Số allele trong một locus bao g m từ 3 allele ở 3 locus Dipt1, Dipt4 vàDipt6; 4 allele ở 3 locus Dipt3, Shc2, Dipt8 và Shc7; và 5 allele ở 2 locus còn lại, Dipt2 và Dipt7. Từ bảng 3.2 chỉ ra sự khác biệt giữa các allele trong mỗi locus tại những quần thể khác nhau.
Ở locus Dipt2 thì ở cả 2 quần thể Mã Đà và Lò Gò Xa Mát allele chiếm tỉ lệ cao đều là allele130 với tỉ lệ ở quần thể Mã Đà là 50% và Lò Gò – Xa Mát là 52% trong khi đó allele chiếm tỉ lệ cao ở quần thể T n Phú lại là
allele114 với tỉ lệ 37%. Nếu ở Dipt2 các allele chiếm tỉ lệ cao khác nhau giữa các allele thì allele chiếm tỉ lệ thấp ở cả 3 quần thể đều là allele142 với tỉ lệ lần lƣợt của các quần thể Mã Đà, Lò Gò – Xa Mát, Tân Phú là 4,8%, 4% và 5,6%; và allele136 với tỉ lệ lần lƣợt của 3 quần thể này là 9,5%, 4% và 7,4%. Allele có tần số thấp cũng đƣợc tìm thấy ở allele128 của quần thể Mã Đà là 9,5%.
Locus Dipt7 tần số các allele giữa các quần thể lại có sự khác biệt rõ ràng. Ở quần thể Mã Đà 2 allele chiếm tỉ lệ cao nhất là allele125 và allele127 cùng với tỉ lệ 28,6%; quần thể Lò Gò – Xa Mát allele chiếm tỉ lệ cao là allele125 (48%) nhƣng không có sự xuất hiện của allele150; allele120 chiếm 61.1% là tỉ lệ cao nhất ở quần thể T n Phú. Xuất hiện allele hiếm (<5%) ở 2 quần thể Mã Đà và T n Phú là allele150 với tỉ lệ lần lƣợt là 4,8% và 3,7%. 2 allele có tần số thấp cũng xuất hiện ở allele127 và allele138 tƣơng ứng 7,4% và 5,6%. Locus Dipt7 ở quần thể Lò Gò – Xa Mát chỉ xuất hiện 4 allele.
Allele138 của locus Shc2 là allele xuất hiện nhiều nhất ở 2 quần thể Mã Đà và Lò Gò – Xa Mát với tần xuất lần lƣợt là 54,8% và 44% trong khi đó với tần xuất 44,4% allele129 là allele xuất hiện nhiều nhất ở quần thể T n Phú. Nếu allele xuất hiện nhiều nhất ở Mã Đà và Lò Gò – Xa Mát là giống nhau thì allele xuất hiện tần số thấp nhất lại là allele144 ở 2 quần thể Mã Đà và T n Phú với phần trăm là 7,1% và 7,4%; quần thể Lò Gò – Xa Mát với tần xuất 12% thuộc allele129 ít thấy nhất ở locus Shc2. Tần số thấp cũng tìm thấy ở allele129 của quần thể Mã Đà, với tỉ lệ 9,5%.
Chiếm hơn 50% tổng allele ở locus Dipt8 ở quần thể Mã Đà và Lò Gò – Xa Mát là allele175 với phần trăm là 66,7% và 70%. Trong khi đó chỉ chiếm 48,1% ở allele170 vẫn là allele xuất hiện nhiều nhất ở locus Dipt8 ở quần thể T n Phú. Với tần xuất thấp lần lƣợt là 4,8% và 7,4% đƣợc tìm thấy tƣơng ứng ở allele270 ở quần thể Mã Đà và T n Phú. Tần số thấp cũng tìm thấy ở allele200 thuộc quần thể T n Phú, chiếm 8%. 4/5 allele
đƣợc tìm thấy ở quần thể Lò Gò – Xa Mát, thấp hơn 1 allele ở 2 quần thể còn lại Mã Đà và Tân Phú.
