Để đảm bảo cho TTCK có thể vận hành một cách bình thường, bên cạnh các chủ thể nêu trên cần có các tổ chức cung cấp các dịch vụ hỗ trợ kinh doanh chứng khoán như: tổ chức lưu ký chứng khoán và thanh toán bù trừ, tổ chức đánh giá hệ số tín nhiệm, tổ chức tài trợ chứng khoán.
- Tổ chức lưu ký chứng khoán và thanh toán bù trừ
Tổng quan về thị trường chứng khoán ở Việt Nam trước năm 2006, các chức năng đăng ký, lưu ký và thanh toán bù trừ chứng khoán do Trung tâm giao dịch chứng khoán TP.HCM (nay là SGDCK TP.HCM) và Hà Nội thực hiện độc lập. Từ năm 2006, theo Quyết định ngày 27/7/2005 của Thủ tướng chính phủ, TTLKCK được thành lập với mục đích thống nhất các hoạt động lưu ký, thanh toán và đăng ký chứng khoán của toàn TTCK vào một đầu mối duy nhất đã đánh dấu một bước phát triển quan trọng trong quá trình hoàn thiện cấu trúc của TTCK Việt Nam.
- Công ty đánh giá hệ số tín nhiệm
Công ty đánh giá hệ số tín nhiệm là tổ chức chuyên thực hiện việc đánh giá về tình hình hiện tại và triển vọng hoạt động của các doanh nghiệp dưới dạng các hệ số tín nhiệm.
Sự ra đời và hoạt động của các tổ chức đánh giá hệ số tín nhiệm là điều kiện đảm bảo cho sự hoạt động hiệu quả của TTCK. Tuy nhiên, tùy theo mức độ phát triển của mỗi thị trường mà cần xác định số lượng và quy mô hoạt động của các tổ chức này một cách thích hợp.
Tổ chức tài trợ chứng khoán là các tổ chức được thành lập với mục đích khuyến khích mở rộng và tăng trưởng TTCK thông qua các hoạt động cho vay bảo lãnh, cho vay để mua cổ phiếu, cho vay chứng khoán cho các giao dịch chênh lệch... Các tổ chức tài trợ chứng khoán ở các nước khác nhau có đặc điểm khác nhau, có nước không có loại hình tổ chức này, nhưng mô hình tổ chức phổ biến nhất là sự kết hợp giữa các CTCK và NHTM trong cung cấp dịch vụ tín dụng chứng khoán.
TTCK tập trung đầu tiên - Trung tâm giao dịch chứng khoán Thành phố Hồ Chí Minh (nay là SGDCK TP.HCM) đã được thành lập và chính thức đi vào hoạt động từ tháng 7/2000. Tiếp đó là Trung tâm giao dịch chứng khoán Hà Nội (nay là SGDCK Hà Nội) được thành lập và vận hành từ tháng 3/2005. Để thu hẹp thị trường tự do, tháng 6/2009, Sở giao dịch chứng khoán Hà Nội đã đưa vào vận hành hệ thống giao dịch UPCoM - tổ chức theo định hướng mô hình thị trường OTC, nhằm tạo ra một thị trường giao dịch cổ phiếu của các công ty đại chúng chưa niêm yết. Qua hơn 13 năm hoạt động, số lượng chủ thể tham gia thị trường, số lượng chứng khoán niêm yết và mức vốn hóa của thị trường không ngừng tăng lên.