạn đọc

Một phần của tài liệu nextseq-550dx-research-mode-instrument-reference-guide-1000000041922-vie (Trang 64)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(76 trang)