Chức năng kiểm toán nội bộ ở Ngân hàng Trung ương Đức độc lập với Ban điều hành ngân hàng. Theo cơ cấu phi tập trung hoá, việc kiểm toán ở Hội sở Trung ương sẽ có trách nhiệm phối hợp các hoạt động kiểm toán trong toàn Ngân hàng Trung ương Đức.
Vụ kiểm toán nội bộ thực hiện kiểm toán mọi lĩnh vực hoạt động của Ngân hàng Trung ương. Tất cả các hệ thống, hoạt động đều được đánh giá rủi ro trong kế hoạch kiểm toán dài hạn tám năm. Trong đó, các hoạt động có rủi ro cao nhất sẽ được kiểm toán hằng năm; hoạt động có rủi ro trung bình hoặc thấp sẽ thực hiện kiểm toán 2-3 năm một lần. Kiểm toán nội bộ có thể kiểm toán trước (tiền kiểm) và kiểm toán trong quá trình hoạt động diễn ra đối với một số lĩnh vực có rủi ro cao như các dự án xây dựng, dự án về công nghệ thông tin...
Báo cáo của Vụ kiểm toán nội bộ được gửi lên Chủ tịch, các thành viên khác của Hội đồng quản trị Ngân hàng Trung ương và kiểm toán bên ngoài.
- Kiểm soát nội bộ:
Cơ cấu tổ chức của Ngân hàng Trung ương Đức có Vụ Kiểm soát giúp Ban điều hành đảm bảo công tác kiểm soát nội bộ. Vụ kiểm soát được nhận báo cáo của Vụ kiểm toán nội bộ và có sự phối hợp chặt chẽ với nhau.
* Một số kết luận về hiệu quả hoạt động kiểm toán nội bộ Ngân hàng Trung ương Đức:
+ Hiệu quả hoạt động kiểm toán nội bộ Ngân hàng Trung ương Đức được các kiểm toán viên độc lập từ bên ngoài đánh giá trong quá trình thực hiện kiểm toán báo cáo tài chính hằng năm. Do đó, hiệu quả kiểm toán nội bộ luôn được đánh giá khách quan, tạo điều kiện cho kiểm toán nội bộ thấy được mặt mạnh, mặt yếu của mình để có thể phát huy những điểm mạnh và khắc phục những tồn tại, hạn chế nhằm nâng cao hiệu quả hoạt động kiểm toán nội bộ.
+ Tính khách quan, độc lập trong quá trình hoạt động của Vụ Kiểm toán nội bộ được đảm bảo, Kiểm toán nội bộ Ngân hàng Trung ương Đức hoạt động độc lập với Ban điều hành Ngân hàng. Do đó, các kiểm toán viên không bị chi phối, tác động khi đưa ra các tồn tại, sai phạm và kiến nghị các biện pháp xử lý.
+ Vụ Kiểm toán nội bộ thực hiện lập kế hoạch kiểm toán dài hạn 8 năm trên cơ sở đánh giá rủi ro. Do đó, có thể tập trung nguồn lực kiểm toán những lĩnh vực có rủi ro cao trong ngân hàng, vừa có thể nâng cao khả năng phát hiện sai phạm, tồn tại, đảm bảo cho Ngân hàng hoạt động an toàn, hiệu quả, vừa đảm bảo tiết kiệm chi phí dành cho kiểm toán nội bộ.
+ Hoạt động của Vụ kiểm toán nội bộ có sự phối hợp chặt chẽ của Vụ Kiểm soát nội bộ. Trong quá trình thực hiện kiểm toán, Kiểm toán nội bộ có thể khai thác kết quả hoạt động của Kiểm soát nội bộ, Vụ kiểm toán nội bộ đánh giá hiệu quả của hệ thống kiểm soát nội bộ để tiến hành lập kế hoạch kiểm toán, có thể thu hẹp phạm vi hoặc rút ngắn thời gian thực hiện kiểm toán tại các đơn vị. Vì vậy có thể tạo điều kiện để nâng cao hiệu quả hoạt động kiểm toán nội bộ.