Nguyên nhân tồn tại trên là do:
• Thời tiết, khí hậu trong những năm gần đây diễn biến phức tạp.
• Tích tụ ruộng đất khó khăn nên sản xuất tập trung, quy mô lớn chua nhiều và chưa đồng đều giữa các khu, vùng trong huyện, sản xuất chưa gắn chặt với bảo vệ môi trường.
• Việc liên doanh, liên kết với các công ty, doanh nghiệp, nhà máy chế biến nông sản, thực phẩm còn hạn chế nên nông dân chưa thực sự yên tâm đầu tư mở rộng sản xuất.
• Xu hướng lực lượng lao động trẻ, có trình độ thoát ly nông nghiệp sang làm công nghiệp, dịch vụ, sản xuất nông nghiệp phụ thuộc nhiều và thiên nhiên, môi trường ô nhiễm là nguyên nhân xuất hiện nhiều loại sâu bệnh phát triển hại mùa màng..., do khủng hoảng kinh tế, giá cả biến động, dẫn đến thuốc bảo vệ thực vật, thuốc thú y, thức ăn chăn nuôi tăng cao, giá cả sản phẩm chăn nuôi biến động mạnh, dẫn đến tình trạng giảm sút số lượng đàn gia súc trong chăn nuôi...
• Các công tác dịch vụ nông nghiệp, kinh phí đầu tư cho sản xuất nông nghiệp còn hạn chế.
• Dân số nông thôn vẫn chiếm hơn 90% dân số toàn huyện. Trình độ khoa học công nghệ còn chưa cao, chưa đồng bộ và tinh thần hợp tác của nông dân còn hạn chế. Tốc độ tăng trưởng ngành nông nghiệp chưa đạt quy hoạch ngoài yếu tố diện tích đất nông nghiệp bị thu hẹp, có yếu tố huy động đầu tư cho phát triển nông nghiệp còn thấp, chưa thỏa đáng. Phát triển chăn nuôi tập trung còn hạn chế, trồng trọt chưa xây dựng được nhiều vùng sản xuất hàng hóa có thương hiệu sản phẩm. Công nghiệp còn nhỏ lẻ, quy mô nhỏ. Về văn hóa-xã hội đã đạt được nhiều thành tựu đáng kể song chất lượng dạy nghề chưa đáp ứng yêu cầu cung cấp nhân lực cho doanh nghiệp, chất lượng khám chữa bệnh còn hạn chế. Hệ thống hạ tầng còn yếu, thủy lợi, giao thông nội đồng một số nơi chất lượng chưa cao. Hệ thống hạ tầng phục vụ cho công nghiệp còn chưa được đầu tư nhiều. Đứng trước bối cảnh hội nhập kinh tế thế giới như hiện nay và yêu cầu công nghiệp hóa hiện đại hóa đặt ra cho Ninh Giang thách thức trong việc phát triển công nghiệp nâng cao chất lượng sản phẩm nông nghiệp và phát triển ngành dịch vụ nhằm đáp ứng kịp thời nhu cầu của xã hội.