Dipt1 là locus chỉ có 3 allele và allele có tần số lớn nhất đều là allele193 ở cả 3 quần thể, đặc biệt là quần thể Lò Gò – Xa Mát allele này chiếm đến 90% tổng số allele. Allele chiếm tỉ lệ ít nhất ở locus này chỉ giống nhau ở quần thể Mã Đà và Tân Phú; với tỉ lệ 9,5% và 7,4% của allele270; ở quần thể Lò Gò – Xa Mát xuất hiện 2 allele có tần số thấp là allele200 và allele211 ứng với tỉ lệ 2% và 8%.
Dipt4 là locus mà cả 3 quần thể Mã Đà, Lò Gò – Xa Mát và Tân Phú, allele có tần số lớn nhất và nhỏ nhất đều thuộc allele214 (>50%) và allele250 (8%-13%).
Dipt3 g m 4 allele224, allele229, allele240 và allele256. Allele 256 không xuát hiện ở quần thể Lò Gò – Xa Mát; trong đó allele224 là allele có tần số lớn nhất ở cả 3 quần thể, Mã Đà, Lò Gò – Xa Mát và Tân Phú vớiphần trăm lần lƣợt là 59,5%, 86% và 40,7%. Trong khi đó allele240 là allele có tần số nhỏ nhất ở quần thể Mã Đà và Lò Gò – Xa Mát (4,8% và 6%) và allele256 là allele có tần số nhỏ nhất ở trong quần thể T n Phú, chiếm 9,3%.
Shc7 cũng g m 4 allele và 1 allele170 không xuất hiện ở quần thể Lò Gò – Xa Mát. Trong đó quần thể Mã Đà và Lò Gò – Xa Mát tiếp tục có allele tần số lớn nhất giống nhau là allele224 còn ở quần thể T n Phú là allele170. Nếu allele224 là allele có tần số lớn nhất ở Mã Đà và Lò Gò – Xa Mát thì ở quần thể T n Phú đ y là allele có tần số nhỏ nhất chỉ chiếm 5,6%. Ở quần thể Mã Đà và Lò Gò – Xa Mát thì allele có tần số nhỏ nhất tiếp tục giống nhau là allele184 với phần trăm lần lƣợt là 9,5% và 4%.
Dipt6 chỉ có 3 allele, trong đó allele 286 là allele xuất hiện ít nhất ở cả 3 quần thể Mã Đà, Lò Gò – Xa Mát và T n Phú với tần số là 14,3%, 14% và 20,4%. Nhƣng ở allele xuất hiện nhiều nhất lại khác nhau, ở quần thể Mã Đà là allele258 với tần xuất 50%, ở quần thể Lò Gò – Xa Mát và T n Phú là allele264 với tần
xuất lần lƣợt là 44% và 55,6%.
Bảng 3.2. Tần số allele cho mỗi locus của 3 quần thể ở Đông Nam Bộ
Locus Allele Mã Đà Lò Gò-Xa Mát Tân Phú
Dipt2 21 25 27 114 0.262 0.300 0.370 128 0.095 0.100 0.278 130 0.500 0.520 0.222 136 0.095 0.040 0.074 142 0.048 0.040 0.056 Dipt7 21 25 27 120 0.262 0.100 0.611 125 0.286 0.480 0.222 127 0.286 0.240 0.074 138 0.119 0.180 0.056 150 0.048 0.000 0.037 Shc2 21 25 27 124 0.286 0.220 0.370 129 0.095 0.120 0.444 138 0.548 0.440 0.111 144 0.071 0.220 0.074 Dipt8 21 25 27 170 0.167 0.220 0.481 175 0.667 0.700 0.352 200 0.119 0.080 0.074 270 0.048 0.000 0.093 Dipt1 21 25 27 193 0.548 0.900 0.593 200 0.357 0.020 0.333 211 0.095 0.080 0.074 Dipt4 21 25 27 214 0.619 0.540 0.519 230 0.286 0.380 0.352 250 0.095 0.080 0.130 Dipt3 21 25 27 224 0.595 0.860 0.407 229 0.238 0.080 0.389 240 0.048 0.060 0.111 256 0.119 0.000 0.093 Shc7 21 25 27 170 0.190 0.000 0.463 178 0.333 0.380 0.333 184 0.095 0.040 0.148 224 0.381 0.580 0.056 Dipt6 21 25 27 258 0.500 0.420 0.241 264 0.357 0.440 0.556 286 0.143 0.140 0.204