Mụ hỡnh khoa dược :Mụ hỡnh hoạt động cũn chưa phự hợp do cũn thiếu nhõn lực : Chưa cú tổ dược lõm sàng, thụng tin thuốc. Khoa chưa tổ chức được phũng pha chế tập trung hoỏ trị liệu.
Nhõn lực : nhõn lực khoa Dược qua 10 năm khụng tăng cả về dược sỹ đại học và trung học trong khi lượng bệnh nhõn nội ngoại trỳ tăng . Chưa cú nhõn lực chuyờn về dược lõm sàng và quản lý dược bệnh viện.
Cơ sở vật chất : Cỏc phũng cấp phỏt thuốc cũn chật chội và hệ thống điều hoà cũn chưa đảm bảo cỏc tiờu chuẩn thực hành bảo quản thuốc tốt. Chưa cú bộ phận pha chế dịch truyền phối hợp như hoỏ trị liệu.
Kinh phớ : Do cơ chế chi trả của BHYT theo hỡnh thức khoỏn định xuất trong khi danh mục thuốc, cỏc kỹ thuật mới luụn phỏt triển, khoa Dược luụn gặp nhiều khú khăn trong cung ứng thuốc do thiếu kinh phớ.
Năng lực quản lớ : Cỏc dược sỹ cũn chưa được đào tạo chuyờn về quản lý dược bệnh viện. Cỏc quy trỡnh quản lý chưa được xõy dựng đồng bộ. Khoa đó xõy dựng được một số quy trỡnh kiểm tra, phõn cụng trỏch nhiệm, cần tiếp tục hoàn chỉnh thờm. ( Phụ lục 1, phụ lục 2). Phần mềm quản lý bệnh viện cũn tiếp tục bổ sung cỏc tớnh năng quản lý. Cũn khú khăn trong thực hiện cỏc quy chế quản lớ dược: quy chế quản lớ thuốc gõy nghiện, hướng tõm thần, thuốc quản lớ đặc biệt.
Danh mục thuốc : Việc quản lớ cung ứng một danh mục thuốc lớn trong bệnh viện là một cụng việc nặng nề đũi hỏi khoa dược phải cú cơ sở bảo quản đảm bảo, phần mềm quản lý tồn kho, quản lý mua, cỏc quy trỡnh làm việc chuẩn, cỏc dược sỹ hiểu biết về nhiều lĩnh vực chuyờn mụn. Danh mục thuốc nờn xem xột để rỳt ngắn, loại bỏ những thuốc kộm hiệu quả [58].
Cỏc văn bản quản lý cũn chậm điều chỉnh như cỏc văn bản về hoạt động đấu thầu thuốc, quy trỡnh phờ duyệt kế hoạch đấu thầu chậm, nhiều thủ tục rườm rà, giỏ kế hoạch khụng phự hợp, phờ duyệt theo hỡnh thức hợp đồng trọn gúi gõy nhiều khú khăn cho hoạt động cung ứng thuốc do số lương thuốc sử dụng nhiều biến động.