Tư vấn học đường là một hoạt động phong phú và đa dạng, lại khá mới mẻ trong nhà trường. Vì vậy, khâu kiểm tra và đánh giá phải được tiến hành kịp thời và phù hợp. Việc kiểm tra đánh giá phải dựa trên kế hoạch đã quy định và có tiêu chí, chuẩn mực cụ thể cho từng hoạt động. Kiểm tra việc thực hiện các hoạt động tư vấn thường xuyên theo chuyên đề về chất lượng, số lượng và hiệu quả các cuộc tư vấn trực tiếp, tư vấn gián tiếp theo yêu cầu của học sinh thể hiện qua hồ sơ, minh chứng và sự tiến bộ của học sinh. Cần quan tâm đến đánh giá vai trò tư vấn của học sinh với học sinh các lớp, các chi đoàn, các đội nhóm Xung kích, Tình nguyện, Câu lạc bộ, Nhóm bút…dưới sự chỉ đạo của tổ tư vấn, của giáo viên chủ nhiệm, giáo viên bộ môn và Đoàn thanh niên.
Việc kiểm tra, đánh giá công tác tư vấn không đơn thần chỉ dựa vào số liệu và số lượng mà phải dựa trên nhiều yếu tố như: số lượng và chất lượng các chuyên đề, ngoại khóa, diễn đàn tư vấn dưới hình thức tương tác đám đông; số lượng và chất lượng thông tin mà học sinh cung cấp và nhận được khi cần được tư vấn gián tiếp và trực tiếp; môi trường học tập an toàn, lành mạnh của học sinh do công tác tư vấn góp phần tạo nên; mức độ giảm thiểu những hành vi lệch chuẩn, những hành động bột phát của học sinh hàng ngày, hàng tháng đã được. Kết quả học tập, rèn luyện của học sinh về văn hóa và đạo đức lối sống, môi trường học tập và sự phát triển toàn diện, kỹ năng mềm, sự năng động sáng tạo của học sinh...chính là thước đo đánh giá sự thành công của công tác tư vấn học đường. Trong hoạt động tư vấn, công tác kiểm tra đánh giá kịp thời, khách quan, chính xác là vô cùng quan trọng.