VNĐ/năm cho chi phí riêng cho các thủ tục giấy tờ (gộp chung chi phí với công tác nộp TĐT). Giờ đây, khi áp dụng phương pháp hoàn TĐT, công ty có thể thực hiện nộp hồ sơ hoàn thuế qua trang TTĐT mà không cần đến trực tiếp Chi cục thuế, do vậy tiết kiệm được một số loại chi phí như trên. Quá trình TCT thực hiện tiếp nhận hồ sơ và xử lý hồ sơ được giảm thiểu xuống còn 6 ngày làm việc, vừa nhanh chóng vừa chính xác.
2.3.3. Hạn chế của công tác triển khai thuế theo phương thức điện tử củacông ty công ty
Một là hạn chế trong quy trình triển khai thuế theo phương thức điện tử: Khi đến kỳ nộp thuế cao điểm, do quá nhiều DN tiến hành nộp thuế theo PTĐT rất nên thường xuyên xảy ra tình trạng quá tải trên HT dẫn đến việc nộp TĐT của công ty cũng bị trì trệ. Thường xuyên vấn đề trong giao dịch như lỗi kết nối, nghẽn mạng, gây ra hiện tượng không thể kiểm soát được số tiền thuế đã nộp thành công hay chưa hoặc đang trong trạng thái bị “treo”.
Hai là, hạn chế về trình độ của nhân viên thực hiện công tác triển khai thuế theo phương thức điện tử: Khả năng thành thạo sử dụng phần mềm và thao tác tin học văn phòng khi truy cập mạng của nhân viên kế toán tổng hợp còn bị giới hạn. Việc nhân viên kế toán chưa khai thác được các phần mềm hỗ trợ kê khai do TCT cung cấp cũng được coi là một hạn chế vô cùng lớn trong việc thực hiện công tác triển khai thuế theo phương thức điện tử của công ty. Đây cũng là lý do chính trong việc gây mất thời gian khi thực hiện trách nhiệm nộp thuế của công ty.
Ba là, hạn chế về CSHT và công nghệ đáp ứng: CSHT, CNTT đã được trang bị đầy đủ nhưng chưa đáp ứng được chất lượng tốt về đường truyền thi thoảng còn bị tắc nghẽn cục bộ, HT mạng Internet và máy tính của công ty cũng có thể gặp vấn đề hỏng hóc khi đang thực hiện công tác tác triển khai thuế theo phương thức điện tử.
Bốn là, hạn chế về HT phần mềm sử dụng: Ngoài các phần mềm nội bộ mà công ty sử dụng thì công ty phải thực hiện lập TK và khai thuế cho công ty ở một phần mềm và HT khác. Điều này không thể tránh khỏi những bất tiện trong quá trình đồng bộ dữ liệu giữa các phần mềm nên có thể dẫn đến những sai sót không đáng có gây ảnh hưởng đến tính chính xác của số thuế.
Năm là, hạn chế về chi phí, hàng năm, công ty phải mất thêm 1 khoản chi phí trung bình khoảng 560 triệu VNĐ/năm để chi trả cho chi phí chuyển khoản mỗi khi DN thực hiện các giao dịch với các CQT và ngân hàng. Trong khi đó nếu việc nộp tiền mặt tại ngân hàng thì công ty có thể không mất nhiều chi phí cho việc nộp khoản chi phí đó. Mặc dù không lớn, nhưng nó cũng gây cản trở cho quá trình triển khai thuế theo phương thức điện tử của công ty.
Sáu là, hạn chế từ phía ngân hàng ủy nhiệm chi: Do quá trình chuyển khoản chậm dẫn đến thời gian nộp thuế của DN bị kéo dài và quá hạn, không đúng ngày nộp thuế. Thường xuyên xảy ra các lỗi sai sót trong tiến trình thực hiện việc chuyển khoản khi tiến hành ủy quyền cho ngân hàng nộp thuế hộ như sai thông tin của Công ty, số thuế phải nộp... Bên cạnh đó, công ty còn e ngại trong việc bảo mật các thông tin về thuế và tài chính của công ty.
Bảy là, hạn chế về HĐĐT: Công ty bắt đầu sử dụng HĐĐT từ tháng 7/2020 và công ty thấy rằng HĐĐT ngoài những sự thuận tiện, nhanh gọn và chính xác thì còn tồn tại một số khuyết điểm cần được cải thiện như việc: Xuất hóa đơn sai thông tin, xuất thiếu hóa đơn và chưa thu hồi được 1 số hóa đơn hủy. Việc này cũng làm tăng hoặc giảm số thuế phải nộp, làm cho số thuế phải nộp bị tăng hoặc giảm không chính xác như ban đầu.