Xử lý mẫu là giai đoạn đầu tiờn nhưng rất quan trọng của quỏ trỡnh phõn tớch. Mọi sai sút trong giai đoạn này đều là nguyờn nhõn tạo ra sai số cho kết quả phõn tớch, cú khi sai số rất lớn. Vỡ thế mọi cỏch xử lý mẫu phõn tớch, cựng với việc tuõn thủ cỏc điều kiện của QA/QC (quanlity of Analysis /Quality of Contrl), cũn phải đỏp ứng được cỏc yờu cầu cụ thể sau đõy:
- Khụng làm mất chất phõn tớch
- Khụng làm nhiễm bẩn thờm chất phõn tớch vào mẫu do bất kỳ nguồn nào
- Kết quả xử lý phải phự hợp với phương phỏp đó chọn
- Dựng cỏc húa chất phải đảm bảo độ sạch đỳng yờu cầu, mục đớch phõn tớch và mức độ phõn tớch.
- Khụng đưa thờm cỏc chất cú ảnh hưởng vào mẫu.
- Cú thể tỏch hay làm giàu được mẫu cần phõn tớch thỡ càng tốt.
Xử lý mẫu phõn tớch là một quỏ trỡnh phức tạp cú húa học, húa lý hay vật lý và húa học kết hợp để chuyển cỏc chất, cỏc nguyờn tố, cỏc ion cần xỏc định cú trong mẫu phõn tớch ban đầu thành dạng tan trong dung mụi thớch hợp như: nước, dung mụi hữu cơ…, để sau đú cú thể xỏc định được nú theo một phương phỏp phõn tớch thớch hợp.
Trong cỏc mẫu phõn tớch cỏc chất cần xỏc định tồn tại trong cỏc trạng thỏi liờn kết húa học khỏc nhau, trong trạng thỏi vụ cơ, hữu cơ khỏc nhau, cú khi rất bền vững. Nờn khụng thể xỏc định được đỳng đắn hàm lượng của nú, trong 1 tổ hợp phức tạp bền vững và bị cỏc nguyờn tố, cỏc chất khỏc, mạng lưới liờn kết tồn tại của mẫu cản trở. Do đú, cần phải xử lý mẫu để phỏ vỡ cỏc cấu trỳc phức tạp về dạng chất đơn giản phự hợp với phương phỏp phõn tớch đó chọn. Sau đõy là 1 số phương phỏp vụ cơ húa mẫu: