4. Ý nghĩa khoa học và thực tiễn
3.3.2. So sánh trình tự amino acid suy diễn của gen GmDREB6 của
DT2008 với trinh tự amino acid suy diễn của EF551166 và NM_001248412 trên GenBank
Hình 3.8 thể hiện trình tự amino acid suy diễn từ gen GmDREB6 phân lập từ giống đậu tương DT2008 và từ gen GmDREB6 mang mã số EF551166 và NM_001248412 trên GenBank.
Hình 3.8. Trình tự amino acid suy diễn của gen GmDREB6 phân lập từ giống đậu tương DT2008 và trình tự gen GmDREB6 mang mã sốEF551166,
NM_001248412 trên GenBank
Hình 3.9 và bảng 3.2 trình bày kết quả so sánh sự sai khác về trình tự amino acid suy diễn của gen GmDREB6 phân lập từ giống đậu tương DT2008 và hai trình tự gen GmDREB6 mang mã số EF551166, NM_001248412.2 trên GenBank.
Hình 3.9. So sánh trình tự amino acid suy diễn của gen GmDREB6 phân lập từ giống đậu tương DT2008 và của trình tự gen DREB6 mang mã số EF551166,
Bảng 3.2. Các vị trí sai khác trong trình tự amino acid suy diễn của gen
GmDREB6 phân lập từ giống đậu tương DT2008 và suy diễn từ trình tự mang mã số EF551166, NM_001248412.2 TT Vị trí amino acid DT2008 EF551166 NM_001248412.2 1 7 F N N 2 18 T S S 3 66 L Q Q 4 107 P G G 5 137 P A A 6 194 K L L 7 212 G A A 8 227 S W W
Hình 3.9 và bảng 3.2 cho thấy, trình tự amino acid suy diễn của gen
GmDREB6 phân lập từ giống đậu tương DT2008 và trình tự amino acid suy diễn từ gen GmDREB6 mang mã số EF551166, NM_001248412.2 trên GenBank có 8 vị trí amino acid sai khác, đó là các vị trí 6, 18, 66, 107, 137, 194, 212, 227.
Sự sai khác về trình tự amino acid trong protein suy diễn của gen
GmDREB6 so với hai gen mang mã số EF551166, NM_001248412.2 trên GenBank có liên quan gì đến mức độ chống chịu stress hạn của cây đậu tương cần tiếp tục xem xét vùng AP2 và các điểm liên kết với sợi DNA. Kết quả so sánh ở hình 3.10 cho thấy, ở vùng AP2 của protein suy diễn từ gen GmDREB6 phân lập từ giống đậu tương DT2008 có 2 vị trí sai khác, đó là amino acid thứ
66 và 107. Hai điểm sai khác về amino acid không thuộc vào những vị trí DNA binding (60, 61, 63, 65, 67, 69, 73, 75, 82, 84, 87).
Hình 3.10. So sánh trình tự amino acid của vùng AP2 trong protein suy diễn từ
gen GmDREB6 của giống đậu tương DT2008 và EF551166, NM_001248412.2
KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