Mẫu bệnh phẩm

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu xây dựng quy trình chẩn đoán helicobacter pylori bằng nested PCR từ dịch dạ dày (Trang 35 - 36)

3. Nội dung nghiên cứu gồm

2.1.1. Mẫu bệnh phẩm

- Chủng vi khuẩn H. pylori ký hiệu là H.p1091 do viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương cung cấp. Các chủng được lữu trữ trong điều kiện -80°C tại Phòng thí nghiệm Y sinh - Trường Đại học Khoa học – Đại học Thái Nguyên.

- Tiến hành lấy mẫu bệnh phẩm là dịch dạ dày thu nhận từ 35 bệnh nhân được chỉ định nội soi do nghi có tổn thương viêm hoặc loét dạ dày tá tràng và dịch được đến khám tại một số bệnh viện trên địa bàn tỉnh Thái Nguyên. Tất cả các bệnh nhân đều được biết thông tin và mục tiêu nghiên cứu.

2.1.2. Hóa chất, dụng cụ thiết bị

Hóa chất: Các hoá chất dùng trong tách chiết DNA tổng số, PCR, điện di PCR được cung cấp bởi Qiagen, Sigma, Thermal Scientific.

Primer: Ðược thiết kế để nhân lên đặc hiệu đoạn DNA do công ty Phusachemistry cung cấp.

Dụng cụ thiết bị nghiên cứu gồm:

+ Máy ly tâm (Hettich), tủ lạnh sâu -20°C. + Tủ an toàn sinh học cấp 2 (Thermo Fisher).

+ Tủ an toàn sinh học Esco PCR Cabine (Esco), Máy vortex. + Micropipettes 10µl, 100 µl, 1000 µl, máy PCR (Bio-rad).

Các dụng cụ khác:

- Tube đựng bệnh phẩm 15ml, 50ml. - Đầu côn có lọc 10µl, 100 µl, 1000 µl.

- Giấy thấm, giấy xét nghiệm, sổ lưu kết quả xét nghiệm. - Bút viết kính, bút bi, mũ, khẩu trang.

- Găng không có bột. - Quần áo bảo hộ.

- Dung dịch nước rửa tay, cồn sát trùng tay nhanh, dung dịch khử trùng. - Khăn lau tay.

- Dụng cụ để làm lạnh và giữ ống PCR.

2.2. Địa điểm và thời gian

Nghiên cứu được thực hiện tại Phòng thí nghiệm Y Sinh - Trường Đại học Khoa học - Đại học Thái Nguyên.

Thời gian nghiên cứu: Từ tháng 11/2018 đến tháng 9/2019.

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu xây dựng quy trình chẩn đoán helicobacter pylori bằng nested PCR từ dịch dạ dày (Trang 35 - 36)